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Biochimie Module A Points importants Maechler bis Flashcards

1
Q

La ___, E de la glycolyse, est sous contrôle allostérique:
• ADP en est un inhibiteur/activateur(?) allostérique
• ATP en est un inhibiteur/activateur(?) allostérique

A

phosphofructokinase;
activateur;
inhibiteur

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Q 
Inhibiteurs enzymatiques:
○ \_\_\_ \_\_\_: \_\_\_: 
● La \_\_\_ 
● Le \_\_\_ 
● L'\_\_\_
● Les \_\_\_ \_\_\_
○ \_\_\_: 
● \_\_\_: 
• \_\_\_ (analogues du S, E michaéliennes)
• \_\_\_ \_\_\_ (non analogues du S, E michaéliennes)
• \_\_\_ \_\_\_ \_\_\_ (non analogues du S, E allostériques non michaéliennes)
● \_\_\_




A 
Non spécifique;
Dénaturation;
température;
pH (acides/bases);
alcool;
métaux lourds;
Spécifique;
Réversible;
Compétitif;
Non compétitif;
Effecteur allostérique négatif;
Irréversible
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3
Q

Inhibiteur non compétitif ou effecteur allostérique?

• Ne change pas la KM

A

Inhibiteur non compétitif

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4
Q

Inhibiteur non compétitif ou effecteur allostérique?

• Effets sur une enzyme allostérique non michaélienne

A

effecteur allostérique

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5
Q

Inhibiteur non compétitif ou effecteur allostérique?

• Effets physiologiques, enzyme régulée

A

effecteur allostérique

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6
Q

Inhibiteur non compétitif ou effecteur allostérique?

• Effets sur une enzyme michaélienne

A

Inhibiteur non compétitif

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7
Q

Inhibiteur non compétitif ou effecteur allostérique?

• Effets non physiologiques, enzyme piratée

A

Inhibiteur non compétitif

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8
Q

Inhibiteur non compétitif ou effecteur allostérique?

• Module la K0.5

A

effecteur allostérique

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9
Q

Régulation métabolique: Adapter la demande/l’offre(?) métabolique à la demande/l’offre(?) Cr:
• Ajuster la concentration d’un métabolite spécifique au besoin Cr
• Freiner/accélérer(?) la production lorsque la demande est insatisfaite

A

l’offre;
la demande;
accélérer;

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10
Q

Régulation métabolique: Adapter la demande/l’offre(?) métabolique à la demande/l’offre(?) Cr:
• Freiner/accélérer(?) la production lorsque la demande est satisfaite
• L’enzyme régulant une voie métabolique catalyse la réaction ___

A

l’offre;
la demande;
freiner;
limitante

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11
Q

Régulation métabolique: Réaction limitante:
• Dans une chaîne de réactions, les enzymes ne sont pas/sont(?) en excès, sauf pour la réaction limitante
• L’étape régulatrice est en tout début/toute fin(?) de chaîne de réactions

A

sont;

tout début

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12
Q

Régulation métabolique: Réaction limitante:
• La première réaction de la chaîne doit être non spécifique/spécifique(?) de la voie métabolique
• La première réaction spécifique est réversible/irréversible(?) (en conditions cellulaires=selon la T, le pH, la concentration de substrat et produits)

A

spécifique (si c’est une réaction carrefour: on affecterait plusieurs voies);
irréversible

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13
Q

Régulation métabolique: réactions limitantes:
• L’étape régulatrice en fin/début(?) de chaîne
• Première réaction doit être spécifique/non spécifique(?) de la voie
• La première réaction spécifique est réversible/irréversible(?)

A

début;
spécifique;
irréversible

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14
Q 
Vitesse de réaction limitante:
• Fonction de la disponibilité en \_\_\_ (et en \_\_\_ associé)
• Dépend de l’\_\_\_ de l’enzyme
• Dépend de la \_\_\_ de l’enzyme

A

substrat;
coenzyme;
activité;
concentration

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15
Q

___ en ___:

  1. Approvisionnement en précurseur A et flux métabolique
  2. Compétition avec une éventuelle autre réaction
  3. Approvisionnement en CoE (et sa régénération)
A

Disponibilité;

substrat

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16
Q

Activité de l’enzyme:

  1. Activation par ___ (réversible/irréversible(?), enzymes digestives)
  2. Activation par fixation d’une protéine de ___ (réversible/irréversible(?))
  3. Contrôle par ___/___ (covalent/non covalent(?), réversible/irréversible(?))
  4. Contrôle ___ (covalent/non covalent(?), réversible/irréversible(?))
A 
protéolyse;
irréversible;
contrôle;
réversible;
phosphorylation / déphosphoprylation;
covalent;
réversible;
allostérique;
non covalent;
réversible
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17
Q

Phosphorylation / déphosphorylation:
• Phosphorylation (sur ___(AA?), ___(AA?) ou ___(AA?)) catalysée par une ___ (qui peut être elle-même phosphorylée → cascade)
• Déphosphorylation par une ___
• Le contrôle ___ passe généralement par des
réaction P/dé-P
• La cascade d’activation permet l’___ de la réponse signal

A 
serine;
thréonine;
tyrosine;
kinase;
phosphatase;
hormonal;
amplification
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18
Q

La cascade d’activation permet l’amplification du signal: exemple du métabolisme du ___. Mobilisation de ___ à partir du ___.

A

glycogène;
glucose-1-phosphate;
glycogène

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19
Q

Contrôle allostérique → enzymes michaéliennes/non michaéliennes(?):
• Activateurs (par métabolite aval (produit)/amont (substrat)(?), effecteur positif/négatif(?))
• Inhibiteurs (par métabolite aval (produit)/amont (substrat)(?), feedback positif/négatif(?))

A 
non michaéliennes;
amont (substrat);
positif;
aval (produit);
négatif
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20
Q

Les enzymes allostériques ont des effecteurs:
• Se lient sur les sites allostériques =/≠(?) site substrat
• Effecteurs positifs (=___) ou négatifs (=___)
• Augmentation ou diminution de l’___ (à comprendre dans le sens de ___) envers le substrat

A 
≠;
activateurs;
inhibiteurs;
affinité;
saturabilité
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21
Q

La ___ (E de la glycolyse) est sous contrôle allostérique:
• ADP/ATP(?) en est un activateur
• ADP/ATP(?) en est un inhibiteur
• réaction catalysée: ___ + ___ → ___ + ___

A 
phosphofructokinase;
ADP;
ATP;
Fructose-6-P;
ATP;
Fructose-1,6-BP;
ADP
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22
Q

Un effecteur allostérique négatif est un:
• inhibiteur/activateur(?)
• compétitif/non compétitif(?)
• irréversible/réversible(?)
• d’enzymes allostériques/michaéliennes(?)

A

inhibiteur;
non compétitif;
réversible;
allostériques

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23
Q

Effecteur allostérique:
• Module la K___
• Effets sur une enzyme allostérique michaélienne/non michaélienne(?)
• Effets non physiologiques/physiologiques(?), enzyme piratée/régulée(?)

A

0.5;
non michaélienne;
physiologiques;
régulée

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24
Q

Régulation par activité de l’enzyme:

  1. ___
  2. Protéine de ___
  3. ___/___
  4. Contrôle ___
A

Protéolyse;
contrôle;
Phosphorylation/déphosphorylation;
allostérique

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25
Régulation par concentration de l’enzyme ou contrôle transcriptionnel dépend de: • Vitesse de synthèse et dégradation (=___(ang?)) • Facteurs de transcriptions (protéines régulatrices se fixant sur l’ADN, dans la région ___(≠régulatrice?) du gène codant pour l’enzyme)
turnover; | promotrice
26
Régulation par concentration de l’enzyme ou contrôle transcriptionnel dépend de: • Induction/Répression(?) si synthèse de l’enzyme est accélérée • Induction/Répression(?) si synthèse est freinée • Facteurs de transcriptions eux-mêmes sous contrôle ___ et/ou ___
Induction; Répression; hormonal; métabolique
27
Vitesse de réaction limitante: • Fonction de la disponibilité en ___ (et en ___ associé) • Dépend de l’___ de l’enzyme (protéolyse, fixation d'un P de contrôle, P/dé-P, contrôle allostérique) • Dépend de la ___ de l’enzyme 
substrat; coenzyme; activité; concentration
28
Contrôle allostérique/par modification covalente/transcriptionnel(?): • Réponse immédiate comme l'E est tout de suite informée par une molécule qui se trouve dans la C (ordre: ≤ à la seconde) 
allostérique
29
Contrôle allostérique/par modification covalente/transcriptionnel(?): • Régulation physiologique, à l'échelle de l'organisme, aux conditions nutritionnelle et métabolique
par modification covalente
30
Contrôle allostérique/par modification covalente/transcriptionnel(?): • Réponse à long terme (ordre: heures à mois)
transcriptionnel
31
Contrôle allostérique/par modification covalente/transcriptionnel(?): • Permet l’amplification du signal hormonal
par modification covalente
32
Contrôle allostérique/par modification covalente/transcriptionnel(?): • Réponse moyen terme (ordre: seconde à minutes)
par modification covalente
33
Contrôle allostérique/par modification covalente/transcriptionnel(?): • Régulation adaptative, Cr et/ou à l'échelle de l'organisme, aux conditions de vie (alimentation, activité, périodes de vie, maladie, saisons)
transcriptionnel
34
Contrôle allostérique/par modification covalente/transcriptionnel(?): • Permet l’économie des ressources
transcriptionnel
35
Contrôle allostérique/par modification covalente/transcriptionnel(?): • Régulation locale, Cr, aux concentrations de métabolites
allostérique
36
Régulation métabolique: • Régulation adaptative aux conditions de vie (alimentation, activité, saisons) • Réponse long terme (ordre: heures à mois) • Permet l’économie des ressources Mécanisme observable chez quel animal par exemple?
Hibernation d'une marmotte
37
Contrôle allostérique/par modification covalente (type P / dé-P)/transcriptionnel(?): • Niveau: organisme (physiologique)   
par modification covalente (type P / dé-P)
38
Contrôle allostérique/par modification covalente (type P / dé-P)/transcriptionnel(?): • Délai: ≤ à la seconde
allostérique
39
Contrôle allostérique/par modification covalente (type P / dé-P)/transcriptionnel(?): • Délai: heures à mois
transcriptionnel
40
Contrôle allostérique/par modification covalente (type P / dé-P)/transcriptionnel(?): • Niveau: cellulaire et/ou organisme
transcriptionnel
41
Contrôle allostérique/par modification covalente (type P / dé-P)/transcriptionnel(?): • Délai: secondes à minutes
par modification covalente (type P / dé-P)
42
Contrôle allostérique/par modification covalente (type P / dé-P)/transcriptionnel(?): • Niveau: cellulaire (local)
allostérique
43
Les coenzymes: • Indispensable à l’activité de certaines ___ • Sont/Ne sont pas(?) des protéines • Ne retrouvent pas/Retrouvent(?) leur état initial • Participent/Ne participent pas(?) à la stœchiométrie de la réaction • Sont généralement des ___(molécules?)
``` enzymes; Ne sont pas; Retrouvent; Participent; vitamines ```
44
Les coenzymes transfèrent d’une molécule à une autre, par prise en charge permanente/transitoire(?), des: • ___ • ___ • ___
transitoire; Électrons; Atomes; Molécules
45
Les coenzymes: Deux mécanismes: • ___ (coenzyme lié/libre(?)), par ex. NAD • ___ ___ (coenzyme lié/libre(?)), par ex. FAD
Cosubstrat; libre; Groupe prosthétique; lié
46
Les coenzymes: Deux fonctions: • ___(réaction?) • Transfert de ___ d'___
Oxydoréduction; groupements; atomes
47
Mécanismes des coenzymes; cosubstrats/groupes=groupements prosthétiques(?): • Faiblement fixés (liaisons non covalentes)
cosubstrats
48
Mécanismes des coenzymes; cosubstrats/groupes=groupements prosthétiques(?): • Fonctionnent dans une double réaction couplée en 1 seule opération (prise en charge et transfert facteur X)
groupes=groupements prosthétiques
49
Mécanismes des coenzymes; cosubstrats/groupes=groupements prosthétiques(?): • Solidement fixés (liaisons covalentes)
groupes=groupements prosthétiques
50
Mécanismes des coenzymes; cosubstrats/groupes=groupements prosthétiques(?): • Participent à 2 réactions enzymatiques séquentielles couplées: 1. prise en charge facteur X 2. transfert facteur X
cosubstrats
51
Coenzymes d’oxydoréduction: Transfert d’___ ___: • Électrons e- • Atomes d’hydrogène H • Ion hydrure H-
équivalents réducteurs
52
1 équivalent réducteur = 1 ___ transféré dans une réaction oxred (indépendamment du mode de transfert)
e-
53
Coenzymes d’___: Transfert d’équivalents réducteurs: • Coenzymes ___ (NAD & NADP) • Coenzymes ___ (FAD & FMN)
oxydoréduction; pyridiniques; flaviniques
54
coenzymes d’oxydoréduction = (syn?)___ des ___
cofacteurs; | oxydoréductases
55
Groupes d'oxydoréductases: • ___ (l'accepteur d'hydrogène est l'oxygène lui-même) • ___ (l'accepteur d'e- ou d'hydrogène est un autre substrat que l'oxygène) • ___ (l'accepteur d'hydrogène est le peroxyde d'hydrogène, dégradent H2O2) • ___ (l'oxygène est fixé directement sur une molécule de substrat) 
Oxydases; Déshydrogénases; Hydroperoxydases; Oxygénases
56
AH2 + NAD+ → A + NADH + H+: • L’enzyme E a extrait des ___ ___ du métabolite AH2 • Le coenzyme oxydé/réduit(?) pourra lui-même transférer ses e- • Donc: correspond à extraction et transfert d’___(≠e-?)
équivalents réducteurs; réduit; énergie
57
Coenzymes d’oxydoréduction: Transfert d’___ ___: • Coenzymes pyridiniques (___ & ___) • Coenzymes flaviniques (___ & ___)
``` équivalents réducteurs; NAD; NADP; FAD; FMN ```
58
NAD=___ ___ ___
Nicotinamide Adénine Dinucléotide
59
NAD: Coenzyme d’___(réaction?)
oxydoréduction
60
Potentiel d’oxydoréduction du couple NAD+/NADH+H+: | +/-? x.xx V
- 0.32
61
NADH absorbe/émet de(?) la lumière à ___nm
absorbe; | 340
62
La concentration de substrat n'influence pas/influence(?) la Vi. On détermine la vitesse maximale Vmax.
influence
63
NAD: Extraction et transfert d’___ ___ dans les réactions anaboliques/cataboliques(?)
équivalents réducteurs; | cataboliques
64
* 1er temps: NAD+ est un réducteur/oxydant(?) qui accepte les équivalents réducteurs extraits de substrats oxydés/réduits(?) AH2 * 2ème temps: NADH est réducteur/oxydant(?) et transfert ses équivalents réducteurs à la ___ respiratoire
oxydant; réduits; réducteur; chaîne
65
NAD: Extraction d’___ ___ dans les réactions anaboliques/cataboliques(?) et transfert sur la chaîne ___ (produit de l’___(molécule?))
équivalents réducteurs; cataboliques; respiratoire; ATP
66
NADP: • Est principalement impliqué dans les voies de biosynthèse/catabolisme(?) • Agit principalement comme oxydant/réducteur(?) (NADP/NADPH(?)) • Sous sa forme oxydée/réduite(?), donne ses équivalents réducteurs dans les réactions cataboliques/anaboliques(?)
``` biosynthèse; réducteur; NADPH; réduite; anaboliques ```
67
FAD = ___ ___ ___
Flavine Adénine Dinucléotide
68
FAD: dinucléotide formé de ___ & d'___ (= respectivement___ ___ & ___ ___)
FMN; AMP; flavine mononucléotide; adénosine monophosphate
69
FAD: • Dérivé de la ___ (=vitamine ___) • ___ ___ de quelques déshydrogénases
riboflavine; B2; Groupe prosthétique
70
FAD: • Transfert des ___ ___ à la chaîne respiratoire • Est localisé dans les ___(≠cellules?)
équivalents réducteurs; | mitochondries
71
Potentiel d’oxydoréduction du couple FAD/FADH2: +/-? x.x V
- 0.1
72
___ & ___: Coenzymes transporteurs d’électrons impliqués dans les voies anaboliques/cataboliques(?) (production de précurseurs et d’énergie) 
NAD; FAD; cataboliques
73
___: Coenzyme transporteur d’électrons impliqués dans les voies anaboliques/cataboliques(?) (production de molécules complexes)
NADP; | anaboliques
74
Coenzymes de transfert de groupes d’atomes; groupes d'atomes tels que du/des: • ___ • Groupes ___ • Autres
CO2; | pluricarbonés
75
___(CoE?) assists in various metabolic reactions involving the transfer of carbon dioxide.
Biotin
76
CoA: • Transporte les groupes ___, par ex. ___ à 2 carbones • Dérivé vitaminique: acide ___ = vitamine ___
acyles; acétyle; pantothénique; B5
77
CoA: • Formation d’acetyl-CoA est couplée à des réactions endergoniques/exergoniques(?) • Acétyl-CoA est le ___ des voies métaboliques
exergoniques; | carrefour
78
Co-co-co-coment; Classe: • Coenzyme = ___
Cofacteur
79
Co-co-co-coment; Mécanisme: • ___: faible liaison, non covalente • ___ ___: liaison covalente 
Cosubstrat; | Groupe prosthétique
80
Co-co-co-coment; Fonction (précisez de quels CoE il s'agit): • Oxred (___ et ___) • Oxred (___ et ___) • Transfert de groupe pluricarbonés (___)
``` NAD; NADP; FAD; FMN; CoA ```
81
Voies du glucose: • Glucose-6-P → ___ (voie métabolique?) → Pyruvate • Glucose-6-P → ___(molécule?) (dépôt) • Glucose-6-P → Ribose-5P (voie des ___)
Glycolyse; Glycogène; pentoses
82
Glycolyse: Voie du catabolisme/de l'anabolisme(?) réducteur/oxydatif(?) aérobie/anaérobie(?)
du catabolisme; oxydatif; anaérobie
83
Glycolyse: • Insertion/Extraction(?) d’équivalents réducteurs • Accepteur d'équivalents réducteurs: ___(CoE?) • Ne consomme pas/consomme(?) d’oxygène • Consomme/Fournit(?) des métabolites ou précurseurs • Voie cytosolique/mitochondriale(?)
``` Extraction; NAD+; Ne consomme pas; Fournit; cytosolique ```
84
Glycolyse: classes de réactions enzymatiques (précisez de quelles E il s'agit): • Transfert de phosphate: ___ • Changement de position de phosphore: ___ • Conversion cétose/aldose: ___
kinase; mutase; Isomérase
85
Glycolyse: classes de réactions enzymatiques (précisez de quelles E il s'agit): • Déshydratation: ___ • Clivage liaison C-C d’un aldose: ___ • Extraction d’équivalents réducteurs: ___
énolase; aldolase; déshydrogénase
86
Glycolyse: Phase préparatoire d’investissement: • Génère/Nécessite(?) de l’énergie • Débute à ___ carbones • Finit à 2 x ___ carbones
Nécessite; 6; 3
87
Glycolyse: Phase de retour sur investissement: • Génère de l’énergie directe (___(molécule?)) et indirecte (___(molécule?)) • Compte à double/simple(?) • Produit du ___
ATP; NADH; à double; pyruvate
88
Bilan glycolyse: • ___(#?) ___ • ___(#?) ___ • ___(#?) ___
2 ATP; 2 NADH; 2 pyruvates
89
Phase préparatoire d’investissement/Phase de retour sur investissement(?) compte x2.
Phase de retour sur investissement
90
Glucose → Glycolyse → Pyruvate → voie anaérobie chez les levures → production in fine d'___(molécule précise?) et de ___  
EtOH; | CO2
91
Glucose → Glycolyse → Pyruvate → voie anaérobie chez les animaux → production in fine de ___ et de ___(#?) ATP
Lactate; | 2
92
biotine = vitamine ___
B8
93
Coenzyme NAD(P) dont le précurseur est la vitamine ___ =___ aussi appelée ___: • ___: désigne l’acide nicotinique et l'amide nicotinique (appelé aussi nicotinamide) • NAD et NADP jouent un rôle essentiel pour le transfert d'___(≠énergie?) dans les voies métaboliques • La ___ est présente dans les aliments d'origine animale et végétale.
``` PP=pellagra preventive ; B3; niacine; Niacine; électrons; niacine ```
94
Biotin assists in various metabolic reactions involving the transfer of ___ ___(molecule?) .
carbon dioxide

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