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Flashcards in Biochimie Module A Points importants Maechler ter Deck (80):
1

La glycolyse fournit aussi des ___ de molécules complexes.

précurseurs

2

La glycolyse a lieu partout et toujours, mais:
• N’utilisent que le glucose: les ___ ___ et le ___
• Utilisent en priorité le glucose: les ___
• Utilisent peu le glucose: le ___, le tissu ___

globules rouges;
cerveau (voire aussi des corps cétoniques);
muscles;
foie;
adipeux

3

La capacité de stockage des glucides dans l’organisme est faible/forte(?), donc:
• Stockons/Utilisons(?) le glucose tant qu’il y en a
• Stockons/Utilisons(?) l’excédant sous d’autres formes

faible;
Utilisons;
Stockons

4

La part de glucose absorbé qui dépasse les besoins énergétiques immédiats de l’organisme est stockée sous d’autres formes (sous forme de ___ et de ___).

glycogène;
lipides

5

Origines du glucose pour la glycolyse:
• Alimentaire (___ et ___)
• Métabolique (___ et ___)

polysaccharides;
disaccharides;
néoglucogenèse;
glycogénolyse

6

La glycolyse en 2 phases:
• Phase d’___ (+/-? ___(#?) ATP pour 1 glucose)
• Phase de ___ ___ ___ (+/-? ___(#?) ATP pour 1 glucose)

investissement;
-2;
retour sur investissement;
+4

7

1ère étape: phosphorylation du glucose:
• Phosphorylation en C___(#?) produit du ___
• Génère/Consomme(?) 1 ATP
• Réversible/Irréversible(?)
• Non limitante/Limitante(?)

6;
glucose-6-P;
Consomme;
Irréversible;
Limitante

8

1ère étape: phosphorylation du glucose:
• ___ le glucose dans la C (charge nég/pos(?) du phosphate)
• Limite/Favorise(?) l’entrée de glucose dans la C
• E: ___ (bas KM)/ ___ (haut KM)

Piège;
nég;
Favorise;
hexokinase;
glucokinase

9

Hexokinase:
• Localisation: ___
• Spécifique/Non spécifique(?) pour le glucose
• Faible/Forte(?) affinité pour le glucose (KM = ___ mM)

ubiquitaire;
Non spécifique (autres substrats: fructose, mannose, etc);
Forte;
0.1

10

Origines du glucose pour la glycolyse:
• Métabolique/Alimentaire(?) (polysaccharides, disaccharides)
• Métabolique/Alimentaire(?) (néoglucogenèse, glycogénolyse)

Alimentaire;
Métabolique

11

L'hexokinase peut phosphoryler n'importe quel ___(≠sucre?), ce qui permet à ces ___(≠sucres?), dans les tissus où elle est présente, de rejoindre la glycolyse au niveau du ___(molécule?).

hexose;
hexoses;
fructose-6-phosphate

12

Hexokinase/Glucokinase(?):
• Active à toutes glycémies

Hexokinase

13

Hexokinase/Glucokinase(?):
• Confère à sa C une propriété de détecteur de
l’élévation de la glycémie, donc à état de pléthore, stockons.

Glucokinase

14

Glucokinase:
• Localisation: ___(org?) et C à ___ (C α/β/γ/δ(?) du ___(org?)
• Non spécifique/Spécifique(?) pour le glucose
• Faible/Forte(?) affinité pour le glucose (KM = ___ mM)

Foie;
insuline;
β;
pancréas;
Spécifique;
Faible;
10

15

ΔG°’ = variation d’___ ___ ___

énergie libre standard

16

Hexokinase/Glucokinase(?):
• Active à hautes glycémies (post-prandial)

Glucokinase

17

Glycolyse: 3 étapes avec ΔG°’ (___/___(unités?)) très positif/négatif(?) sont donc irréversibles

kJ/mol;
négatif

18

Hexokinase/Glucokinase(?):
• Doit être capable d’alimenter en toutes circonstances la glycolyse pour fournir de l’énergie

Hexokinase

19

Les 3 étapes irréversibles de la glycolyse:...(précisez les E impliquées dans ces réactions)

1. Hexokinase/Glucokinase
3. Phosphofructokinase
10. Pyruvate kinase

20

Etapes irréversibles de la glycolyse:
La réaction #___(#?) est aussi très exergonique, mais pratiquement couplée à la réaction #___(#?) qui est endergonique, donc la 1ère est/n'est pas(?) limitante.

7;
6;
n'est pas

21

ΔG = ...(formule?)

ΔG°’ + RTln([C][D]/[A][B])

22

Réaction #4 de la glycolyse ayant un ΔG°’ de + 23.8 kJ/mol;
• Réaction exergonique/endergonique(?), donc spontanée/pas spontanée(?) mais l’___ de ___ liée aux réactions #___(#?) et #___(#?) suffit à « pousser » la réaction.

endergonique;
pas spontanée;
action;
masse;
1;
3

23

Si le NAD+/NADH(?) s'accumule dans le compartiment cytosolique, la glycolyse s'arrête.

NADH

24

Réoxydation du NADH en NAD+ par la ___ ___(E?), en aérobiose/anaérobiose(?) par fermentation lactique dans le compartiment mitochondrial/cytosolique(?).

lactate déshydrogénase;
anaérobiose;
cytosolique

25

Réoxydation du NADH en NAD+ par les ___, en aérobiose/anaérobiose(?), et par la chaîne ___ dans le compartiment mitochondrial/cytosolique(?).

navettes;
aérobiose;
respiratoire;
mitochondrial

26

• Le NAD ne passe pas la membrane externe/interne(?) des mitochondries.

interne

27

• Des ___ prennent en charge et transfèrent les équivalents réducteurs du cytosol à la mitochondrie.

navettes

28

• 1 seul et même pool/2 pools(?) de NAD: cytosolique et mitochondrial.

2 pools

29

• Dans la mitochondrie, les ___ ___
sont transférés sur la chaîne respiratoire.
• Il y a donc production in fine d’___(molécule?) par ce mécanisme (contrairement à/tout comme lors de(?) la fermentation lactique).

équivalents réducteurs;
ATP;
contrairement à

30

• Il existe essentiellement 2 navettes (celle du ___ et la navette ___/___)

glycérol-3-phosphate;
malate/aspartate

31

Navette glycérophosphate:
• 1er temps: Réduction du ___ en ___ et oxydation du ___ en ___

dihydroxyacétone-P;
glycérol-3-phosphate;
NADH;
NAD+

32

Navette glycérophosphate:
• 2ème temps: oxydation du ___ par le ___(CoE?) en ___ (navette bouclée)

glycérol-3-phosphate;
FAD;
dihydroxyacétone-P

33

Navette glycérophosphate:
• 3ème temps: le ___(CoE?) produit transfert ses électrons à la chaîne respiratoire

FADH2

34

En bout de chaîne: 1 FADH2 génère ___(#?) ATP

2

35

Navette malate/aspartate:
• 1er temps: Réduction/Oxydation(?) du NADH en NAD+ et formation de ___

Oxydation;
malate

36

Navette malate/aspartate:
• 2ème: le ___ entre dans la mitochondrie et est réduit/oxydé(?) par le ___(CoE?) mitochondrial/cytosolique(?)

malate;
oxydé;
NAD+;
mitochondrial

37

Navette malate/aspartate:
• 3ème: l’___ est exporté dans le cytosol

aspartate

38

Navette malate/aspartate:
• 4ème: le ___(CoE?) produit transfert ses électrons à la chaîne respiratoire

NADH

39

En bout de chaîne: 1 NADH génère ___(#?) ATP

3

40

Adaptation métabolique: 2 types de course → 2 types de métabolisme;
• 100m: utilisation majoritaire des oxydations phosphorylantes de la chaîne respiratoire/de la lactate déshydrogénase(?)
• Marathon: utilisation majoritaire des oxydations phosphorylantes de la chaîne respiratoire/de la lactate déshydrogénase(?)

de la lactate déshydrogénase;
des oxydations phosphorylantes de la chaîne respiratoire

41

La ___ catalyse l'étape irréversible et limitante qui contrôle le flux glycolytique sous contrôle allostérique.

phosphofructokinase

42

Phosphofructokinase et son contrôle allostérique:
• ADP en est un effecteur allostérique positif/négatif(?)
• ATP en est un effecteur allostérique positif/négatif(?)

positif;
négatif

43

Destinées du pyruvate:
• Anaérobiose: le pyruvate est oxydé/réduit(?) en ___ (permet la régénération du ___)

réduit;
lactate;
NAD+

44

Destinées du pyruvate:
• Anaérobiose/Aérobiose(?): le pyruvate est métabolisé dans la mitochondrie

Aérobiose

45

Cycle de l’___ ___=Cycle de Krebs= ___ ___(ang?) cycle (=___ (abr?) cycle)

acide citrique;
tricarboxylic acid;
TCA

46

Krebs cycle, which was first described by Hans Adolf Krebs in 1937. It is called tricarboxylic acid cycle because the ___(≠tricarboxylic?) acid is both the first product and the final reactant, and it contains ___(#?) ___ groups.

citric;
three carboxyl

47

Cycle de l’acide citrique: définitions:
• Voie de l'anabolisme/du catabolisme(?) réducteur/oxydatif(?) aérobie/anaérobie(?)
• Réduction/Oxydation(?) du groupement acétyl sous sa forme active ___
• Voie cytosolique/mitochondriale(?)

du catabolisme;
oxydatif;
aérobie;
Oxydation;
acétyl-CoA;
mitochondriale

48

Cycle de l’acide citrique: définitions:
• ___ de l’anabolisme et du catabolisme
• Dans peu de/toutes les(?) cellules (sauf dans les ___ ___)
• Fournit ___% de l’énergie cellulaire

Carrefour;
toutes les;
GR;
90

49

Cycle de l’acide citrique;
Voie du catabolisme oxydatif aérobie:
• Produit du ___ à partir d’un intermédiaire « utilisable », l’___: catabolisme/oxydatif/aérobie(?)

CO2;
acétyl-CoA;
catabolisme

50

Cycle de l’acide citrique;
Voie du catabolisme oxydatif aérobie:
• ___(CoE?) et ___(CoE?) sont les accepteurs d’équivalents réducteurs: catabolisme/oxydatif/aérobie(?)

NAD+;
FAD;
oxydatif

51

Cycle de l’acide citrique: Voie du ___ ___ ___

catabolisme oxydatif aérobie

52

Cycle de l’acide citrique;
Voie du catabolisme oxydatif aérobie:
• Dépend de la fourniture d’___ sur la chaîne respiratoire: catabolisme/oxydatif/aérobie(?)

oxygène;
aérobie

53

Origines de l’acétyl-CoA sont diverses/univoques(?) et dépendent de l’état ___:
• graisses → acides gras et glycérol
• polysaccharides, disaccharides → glucose et autres sucres
• protéines → acides aminés

diverses;
nutritionnel

54

Origines de l’acétyl-CoA sont diverses/univoques(?) et dépendent de l’état ___:
Catabolisme des:
• ___(macronutriments?)
• ___(macronutriments?)
• ___(macronutriments?)

diverses;
nutritionnel;
Glucides;
Lipides;
Protéines

55

Origines de l’acétyl-CoA: glucides:
• Dans le cytosol, le glucose (6C) produit du
___ (3C)
• Dans la mitochondrie, le ___ produit de l’acétyl-CoA

pyruvate;
pyruvate;

56

Origines de l’acétyl-CoA: lipides:
• Dans le cytosol, les triglycérides produisent
des ___ ___
• Dans la mitochondrie, le catabolisme des ___ ___ (lors de la ___(voie métabolique?)) produit de l’acétyl-CoA
• Les ___ ___ (en période de jeûne) produisent aussi de l’acétyl-CoA

acides gras;
acides gras;
β-oxydation;
corps cétoniques

57

Origines de l’acétyl-CoA: protéines:
• Le catabolisme/L'anabolisme(?) des protéines produit des acides aminés
• Les acides aminés forment soit du ___, soit de l’___, soit entrent directement dans le cycle de l’___ ___

Le catabolisme;
pyruvate;
acétyl-CoA;
acide citrique

58

Cycle de l’acide citrique: la fourniture d’___(molécule?) règle la vitesse du cycle

acétyl-CoA

59

La fourniture d’acétyl-CoA règle la vitesse du cycle de Krebs; la ___(E?):
• En amont du cycle, commande le flux d’entrée de l’acétyl-CoA
• Son activité dépend de la disponibilité de ___ et de ___ (les coenzymes de la réactions)
• Son activité est contrôlée par modification non covalente/covalente(?)

Pyruvate-DH;
NAD+;
CoA-SH;
covalente

60

Pyruvate-DH catalyse la réaction suivante:
... → ...

Pyruvate + CoA-SH + NAD+ → NADH + H+ + CO2 + Acétyl-CoA

61

PDH phosphorylée = active/inactive(?):
• PDH kinase: activée par l'___, l'___, le ___, (inhibée par le ___)

inactive;
ATP;
acétyl-CoA;
NADH;
pyruvate

62

PDH déphosphorylée = active/inactive(?):
• PDH phosphatase: activée par le ___(ion?), l'___(H?)

active;
Ca2+;
insuline

63

• Contrôle par modification covalente/allostérique(?) de la PDH-Kase et de la PDH-Pase

allostérique

64

Contrôle de l’activité de la PDH par modification covalente/allostérique(?)

modification covalente (PY/dPY)

65

Cycle de l’acide citrique: Vue d’ensemble:
• Total de ___(#?) réactions
• ___(#?) carbones de l’acétyl éliminés à chaque « tour » sous forme de ___(#?) ___(molécule?)

8;
2;
2 CO2

66

Cycle de l’acide citrique: Vue d’ensemble:
• ___(#?) réactions d’oxydation (transfert d’équivalents réducteurs sur ___ et ___)
• 1 réaction produit du ___ (directement converti en ATP)

4;
NAD+;
FAD;
GTP

67

Cycle de l’acide citrique: Vue d’ensemble:
● 4 réactions redox:
• 3x2e- transmis au ___
• 1x2e- ___
● 1 GTP (liaison basse/haute(?) énergie)

NAD+;
FAD;
haute

68

Cycle de l’acide citrique: ___(#?) réactions réversibles/irréversibles(?) & limitantes/non limitantes(?) règlent la vitesse du cycle. De quelles réactions s'agit-il (précisez le #)?

3;
irréversibles;
limitantes;
# 1, 3 et 4

69

Cycle de l’acide citrique: 3 réactions irréversibles & limitantes règlent la vitesse du cycle:
#1: ...(E?): ___(réaction?) de l’___ et de l'___ en ___ (libère 1 ___)

Citrate synthase;
condensation;
acétyl-CoA;
oxaloacétate;
citrate;
CoA-SH

70

Cycle de l’acide citrique: 3 réactions irréversibles & limitantes règlent la vitesse du cycle:
#3: ...(E?): ___(réaction?) (produit du ___) oxydative/réductive(?) (produit du ...) de l’___.

Isocitrate-DH;
décarboxylation;
CO2;
oxydative;
NADH + H+;
isocitrate

71

Cycle de l’acide citrique: 3 réactions irréversibles & limitantes règlent la vitesse du cycle:
#4: ...(E?): ___(réaction?) (produit du ___) oxydative/réductive(?) (produit du ...) de l'___

α-Cétoglutarate-DH;
décarboxylation;
CO2;
oxydative;
NADH + H+;
α-cétoglutarate

72

Cycle de l’acide citrique: Réactions irréversibles & limitantes: quelles sont les E impliquées?

citrate synthase, isocitrate-DH, et l'α-cétoglutarate-DH

73

Cycle de l’acide citrique: Réactions irréversibles & limitantes: CS, ICDH, α-CGDH:
• Activité régulée par la ___ en substrats
• Activées/Inhibées(?) par leurs produits
• Contrôle allostérique (inhibiteurs: ___ et ___)

disponibilité;
Inhibées;
ATP;
NADH

74

Cycle de l’acide citrique fournit des précurseurs pour l'anabolisme/le catabolisme(?).

l'anabolisme

75

Cycle de l’acide citrique fournit des précurseurs pour l'anabolisme: formation de:
• Glucides: ___(voie métabolique?)
• Lipides: le ___(molécule?) quitte la mitochondrie et
forme des acides gras dans le cytosol
• Protéines: différents intermédiaires du cycle de l’acide citrique
• Autres: porphyrines, etc.

néoglucogenèse;
citrate

76

La ___ combinée au ___(ion?) forme l'___ ; c'est un constituant de base des hémoglobines et des myoglobines, qui sont les transporteurs d'oxygène atmosphérique.

porphyrine;
fer;
hème

77

Cycle de l’acide citrique fournit des précurseurs pour l'anabolisme: formation de:
• ___(macronutriments?)
• ___(macronutriments?)
• ___(macronutriments?)
• Autres: ___(molécules?), etc.

Glucides;
Lipides;
Protéines;
porphyrines

78

Cycle de l’acide citrique fournit des précurseurs pour l'anabolisme: formation de: Glucides via la néoglucogenèse:
• Depuis le cycle de l’acide citrique: ___ mitochondrial → ___ cytosolique → ___ (via la ___(E?)) → ___ (via la ___(E?))
• contourne la réaction défavorable ___(molécule?) → ___(molécule?)

malate;
malate;
oxaloacétate;
MDH;
phosphoénolpyruvate;
PEPCK=Phosphoénolpyruvate carboxykinase;
pyruvate;
phosphoénolpyruvate

79

L'___ est la partie protéique d'une molécule qui comporte une partie non protéique.

apoprotéine

80

Dans l'exemple de l'hémoglobine, la globine est l'___, l'hème le ___.

apoprotéine;
cofacteur