Biochimie Module A Points importants Maechler Flashcards
1
Q
Le métabolisme fournit les éléments de ___ des cellules.
A
construction
2
Q
Flux de l’énergie;Les hétérotrophes/autotrophes(?) produisent à l’aide de l’énergie solaire de l’O2 et des composés organiques. Les hétérotrophes/autotrophes(?) transforment ces derniers grâce à la respiration Cr en H2O et CO2.
A
autotrophes;hétérotrophes
3
Q
• Un organisme vivant se ___ et se ___.• Cela nécessite de la ___ et de l’___. 
A
conserve;reproduit;matière;énergie
4
Q
• Le métabolisme comprend le ___ et l’___.• Organismes hétérotrophes dérivent l’énergie de molécules simples/complexes(?) et la matière de molécules simples/complexes(?).
A
catabolisme;anabolisme;complexes;simples
5
Q
Organisme autotrophe libérant son énergie stockée sous forme minérale/organique(?): production de ___, de ___, et d’___
A
organique;chaleur;CO2;eau
6
Q
Bois, charbon, gaz, pétrole: des végétaux qui fournissent de l’énergie grâce à la combustion de leur carbone minéral/organique(?).
A
organique
7
Q
• Le carbone de la matière organique est globalement oxydé/réduit(?).• Le carbone organique/minéral(?) sous forme de CO2 est oxydé/réduit(?).
A
réduit;minéral;oxydé
8
Q
• Respiration cellulaire oxyde/réduit(?) le carbone minéral/organique(?) en carbone minéral/organique(?).• Ceci produit de l’___ (ATP).
A
oxyde;organique;minéral;énergie
9
Q
ATP=___ ___(abr?): une ___ d’___ énergétique
A
adénosine triphosphate;monnaie;échange
10
Q
ATP utilisée pour: • ___ • ___ ___ • ___ • ___
A
Mouvements;Gradients ioniques;Signalisation;Anabolisme
11
Q
ATP est « la monnaie » de l’énergie:• Continuellement/alternativement(?) formé et consommé • Un être humain, au repos, en consomme: ___kg/jour • Exercice intense, consommation: ___kg/min • Concentration cellulaire: ___-___ mM
A
Continuellement;40;0.5;2-4
12
Q
• Catabolisme: réactions exergoniques/endergoniques(?)• Anabolisme: réactions exergoniques/endergoniques(?)
A
exergoniques;endergoniques
13
Q
dégradations:Voies cataboliques ou anaboliques?
A
cataboliques
14
Q
nécessite énergie:Voies cataboliques ou anaboliques?
A
anaboliques
15
Q
réductives (nécessite des électrons):Voies cataboliques ou anaboliques?
A
anaboliques
16
Q
Les voies sont convergentes:Voies cataboliques ou anaboliques?
A
cataboliques
17
Q
oxydatives (donne des électrons):Voies cataboliques ou anaboliques?
A
cataboliques
18
Q
fournit de l’énergie:Voies cataboliques ou anaboliques?
A
cataboliques
19
Q
Biosynthèse:Voies cataboliques ou anaboliques?
A
anaboliques
20
Q
Les voies sont divergentes:Voies cataboliques ou anaboliques?
A
anaboliques
21
Q
utilisent ___(CoE?) et ___(CoE?) comme porteurs d’électrons (accepteurs):Voies cataboliques ou anaboliques?
A
NAD+;FAD;cataboliques
22
Q
utilisent ___(CoE?) comme donneur d’électrons:Voies cataboliques ou anaboliques?
A
NADPH;anaboliques
23
Q
Les voies anaboliques sont le plus souvent/ne sont le plus souvent pas(?) l’inverse des voies cataboliques.
A
ne sont le plus souvent pas
24
Q
NADH et FADH2: une monnaie ___(≠ énergétique?): des équivalents réducteurs échangés contre de l’___(molécule?)
A
red-ox;ATP
25
* Keq = [C]eq*[D]eq/[A]eq*[B]eq
| * Keq = ___ d’___
constante;
| équilibre
26
* ΔH = ___ générée/absorbée entre l’état initial et final
* ΔS = ___ (=état de désordre) décroît/croît(?) dans l’univers par un processus spontané
* ΔG = ___ ___ de ___ = variation de la ___ de la réaction
```
chaleur;
entropie;
croît;
énergie libre;
Gibbs;
spontanéité
```
27
• ΔH « – » : réaction défavorable/favorable(?) sur le plan de l’enthalpie (endothermique/exothermique(?))
• ΔS « + » : réaction défavorable/favorable(?) sur le plan de l’entropie
⇉ Donc ΔG « – » : réaction non-spontanée/spontanée(?) endergonique/exergonique(?)
```
favorable;
exothermique;
favorable;
spontanée;
exergonique
```
28
Conditions standards définissent la variation d’énergie libre standard ΔG°’:
● " °/’(?) " Pression = 101.3 kPa (=___ atm)
● " °/’(?) " Température = ___° K (___°C)
● " °/’(?) " pH = ___
● Conditions initiales de concentration des réactants: [A] = [B] = [C] = [D] = ___M
```
°;
1;
°;
298;
25;
’;
7.0;
1
```
29
* ΔG°’= ...(formule?)
* Si ΔG°’ négative: réaction exergonique/endergonique(?)
* Si ΔG°’ positive: réaction exergonique/endergonique(?)
-RTln(Keq);
exergonique;
endergonique
30
Les conditions réelles de la vie cellulaire définissent la variation d’énergie libre ΔG:
• ΔG°’= ...(formule?)
• ΔG = ...(formule?)
• ΔG varie/ne varie pas(?) au cours de la réaction
-RTln(Keq);
ΔG°’+RTln([C][D]/[A][B]);
varie
31
* ΔG°’ est une autre manière d’exprimer la ___ d’___
| * ΔG°’ reflète les propriétés des composés (i.e. ___ et ___)
constante;
équilibre;
substrats;
produits
32
Molécules A, B, C et D ont une énergie libre:
Lors de la réaction A+B (état initial) vers C+D (état final), il y a ___ d’énergie libre ΔG:
• ΔG = ΔGproduits – ΔGsubstrats
• Si ΔG négative: réaction non spontanée/spontanée(?) → le système a gagné/perdu(?) de l'énergie libre
variation;
spontanée;
perdu
33
* Si ΔG°’ négative: réaction endergonique/exergonique(?)
| * Si ΔG°’ positive: réaction endergonique/exergonique(?)
exergonique;
| endergonique
34
ΔG = variation de la spontanéité de la réaction;
1) A+B ⇆ C+D
2) ΔG°’= - RTln(Keq)
3) +RTln([C][D]/[A][B])
• Quelle numéro correspond au terme "réaction"?
1) A+B ⇆ C+D
35
ΔG = variation de la spontanéité de la réaction;
1) A+B ⇆ C+D
2) ΔG°’= - RTln(Keq)
3) +RTln([C][D]/[A][B])
• Quelle numéro correspond au terme "spontanéité"?
2) ΔG°’= - RTln(Keq)
36
ΔG = variation de la spontanéité de la réaction;
1) A+B ⇆ C+D
2) ΔG°’= - RTln(Keq)
3) +RTln([C][D]/[A][B])
• Quelle numéro correspond au terme "variation"?
3) +RTln([C][D]/[A][B])
37
* ln(1)=___
| * log(1)=___
0;
| 0
38
* ln(e)=___
| * log(10)=___
1;
| 1
39
L’ATP occupe une position basse/intermédiaire/supérieure(?) sur le thermomètre des ΔG°' → monnaie d’échange
intermédiaire
40
Dans les conditions cellulaire, l’hydrolyse de l’ATP est une réaction endergonique/exergonique(?). ___ kJ/mol
exergonique;
| -30,5
41
Une réaction endergonique peut/ne peut pas(?) être possible si elle est « poussée » par un rapport Produit/Substrat très favorable.
peut
42
Une réaction endergonique (ΔG°’ positive/négative(?)) est possible si elle est couplée à une réaction exergonique (ΔG°’ positive/négative(?)).
positive;
| négative
43
ΔG# = ___ ___ d’___
énergie libre;
| activation
44
ΔG ne nous dit rien de la ___ de réaction. Cette dernière dépend de ΔG#: différence d’___ ___ entre l’___ ___ et l’___ de ___.
```
vitesse;
énergie libre;
état initial;
état;
transition
```
45
La vitesse de réaction est directement/inversement(?)
| proportionnelle au ΔG#.
inversement
46
Comment passer la barrière de l’état de transition;
• Le chimiste ___ son tube à essai
• Le biologiste introduit des ___
chauffe;
| enzymes
47
ΔG#/ΔG°’/ΔG(?): variation d’énergie libre dans une réaction
(variation de la spontanéité de la réaction)
ΔG#/ΔG°’/ΔG(?): variation d’énergie libre en conditions
standards (propriétés de la réaction)
ΔG#/ΔG°’/ΔG(?): énergie libre d’activation (détermine la vitesse de la réaction)
ΔG;
ΔG°’;
ΔG#
48
Les électrons sont transférés de l'oxydant au réducteur/du réducteur à l’oxydant(?):
• réducteur: accepteur/donneur(?) d’électrons
• oxydant: accepteur/donneur(?) d’électrons
du réducteur à l’oxydant;
donneur;
accepteur
49
un ___ ___ = un e- transféré dans une réaction d’oxydoréduction
équivalent réducteur
50
Potentiel redox standard E°; en condition Cr (pH=___) on définit E°’;
• couple 2H+/H2: +/- x,xx(?) V
• couple NAD+/NADH+H+: +/- x,xx(?) V
• couple O2/H2O: +/- x,xx(?) V
7;
-0.42;
-0.32;
+0.82
51
Une réaction endergonique/exergonique(?) est spontanée et spontanée ≠/=(?) instantanée.
exergonique;
| ≠
52
saccharose + H2O → ___ + ___, ΔG°’= -29.3 kJ/mol;
| Une enzyme spécifique (ici la ___) catalyse (accélère) la réaction dans une échelle de secondes.
glucose;
fructose;
saccharase
53
* enzyme vient des racines grecques en (=___) zume (=___).
* Le ___, est la pâte de levures vivantes utilisée pour faire lever le pain.
* Les premières enzymes identifiées ont été extraites des levures (celles-ci transforment le glucose en ___(≠éthanol?)).
dans;
levain;
levain;
alcool
54
Classification des enzymes;
• ___: transfert d’électrons
• ___: transfert d’atomes ou de groupements
• ___: coupure de liaison par H2O
• ___=___: autres coupures de liaison
• ___=___: crée des liaisons (produit/consomme(?) de l’ATP)
• ___: isomérisation
```
Oxydoréductase;
Transférase;
Hydrolase;
Lyase;
synthase;
Ligase;
synthétase;
consomme;
Isomérase
```
55
La vitesse de réaction dépend de ΔG___: différence d’énergie libre entre l’état initial et l’état de transition.
#
56
Enzyme:
• Est une ___
• ___ biologique de réactions biochimiques
• Augmente la ___ de réaction
• Change/ne change pas(?) la constante d’équilibre Keq
• ↗/↘(?) l’énergie libre d’___ ΔG#
• Est non spécifique/spécifique(?) à son substrat
• Est régulable/non régulable(?)
```
protéine;
Catalyseur;
vitesse;
ne change pas;
↘;
activation;
spécifique;
régulable
```
57
La concentration de substrat influence/n'influence pas(?) la Vi=vitesse initiale, on détermine la vitesse maximale de E = Vmax
influence (+ il y a de S à t0, + Vi sera élevée jusqu'à atteindre un plateau équivalent à la Vmax)
58
Modèle Michaelis-Menten;
| Enzyme complémentaire à l’état de ___
transition
59
___ = constante de Michaelis-Menten: elle définit la relation enzyme↔substrat
KM
60
Modèle Michaelis-Menten;
Quand [S] tend vers l’infini, Vi = ___. Dans ces conditions, la vitesse dépend des propriétés de l’enzyme définies par la ___
Vmax;
| KM
61
Constante Michaelis-Menten KM = [___] à ___/___
S;
| Vmax/2
62
KM: concentration de substrat qui permet à l’enzyme de travailler au quart/au tiers/a la moitié(?) de sa vitesse maximale.
a la moitié
63
La KM indique la ___ de travail d’une enzyme, le nombre de ___ sur un télésiège aussi.
cadence;
| places
64
* La Vmax est la vitesse de réaction lorsque l’enzyme est à demi-saturation/saturation(?)
* La KM est la concentration de substrat lorsque l’enzyme est à demi-saturation/saturation(?) (indique la ___ de travail d’une enzyme)
saturation;
demi-saturation;
cadence
65
• KM élevée/basse(?) rime avec haute affinité et faible capacité.
• KM élevée/basse(?) rime avec faible affinité et haute capacité.
• affinité à comprendre dans le sens de ___.
basse;
élevée;
saturabilité
66
* Km basse → basse/haute(?) affinité=il n’y a pas besoin d’avoir bcp de substrat pour que tous les sièges du télésiège soit plein.
* Si la Km est élevée → basse/haute(?) capacité → basse/haute(?) affinité → +/-(?) difficilement saturable
haute;
haute;
basse;
+
67
La ___ permet de prédire:
• si une enzyme opère proche de sa Vmax
• si un changement dans la concentration du substrat va changer sa vitesse

KM
68
KM en mM glucose:
• HEXOKINASE: ___ mM
• GLUCOKINASE: ___ mM;
La concentration sanguine de glucose (glycémie) varie de ___ à ___ mM. Laquelle de ces kinases va réagir aux changements de la concentration de glucose?
0.1;
10;
4 à 10;
GLUCOKINASE
69
Avec son KM bas, la glucokinase/l’hexokinase(?) est continuellement en Vmax, métabolisant le glucose efficacement dans des conditions physiologiques.
l’hexokinase
70
Avec son KM élevé, la glucokinase/l’hexokinase(?) peut « sentir » des changements de glucose entre 4-10 mM. (+/- active, donc senseur au glucose)
la glucokinase
71
KM est directement/inversement(?) proportionnel à l’affinité de l’enzyme pour le substrat.
inversement
72
Cinétique enzymatique;
| Representation de ___-___ ou "double inverse"
LINEWEAVER-BURK
73
```
Site ___ d’une enzyme:
• Site de liaison du/des substrat/s
• Lieu de la réaction
• Localisé au fond d’une poche de la zone interne/externe(?) de la protéine
• Modèle de ___↔___
• Modèle d’___ ___
```
```
actif;
interne;
clé;
serrure;
ajustement induit
```
74
Modèle d’ajustement induit = ___ ___(ang?)
induced fit
75
Dans le site actif des E, il y a catalyse car:
• ↗/↘(?) de la concentration des réactants
• ___ propice des molécules
• ↗/↘(?) de l’énergie libre d’activation ΔG___ pour atteindre l’___ ___ ___
```
↗;
Orientation;
↘;
#;
état de transition
```
76
A l’extrême, une dénaturation des protéines (en l'occurrence d'E) par une température trop élevée produit une inhibition spécifique/non spécifique(?).
non spécifique
77
Protéines = ___(all?) = blanc d’œuf
Eiweiss
78
Les inhibiteurs:
• Irréversibles/réversibles(?) (se lient de façon covalente à un groupe fonctionnel)
• Irréversibles/réversibles(?) (compétitifs, non compétitifs, mixtes)
Irréversibles;
| réversibles
79
Inhibiteurs réversibles compétitifs:
• Non analogues/analogues(?) structuraux du substrat
• ↗/↘/ne changent pas(?) la KM, ↗/↘/ne changent pas(?) la Vmax
analogues;
↗;
ne changent pas
80
Le cyanure est un inhibiteur compétitif/non compétitif(?) de la ___ ___ ___(= complexe ___(#?) de la chaîne respiratoire mitochondriale). E essentielle à l'une des dernières étapes de la respiration Cr. Sans son activité, les mouvements respiratoires pulmonaires cessent.
Le ___-___ utilisé dans les camps de la mort nazis était constitué d'acide ___.
```
compétitif;
cytochrome c oxydase;
IV;
Zyclon-B;
cyanhydrique
```
81
L’éthanol est catabolisé dans ...(org?) par une double réduction/oxydation(?): 1) en ___, 2) en acide ___.
le foie;
oxydation;
acétaldéhyde;
acétique
82
Antabuse: inhibiteur compétitif/non compétitif(?) de l'___ ___(E?), causant une accumulation d’___ aux effets indésirables (hypotension, vomissements, nausée, inconfort).
compétitif;
acétaldéhyde déshydrogénase;
acétaldéhyde
83
Inhibiteurs non compétitifs:
• Non analogues/analogues(?) structuraux du substrat
• ↗/↘/ne changent pas(?) la KM, mais ↗/↘/ne changent pas(?) la Vmax
Non analogues;
ne changent pas;
↘
84
Inhibiteurs compétitifs/non compétitifs(?):
| Typiquement des ions ___ (___, ___, ___ etc.) qui modifient la répartition des charges de l'enzyme.
```
non compétitifs;
métalliques;
cuivre;
mercure;
argent
```
85
• Inhibiteurs compétitifs/non compétitifs(?):
Augmentent la KM, ne changent pas la Vmax
• Inhibiteurs compétitifs/non compétitifs(?):
Ne changent pas la KM, mais diminuent la Vmax
compétitifs;
| non compétitifs
86
Les activateurs:
• Ions ___ (___, ___ etc.)
• ___ ___ ___ (clivage d’une liaison peptidique d’une ___ = ___, comme pour les E de la digestion)
• Modification covalente/non covalente(?) réversible/non réversible(?) (Py/déPy)
```
métalliques;
calcium;
magnésium;
Protéolyse limitée activante;
proE;
zymogène;
covalente;
réversible
```
87
Enzymes allostériques sont caractérisés par une courbe ___ (donc elles sont michaéliennes/non michaéliennes(?))
sigmoïde;
| non michaéliennes
88
Les enzymes allostériques:
• Vi ralenti/accélère(?) à l’approche du KM (ou plutôt K0.5), point d’___ au KM, puis Vi ralenti/accélère(?) brutalement après KM
• La fixation du substrat sur l’enzyme ↗/↘(?) l’affinité de l’enzyme pour le substrat: effet ___
```
accélère;
inflexion;
ralenti;
↗;
coopératif
```
89
Les enzymes allostériques: coopérativité: 2 modèles s'opposent:
• modèle ___
• modèle ___

concerté;
| séquentiel
90
Les enzymes michaéliennes/allostériques(?) ont des effecteurs:
• Se lient sur les sites ___ (du grec ___=
autre=différent), donc =/≠(?) site substrat
• Effecteurs positifs (=___) ou négatifs (=___)
• Augmentation ou diminution de l’___ (à comprendre dans le sens de ___) envers le substrat
```
allostériques;
allostériques;
allos;
≠;
activateurs;
inhibiteurs;
affinité;
saturabilité
```
