Chapitre 8 Régulation de la transcription procaryote Flashcards
(73 cards)
Qu’est l’expression génique différentielle?
La régulation de l’expression génique dépendamment de l’environnement
À quoi sert l’expression génique différentielle chez les bactéries?
Permet de ne pas exprimer ce dont elles n’ont pas besoin à un moment précis
À quoi sert l’expression génique différentielle chez les org. multicellulaires?
Permet de réguler la différenciation cellulaire lors du développement
Quelles protéines permettent la régulation des gènes?
Les activateurs et répresseurs. Les ARN régulateurs peuvent aussi avoir un rôle dans la régulation
Quel est le lieu où la régulation de l’expression se fait le plus souvent?
Se fait le plus souvent au niveau de l’initiation de la transcription, mais peut se faire à divers étapes de la transcription et même durant l’épissage
De quoi dépend le taux de base de la transcription des protéines?
De la force du promoteur et de la sous unité sigma de l’ARN pol
Vrai ou faux : l’ARN pol peut initier la transcription n’impote ou sur l’ADN
Vrai, c’est la sous unité sigma qui oblige l’initiation aux sites des promoteurs
Comment son organisés les gènes chez les procaryotes?
En opérons, car les transcrits sont polycistroniques
Qu’est un opéron?
Un segment d’ADN régulé par un promoteur qui controle l’expressions de plusieurs gènes ayant des fonctions physiologiques similaires ou ayant une même réponse à l’environnement
Qu’est l’opérateur de l’opéron?
Un segment de l’ADN récepteur de signaux chimiques pouvant répresser la transcription de l’Opéron.
Explique le mécanisme d’action standard de régulation de la transcription
Des prot régulatrices lient l’ADN à des sites spécifiques et inhibent ou activent la transcription du gène. Les 2 agissent par interférence avec l’ARN pol. Répresseurs se lie au site opérateur et bloque pol.
Activateur augmente l’affinité de pol pour le promoteur
Explique le mécanisme de régulation de la transcription indirect par allostérie
L’ARN pol se fixe au promoteur mais est incapable de faire la transition vers le complexe ouvert.
Un activateur vient alors se fixer et induit le changement de conformation permettant la transcription
Explique le rôle allostérique de l’activateur NtrC en carence d’azote
↓conc. azote induit action kinase de NtrB qui ajoute un Pi sur NtrC. NtrC-P se lie à l’ADN en amont du gène glnA et agit sur sigma54 (allostérie) pour permettre l’ouverture du complexe et la transcription.
Pourquoi glnA a besoin de régulation allostérique?
Elle code pour la glutamine synthétase qui fixe le NH4 ce qui ↑con. azote ds la cell, mais requiert bcq d’ATP. Activation du gène que lorsque ↓conc. azote cytosolique
Explique le mécanisme de régulation de la transcription indirect par distorsion de l’ADN
L’espace entre les boites -35 et -10 est trop grand, il peut accueillir l’ARNpol-σ70 mais l’initiation ne se produit pas car les séquences ne sont psa alignées correctement. On a besoin d’un activateur qui va tordre l’ADN et permettre la transcription
Explique comment l’activateur MerR permet l’expression de l’opéron Mer en présence de mercure
L’activateur inactif MerR est lié à l’ADN entre les boites -35 et -10 qui ne sont pas en configuration optimale. Le mercure vient alors lier MerR l’activant. MerR tord l’ADN rapprochant les deux boites et permettant la bonne configuration permettant la transcription de l’opéron
Comment ce fait il que la présence de MerR sur le promoteur n’empêche pas la liaison de l’ARNpol?
La conformation 3D permet à Pol de se placer audessu de l’ADN, soit de l’autre côté que MerR
Explique le mécanisme de régulation de la transcription à distance
Le site de liaison de l’activateur ou répresseur est assez éloigné du promoteur. Il se crée alors une boucle dans l’ADN rapprochant la prot avec l’ARNpol. L’activateur NtrC agit justement à distance
Explique le mécanisme de régulation de la transcription par rétention de l’ARN polymérase
Plutot que d’empêcher la liaison de pol, il la retiennent au promoteur
L’opéron gal régule sa transcription grâce la rétention de l’ARNpol. Explique ce qui se produit en présence et en absence de galactose
En absence de gal : répresseur se lie près du promoteur, l’ARNpol se lie et le répresseur interagit avec elle l’empêchant de transiter vers le complexe ouvert.
En présence de gal : répresseur se dissocie et l’opéron peut être transcrit
Comment nomme-t-on une molécule qui dissocie un répresseur (ex le galactose dans l’opéron gal)?
Un inducteur
Explique le mécanisme de régulation de la transcription par antiactivation
Un dimère permettant le recrutement de l’ARNpol se lie différement dû à un changement de l’environnement et cause la formation d’une boucle maintenant une forte répression de l’opéron
L’opéron arabinose régule sa transcription grâce la liaison d’un dimère araC. Explique ce qui se produit en présence et en absence d’arabisone
En présence d’arabinose : araC se lie aux sites I1 et I2, ce qui recrute l’ARNpol par l’unit situé en I2 adjacent au promoteur. La transcription est activée
En absence d’arabinose : Conformation du dimère change, araC se lie en I1 et en araO2 situé bcq plus loin. Induit la formation d’une boucle ui empêche la liaison de pol au promoteur
AraC a-t-il un rôle de d’activateur ou de répresseur?
Les deux, ça dépend de l’environnement
