Bio cell : Oxydation irréversible ADN Flashcards

1
Q

Sur quels composants de l’ADN les ERO et ERN peuve,t réagir ?

A
  • Bases
  • Désoxyribose
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Q

Quelles sont les effets des ERO et ERN sur les bases de l’ADN ?

A
  • Formation d’adduits
  • Nitration
  • Nitrosation
  • Désamination des bases
  • Oxydation
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Q

Quels sont les produits à l’origine des adduits se formant sur les bases de l’ADN ?

A
  • Radicaux peroxyde d’AG
  • Aldéhyde : MDA, 4HNE, acroéline
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4
Q

Caractéristiques de la localisation des adduits sur les base de l’ADN ?

A
  • Groupement aminé des bases
  • Guanine +++
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5
Q

Quel est le composé qui réagit le plus avec la guanine ?

A

MDA → malondialdéhyde

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6
Q

Réaction de la guanine avec un dérivée oxydant ?

A

Fragmentation → Ouverture du cycle → intermédiaire réactif électrophile → Fixation sur nucléophiles → Liaison avec ADN → Pontages → Condensation chroma +++ → impact transcription/ réplication

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7
Q

Les formations d’adduits sur l’ADN sont ……. des oxydations

A

Non spécifiques

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8
Q

Quels sont les acteurs de la nitration, nitrosation et désamination des bases ?

A
  • Dioxyde d’azotes → NO°2
  • Anion peroxyde → ONOO-
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9
Q

Qu’est-ce que la nitration des bases ?

A

Formation de :
* Nitroguanine
* Bases xanthiques

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10
Q

Comment sont obtenues les bases xanthiques ?

A

Désamination de xanthine et hypoxantine

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11
Q

Rôle de la xanthine oxydase ?

A

→ Enzyme pro-oxydante
Conduit à la formation :
* Acide urique
* Anion superoxyde

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12
Q

Importance de la “dangerosité” de la nitration des bases de l’ADN ?

A

Peut entrainer une 2eme vague de production d’ERO

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13
Q

Quelles sont les espèces oxydantes intervenant dans l’oxydation des bases ?

A
  • Oxygène singulet
  • LOO°
  • ONOO- (+ rare)
  • Radical hydroxyle
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14
Q

Quelle fonction chimique peut être oxydée par les ions ?

A

Les grpt thiols des protéines

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15
Q

Rôle de O2°-, H2O2 et NO dans l’oxydation des base de l’ADN ?

A

Formation des espèces oxydées

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16
Q

Quels sont les mécanismes d’oxydation des bases principales ?

A

→ 2
* Addition : guanine et adénine
* Arrachement d’un atome d’H

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17
Q

Addition d’°OH sur Guanine ?

A
  • C4, C5 ou C8 (+++)
    Addition → intermédiaire R° 8-hydroxyguanine ou ouverture de cycle FAPyGuanine
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18
Q

Sur quelles base se déroule majoritairement l’arrachement des hydrogènes ?

A
  • Cytosine
  • Thymine
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19
Q

Qu’obtient on après arrachement d’un hydrogène ?

A

Radical de base

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20
Q

Comment réagit le radical de base ?

A

Oxydation → Radical peroxyde de base → arrache un atome H → Hydroperoxyde de base

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21
Q

Effet de °OH sur la thymine ?

A

Arrachement d’un H sur le cycle ou groupement méthyle

22
Q

Qu’obtient on avec l’arrachement d’un H sur le cycle de la thymine ?

A

Thymine glycol

23
Q

Qu’obtient on avec l’arrachement d’un H sur le méthyle d’une thymine ?

A

5-hydroxyméthyleuracile

24
Q

Caractéristiques des réactions d’arrachement d’hydrogène sur les thymines ?

A

Catalysées par le Fe et autres métaux

25
Q

Quels sont les produits que l’on peut obtenir avec la réaction d’un °OH sur une cytosine ?

A

→ Arrachement d’un atome H
* Cytosine glycol
* 5,6-dihydroxycytosine

26
Q

Qu’implique une atteinte de la désoxyribose par l’oxydation ?

A

Déstructurations de l’ADN

27
Q

Produit obtenu par l’oxydation de la désoxyribose ?

A

Radicaux peroxyles

28
Q

Forme des radicaux peroxyles ?

A

Radical carbone centré

29
Q

Qu’engendre l’oxydation de la désoxyribose ?

A

Fragmentation de l’ADN
→ Carbonyles et MDA
→ Déstructuration de l’ADN
→ Rupture de liaison avec la base

30
Q

Quelles sont les produit obtenues après altération du désoxyribose ?

A
  • Sites abasiques
  • Simple brin d’ADN
31
Q

Quels sont les principaux sites cellulaires d’oxydation de l’ADN ?

A
  • Noyau
  • Mitochondires
32
Q

Quelle espèce dans le noyau peut réagir et oxyder l’ADN ?

A

Radical hydroxyle

33
Q

Le radical hydroxyle est formé dans/a proximité/loin du noyau ?

A

A proximité

34
Q

Quels facteurs augmentent le risque d’oxydation de l’ADN ?

A

Présence de Fe et Cu liés à l’ADN

35
Q

Pourquoi le risque d’oxydation de l’ADN est + important dans la mitochondrie que dans le noyau ?

A
  • Proximité avec la chaine respiratoire (fuite d’e-)
  • Réparation moins efficace
  • Augmente avec l’âge
36
Q

Quelles sont les différentes sorte de toxicités cellulaires observée avec l’oxydation irréversible de l’ADN ?

A
  • Arrêt de la réplication
  • Effets mutagènes
37
Q

Quelles sont les conditions d’arrêt de la réplication ?

A
  • Certains types d’oxydation
  • Base très modifiée
  • Réparation plus suffisement rapide
38
Q

Quels sont les différents effets mutagènes observables ?

A
  • Protéine nucléaire
  • Cancérogénèse
  • Effets génotoxique
39
Q

Qu’est-ce que que la modification des protéines nucléaires ?

A
  • Pas d’arrêt de réplication
  • Incorporation d’erreurs minimes
  • incorporation d’un nucléotide incorrect face à la base oxydée
40
Q

Quelle est la mutation protéique nucléaire la plus fréquente ?

A

Transversion GC en AT

41
Q

Quels sont les effets génotoxiques directs qui ont un risque carcinogène ?

A
  • Aberration Xsomique
  • Coupure simple ou double brin
  • Echange de chromatide
  • Formation de µnoyaux
42
Q

Que sont les µnoyaux ?

A

Partie des Xsomes part dans une des cellules et forme des petits amas

43
Q

Principe de la réparation de l’oxydation des bases ?

A
  • Elimination des bases oxydées
  • Clivage du désoxyribose
  • Remplacement de la base par une nouvelle synthèse
44
Q

Nom de la réparation de l’oxydation des bases ?

A

BER : Base Excision Repair
Réparation par excision de base

45
Q

Quelles sont les enzymes spécifiques à la réaction BER ?

A
  • DNA glycosylase
  • Endonucléase
  • Desoxyribosephosphodiesterase
  • Polymérase
  • Ligase
46
Q

Rôle de la DNA glycosylase ?

A

Permet d’éliminer la base oxydée → obtention d’un site AP → Clivage par endonucléase

47
Q

Rôle de la desoxyriboephosphodiesterase ?

A

Permet d’éliminer la désoxyribophosphate

48
Q

Rôle de la polymérase dans la réparation de l’ADN ?

A

Introduit le bon nucléotide

49
Q

Rôle de la ligase dans la réparation de l’ADN ?

A

Réalise la suture entre les nucléotides

50
Q

Caractéristiques des glycosylases ?

A
  • Famille
  • 11 chez l’Ho
  • +/- spécifique de la base oxydée