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{P2} UE6.1 > Biochimie : Transcription > Flashcards

Biochimie : Transcription Flashcards

1
Q

Qu’est-ce que la transcription ?

A

Production d’un ARN à partir d’un gène présent sur l’ADN

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Q

Qu’est-ce que la reverse transcription ?

A

A partir d’un ARN refaire un ADN double brin

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Q

Principale différence pour la transcription entre les procaryote et les eucaryotes ?

A
  • Eucaryote : à lieu dans le noyau
  • Procaryote : à lieu dans le cytoplasme
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Q

Qu’implique la production de l’ARN dans le noyau pour les eucaryote ?

A

Nécessité de protéger l’ARN par modification d’une possible dégradation

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5
Q

Différences entre L’ADN et l’ARN ?

A
  • ADN : Désoxyribo
  • ARN : Ribo
  • T → U
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6
Q

Quels sont les ARNs existants ?

A
  • ARNt
  • ARNr
  • ARNm
  • s/ncARN
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7
Q

Rôles des ARNr ?

A

→ ARN ribosomique
* Structure des ribosomes
* Formation des ribosomes

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8
Q

Rôles des ARNt ?

A

→ ARN de transfert
* Aide à la traduction des messager en protéines

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9
Q

Rôle des ARNm ?

A

→ARN messager
* Messager codant des protéines

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10
Q

Rôles de s/ncARN ?

A

→ Small ARN/ ARN non codant
* Petite tailles ( ≈ 500 nucléotides)
* Fonction de régulation

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11
Q

Quel est l’ARN le plus produit ?

A

ARNr → 90% des ARN transcrit

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12
Q

Quelles est la différence entre l’ARNm et tous les autres ARN ?

A
  • ARNm = seul à être traduit (intermédiaire)
  • Les autre = produits finis
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13
Q

Qu’est-ce que le TSS ?

A

1er nucléotide transcrit = +1
→ Extrémité 5’P de l’ARN

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14
Q

Qu’est-ce que l’unité de transcription ?

A

Limite du fragment d’ADN qui sera transcrit en ARN par l’ARN polymérase

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15
Q

Rôle du brin codant ?

A

Modèle de transcription (formation d’un brin quasi identique)

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16
Q

Autres noms du brin codant ?

A
  • Brin sens
  • Brin du haut
  • Brin +
  • Brin 5’→3’
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17
Q

Rôle du brin matrice ?

A

Base pour la traduction (formation d’un brin complémentaire)

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18
Q

Autres noms du brin matrice ?

A
  • Brin transcrit
  • Brin antisens
  • Brin du bas
  • Brin -
  • Brin 3’→5’
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19
Q

Rôle de la région promotrice ?

A

Possède des signaux pour démarrer la transcription

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20
Q

Rôle de la région terminatrice ?

A

Possède des signaux pour arrêter la transcription

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21
Q

Qu’est-ce que le terminateur ?

A

Il situe le lieu où l’ARN polymérase va se dissocier de l’ADN
→ Extrémité 3’OH de l’ARN

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22
Q

Que sont les région 5’UTR et 3’UTR ?

A

Région promotrice et terminatrice des ARN
→ Ne sont pas traduite

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23
Q

Qu’est-ce qu’un opéron ?

A

Plusieurs protéine codées par un même fragment d’ADN (présente côte à côte dans le génome)
→ Procaryote

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24
Q

Quels sont les signaux que l’on retrouve chez les procaryotes ?

A
  • Promoteur
  • Opérateur
  • Séquence RBS
  • Codon d’initiation
  • Cadre ouvert de lecture
  • Codon stop
  • Terminateur
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25
Q

Caractéristiques du promoteur ? (procaryote)

A

Contient :
* Nucléotide +1 (TSS)
* TATA box (-10)
* Boite pribnow (TTGACA, -35)

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26
Q

Rôle du promoteur ? (procaryote)

A

Permet à l’ARN polymérase de débuter la transcription

27
Q

Qu’est-ce que l’opérateur ? (procaryote)

A

Séquence reconnue par d’éventuels régulateurs

28
Q

Rôle de l’opérateur ?

A

En se fixant sur l’opérateur, les régulateurs peuvent empêcher la polymérase d’avancer

29
Q

Où se situe l’opérateur ?(procaryote)

A

En général : entre TATA box et TSS

30
Q

Caractéristique du terminateur ?

A

Peut être :
→ Rho dépendante
→ Rho indépendante

31
Q

Caractéristique d’un terminateur rho dépendante ?

A

Constitué d’une séquence consensus reconnue par prot Rho
→ Provoque détachement

32
Q

Caractéristique d’un terminateur Rho indépendante ?

A
  • Séquence répétée inversée
    → formation d’une structure en tige de boucle → met fin à la transcription
33
Q

Quels sont les signaux que l’on retrouve dans les gènes eucaryotes ?

A
  • Les ≠ types de gène/promoteurs
  • Séquence de fixat° des facteurs de transcription
  • Boite TATA
  • Coiffe 5’
  • Jonctions introns/exons
  • Terminateur
34
Q

Quels sont les ≠ types de gènes eucaryote et les ARN polymérases associées ?

A
  • Gènes ARNr 18s et 28s → ARN polymérase I
  • Gènes ARNm et ARNnc → ARN polymérase II
  • Gènes ARNt et ARNr 5S → ARN polymérase III
35
Q

Où se situent les séquences de fixation des transcription (chez eucaryotes) ?

A
  • Dans la région promotrice
  • A cheval sur TSS
36
Q

Rôle des séquences de fixation des facteurs de transcription ?

A

Facilitent ou empêchent la fixation de l’ARN polymérase

37
Q

Localisation de la TATA box chez les eucaryotes ?

A

A - 25/30 du TSS

38
Q

Chez les eucaryotes, avec quel action est couplée la terminaison de la transcription ?

A

La poly adénylation en 3’ des ARNm

39
Q

Caractéristique de la polyadénylation ?

A
  • Modification post transcriptionnelle
  • Au niveau d’une séquence AAUAA
  • Fait intervenir le complexe CPSF
  • Ajout ≈ 200 A
40
Q

Quels sont les principes de la transcription ?

A
  • Unidirectionnel
  • Action d’une ARN polymérase ADN dépendante
  • 3 étape
  • Plusieurs étape post transcriptionnelles chez les eucaryotes
  • Régulation
41
Q

Quelles sont les 3 étapes de la transcription ?

A
  • Initiation
  • Elongation
  • Terminaison
42
Q

Sens de synthèse de la transcription ?

A

Sens 5’-3’

43
Q

Caractéristique de l’ARN polymérase chez les procaryotes ?

A
  • Unique
  • 6 sous unités
  • PM ≈ 480 kDa
44
Q

Caractéristiques de l’ARN polymérase chez les eucaryotes ?

A
  • 3 ARN polymérase ≠
  • 5 à 12 sous unités
45
Q

Comment se fait l’adaptation des procaryote pour leur transcription ?

A

1 seul ARN polymérase mais plusieurs facteur sigma

46
Q

Problème de l’ARN polymérase II ?

A

Incapable de lier ADN assez fortement et d’initier la transcription

47
Q

Comment chez les eucaryotes est permis la liaison de l’ARN pol II à l’ADN ?

A
  • Intervention des facteurs généraux de transcription (TFII)
  • Formation du CIT
48
Q

Quelles sont les les TFII existantes ?

A

=> 5
* B
* D
* E
* F
*H

49
Q

Comment est initiée la transcription ?

A

Fixat° du complexe ARN poly → Ouverture double hélice

50
Q

Quelles sont les régions du promoteur chez les eucaryotes ?

A

=> 3
* TATA box : -25
* GC box : -50
* CAAT box : -90

51
Q

Comment peut se faire la reconnaissance du promoteur chez les eucaryotes ?

A

→ Formation d’un complexe d’initiation

52
Q

Par quel mécanisme se fait l’élongation lors de la transcritpion ?

A

Formation de liaison phosphodiester (sens 5’-3’)

53
Q

Comment expliquer que la transcription prenne plus de temps chez les eucaryote que chez les procaryotes ?

A

Remodelage des histones et nucléosome (eucaryotes)

54
Q

Que se passe-t-il chez les procaryotes et le eucaryotes lorsque l’élongation à commencé ?

A
  • Pro → relargage facteur σ
  • Eu → phosphorylation queue CTD par TFIIH
55
Q

Terminaison procaryote ?

A
  • Rho dépendante ou indépendante
  • Séquence terminateur + facteur de terminaison
56
Q

Terminaison de la transcription avec ARN poly II chez eucaryotes ?

A

Couplée à la maturation des ARNm → Polyadénylation

57
Q

Quelles sont les modification post transcriptionnelle chez les eucaryotes ?

A
  • La coiffe 5’
  • La queue poly A
  • L’épissage
58
Q

Caractéristique de la coiffe 5’ ?

A
  • Co-transcriptionnelle
  • Dès le début de la transcription dans le noyau
  • En 5’
59
Q

Rôle de la coiffe ?

A
  • Stabilisation
  • Export nucléaire
  • Traduction
60
Q

Rôle de la polyadénylation ?

A

Stabilisation et protection de l’ARNm

61
Q

Tailles des introns ?

A

500 à 500k nucléotides

62
Q

Taille des exons ?

A

100 à 500 nucléotides

63
Q
A

{P2} UE6.1 (33 decks)

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