Que sont les gènes signatures?
Des gènes spécifiques à un type de cellule particulier. Les gènes sont présent chez toutes les cell mais exprimé seulement chez la cellule un question
Qu’est ce qui permet la différenciation d’une cellule?
La régulation de la transcriptions de gènes spécifiques et les interactions entres les cellules
Qu’est la morphogenèse?
Le processus de développement des structures d’un organisme au cours de son embryogenèse
Qu’est ce qu’un gène homologue?
Un gène commun à toutes les espèces provenant du même phylum, mais seulement exprimé chez un type de cell
Quels sont les 2 banques d’ADN?
Banque d’ADN génomique (représente tout le génome)
et Banque d’ADN complémentaire (représente tous les ARNm exprimés dans un tissu ou à un stade de développement donné)
Quelle est l’utilité des banques d’ADNg?
Étude des séquences régulatrices, frontières intron exon, séquencage des génomes, criblage.
Quelle est l’utilité des banques d’ADN complémentaire?
Permet d’enrichir la banque en séquences codantes
Comment forme-t-on une banque d’ADN complémentaire?
À base d’ARNm rétrotranscrit en ADN double brin
À quoi sert le criblage?
À identifier et isoler les clones d’intérêt contenus dans les banques d’ADN par l’hybridation des séquences formant des puces à ADN
Comment utilise-t-on des séquences dégénérés?
On connait la séquence d’a.a., on peut déduire la séquence de nucléotides et fabriquer des amorces pour le PCR ou le criblage.
Quels sont les 3 stratégies favorisant le différenciation des cell?
Changement de localisation des ARNm par Induction de polarité.
Contact entre les cellules voisines/sécrétion paracrine
Gradient moléculaire dictant les patrons moléculaires
Par quel moyen les ARNm sont ils mobilisés dans la cellule?
Par les protéines se mouvant sur les filament d’actine. L’asymétrie du processus repose sur l’asymétrie intrinsèque des éléments du cytosquelette
Comment le contact cellule-cellule agie sur les voies de différenciation des cell?
Présentation de prot membranaires ou sécrétion de protéines qui, lorsque liés à une cellule adjacente, provoque une réponse chez la cell cible
Quelles sont les 2 voies d’influence cell-cell?
Inhibition latérale
Signalisation inductive
Quels sont les récepteurs exprimés par les cell épidermiques et les neuroblastes?
Neuroblastes expriment Delta
Epidermique exprime Notch
Que provoque la perte de signal Notch?
La surproduction de cellule neurale
Comment fonctionne les gradients de morphogenèse?
Dans le tube neural par exemple, les cellules centrales sécrètent un morphogène Shh . En fonction de la concentration de Shh à laquelles elles sont exposés, les cellules auront des différentiations différentes
Quels facteurs de transcription régulent la présence de stomates chez la plante?
SPCH qui promeut la division asymétrique
MUTE qui promeut la différenciation
FAMA qui permet la division symétrique formant le stomate
Comment se forme les bandes chez l’oeuf de drosophile?
La transcription du gène Eve dépend de 5 enhancers qui sont activés ou inhibés en fonction de la concentration des répresseurs. La concentration de ces répresseurs varie sous la forme d’un gradient antéro-postérieur faisant que les bandes se forment à des endroits précis selon leur affinité avec les répresseurs
Quelle méthode permet d’étudier les commutateurs complexes in vitro?
Co-immuno-précipitation
Quelle méthode permet d’étudier les commutateurs complexes in vivo?
Le système de double hybride,
Transfer d’énergie et de lumière
Immuno-précipitation de la chromatine
Comment fonctionne la co-immunoprécipitation?
On fusionne GST (glutathione S-trnsférase) à notre gène d’intéret. La protéine de fusion est ensuite purifiée en la passant dans une colonne de chromatographie où GSP reste lier aux billes. On lave ensuite la colonne avec un enzyme clivant le lien GST-prot. On obtient ainsi notre prot . On peut visualider les prot présente avec un anticorps spécifique
Explique le système double hybride
On lie un domaine de liaison de l’ADN avec une prot connue et on observe si la prot inconnue, liée à Gal4, vient s’y lier. Si oui un gne essentiel à la survie de la levure sera produit. Si non, la levure meurt. Permet de faire une puce d’ADN avec les données
Explique comment l’interaction prot-prot peut être visualisé en fluorescence
Une prot fusionnée à la luciférase et une autre liée à Yellow fluorescent prot. Si les deux partenaires se lient, il y a transfert d’énergie de la luciférase vers YFP. Une fluorescence est alors émise
Explique l’approche chromatine immunoPrécipitation on chip (ChIP-chip)
Le génome est coupé en fragment et amplifié par PCR et marquées par fluorescence. Ils sont ensuite hybridés sur une puce ADN. Les sites de liaison des prot à l’ADN sont identifiés selon l’intensité de la fluorescence sur la puce. On peut ainsi situer les séquences identifiées sur une carte du génome
Quelle est la différence entre ChIP-chip et ChIP-seq
Les séquences immunoprécipitées sont recueillis pour former une banque de séquences analysée par séquençage à haut débi (plus précis)t, plutot que l’observer sur une puce. On peut ensuite comparer la fréquence obtenue avec le génome connu
Que cause l’expression inadéquate des gènes Hoxa et Hoxd?
Polydactylie,
Permet d’avoir uniquement que 5 doigt, mais permet aux poissons d’avoir plus de 5 rayons à leurs nageoires. Dépend de leur régulation
Quel est le rôle des gènes homéotiques?
Responsable de la diversification des différentes parties du corps
Quel complexe de gènes homéotiques régulent la formation des pattes chez la mouche?
Antennapedia
Que ce passe-t-il si Antennapedia est sur exprimé au niveau de la tête?
Formation de pattes au lieu des antennes
Que ce passe-t-il si Antennapedia est sous-exprimé au niveau du mésothorax?
Pattes ressemblant à des antennes formées
Que controle l’homéodomaine Ubx (ultrabithorax)
La formation d’une seconde paire d’aile métathoracique. (inhibe le développement du deuxième segment thoracique dont ANTP)
Quelle différence fait que l’homéodomaine Ubx est exprimé chez le papillon mais non chez la mouche?
Le gène est inhibé par un répresseur chez la mouche, mais cette séquence régulatrice est modifiée chez le papillon de telle sorte que la prot Ubx ne peut plus s’y lier
