Biochimie Module A Points importants Maechler Flashcards Preview

Module 1 > Biochimie Module A Points importants Maechler > Flashcards

Flashcards in Biochimie Module A Points importants Maechler Deck (90):
1

Le métabolisme fournit les éléments de ___ des cellules.

construction

2

Flux de l’énergie;Les hétérotrophes/autotrophes(?) produisent à l'aide de l'énergie solaire de l'O2 et des composés organiques. Les hétérotrophes/autotrophes(?) transforment ces derniers grâce à la respiration Cr en H2O et CO2.

autotrophes;hétérotrophes

3

• Un organisme vivant se ___ et se ___.• Cela nécessite de la ___ et de l’___. 

conserve;reproduit;matière;énergie

4

• Le métabolisme comprend le ___ et l’___.• Organismes hétérotrophes dérivent l’énergie de molécules simples/complexes(?) et la matière de molécules simples/complexes(?).

catabolisme;anabolisme;complexes;simples

5

Organisme autotrophe libérant son énergie stockée sous forme minérale/organique(?): production de ___, de ___, et d'___

organique;chaleur;CO2;eau

6

Bois, charbon, gaz, pétrole: des végétaux qui fournissent de l’énergie grâce à la combustion de leur carbone minéral/organique(?).

organique

7

• Le carbone de la matière organique est globalement oxydé/réduit(?).• Le carbone organique/minéral(?) sous forme de CO2 est oxydé/réduit(?).

réduit;minéral;oxydé

8

• Respiration cellulaire oxyde/réduit(?) le carbone minéral/organique(?) en carbone minéral/organique(?).• Ceci produit de l’___ (ATP).

oxyde;organique;minéral;énergie

9

ATP=___ ___(abr?): une ___ d’___ énergétique

adénosine triphosphate;monnaie;échange

10

ATP utilisée pour: • ___ • ___ ___ • ___ • ___

Mouvements;Gradients ioniques;Signalisation;Anabolisme

11

ATP est « la monnaie » de l’énergie:• Continuellement/alternativement(?) formé et consommé • Un être humain, au repos, en consomme: ___kg/jour • Exercice intense, consommation: ___kg/min • Concentration cellulaire: ___-___ mM

Continuellement;40;0.5;2-4

12

• Catabolisme: réactions exergoniques/endergoniques(?)• Anabolisme: réactions exergoniques/endergoniques(?)

exergoniques;endergoniques

13

dégradations:Voies cataboliques ou anaboliques?

cataboliques

14

nécessite énergie:Voies cataboliques ou anaboliques?

anaboliques

15

réductives (nécessite des électrons):Voies cataboliques ou anaboliques?

anaboliques

16

Les voies sont convergentes:Voies cataboliques ou anaboliques?

cataboliques

17

oxydatives (donne des électrons):Voies cataboliques ou anaboliques?

cataboliques

18

fournit de l’énergie:Voies cataboliques ou anaboliques?

cataboliques

19

Biosynthèse:Voies cataboliques ou anaboliques?

anaboliques

20

Les voies sont divergentes:Voies cataboliques ou anaboliques?

anaboliques

21

utilisent ___(CoE?) et ___(CoE?) comme porteurs d’électrons (accepteurs):Voies cataboliques ou anaboliques?

NAD+;FAD;cataboliques

22

utilisent ___(CoE?) comme donneur d’électrons:Voies cataboliques ou anaboliques?

NADPH;anaboliques

23

Les voies anaboliques sont le plus souvent/ne sont le plus souvent pas(?) l’inverse des voies cataboliques.

ne sont le plus souvent pas

24

NADH et FADH2: une monnaie ___(≠ énergétique?): des équivalents réducteurs échangés contre de l’___(molécule?)

red-ox;ATP

25

• Keq = [C]eq*[D]eq/[A]eq*[B]eq
• Keq = ___ d’___

constante;
équilibre

26

• ΔH = ___ générée/absorbée entre l’état initial et final
• ΔS = ___ (=état de désordre) décroît/croît(?) dans l’univers par un processus spontané
• ΔG = ___ ___ de ___ = variation de la ___ de la réaction

chaleur;
entropie;
croît;
énergie libre;
Gibbs;
spontanéité

27

• ΔH « – » : réaction défavorable/favorable(?) sur le plan de l’enthalpie (endothermique/exothermique(?))
• ΔS « + » : réaction défavorable/favorable(?) sur le plan de l’entropie
⇉ Donc ΔG « – » : réaction non-spontanée/spontanée(?) endergonique/exergonique(?)

favorable;
exothermique;
favorable;
spontanée;
exergonique

28

Conditions standards définissent la variation d’énergie libre standard ΔG°’:
● " °/’(?) " Pression = 101.3 kPa (=___ atm)
● " °/’(?) " Température = ___° K (___°C)
● " °/’(?) " pH = ___
● Conditions initiales de concentration des réactants: [A] = [B] = [C] = [D] = ___M

°;
1;
°;
298;
25;
’;
7.0;
1

29

• ΔG°’= ...(formule?)
• Si ΔG°’ négative: réaction exergonique/endergonique(?)
• Si ΔG°’ positive: réaction exergonique/endergonique(?)

-RTln(Keq);
exergonique;
endergonique

30

Les conditions réelles de la vie cellulaire définissent la variation d’énergie libre ΔG:
• ΔG°’= ...(formule?)
• ΔG = ...(formule?)
• ΔG varie/ne varie pas(?) au cours de la réaction

-RTln(Keq);
ΔG°’+RTln([C][D]/[A][B]);
varie

31

• ΔG°’ est une autre manière d’exprimer la ___ d’___
• ΔG°’ reflète les propriétés des composés (i.e. ___ et ___)

constante;
équilibre;
substrats;
produits

32

Molécules A, B, C et D ont une énergie libre:
Lors de la réaction A+B (état initial) vers C+D (état final), il y a ___ d’énergie libre ΔG:
• ΔG = ΔGproduits – ΔGsubstrats
• Si ΔG négative: réaction non spontanée/spontanée(?) → le système a gagné/perdu(?) de l'énergie libre

variation;
spontanée;
perdu

33

• Si ΔG°’ négative: réaction endergonique/exergonique(?)
• Si ΔG°’ positive: réaction endergonique/exergonique(?)

exergonique;
endergonique

34

ΔG = variation de la spontanéité de la réaction;
1) A+B ⇆ C+D
2) ΔG°’= - RTln(Keq)
3) +RTln([C][D]/[A][B])
• Quelle numéro correspond au terme "réaction"?

1) A+B ⇆ C+D

35

ΔG = variation de la spontanéité de la réaction;
1) A+B ⇆ C+D
2) ΔG°’= - RTln(Keq)
3) +RTln([C][D]/[A][B])
• Quelle numéro correspond au terme "spontanéité"?

2) ΔG°’= - RTln(Keq)

36

ΔG = variation de la spontanéité de la réaction;
1) A+B ⇆ C+D
2) ΔG°’= - RTln(Keq)
3) +RTln([C][D]/[A][B])
• Quelle numéro correspond au terme "variation"?

3) +RTln([C][D]/[A][B])

37

• ln(1)=___
• log(1)=___

0;
0

38

• ln(e)=___
• log(10)=___

1;
1

39

L’ATP occupe une position basse/intermédiaire/supérieure(?) sur le thermomètre des ΔG°' → monnaie d’échange

intermédiaire

40

Dans les conditions cellulaire, l’hydrolyse de l’ATP est une réaction endergonique/exergonique(?). ___ kJ/mol

exergonique;
-30,5

41

Une réaction endergonique peut/ne peut pas(?) être possible si elle est « poussée » par un rapport Produit/Substrat très favorable.

peut

42

Une réaction endergonique (ΔG°’ positive/négative(?)) est possible si elle est couplée à une réaction exergonique (ΔG°’ positive/négative(?)).

positive;
négative

43

ΔG# = ___ ___ d’___

énergie libre;
activation

44

ΔG ne nous dit rien de la ___ de réaction. Cette dernière dépend de ΔG#: différence d’___ ___ entre l’___ ___ et l’___ de ___.

vitesse;
énergie libre;
état initial;
état;
transition

45

La vitesse de réaction est directement/inversement(?)
proportionnelle au ΔG#.

inversement

46

Comment passer la barrière de l’état de transition;
• Le chimiste ___ son tube à essai
• Le biologiste introduit des ___

chauffe;
enzymes

47

ΔG#/ΔG°’/ΔG(?): variation d’énergie libre dans une réaction
(variation de la spontanéité de la réaction)
ΔG#/ΔG°’/ΔG(?): variation d’énergie libre en conditions
standards (propriétés de la réaction)
ΔG#/ΔG°’/ΔG(?): énergie libre d’activation (détermine la vitesse de la réaction)

ΔG;
ΔG°’;
ΔG#

48

Les électrons sont transférés de l'oxydant au réducteur/du réducteur à l’oxydant(?):
• réducteur: accepteur/donneur(?) d’électrons
• oxydant: accepteur/donneur(?) d’électrons

du réducteur à l’oxydant;
donneur;
accepteur

49

un ___ ___ = un e- transféré dans une réaction d’oxydoréduction

équivalent réducteur

50

Potentiel redox standard E°; en condition Cr (pH=___) on définit E°’;
• couple 2H+/H2: +/- x,xx(?) V
• couple NAD+/NADH+H+: +/- x,xx(?) V
• couple O2/H2O: +/- x,xx(?) V

7;
-0.42;
-0.32;
+0.82

51

Une réaction endergonique/exergonique(?) est spontanée et spontanée ≠/=(?) instantanée.

exergonique;

52

saccharose + H2O → ___ + ___, ΔG°’= -29.3 kJ/mol;
Une enzyme spécifique (ici la ___) catalyse (accélère) la réaction dans une échelle de secondes.

glucose;
fructose;
saccharase

53

• enzyme vient des racines grecques en (=___) zume (=___).
• Le ___, est la pâte de levures vivantes utilisée pour faire lever le pain.
• Les premières enzymes identifiées ont été extraites des levures (celles-ci transforment le glucose en ___(≠éthanol?)).

dans;
levain;
levain;
alcool

54

Classification des enzymes;
• ___: transfert d’électrons
• ___: transfert d’atomes ou de groupements
• ___: coupure de liaison par H2O
• ___=___: autres coupures de liaison
• ___=___: crée des liaisons (produit/consomme(?) de l’ATP)
• ___: isomérisation

Oxydoréductase;
Transférase;
Hydrolase;
Lyase;
synthase;
Ligase;
synthétase;
consomme;
Isomérase

55

La vitesse de réaction dépend de ΔG___: différence d’énergie libre entre l’état initial et l’état de transition.

#

56

Enzyme:
• Est une ___
• ___ biologique de réactions biochimiques
• Augmente la ___ de réaction
• Change/ne change pas(?) la constante d’équilibre Keq
• ↗/↘(?) l’énergie libre d’___ ΔG#
• Est non spécifique/spécifique(?) à son substrat
• Est régulable/non régulable(?)

protéine;
Catalyseur;
vitesse;
ne change pas;
↘;
activation;
spécifique;
régulable

57

La concentration de substrat influence/n'influence pas(?) la Vi=vitesse initiale, on détermine la vitesse maximale de E = Vmax

influence (+ il y a de S à t0, + Vi sera élevée jusqu'à atteindre un plateau équivalent à la Vmax)

58

Modèle Michaelis-Menten;
Enzyme complémentaire à l’état de ___

transition

59

___ = constante de Michaelis-Menten: elle définit la relation enzyme↔substrat

KM

60

Modèle Michaelis-Menten;
Quand [S] tend vers l’infini, Vi = ___. Dans ces conditions, la vitesse dépend des propriétés de l’enzyme définies par la ___

Vmax;
KM

61

Constante Michaelis-Menten KM = [___] à ___/___

S;
Vmax/2

62

KM: concentration de substrat qui permet à l’enzyme de travailler au quart/au tiers/a la moitié(?) de sa vitesse maximale.

a la moitié

63

La KM indique la ___ de travail d’une enzyme, le nombre de ___ sur un télésiège aussi.

cadence;
places

64

• La Vmax est la vitesse de réaction lorsque l’enzyme est à demi-saturation/saturation(?)
• La KM est la concentration de substrat lorsque l’enzyme est à demi-saturation/saturation(?) (indique la ___ de travail d’une enzyme)

saturation;
demi-saturation;
cadence

65

• KM élevée/basse(?) rime avec haute affinité et faible capacité.
• KM élevée/basse(?) rime avec faible affinité et haute capacité.
• affinité à comprendre dans le sens de ___.

basse;
élevée;
saturabilité

66

• Km basse → basse/haute(?) affinité=il n’y a pas besoin d’avoir bcp de substrat pour que tous les sièges du télésiège soit plein.
• Si la Km est élevée → basse/haute(?) capacité → basse/haute(?) affinité → +/-(?) difficilement saturable

haute;
haute;
basse;
+

67

La ___ permet de prédire:
• si une enzyme opère proche de sa Vmax
• si un changement dans la concentration du substrat va changer sa vitesse

KM

68

KM en mM glucose:
• HEXOKINASE: ___ mM
• GLUCOKINASE: ___ mM;
La concentration sanguine de glucose (glycémie) varie de ___ à ___ mM. Laquelle de ces kinases va réagir aux changements de la concentration de glucose?

0.1;
10;
4 à 10;
GLUCOKINASE

69

Avec son KM bas, la glucokinase/l’hexokinase(?) est continuellement en Vmax, métabolisant le glucose efficacement dans des conditions physiologiques.

l’hexokinase

70

Avec son KM élevé, la glucokinase/l’hexokinase(?) peut « sentir » des changements de glucose entre 4-10 mM. (+/- active, donc senseur au glucose)

la glucokinase

71

KM est directement/inversement(?) proportionnel à l’affinité de l’enzyme pour le substrat.

inversement

72

Cinétique enzymatique;
Representation de ___-___ ou "double inverse"

LINEWEAVER-BURK

73

Site ___ d’une enzyme:
• Site de liaison du/des substrat/s
• Lieu de la réaction
• Localisé au fond d’une poche de la zone interne/externe(?) de la protéine
• Modèle de ___↔___
• Modèle d’___ ___

actif;
interne;
clé;
serrure;
ajustement induit

74

Modèle d’ajustement induit = ___ ___(ang?)

induced fit

75

Dans le site actif des E, il y a catalyse car:
• ↗/↘(?) de la concentration des réactants
• ___ propice des molécules
• ↗/↘(?) de l’énergie libre d’activation ΔG___ pour atteindre l’___ ___ ___

↗;
Orientation;
↘;
#;
état de transition

76

A l’extrême, une dénaturation des protéines (en l'occurrence d'E) par une température trop élevée produit une inhibition spécifique/non spécifique(?).

non spécifique

77

Protéines = ___(all?) = blanc d’œuf

Eiweiss

78

Les inhibiteurs:
• Irréversibles/réversibles(?) (se lient de façon covalente à un groupe fonctionnel)
• Irréversibles/réversibles(?) (compétitifs, non compétitifs, mixtes)

Irréversibles;
réversibles

79

Inhibiteurs réversibles compétitifs:
• Non analogues/analogues(?) structuraux du substrat
• ↗/↘/ne changent pas(?) la KM, ↗/↘/ne changent pas(?) la Vmax

analogues;
↗;
ne changent pas

80

Le cyanure est un inhibiteur compétitif/non compétitif(?) de la ___ ___ ___(= complexe ___(#?) de la chaîne respiratoire mitochondriale). E essentielle à l'une des dernières étapes de la respiration Cr. Sans son activité, les mouvements respiratoires pulmonaires cessent.
Le ___-___ utilisé dans les camps de la mort nazis était constitué d'acide ___.

compétitif;
cytochrome c oxydase;
IV;
Zyclon-B;
cyanhydrique

81

L’éthanol est catabolisé dans ...(org?) par une double réduction/oxydation(?): 1) en ___, 2) en acide ___.

le foie;
oxydation;
acétaldéhyde;
acétique

82

Antabuse: inhibiteur compétitif/non compétitif(?) de l'___ ___(E?), causant une accumulation d’___ aux effets indésirables (hypotension, vomissements, nausée, inconfort).

compétitif;
acétaldéhyde déshydrogénase;
acétaldéhyde

83

Inhibiteurs non compétitifs:
• Non analogues/analogues(?) structuraux du substrat
• ↗/↘/ne changent pas(?) la KM, mais ↗/↘/ne changent pas(?) la Vmax

Non analogues;
ne changent pas;

84

Inhibiteurs compétitifs/non compétitifs(?):
Typiquement des ions ___ (___, ___, ___ etc.) qui modifient la répartition des charges de l'enzyme.

non compétitifs;
métalliques;
cuivre;
mercure;
argent

85

• Inhibiteurs compétitifs/non compétitifs(?):
Augmentent la KM, ne changent pas la Vmax
• Inhibiteurs compétitifs/non compétitifs(?):
Ne changent pas la KM, mais diminuent la Vmax

compétitifs;
non compétitifs

86

Les activateurs:
• Ions ___ (___, ___ etc.)
• ___ ___ ___ (clivage d’une liaison peptidique d’une ___ = ___, comme pour les E de la digestion)
• Modification covalente/non covalente(?) réversible/non réversible(?) (Py/déPy)

métalliques;
calcium;
magnésium;
Protéolyse limitée activante;
proE;
zymogène;
covalente;
réversible

87

Enzymes allostériques sont caractérisés par une courbe ___ (donc elles sont michaéliennes/non michaéliennes(?))

sigmoïde;
non michaéliennes

88

Les enzymes allostériques:
• Vi ralenti/accélère(?) à l’approche du KM (ou plutôt K0.5), point d’___ au KM, puis Vi ralenti/accélère(?) brutalement après KM
• La fixation du substrat sur l’enzyme ↗/↘(?) l’affinité de l’enzyme pour le substrat: effet ___

accélère;
inflexion;
ralenti;
↗;
coopératif

89

Les enzymes allostériques: coopérativité: 2 modèles s'opposent:
• modèle ___
• modèle ___


concerté;
séquentiel

90

Les enzymes michaéliennes/allostériques(?) ont des effecteurs:
• Se lient sur les sites ___ (du grec ___=
autre=différent), donc =/≠(?) site substrat
• Effecteurs positifs (=___) ou négatifs (=___)
• Augmentation ou diminution de l’___ (à comprendre dans le sens de ___) envers le substrat

allostériques;
allostériques;
allos;
≠;
activateurs;
inhibiteurs;
affinité;
saturabilité