Combien y a t il d’origine de réplication chez les procaryote? Par rapport au eucaryotes
1 origine chez les procaryote
Plusieurs chez les eucaryotes (30000-50000 ORI)
Comment se nomme les sites spécifiques auxquels commence la réplication?
Les origines de réplication (ORI)
Comment se compare la vitesse de réplication chez les eucaryotes par rapport aux procaryotes
La réplication est 20x plus lente chez les eucaryotes (2-3kb/min)
Pour compenser, le génome a plusieurs sites de réplications qui répliquent l’ADN simultanément
Pourquoi l’origine de réplication est elle riche en A-T
Car il y a moins de pont H et que c’est plus facile à défaire
Qu’est ce qui est particulier des protéines initiatrice
Seul protéine à reconnaitre une séquence spécifique de l’ADN. (Le site 9-mère) Les autres prot reconnaissent la protéines. La prot initiatrice sert de socle pour l’assemblage du complexe d’initiation
Qu’est le site 13-mère?
Le site de séparation initial des brins. Riche en A-T
Qu’est la DnaA
L’équivalent de la protéine iniatrice chez le procaryote. Se lie spécifiquement à la séquence 9-mère.
Lorsque lié à l’ATP, la protéine interagit aussi avec un site 13-mère et permet de séparer l’ADN
Qu’est le complexe de reconnaissance de l’origine de réplication
C’est l’initiateur, un complexe de 6 protéines qui permet l’initiation de la réplication
Quels motifs structurels permet la reconnaissance de l’origine de l’réplication chez les Eucaryotes?
Séquence riche en AT
Structure d’ADN particulière
Régions libres de nucléosomes
région impliqués dans la transcription
Comment fonctionne l’hélicase?
six sous unités en forme d’anneau qui se fixe sur L’ADNsb qui force la séparation de l’ADNdb grâce la liaison de la charpende sucre-p en hydrolisant l’ATP pour se déplacer
Que sont les protéines SSB
Des prot fixatrice de l’ADN monocaténaire, empêche l’ADNsb de se recoller ou de former des épingles
Qu’elle est la différence entre la topoisomérase I et II?
topo I coupe un seul brin pour le désenrouler puis ressoude
Topo II coupe et ressoude les deux brins
De quoi a besoin l’ADN polymérase pour initier l’élongation?
D’une amorce, fabriqué par l’ARN polymérase. L’amorce est ensuite reconnue par un poseur d’anneau coulissante qui installe l’anneau en l’ouvrant (ATP). L’ADN polymérase se lie à l’anneau en compétitionnant avec le site de liaison du poseur
À quoi sert l’anneau coulissante?
À augmenter la processivité de la polymérase (temps d’attention)
Quelles sont les 2 polymérases chez les procaryotes et leurs fonctions?
ADN Pol I substitut les amorces ARN possède une fonction exonucléase 5’
ADN Pol III Réplication du chromosome (élongation normale
Quelles sont les 3 polymérases chez les eucaryotes et leurs fonctions?
L’ADN Pol ε synthétise le brin continu
L’ADN Pol δ synthétise le brin discontinu
(ε et δ répliquent l’ADN et participe à la réparation par excision NER et BER)
L’ADN Pol alpha synthétise des amorces d’ADN pendant la réplication de l’ADN en travaillant de paire avec la primase
Nomme les étapes de l’initiation chez les eucaryotes
Synthèse de l’amorce d’ARN par la primase
Synthèse d’un peu d’ADN par l’ADN polymérase alpha
reconnaissance de l’amorce par le poeur d’anneau
pose de l’Anneau coulissante
La polymérase vient se lier pour l’élongation
Comment fonctionne la sélectivité cinétique de la polymérase
Essai de trouver le nucléotide compatible par essai erreur, pas d’analyse, comme essayer des aimants magnétiques. Lorsqu’il y a match, la catalyse lie le nucléotide à la charpente sucre-P
Comment l’ADN polymérase distingue rNTP des dNTP?
La forme de la prot discrimine les RNTP qui ne peuvent être incorporés en raison d’un groupe oxy.
On parle d’exclusion stérique
Qu’est le répliosome?
Le répliosome est le complexe de réplication associant toutes les protéines nécessaire à la réplication
Quelles protéines sont impliqués dans le répliosome
Topoisomérase Hélicase Primase Prot SSB fixatrice d'ADN Anneau coulissante Polymérase
Quelles sont les étapes du remplacement de l’amorce d’ARN?
La RNase H retire les nucléotides de l’amorce sauf le dernier
Une exonucléase 5’ retire le dernier
L’ADN polymérase comble la brèche
L’ADN ligase forme la liaison phosphodiester pour lier le fragment
Comment s’associe le nucléosome au brin nouvellement formé?
Le vieux nucléosome est partagé entre les deux nouveaux brins alors que les nouveaux sont recrutés par la clamp (ou anneau coulissante)
Quelle extrémité du chromosome ne peut pas être répliqué?
Combien de nucléotides sont perdus?
L’extrémité 3’
5 à 10 nucléotides
Quelle enzyme permet d’allonger l’extrémité des télomères?
La télomérase
Comment fonctionne la télomérase?
Elle ajoute des séquences répétitives au bout de l’extrémité 3’ comme une polymérase. Elle se sert de sa partie ARN comme matrice. Cela permet l’ajout d’un fragment d’okazaki de plus.
Lorsque le télomère est long, la télomérase est elle plus ou moins active?
Moins active, ça empêche que le télomère devienne trop long
De quelle façon le bout du télomère évite d’être pris pour un bris de l’ADN?
En laissant une séquence de 50 à 300 nucléotides riche en G qui est reconnu par la prot. TRF2 qui assure le positionnement du complexe shelterin. La prot POT1 vient alors lier la séquence d’ADNsb puis forme la T-loop
Qu’est la formation T-loop?
Une formation au bout du télomère qui forme une boucle afin d’éviter d’être pris pour un bris double brin de l’ADN.
Quelles sont les protéines impliqués dans le complexe shelterin ?
TRF2 et POT1
Que sont les caténanes?
Lorsque deux fourches de réplications se rencontre, il en résulte un surenroulement.
Comment corrige t-on les caténanes?
Grĉe aux topoisomérases, on désenroule l’ADN
