BM16 Flashcards
(41 cards)
EN ABSENCE DE PROTÉINES RÉGULATRICES,
CHAQUE GÈNE A UN NIVEAU D’EXPRESSION FIXE, Par quoi est-il déterminé?
PAR L’AFFINITÉ DU PROMOTEUR AU FACTEUR D’ INITIATION sigma70
À quel stade se fait majoritairement la régulation (transcription bactéries)?
Au stade de l’initiation (mais existe aussi pendant les phases d’élongation et de terminaison
Combien y a-t-il de gènes à l’initiation?
Un seul gène, un seul promoteur à inhiber
Que sont les signaux extracellulaires?
MOLÉCULES PRÉSENTES DANS LE MILIEU DE
CROISSANCE DE LA BACTÉRIE ; FACTEURS
ABIOTIQUES
Par quoi sont transmis les signaux extracellulaires?
DES PROTÉINES DE RÉGULATION :
ACTIVATRICES / INHIBITRICES
Que font les protéines de régulation activatrices/inhibitrices?
CELLES-CI SE LIENT À L’ADN,
SUR (INHIBITRICES) LA RÉGION PROMOTRICE
OU PRÈS (ACTIVATRICES) DE LA R. P.
OU MÊME À PROXIMITÉ DU GÈNE CIBLÉ.
Liaison ARN-Pol/promoteur en absence de protéines activatrices
LA LIAISON DE L’ARN POLYMÉRASE / s À DE NOMBREUSES
RÉGIONS PROMOTRICES EST ASSEZ RARE / TROP RARE
MÉCANISME COURANT EN ABSENCE
D’UN OU PLUSIEURS DES ÉLÉMENTS
DU PROMOTEUR
NIVEAU BASAL DE TRANSCRIPTION
LA LIAISON D’UNE PROTÉINE INHIBITRICE SUR LA RÉGION DE LIAISON DE L’ARN POLYMÉRASE / s
L’OPÉRATEUR,
SUFFIT POUR EMPÊCHER LA TRANSCRIPTION.
POUR DÉCLENCHER LA TRANSCRIPTION, LA FONCTION D’UNE PROTÉINE
ACTIVATRICE…
D’AIDER L’ARN POLYMÉRASE / s À SE LIER EFFICACEMENT
AU PROMOTEUR
= RECRUTEMENT DE L’ARN POLYMÉRASE.
INTERACTION FAVORISE L’OUVERTURE DU COMPLEXE ARN-POL / ADN
Qu’est-ce que l’isomérisation?
LA TRANSITION ENTRE COMPLEXE FERMÉ ET COMPLEXE OUVERT
POUR D’AUTRES PROMOTEURS, L’ARN POLYMÉRASE SE LIE CORRECTEMENT,
MAIS LA TRANSITION ENTRE COMPLEXE FERMÉ ET COMPLEXE OUVERT
EST IMPOSSIBLE,
SAUF AVEC L’AIDE D’UNE
PROTÉINE ACTIVATRICE. Que fait cette protéine?
CE TYPE DE PROTÉINE ACTIVATRICE STIMULE
LE CHANGEMENT DE CONFORMATION
DE L’ARN POLYMÉRASE SUR LE PROMOTEUR,
CE QUI DÉCLENCHE LA TRANSITION
DU COMPLEXE FERMÉ ® OUVERT
Qu’est-ce que le principe de l’allostérie?
CHANGEMENT DE CONFORMATION D’UNE PROTÉINE ENZYMATIQUE
INDUIT PAR LA LIAISON D’UNE AUTRE MOLÉCULE (Régulateur)
Que peut faire l’induction allostérique d’une protéine enzymatique?
ACTIVER
OU INHIBER LA FORMATION DU COMPLEXE ENZYME-SUBSTRAT
Que font les boucles d’ADN?
SONT NÉCESSAIRES POUR RAPPROCHER
UNE MOLÉCULE ACTIVATRICE DONT LE SITE DE LIAISON EST SITUÉ
À PLUSIEURS CENTAINES DE BASES (100 - 3000 PB)
DE LA RÉGION PROMOTRICE DU GÈNE CIBLÉ.
Les boucles d’ADN impliquent implique la coopération entre deux protéines. Lesquelles?
UNE PROTÉINE QUI FAVORISE LA COURBURE DE L’ADN
ET
LA PROTÉINE ACTIVATRICE.
Que fait l’opéron Lac?
RÉGULE LE MÉTABOLISME DU LACTOSE CHEZ Escherichia coli :
FORTEMENT ACTIVÉ QUAND [LACTOSE] +++ ET [GLUCOSE] - - -
Promoteur de l’opéron Lac:
1) NE POSSÈDE PAS D’ÉLÉMENT-UP
2) SA SÉQUENCE -35 N’EST PAS CONSERVÉE.
Þ MÊME SANS INHIBITEUR, L’ARN POLYMÉRASE / s
SE LIE MAL À SON PROMOTEUR
= FAIBLE NIVEAU DE TRANSCRIPTION.
= EXPRESSION BASALE DE L’OPÉRON Lac
Quelles sont les deux protéines de liaison à l’ADN (régulateurs) de l’opéron Lac?
1 ACTIVATEUR = CAP (CATABOLITE ACTIVATOR PROTEIN)
1 RÉPRESSEUR = REP-Lac
Que fait REP-Lac?
SE LIE À L’OPÉRATEUR Lac QUI
COUVRE UNE PARTIE DU PROMOTEUR
= EMPÊCHE L’ARN POLYMÉRASE / s DE
SE LIER À SON PROMOTEUR
Qu’est-ce que l’activateur cap?
CAP EST UN DIMÈRE QUI, UNE FOIS LIÉ
À SON SITE ADN (60 pb EN AMONT DU START),
SE LIE ÉGALEMENT À L’ARN POLYMÉRASE
(LIAISON PROTÉINE-PROTÉINE)
= RECRUTE L’ARN POLYMÉRASE
À SON PROMOTEUR.
= EXPRESSION MAXIMALE DE L’OPÉRON Lac
À quoi se lie Cap?
CAP POSSÈDE UNE RÉGION ACTIVATRICE QUI SE LIE
AU DOMAINE CARBOXY-TERMINAL DE L’HÉLICE a (aCTD), LUI-MÊME CONNECTÉ À
L’ARN POLYMÉRASE PAR UNE TIGE DE LIAISON FLEXIBLE
À quoi se lie aCTD?
(1) À L’ÉLÉMENT UP (SI PRÉSENT) : liaison ADN-protéine,
(2) À CAP ET L’ADN VOISIN (SI UP ABSENT) : liaison protéine-protéine
Cap possède un site de liaison supplémentaire. Que permet-il?
PERMET À L’ARN POLYMERASE
DE SE LIER AU PROMOTEUR.
