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MMD1042 : module 3... LET'S GOOOO > Cours 1 : la transcription de l'ADN > Flashcards

Cours 1 : la transcription de l'ADN Flashcards

(73 cards)

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1
Q

** Réplication = ? —’’ ?

A

ADN —” ADN

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Q

** Transcription = ? —’’ ?

A

ADN —” ARN

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Q

** Traduction = ? —’’ ?

A

ARN —” prot

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4
Q

Qu’est-ce qui fait la synthèse du polymère durant la transcription?

A

ARN polymérase

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5
Q

L’ARN polymérase synthétise de ___ vers ____, donc le brin __________ est lu de ___ vers ___.

A
  • 5’
  • 3’
  • matrice
  • 3’
  • 5’
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6
Q

** Sur quel carbone le groupement OH/H diffère entre le ribose et le désoxyribose?

A

2e C

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7
Q

L’ARN a une structure 1aire, 2aire, 3aire et/ou 4ernère? Pour quelle raison?

A

2aire et 3aire, à cause des interactions entre ses bases

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8
Q

Qu’est-ce qu’un pseudoknot?

A

Dans l’ARN, appariement de bases entre 2 rég simple-brin de boucles : struct secondaire

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9
Q

Rôle de l’ARN polymérase

A

Déroulement de l’ADN et polymérisation de l’ARN.

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10
Q

Qu’est-ce qui est formé transitoirement pendant la transcription?

A

Courte rég d’hélice hybride ADN/ARN : hétéroduplex d’environ 9 nucléotides

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11
Q

Est-ce que l’ARN polymérase requiert une amorce?

A

NON!

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12
Q

Est-ce que la réplication d’ADN et la transcription ont le même degré de précision?

A

Non : transcription - précis, car erreurs ont durée de vie limitée correspondant à durée de vie du transcrit

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13
Q

L’ARN polymérase crée des liens ________ entre les _________ en son ________.

A
  • phosphodiesters
  • nucléotides (d’ARN)
  • site actif
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14
Q

V/F?

La transcription commence et se termine à des endroits aléatoires sur l’ADN.

A

F! À des endroits précis!

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15
Q

Quels sont les endroits précis sur l’ARN où commence et termine la transcription

A

Promoteur = site d’initiation de la transcription

Terminateur = site de terminaison de la transcription

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16
Q

V/F? L’ARN polymérase peut terminer et initier la transcription comme bon lui semble.

A

F! Elle nécessite des FACTEURS PROTÉIQUES et des SIGNAUX DANS L’ADN pour initier et terminer transcription

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17
Q

Quel facteur protéique est nécessaire pour la transcription chez les PROCARYOTES? Décris brièvement son fctionnement.

A

Facteur sigma.

1) s’associe à ARN polymérase pour former complexe d’initiation AVANT DE SE LIER AU PROMOTEUR
2) est relâché QUELQUES 10 NUCLÉOTIDES APRÈS l’initiation de la transcription
3) se rattache à ARN polymérase après qu’elle soit relâchée du brin d’ADN (et que le transcrit d’ARN soit libre)

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18
Q

Qu’y a-t-il au site de terminaison pour aider l’arrêt de la transcription chez les procaryotes?

A

Signal stop

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19
Q

Qu’est-ce qu’une séq consensus/séq canonique?

A

Ordre CALCULÉ de nucléotides/a.a. trouvés à chaque position dans un alignement de séquences. Ces alignements de séqs sont comparés à d’autres et des POURCENTAGES DE MOTIFS DE SÉQS SIMILAIRES sont calculés.

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20
Q

Que permet le facteur protéique sigma?

A

La sélection du promoteur du gène à transcrire

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21
Q

** V/F?

Il y a slmt 1 facteur sigma chez le procaryotes.

A

F : plsrs

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22
Q

Que reconnaissent les facteurs sigma bactériens?

A

De courts motifs de séqs conservés : boîtes -10 (TATAAT) et -35.

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23
Q

La position de la séq consensus -10 et -35 dicte …?

A

Le brin à utiliser et le sens de la transcription

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24
Q

La séquence consensus d’un promoteur est une séq _________ obtenue par analyse statistique des ______________ à chaque position. Plus la séq d’un promoteur est __________ à la séq consensus idéale, plus ______ sera l’affinité du __________ et plus grande sera l’efficacité d’initiation de la _________ : le ________ est donc plus fort.

A
  • idéale
  • fréqs des bases
  • similaire
  • grande
  • facteur sigma
  • transcription
  • promoteur
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25
** Pourquoi les boîtes -10 et -35 ont-elles ce nom-là?
En raison de leur dist du site d'initiation de la transcription (ex. 10 paires de bases en amont du site d'initiation)
26
** Comment se fait la reconnaissance moléculaire entre le complexe d'initiation et la boîte -10?
Liaisons chimiques faibles : NON COVALENTES! - F de VDW - ponts H - liens ioniques - interactions hydrophobes
27
** Les procaryotes possèdent typiquement plsrs facteurs sigma, chacun ayant sa propre __________. Tous interagissent avec _________ et sont responsables de la reconnaissance de ______________ sur ______.
- spécificité de séquence - l'ARN - la séquence promotrice - l'ADN
28
Pour les étapes de la transcription... 1) facteur sigma s'associe à ARN polymérase avant transcription : complexe se fixe sur promoteur 2) le contact de l'ARN polymérase avec promoteur entraîne ...? 3) ...? 4-5) Relâchement du ___________ après la synthèse d'une chaîne de plus ou moins _______ ET ______. 6) rencontre du _________ Il s'agit de la forme que prend l'ARN grâce aux ______. 7) _______ se détache, libérant _____.
2) l'ouverture locale de la double hélice d'ADN : bulle de transcription 3) Initiation de synthèse d'ARN (à 50 ribonucléotides/s) 4-5) facteur sigma... 10 ribonucléotides… élongation. 6) signal de terminaison... appariements locaux 7) l'ARN polymérase... l'ARN
29
Que permet la séq d'ARN transcrite du signal de terminaison?
La formation d'une TIGE-BOUCLE (HAIRPIN) qui crée une contrainte au niv du complexe de l'ARN polymérase : favorisation du détachement de l'ARN polymérase.
30
La séquence en tige-boucle est riche en _______, suivi d'une série de _____.
- G-C | - U
31
Les cells EUCARYOTES utilisent combien de types d'ARN polymérases?
3
32
Quels 3 types d'ARN polymérases chez les eucaryotes (avec fct)?
ARN polymérase I - ARNr : compose les ribosomes ARN polymérase II - ARNm : codent pour prots - ARNnc (non codant) ARN polymérase III - ARNt : servent d'adaptateur lors de synthèse protéique - PETITS ARN : utilisés dans diff processus cellu (snRNA, snoRNA)
33
Qu'est-ce que la "boîte TATA"?
- chez les EUCARYOTES - située à 25 PAIRES DE BASES en amont du site d'initiation - assemblage du complexe d'initiation de la transcription
34
Des facteurs généraux de la transcription chez les eucaryotes s'associent à _______ et reconnaissent et se lient à ...?
- ARN polymérase II | - boîtes TATA
35
3 ex de séqs d'ADN conservées chez eucaryotes impliquées dans la régulation des gènes.
-80, -100, enhancers
36
Par quoi est caractérisé le promoteur chez les eucaryotes?
Par la boîte TATA, se trouvant à -25.
37
L'ARN polymérase II nécessite des __________, soit des ______, et des _________ pour initier la transcription.
- facteurs protéiques - GTF (General Transcription Factors, ou TFII pour transcription factors II) - signaux dans l'ADN
38
Quels sont les facteurs généraux nécessaires à l'initiation de la transcription chez les EUCARYOTES, et combien ont-ils de sous-unités?
TFIID - TBP subunit (1) - TAF subunits (11) TFIIB (1) TFIIE (2) TFIIF (3) TFIIH (9)
39
Nomme le rôle des facteurs généraux nécessaires à l'initiation de la transcription chez les EUCARYOTES : TBP subunit
Reconnaît boîte TATA ("B" pour "Boîte TATA"... mais réel = TATA Binding Protein)
40
Nomme le rôle des facteurs généraux nécessaires à l'initiation de la transcription chez les EUCARYOTES : TAF subunits
- reconnaît les autres séquences près du promoteur | - régule les liens dans l'ADN ("A" pour "autres" et pour "ADN")
41
Nomme le rôle des facteurs généraux nécessaires à l'initiation de la transcription chez les EUCARYOTES : TFIIB
- reconnaît l'élément BRE dans les promoteurs | - positionne bien l'ARN sur promoteur ("B" pour "BRE" et "bien")
42
Nomme le rôle des facteurs généraux nécessaires à l'initiation de la transcription chez les EUCARYOTES : TFIIE
Attire et régule TFIIH | attire et régule TFIIH, donc il est son Héro, pas son Ennemie
43
Nomme le rôle des facteurs généraux nécessaires à l'initiation de la transcription chez les EUCARYOTES : TFIIF
- stabilise interaction de ARN polymérase avec TBP et TFIIP - aide à attirer TFIIE et TFIIH (il fait des interactions et il attire... so he's Friendly)
44
Nomme le rôle des facteurs généraux nécessaires à l'initiation de la transcription chez les EUCARYOTES : TFIIH
- déroule ADN au promoteur (fct hélicase) - phosphoryle queue C-terminale de l'ARN polymérase (fct kinase) - relâche ARN polymérase du promoteur en faisant relâcher TFIIB, TFIIE, TFIIF et TFIIH ("H" car il joue un rôle comme l'Hélicase, il fait la pHospHoylation, et il relâche l'ARN polymérase du promoteur tel un Héro pour que la transcription continue)
45
Bien que l'ARN polymérase II se fixe au niv du promoteur, elle n'est fixée à la boîte TATA que via les __________, et ne reconnaît pas le promoteur directement. C'est d'abord les ______________ qui s'associent à l'ADN du promoteur, et cela permet à ______________ de se lier.
- transcription factors - GTF TFIID et TFIIB - l'ADN polymérase II
46
L'initiation chez les eucaryotes. 1) Reconnaissance de la boîte TATA par ________, soit un complexe contenant __________. 2) Recrutement de _______ par _________ qui est lié à ________. 3) Recrutement de _____________ et de _______________ : _________.
- TFIID - TBP et TAF - TFIIB - TFIID - l'ADN - l'ARN polymérase II - GTF - TFIIF, TFIIE, TFIIH
47
Qu'est-ce que le "signal de départ" pour ce qui est de l'initiation de la transcription eucaryote?
Quand TFIIH phosphoryle queue C-terminale de ARN polym II et que les facteurs de transcri se détachent.
48
Qu'est-ce qui forme le complexe d'initiation de la transcription eucaryote?
ADN polymérase II et GTF.
49
Est-ce que TFIID avec son TBP est libérée par le signal de départ de TFIIH?
NON! Continuent dans le processus d'ÉLONGATION!
50
Les ARN des eucaryotes sont ___________ et ___________ simultanément dans le _______.
- transcrits - modifiés - noyau
51
Chez les eucaryotes, la terminaison est couplée à la ________. Le terminateur est une ______ dans le _________ qui est aussi le signal de ________ : ___________. Durant la terminaison, le _______ est clivé et _________. Puis, à la fin, ______ se détache.
- polyadénylation - séq - pré-ARNm trancrit - polyadénylation - AAUAAA - pré-ARNm - polyadénylé - l'ARN polym II
52
L'ARN est constamment gardé tel quel dans sa vie?
NON : constamment synthétisé et dégradé
53
L'abondance d'ARN, soit la _________, est régulée au niv de ___________ et de ________.
- quantité totale d'ARN - l'initiation de la synthèse - la dégradation de l'ARN
54
Dans le cytoplasme eucaryote, quelle est la demi-vie des ARNm?
Qqs minutes/heures
55
Qu'est-ce que la demi-vie?
Temps que ça prend pour arrive à 50% d'abondance
56
L'efficacité de la transcription détermine...?
la qtt d'ARN produit ET A DONC UN IMPACT SUR LA QTT DE PROTS TRADUITES
57
Les cells et les organismes doivent s'adapter aux ___________. Cette ___________ implique les changements des ____________ : certains sont _____, et d'autres, ______. La régulation de la transcription permet ___________ au "bon ________", selon les _______ de la cell.
- conditions changeantes de leur environnement - adaptation - patrons d'expression des gènes - induits - réprimés - l'expression d'un gène - moment - besoins
58
Le taux de transcription d'un gène est régulé à quel moment? Par quoi?
Lors de l'initiation, par la séq du promoteur et les facteurs de transcriptions SPÉCIFIQUES qui s'y attachent
59
V/F? | La vitesse d'élongation de la transcription peut varier.
F! Elle reste tjrs la même
60
V/F? | Tous les gènes ne sont pas transcrits (exprimés) avec la même efficacité.
V!
61
L'INITIATION de la transcription est contrôlée par des ___________ : soit des __________ ou des __________. Ces deux types de facteurs protéiques facilitent ou non l'assemblage des ____________ et de _________.
- facteurs protéiques - activateurs de la transcription - répresseurs - facteurs généraux de transcription - la polymérase sur le promoteur
62
Que font les facteurs spécifiques de transcription qui régulent celle-ci?
Stimulent ou inhibent la transcription en se liant à des RÉGS DE CONTRÔLE SPÉCIFIQUES de la transcription sur l'ADN EN AMONT DU PROMOTEUR
63
Les séq qui activent la trancri sont des ________. Celles qui l'inhibent sont des ________.
- enhancers | - silencers
64
La liaison de prtos aux enhancers/silencers entraîne quoi?
Changement de conformation de ces complexes et de l'ADN, résultant à activation ou inhibition de transcription
65
Les facteurs d'activation peuvent recruter...? (3 choses)
- facteurs de la transcription généraux - ARN polymérase - complexes du remodelage de la chromatine
66
Qu'est-ce qui se lie à la séq enhancer? Où peut se trouver cette séq?
- la protéine activatrice | - à des milliers de pb du site d'initiation de la transcription
67
Comment est-ce que la séquence enhancer peut-elle se trouver si loin du site d'activation?
Car ADN fait une boucle, permttant interaction malgré distance.
68
Le complexe d'initiation comprend...? (2 choses)
- facteurs généraux de transcription | - ARN polymérase
69
Les facteurs spécifiques de transcription comprennent? (2 choses)
- 1 dom de liaison à l'ADN : DBD | - 1 dom d'activation OU de répression : TAD (pour activation)
70
Est-ce que les facteurs spécifiques de transcription peuvent comprendre un 3e domaine?
Oui : dom de réponse à une signal (ex. dom de liaison à hormone stéroïdienne)
71
Les facteurs de transcription qui se lient à l'ADN et les complexes protéiques qui se lient à ces facteurs déterminent...?
La vitesse d'initiation de la transcription, variant d'un gène à un autre.
72
Le complexe d'initiation de la transcription varie-t-il de gène en gène?
Non!
73
Est-ce que les combinaisons des facteurs de transcription et complexes protéiques varient de gène et gène?
Oui!

MMD1042 : module 3... LET'S GOOOO (10 decks)

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