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MMD1042 : module 3... LET'S GOOOO > Cours 3 : le trafic membranaire intracellulaire > Flashcards

Cours 3 : le trafic membranaire intracellulaire Flashcards

1
Q

Rôle des membranes int.

A

Séparer différents compartiments (organites) jouant différents rôles

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2
Q

Quelles sont les 2 voies principales du trafic membranaire intracellu?

A
  • voie endosomale/de dégradation

- voie de sécrétion/de biosynthèse

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3
Q

Explique le “flux de membrane”

A

Il y a continuellement un flux de membranes entre les compartiments intracellu et la MP.

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4
Q

Pour l’endocytose, MP = compartiment cible ou donneur? Pour exo?

A

Endo : donneur

Exo = cible

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Q

Est-ce que le trafic membranaire est actif?

A

Oui, très : transport via microtubules

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6
Q

Le trafic membranaire se produit dans quel sorte de milieu?

A

Dans un cytoplasme ++ dense

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7
Q

Le transport membranaire se fait via la formation et la fusion de _________. Le tout part du __________ pour aller vers le __________.

A
  • vésicules
  • compartiment donneur
  • compartiment cible
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8
Q

À quoi servent les vésicules dans le transport membranaire?

A

Servent comme interméd de transport de mols de chargements (“cargos”) entre les différents compartiments

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9
Q

Le bourgeonnement et la fusion se passe au niv de quels compartiments?

A

B = au niv du compartiment donneur

F = au niv du compartiment cible

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10
Q

Rappel : comment sont les feuillets de la MP?

A

Asymétriques

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11
Q

Est-ce que l’asymétrie de la MP existe aussi au niv des endomembranes?

A

Oui

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12
Q

Lors de la fusion d’une endomembrane avec la MP, le feuillet face à la lumière des vésicules devient le (feuillet int ou ext?) à la MP, et vice versa.

A

Ext

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13
Q

Quels sont les 4 mécanismes d’internalisation à la MP, ainsi que leur sous-catégories s’il y a lieu.

A

Phagocytose

Macropinocytose

Endocytose:

  • dépendant de la clathrine
  • dépendante de la cavéoline
  • indep de clathrine ou cavéoline

Micropinocytose

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14
Q

Caractéristique de la phagocytose

A

Particules larges, spécifique

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15
Q

Caractéristique de la macropinocytose.

A

Particules liquides, non-spécifique

pinoccccccccccytose… comme qqn qui fait pipi : liquide

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16
Q

Caractéristique de l’endocytose (dép de clathrine)

A

Spécifique, particules de taille moy

Catherine était moyenne… il y avait un problème bien spécifique

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17
Q

Caractéristique de l’endocytose (dép de cavéoline)

A

Plutôt non spécifique, particules de petite taille.

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18
Q

Caractéristique de l’endocytose (indep de cavéoline et clathrine)

A

Plutôt non spécifique, particules de petite taille.

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19
Q

Caractéristique de micropinocytose

A

Particules liquides, plus petits vésicules

pinoccccccccccytose… comme qqn qui fait pipi : liquide

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20
Q

De quoi dépendent les pseudopodes

A

Actine!

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21
Q

Comment est-ce que les macrophages savent quand phagocyter?

A

Par la PS (phosphatidylsérine) dans le membrane. Elle induit la phagocytose des corps apoptotiques, car elle devient exposée au feuillet ext pendant l’apoptose.

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22
Q

**Quelle struct, sur le macrophage, permet la reconnaissance de PS?

A

PS receptor

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23
Q

La macropinocytose dépend-elle de l’actine comme la phagocytose?

A

Oui!

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24
Q

Explique le processus de l’endocytose dépendante de la clathrine.

A

1) récepteurs de chargement, attachés à des adaptines, attirent mols de chargement du milieu ext vers membr ext.
2) recrutement de clathrine (vers feuillet int.) et déformation de la membrane
3) formation de la vésicule par scission (par la dynamine : hydrolyse de GTP)
4) apparition de la vésicule mantelée de clathrine dans le cytosol
5) perte du manteau par hydrolyse d’ATP : la vésicule de transport est nue

(voir titre “L’endocytose médiée par récepteurs” pour le schéma : il aide)

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25
Q

Comment se nomme la clathrine qui n’est pas polymérisée?

A

Triskèle

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26
Q

Comment se nomme la clathrine qui est polymérisée?

A

Treillis polyédrale

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27
Q

Clathrine est en forme de quoi dans le cytosol?

A

Triskèle

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28
Q

Clathrine en forme de quoi pendant la formation de la vésicule?

A

Treillis polyédrale (clathrine polymérisée)

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29
Q

Comment se nomme la forme que prend la MP lors de la formation de la vésicule mantelée, avant la scission?

A

Puits mantelé.

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30
Q

Par quoi est facilitée la formation de la vésicule mantelée de la clathrine?

A

Par l’ACTINE!

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31
Q

Par quoi est médiée la scission lors de l’endocytose médiée par la cavéoline?

A

Par la dynamine

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32
Q

V/F?

Les mêmes manteaux forment les vésicules à partir de différentes membranes donneuses.

A

F! Différents manteaux…

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33
Q

Le manteau de clathrine est utilisé pour faire un passage de quoi vers quoi? (3 combinaisons)

A

1) ext de cell vers endosome
2) endosome vers lysosome
3) Golgi vers lysosome

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34
Q

Le manteau de COPI(COP1) est utilisé pour faire un passage de quoi vers quoi?

A

Golgi vers RE

COPI : logique… Golgi vers RE = ordre alphabétique

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35
Q

Le manteau de COPII(COP2) est utilisé pour faire un passage de quoi vers quoi?

A

RE vers Golgi

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36
Q

En ordre d’âge, quelles sont les 5 structs du syst endosomal-lysosomal?

A

1A) endosome précoce

1B) endosome de recyclage

2) endosome tardif
3) endolysosome
4) lysosome

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37
Q

Qu’est-ce qu’un endosome (struct et provenance)

A

Vésicule entourée d’une simple membrane. L’endosome provient de la membr plasmique suite à l’endocytose

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38
Q

Qu’est-ce qui caractérise la maturation de l’endosome?

A

L’acidité augmente avec la maturation

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39
Q

Syn de “endosome tardif”

A

CMV : corps multivésiculaire

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40
Q

Quel est le pH de l’endosome précose?

A

6,5

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41
Q

Quel est le pH de l’endosome de recyclage?

A

6,5

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42
Q

Quel est le pH de l’endosome tardif?

A

6

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43
Q

Quel est le pH du lysosome?

A

5

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44
Q

Fct de l’endosome de recyclage.

A

Recyclage

45
Q

Fct du lysosome?

A

Dégradation

46
Q

Fct de l’endosome précoce

A

Tri

47
Q

** Qu’est-ce qui est souvent recyclé par l’endosome de recyclage? Et dégradé?

A 
R = Récepteurs
D = ligand
48
Q

Les lysosomes sont riches en __________, mais celles-ci sont slmt actives à _____, donc elles ne sont pas actives avant d’arriver au _________. Cette acidité a lieu grâce au travail de la __________ qui est une _______.

A
  • hydrolases
  • bas pH
  • lysosome
  • V-ATPase (ATPase vacuolaire)
  • pompe à H+
49
Q

Est-ce que les endosomes tardifs peuvent uniquement devenir des lysosome?

A

Non : ils peuvent faire de l’exocytose de leurs exosomes (en se fusionnant avec MP) , soit des vésicules extracellu provenant du syst endosomal.

50
Q

Quelles sont les 2 étapes du développement des exosomes?

A

1) bourgeonnent à l’int de l’endosome tardif

2) sont libérés quand corps multivésiculaire (endosome tardif) fusionne avec MP

51
Q

Les lysosomes reçoivent du matériel de différentes sources? Laquelle/lesquelles?

A

Oui… de la :

  • phagosomes
  • endosomes tardifs
  • autophagosomes
52
Q

Qu’est-ce que les “autophagosomes”?

A

Structs formées d’une MEMBRANE DOUBLE, entourant le CYTOPLASME et certains organites : MITOCHONDRIES (mitophagie) et PEROXISOMES, permettant leur DÉGRADATION.

53
Q

Caractéristiques des peroxysomes (localisation, ressemblances, forme, rôle)

A
  • présent dans toutes les cells eucaryotes
  • ressemblent aux lysosomes
  • sphérique, simple membr
  • IMP pour métabolisme et détoxification
54
Q

Est-ce que les péroxysomes font partie du syst endo-lysosomal?

A

Non!

55
Q

Comment est-ce que les peroxysomes sont IMP pour le métabolisme?

A

Oxydation (synthèse) des acides gras (acides biliaires et lipides)

56
Q

Comment est-ce que les peroxysomes sont IMP pour détoxification?

A

Production et dégradation du H2O2, à l’aide de 50 ENZYMES) et le métabolisme des espèces réactives d’oxygène (ROS)

57
Q

Quels sont les 2 moyens de biogenèse des peroxysomes?

A

Moins commun : se forment “de novo” (i.e. à partir du RE)

Plus commun : fission et croissance (comme mitochondries)

58
Q

Par quoi est médiée la fission des membranes?

A

Par des prots transmembranaires : les SNARE. Sur le vésicule, il y a les v-SNARE, qui interagissent avec d’autres SNARE sur la membrane cible : les t-SNARE (target SNARE)

59
Q

Le désassemblage des complexes v-/t- SNARE dépend de…?

A

L’hydrolyse d’ATP : donc d’une ATPase. Elle est nécessaire pour recycler les composantes

60
Q

V/F?

Il existe plsrs différents SNARE pour différents compartiments.

A

V!

61
Q

Pour se fusionner, une vésicule doit d’abord s’attacher et s’appareiller avec la membr cible : comment peut-elle faire cela?

A

Grâce à une GTPase, de la famille Rab (superfamille Ras)

62
Q

Explique l’activité et l’inactivité de Rab.

A

Actif : grâce à GEF, Rab sous forme GTP

Inactif : grâce à GAP, Rab sous forme GDP

63
Q

Est-ce que différentes ports Rab sont spécifiques pour certains compartiments?

A

Oui!

64
Q

Comment est-ce que la cell choisit telle ou telle membrane? C’est-à-dire, quels sont les facteurs de spécification des membranes des différents compartiments? (3)

A
  • différents SNARE
  • différents Rab
  • composition de la bicouche lipidique est différente
65
Q

Quelle composante de la bicouche lipidique est IMP dans la spécification des membranes?

A

PI (phosphatidylinositol)

66
Q

Qu’y a-t-il de si particulier avec le PI?

A

L’anneau inositol peut être phosphorylé/déphosphorylé sur ses positions 3,4,5 par des kinases et phosphatases.

67
Q

Quels sont les différents variants de PI phosphorylés?

A
  • PI3P
  • PI4P
  • PI5P
  • PI(4,5)P2
  • PI(3,4,5)P3
68
Q

V/F?
Différents PI sont enrichis sur différentes membranes (ex. sur celle de endosome précoce, endosome de recyclage, Gogli, etc.)

A

V!!!

69
Q

En ordre chronologique, quelles sont les structs de la voie endosomale/de dégradation?

(Prots passent de… à … à … à … à … à …)

A

1) enveloppe nucléaire
2) RE
3) Golgi
4) vésicules de transport
5) MP
6) espace extracellu

70
Q

Caractéristiques du RE (composition, localisation, sortes, rôle)

A
  • rx de citernes/sacs membranaires
  • entour le noyau
  • REL ou RER (à cause des ribosomes)
  • fabrique les membranes de la cell!
71
Q

RE est en continuité avec…?

A

Membrane nucléaire!

72
Q

Caractéristiques du REL (ribosomes? rx de…?, continuité, rôles)

A
  • sans
  • tubules
  • continuité avec RER

Rôles:
- synthèse lipidique (phospho, cholesté, hormones stéro, lipoprots)

73
Q

Caractéristiques du RER (ribosomes? rx de…?, continuité, rôles)

A
  • avec ribosomes
  • citernes
  • en continuité avec le REL

Rôles:

  • synthèse prot
  • repliement des prots dans lumière
  • contrôle de qualité
  • glycosylation des prots
74
Q

Caractéristiques des ribosomes (composé de…?, composantes, rôle)

A
  • ARNs ribosomales et prots
  • 2 sous-unités : 50S et 30S
  • essentiel à traduction des prots
75
Q

La traduction des prots se fait à partir d’un ______. Le ribosome se déplace de _______ à _______ en “lisant” chaque ______ contenant ___________. Les ________ transfèrent chaque acide aminé à la _________ jusqu’à un _______.

A
  • ARNm
  • 5’
  • 3’
  • codon
  • 3 nucléotides
  • ARNt spécifiques
  • chaîne polypeptide
  • codon STOP
76
Q

Qu’est-ce qu’un polyribosome?

A

Multiples ribosomes en train de traduire ARNm simultanément

77
Q

Les ribosomes sont dans cytoplasme. Comment peuvent-ils produire prots destinées à être sécrétées hors de cell ou à être insérées dans MP?

A

Les prots destinées à être sécrétées/transmembranaires ont une SÉQ SIGNAL “SIGNAL PEPTIDE” N-terminal
de 23 a.a. (c’est une étiquette) dirigeant ribosome vers RE

78
Q

Est-ce que les prots destinées sécrétées/transmembranaires ont une SÉQ SIGNAL “SIGNAL PEPTIDE” qui peut différer selon le besoin de la cell?

A

Oui!

79
Q

Quelle est la diff entre les ribosomes libres VS ceux attachés au RE?

A

RE : pour prots destinées à être sécrétées/transmembranaires/fonctiennant dans le syst endomembranaire

Libres = prots cytosoliques (ou nucléaires, ou mitochondriales, etc.)

80
Q

Pendant la traduction, il se passe une ____________ du ribosome au niv du RER. Ceci se fait grâce à des particules ____________ (____), qui amènent le complexe ribosome/ARNm au niv du RER. À la fin, la prot va passer par un ___________, aussi appelé un ___________, pour aller dans la _____________. Cette prot va être clivée par un _______.

A
  • translocation
  • de reconnaissance du signal
  • (SRP)
  • canal de tranclocation
  • translocon
  • lumière du RE
  • peptidase

(voir schéma “la translocation co-traductionnelle au RER)

81
Q

Les prots TRANSMEMBRANAIRES sont insérées dans la ___________, au niv du _________, via le _________.

A
  • bicouche
  • RE
  • translocon
82
Q

** Rappel : qu’y a-t-il comme protection en ext de la cell? IMP pour quoi?

A

Glycocalyx, soit lipides ou prots transmembranaires glycolisées

83
Q

** Rappel : rôles du glycocalyx (2)

A
  • protection chimique (intestins)

- reconnaissance cellu (cells immunitaires)

84
Q

Où commence la glycosylation des prots?

A

Dans lumière du RE : précurseurs préformés du glycocalyx s’ajoutent.

85
Q

Quelles sont les 2 classes maj de glycoprots? (avec constitution et localisation)

A

N-glycosylation :

  • oses de glucoses
  • liés au N de l’asparagine (Asn)
  • RE!

O-glycosylation :

  • oses de galactose
  • liés au O de la sérine (Thr)
  • Golgi!

(galactose… des lettres “a” et “o” avec des creux dedans, comme un “o”… Aussi, gOlgi)

86
Q

La N-glycosylation des prots commence dans la _____________ avec ajout de _________, soit une chaîne de _______.

A
  • lumière du RE
  • glycane préformé
  • 14 sucres
87
Q

Que se passe-t-il dans la lumière du RE pour s’assurer que nos prots soient adéquates?

A

La chaperonne/calnexine attachée
la membrane int du RE retient les glycoprots incorrectement repliées. C’est le CONTRÔLE DE QUALITÉ DANS LA LUMIÈRE DU RE! Seules les prots correctement repliées sont permises de quittrer vers Golgi.

88
Q

Qu’est-ce que las UPR?

A

Unfolded Protein Response : s’il y a trop de prots mal repliées, cell augmente la transcription des gènes de chaperonnes pour augmenter qtt de RE : AUTO CONTRÔLE DE LA TAILLE DU RE!

89
Q

Explique le fctionnement de IRE1 dans la UPR.

A

IRE1 : endoribonucléase transmembranaire contrôlant le splicing spécifique de l’ARN de XBP1 et la dégradation d’autres ARNm pour réduire leur traduction

90
Q

Explique le fctionnement de XBP1 dans la UPR.

A

Facteur de transcription augmentant capacité de synthèse de chaperonnes de la cell

91
Q

Que se passe-t-il avec les prots anormalement repliées?

A

Elles sont rétro-transloquées (passent par le translocon, mais de la lumière du RE vers le cytosol), puis éliminées via dégradation associée au RE (ERAD) : processus avec ubiquitines et protéasome

ERAD… comme “éradication”

92
Q

Différence entre lysosomes et protéasome.

A

Les deux font dégradation, mais…

L = prots enfermées dans vésicule

P = prots solubles présentes dans cytosol et nucléoplasme

93
Q

L’appareil de Golgi est constitué de ______. Il y en a 3 types (de int à ext):

  • ___________
  • ___________
  • ___________
A
  • citernes
  • cis
  • médiane
  • trans
94
Q

Y a-t-il qqc entre Golgi et RE?

A

Oui : compartiment intermédiaire RE-Golgien : ERGIC (ER-Golgi Intermediate Compartment)

95
Q

Dans le compartiment interméd RE-Golgien, quels sont les types de transports?

A
  • COPII(COP2)

- COP1(COP1)

96
Q

À quoi sert COPI?

A

Transport de récupération (rétrograde) : récupère les vésicules

97
Q

À quoi sert COPII?

A

Transport antérograde : frome les vésicules

98
Q

Que forment COPI et COPII autour des vésicules?

A

Un manteau

99
Q

La rétention au RE via le transport rétrograde (via COPI) se fait à l’aide de quoi?

A

KDEL, qui s’attache à prot résidente du RE (et qui décide qui reste et qui retourne).

100
Q

Rôles du Golgi (3 maj)

A
  • FINITION(MATURATION) des prots par GLYCOSILATION
  • ÉTIQUETAGE des prots pour marquer destination finale
  • TRIAGE, CONCENTRATION ET EMBALLAGE des prots dans vésicules/granules de sécrétion
101
Q

Qu’est-ce qui permet le transport des vésicules/granules qui quittent Golgi pour aller vers lieu cible?

A

Microtubules grâce à des moteurs : kinésine et dynéine

102
Q

Quel est le lieu, entre les 2 lieux où il peut y avoir une glycosylation, dans lequel glycosylation = la plus complexe

A

Golgi!

103
Q

Quelles sont les 2 types de sécrétions du Golgi?

A

Constitutive VS régulée

104
Q

Qu’est-ce que la “sécrétion constitutive”?

A
  • faite par toutes les cells
  • prots solubles sécrétées en permanence
  • sert aussi à homéostasie (le maintient) de la MP (ex. IMP : Na+/K+ ATPase)
105
Q

Qu’est-ce que la sécrétion “régulée”?

A
  • uniquement dans cells sécrétoires suite à signal extracellu (ex. IMP : cells bêta du pancréas) OU dans cells spécialisées (ex. adipocytes)
106
Q

Qu’est-ce qui se fait à la sortir du réseau trans-Golgien (TGN)

A

SLMT avec sécrétion régulée : UN TRI, pour séparer composantes des différents types de vésicules sécrétoires

107
Q

Le bouton synaptique avec les neurotransmetteurs seraient un ex de sécrétion (exocytose) régulée ou constitutive?

A

Régulée!

108
Q

Pour ce qui est de la neurotransmission. Les vésicules synaptiques se fusionnent au niv de la ________, sur la neurone ________. C’est de l’exocytose _______ (régulée/constitutive?). Cependant, il y a une contrebalance : il y a de ________ qui se produit aussi en même temps, après avoir fait de la diffusion ______.

A
  • zone active
  • post-synaptique
  • régulée
  • l’endocytose
  • latérale
109
Q

Qu’est-ce que le “transport endosomal” dans les cells polarisées?

A

Transcytose : endocytose de la MP apicale, suivi de transport et fusion avec MP basolatérale, car les jcts serrées empêchent d’autres mvts.

MMD1042 : module 3... LET'S GOOOO (10 decks)

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