cours 11 capsules Flashcards
(21 cards)
rôle ARN codant vs non codant
codant portent information pour déterminer séquence d’une protéine
non codants ne codent pas pour des protéines et leur fonction est directement accomplie par l’ARN
l’ARN le plus abondant en terme de masse
ribosomal
l’ARN le plus nombreux en terme de nombre de molécules
ARNt
utilité d’avoir des nucléotides différentes chez ARN que ADN
permettent d’augmenter la diversité structurale ex pour permettre des liaisons à protéines ou autres ARN
définition de transcription
processus par lequel information conservée dans l’ADN est communiquée à l’ARN et donc disponible pour la synthèse protéique
ARN participants à la transcription
ARNt (transfert); apporte les acides aminés à la machinerie de traduction
ARNr (ribosomique); occupe la plus grande partie du ribosome
ARNm (messager); séquence complémentaire à un des brins d’ADN qui est traduit au niveau des ribosomes en protéine
quelle enzyme fait la synthèse d’ARN
ARN polymérase (composée de 5 sous-unités)
caractéristiques de la synthèse d’ARN
similaire à la synthèse d’ADN; 3’OH attaque le P alpha d’un NTP
formation de liaison phosphodiester
libération de PPi
mais pas d’amorce!
où débute la transcription
aux promoteurs
reconnaissance du promoteur est faite par facteurs généraux de transcription pour les eucaryotes
par l’élément sigma pour les bactéries
comment les cellules bactériennes peuvent réguler les patrons d’expression des gènes
utilisation de différents facteurs sigma, chacun spécifique d’une séquence promotrice différente
sigma lie les séquences -35 et -10
pourquoi initiation de la transcription peut pas commencer avec l’ARN polymérase
pcq l’ADN est bcp plus abondant, plus grande taille du génome
aussi, ADN est condensé dans chromatine donc pas accessible
processus d’initiation de la transcription
- remodelage de la chromatine (les facteurs de transcription ne lient pas le promoteur, les complexes de remodelage ouvrent la chromatine) SERT À RENDRE SÉQUENCES ADN PLUS ACCESSIBLES
- recrutement du médiateur
- recrutement de facteurs généraux de la transcription et de l’ARN polymérase
les complexes de remodelage de la chromatine
contiennent enzymes qui catalysent modifications post transcri des histones
plein de combinaisons de modifications qui forment un code de régulation (code des histones) va déterminer la liaison des différents facteurs à la chromatine donc sa conformation ouverte ou fermée
modifications qui ouvrent vs ferment la chromatine
ferme; méthylation des lysines 9 et 27 de la H3
ouvre; méthylation de lysine 4 de h3, acétylation lysine 9 de h3 et lysine 16 de h4
médiateur et facteurs de transcriptions
recrute les facteurs généraux de l’ARN polymérase et fait les contacts avec les facteurs de transcription, la chromatine modifiée et les facteurs généraux
Les différents facteurs généraux; TFIID TBP
TBP est la sous-unitée TFIID qui lie le TATA box
Les différents facteurs généraux; TFIID TAF1
protéine la plus grande chez TFIID, recruté par facteurs de transcription spécifiques ou activateurs et médiateurs
possède plusieurs motifs pour lier TBP, activité HAT, bromodomaine qui peut lier lysines acétylées, activité kinase et activité monoubiquitine ligase de l’histone H1
rôle de TFIIH
formation de la bulle de transcription (hélicases qui déroulent ADN pour faire bulle), dégagement du promoteur (pour que bulle de transcription avance), mode élongation
élongation de la transcription
les deux brins se séparent en avant du site de polymérisation et se remettent ensemble derrière le site de sortie de l’ARN
corrections par pol ii
peut corriger quand arn mésapparié ressort du site actif à travers le canal par lequel entrent les ribonucléotides
donc TFIIS stimule ARN poly à retrancher l’ARN
donc transcription va reprendre là où c’était sorti
les deux types de terminaisons de la transcription
au niveau de certaines séquences d’adn, va rendre le complexe d’élongation instable
sinon mise en jeu d’une protéine qui favorise la dislocation du complexe d’élongation
