Cours 1 : la transcription de l'ADN Flashcards
** Réplication = ? —’’ ?
ADN —” ADN
** Transcription = ? —’’ ?
ADN —” ARN
** Traduction = ? —’’ ?
ARN —” prot
Qu’est-ce qui fait la synthèse du polymère durant la transcription?
ARN polymérase
L’ARN polymérase synthétise de ___ vers ____, donc le brin __________ est lu de ___ vers ___.
- 5’
- 3’
- matrice
- 3’
- 5’
** Sur quel carbone le groupement OH/H diffère entre le ribose et le désoxyribose?
2e C
L’ARN a une structure 1aire, 2aire, 3aire et/ou 4ernère? Pour quelle raison?
2aire et 3aire, à cause des interactions entre ses bases
Qu’est-ce qu’un pseudoknot?
Dans l’ARN, appariement de bases entre 2 rég simple-brin de boucles : struct secondaire
Rôle de l’ARN polymérase
Déroulement de l’ADN et polymérisation de l’ARN.
Qu’est-ce qui est formé transitoirement pendant la transcription?
Courte rég d’hélice hybride ADN/ARN : hétéroduplex d’environ 9 nucléotides
Est-ce que l’ARN polymérase requiert une amorce?
NON!
Est-ce que la réplication d’ADN et la transcription ont le même degré de précision?
Non : transcription - précis, car erreurs ont durée de vie limitée correspondant à durée de vie du transcrit
L’ARN polymérase crée des liens ________ entre les _________ en son ________.
- phosphodiesters
- nucléotides (d’ARN)
- site actif
V/F?
La transcription commence et se termine à des endroits aléatoires sur l’ADN.
F! À des endroits précis!
Quels sont les endroits précis sur l’ARN où commence et termine la transcription
Promoteur = site d’initiation de la transcription
Terminateur = site de terminaison de la transcription
V/F? L’ARN polymérase peut terminer et initier la transcription comme bon lui semble.
F! Elle nécessite des FACTEURS PROTÉIQUES et des SIGNAUX DANS L’ADN pour initier et terminer transcription
Quel facteur protéique est nécessaire pour la transcription chez les PROCARYOTES? Décris brièvement son fctionnement.
Facteur sigma.
1) s’associe à ARN polymérase pour former complexe d’initiation AVANT DE SE LIER AU PROMOTEUR
2) est relâché QUELQUES 10 NUCLÉOTIDES APRÈS l’initiation de la transcription
3) se rattache à ARN polymérase après qu’elle soit relâchée du brin d’ADN (et que le transcrit d’ARN soit libre)
Qu’y a-t-il au site de terminaison pour aider l’arrêt de la transcription chez les procaryotes?
Signal stop
Qu’est-ce qu’une séq consensus/séq canonique?
Ordre CALCULÉ de nucléotides/a.a. trouvés à chaque position dans un alignement de séquences. Ces alignements de séqs sont comparés à d’autres et des POURCENTAGES DE MOTIFS DE SÉQS SIMILAIRES sont calculés.
Que permet le facteur protéique sigma?
La sélection du promoteur du gène à transcrire
** V/F?
Il y a slmt 1 facteur sigma chez le procaryotes.
F : plsrs
Que reconnaissent les facteurs sigma bactériens?
De courts motifs de séqs conservés : boîtes -10 (TATAAT) et -35.
La position de la séq consensus -10 et -35 dicte …?
Le brin à utiliser et le sens de la transcription
La séquence consensus d’un promoteur est une séq _________ obtenue par analyse statistique des ______________ à chaque position. Plus la séq d’un promoteur est __________ à la séq consensus idéale, plus ______ sera l’affinité du __________ et plus grande sera l’efficacité d’initiation de la _________ : le ________ est donc plus fort.
- idéale
- fréqs des bases
- similaire
- grande
- facteur sigma
- transcription
- promoteur
** Pourquoi les boîtes -10 et -35 ont-elles ce nom-là?
En raison de leur dist du site d’initiation de la transcription (ex. 10 paires de bases en amont du site d’initiation)
** Comment se fait la reconnaissance moléculaire entre le complexe d’initiation et la boîte -10?
Liaisons chimiques faibles : NON COVALENTES!
- F de VDW
- ponts H
- liens ioniques
- interactions hydrophobes
** Les procaryotes possèdent typiquement plsrs facteurs sigma, chacun ayant sa propre __________. Tous interagissent avec _________ et sont responsables de la reconnaissance de ______________ sur ______.
- spécificité de séquence
- l’ARN
- la séquence promotrice
- l’ADN
Pour les étapes de la transcription…
1) facteur sigma s’associe à ARN polymérase avant transcription : complexe se fixe sur promoteur
2) le contact de l’ARN polymérase avec promoteur entraîne …?
3) …?
4-5) Relâchement du ___________ après la synthèse d’une chaîne de plus ou moins _______ ET ______.
6) rencontre du _________ Il s’agit de la forme que prend l’ARN grâce aux ______.
7) _______ se détache, libérant _____.
2) l’ouverture locale de la double hélice d’ADN : bulle de transcription
3) Initiation de synthèse d’ARN (à 50 ribonucléotides/s)
4-5) facteur sigma… 10 ribonucléotides… élongation.
6) signal de terminaison… appariements locaux
7) l’ARN polymérase… l’ARN
Que permet la séq d’ARN transcrite du signal de terminaison?
La formation d’une TIGE-BOUCLE (HAIRPIN) qui crée une contrainte au niv du complexe de l’ARN polymérase : favorisation du détachement de l’ARN polymérase.
