T5. Estructura secundaria de las proteínas Flashcards
Las principales fuerzas que estabilizan las estructuras secundarias de las proteínas son puentes de hidrógeno entre las cadenas laterales.
FALSO
Son puentes de hidrógeno entre los grupos péptido.
Las principales fuerzas que estabilizan las estructuras secundarias de las proteínas son puentes de hidrógeno entre los grupos péptido.
VERDADERO
La estructura secundaria consiste en un ordenamiento espacial de la cadena polipeptídica debido a interacciones ente residuos de aminoácidos relativamente distantes en la secuencia
FALSO
Son aminoácidos próximos en la secuencia
Coils y loops son estructuras secundarias ordenadas pero no repetitivas, puesto que aunque presentan ángulos de torsión permitidos carecen de la característica de repetición
FALSO
Coils y loops son estructuras secundarias no ordenadas
Un enlace de hidrógeno es una interacción direccional, puesto que es más fuerte si los átomos que intervienen se encuentran alineados
VERDADERO
Entre los parámetros que definen a una hélice a nivel estructural, “h” hace referencia a la distancia que se recorre por cada vuelta de hélice
FALSO
“h” es la distancia a lo largo del eje que hay entre 2 residuos de aminoácido consecutivos
La distancia por cada vuelta de hélice se llama “p” o paso de rosca.
Cuando hacemos referencia a una hélice desde el punto de vista estructural, n es el número de residuos aminoacídicos por cada vuelta de hélice
VERDADERO
En las hélices alfa, los puentes de hidrógeno se dan entre el H del grupo amino del residuo “n” y el O carbonílico del residuo “n+4”
FALSO
Se dan entre el el O carbonílico del residuo “n” y el H del grupo amino del residuo “n+4”
En una hélice alfa únicamente encontraremos residuos de prolinas en la primera vuelta de rosca.
VERDADERO
Debido a que su N amídico no puede formar puentes de hidrógeno (cuando forma enlace peptídico pierde su único H), pero su O carbonílico sí, puede encontrarse como uno de los 4 primeros residuos, que solo establecen un pdH y lo hacen como aceptores.
La secuencia de aminoácidos de una cadena polipeptídica es irrelevante para la estabilidad de una hélice alfa, puesto que esta se estabiliza gracias a la formación de enlaces de H entre el esqueleto polipeptídico
FALSO
La secuencia de aminoácidos es importante a la hora de estabilizar una hélice alfa, puesto que cada 3-4 residuos las cadenas laterales se encuentran alineadas y pueden establecer interacciones o se pueden repeler
El interior de una hélice alfa se encuentra estrechamente empaquetado y es relativamente rígido
VERDADERO
Las hélices alfa anfipáticas presentan un interior con predominancia de residuos hidrofóbicos mientras y un exterior donde abundan los residuos hidrofílicos
FALSO
El interior de las hélices es compacto y solo presenta el esqueleto polipeptídico.
Las hélices anfipáticas presentan una cara con residuos hidrofóbicos y otra en la que predominan residuos hidrofílicos
Las hélices son poco estables salvo que se encuentren en entornos hidrofóbicos, como el interior de una membrana: en tal caso están muy estabilizadas.
VERDADERO
En un entorno polar, por ejemplo disolución acuosa, el agua compite con los residuos para formar puentes de hidrógeno. En cambio en un entorno apolar la hélice solo establece interacciones consigo misma, lo que la estabiliza.
Cuando hablamos de una estructura helicoidal definiéndola por medio de la notación n “sub m” (nm):
n es el número de restos por vuelta de hélice;
m es el número de átomos implicados en el anillo cerrado por el pdH, sin tener en cuenta el H
FALSO
m tiene en cuenta el H
En las hélices 3 “sub 10” los puentes de hidrógeno no alineados se establecen entre el residuo 1 y el 3, el 2 y el 4…
FALSO
Se establecen entre el residuo n y el n+3, es decir, entre el 1 y el 4, el 2 y el 5…
