Cours 2

Question 1

Quels sont les deux types de classification en taxonomie?

Answer 1

Artificielle (phénotypique) et naturelle (phylogénétique)

Question 2

Vrai ou faux. Il y a moins d’espèces dans le règne des fungi que dans le règne des plantes.

Answer 2

Faux, il y a 10 fois plus d’espèces de champignons que de plantes

Question 3

Comment se nourrissent les champignons?

Answer 3

Par absorption (ils sont hétérotrophes, donc nécessitent du carbone organique dans le milieu)

Question 4

Nommer une grande distinction entre les plantes et les champignons.

Answer 4

La paroi cellulaire des champignons est composée de chitine, alors que celle des plantes est faite de cellulose

Question 5

Quelle est la différence entre une levure et une moisissure?

Answer 5

Une levure est unicellulaire, alors qu’une moisissure est sous forme de filaments (classification artificielle)

Question 6

Vrai ou faux. Peu de champignons font la reproduction sexuée.

Answer 6

Faux, la plupart en font

Question 7

À quoi correspond les fungi imparfaits?

Answer 7

Auparavant, c’était une classe de champignons qui regroupait les espèces pour lesquelles il n’y avait pas de mode de reproduction sexué connu

Question 8

À quoi correspond les champignons qu’on voit hors de la terre?

Answer 8

Ce sont les organes de fructification (basidioma). Les hyphes sont regroupe en mycélium et poussent pour permettre aux basidiospores d’être libérés

Question 9

Vrai ou faux. Ce ne sont pas toutes les levures qui sont capables de fermenter.

Answer 9

Vrai

Question 10

Vrai ou faux. Il n’y a pas d’organe de fructification chez les levures.

Answer 10

Vrai, la forme sexuée s’effectue d’une autre manière

Question 11

Quel est le groupe de fungi duquel proviennent les “vraies” levures?

Answer 11

Groupe monophylétique saccharomycotina (si ne fait pas partie de ce groupe, on appelle “organisme levuriforme”)

Question 12

Quelle est la particularité des espèces appartenant au groupe des ascomycota?

Answer 12

Les espèces sont plutôt homogènes, car elles proviennent toutes d’un ancêtre de levure commun

Question 13

Vrai ou faux. On peut retrouver des levures dans plusieurs groupes phylogénétiques.

Answer 13

Vrai (levures = groupe polyphylétique), ex. ascomycota et basidiomycota. C’est un regroupement artificiel

Question 14

Nommer les mode de reproduction asexuée (anamorphe).

Answer 14

• Fission (cellules filles identiques)
• Bourgeonnement unipolaire (cellule fille plus petite que la cellule mère, col très large)
• Bourgeonnement bipolaire (plus petit col de bourgeonnement)
• Bourgeonnement multilatéral (jamais au même endroit)
• Bllistoconidies (formation d’un “spore” et propulsion)

Question 15

Nommer une méthode qui permet de déterminer l’âge d’une cellule.

Answer 15

Staining au calcofluor permet de visualiser les cicatrices sur les cellules à bourgeonnement multilatéral, ce qui nous permet de savoir combien de reproduction elle a fait

Question 16

En quoi consiste la technique de Dalmau?

Answer 16

Ensemencer une génoise en profondeur pour observer les structures caractéristiques des levures (ex. formation d’hyphes et d’arthroconidies, absence de filamentation…)

Question 17

Homothallisme VS hétérothallisme

Answer 17

• Homo: les cellules ont un “sexe” flexible à l’état 1n (suite au bourgeonnement)
• Hétéro: Il y a des cellules + et des cellules -

Question 18

Qu’est ce que la caryogamie chez les levures?

Answer 18

C’est l’état diploïde qui fait suite à la rencontre de deux cellules de “sexe” opposé (les spores sont formées à partir de là)

Question 19

Comment fait-on pour déterminer si une levure est homo ou hétérothallique?

Answer 19

On prend une thalle (descendance d’une levure ex. via une colonie) et on remet en culture. Il va y avoir croissance seulement chez les hétérothalliques

Question 20

Quelle est la forme de levure la plus observée?

Answer 20

Cellules diploïdes. Il y a formation d’ascospores surtout quand les conditions deviennent sous-optimales

Question 21

Comment fait-on pour mettre en évidence les ascospores?

Answer 21

En faisant croitre la levure dans des conditions difficiles puis en colorant avec du vert de malachite (spores = paroi épaisse qui retient le colorant)

Question 22

Vrai ou faux. Les asques sont liés à la reproduction asexuée.

Answer 22

Faux, on voit souvent de la reproduction sexuée

Question 23

Quel milieu de culture utilise-t-on pour observer l’assimilation d’une source de carbone chez une levure?

Answer 23

Yeast nitrogen base (on fait varier les sucre et on voit sous quelle forme le carbone est assimilé)

Question 24

Quelle est la différence entre l’assimilation d’une source de carbone et la fermentation?

Answer 24

L’assimilation se fait via la voie oxydation et la fermentation utilise plutôt une voie indépendante de l’O2

Question 25

Quel milieu de culture utilise-t-on pour observer la fermentation d'une source de carbone chez une levure?

Answer 25

Bouillon peptone et ampoule de Durham (croissance et production de CO2)

Question 26

Décrire les lois de Kluyver (4)

Answer 26

- Une levure qui ne peut assimiler une source de carbone ne peut la fermenter - Une levure qui le peut fermenter le glucose ne fermente aucun sucre - Une levure qui peut fermenter le glucose peut aussi fermenter le fructose et le mannose - Une levure qui fermente le lactose ne peut fermenter le maltose (et vice versa)

Question 27

Quel milieu de culture utilise-t-on pour observer l'assimilation d'une source d'azote chez une levure?

Answer 27

Yeast carbon base (contient du glucose, on fait varier la source d'azote)

Question 28

Vrai ou faux. Il y a une différence entre les ascomycetes et les basidiomycetes quant à l'hydrolyse de l'urée.

Answer 28

Vrai, la plupart des asco sont négatifs, tant dis que les basidio sont plutôt positifs

Question 29

Quels types de métabolites s'accumulent lors de l'hydrolyse de l'urée?

Answer 29

Métabolites alcalins (ex. ammoniaque), ce qui augmente l'acidité du milieu

Question 30

Quel milieu de culture utilise-t-on pour observer l'hydrolyse de l'urée?

Answer 30

Gélose urée de Christensen (rouge vire au jaune lorsque acide)

Question 31

Quel milieu de culture utilise-t-on pour observer la résistance au cycloheximide?

Answer 31

Yeast nitrogen base + glucose + 0.1µg/ml de clycloheximide

Question 32

À quoi sert le bleu de diazonium B?

Answer 32

On l'ajoute au milieu de croissance pour différencier les ascomycetes (colonies blanches/jaunes car rx négative) des basidiomycètes (colonies rouges/mauves car rx positive)

Question 33

Que peut nous indiquer la nature du coenzyme Q?

Answer 33

On peut différencier les ascomycètes des basidiomycetes selon le nombre d'unités isoprènes de la chaine latérale de la quinone (6 à 8 VS 9 à 10)

Question 34

À quoi sert la coenzyme Q?

Answer 34

Elle est impliquée dans le transport d'électrons dans les mitochodries

Question 35

À quoi sert la taxonomie moléculaire?

Answer 35

À savoir si deux levures appartiennent à la même espèce ou à savoir le % d'homologie de séquence entre deux espèces (basé sur le % en GC et la réassociation)

Question 36

Vrai ou faux. Un % en GC différent permet d'affirmer que les deux levures ne sont pas de la même espèce.

Answer 36

Vrai

Question 37

Vrai ou faux. Un même % en GC permet d'affirmer que les deux levures appartiennent à la même espèce.

Answer 37

Faux. Le % en GC est spécifique, mais pas exclusif (les séquences peuvent être différentes malgré une ressemblance dans leur composition)

Question 38

Qu'est ce que la T° de fusion de l'ADN?

Answer 38

C'est la T° lorsque la moitié des brins sont séparés (t° médiane entre l'ADN double brin et simple brin)

Question 39

De quoi dépend la T° de fusion?

Answer 39

Entre autre du contenu en GC

Question 40

Vrai ou faux. Il peut y avoir une variation d'environ 15% en GC au sein d'une même espèce.

Answer 40

Faux. 1-2% de différence dans le % en GC indique que les souches appartiennent à des espèces différentes

Question 41

Vrai ou faux. Les basidiomycètes ont un % en GC plus élevé que les ascomycètes.

Answer 41

Vrai. 50-70% VS 27-50%

Question 42

Plus la T° de fusion augmente, plus le % en GC...

Answer 42

est grand

Question 43

Quelle est la principale différence entre le % en GC et le test de réassociation?

Answer 43

Lors du test de réassociation, on ne peut pas comparer à des études antérieures

Question 44

Quelle conclusion peut-on tirer lorsque la réassociation est supérieure à 80%?

Answer 44

Il s'agit de la même espèce

Question 45

Sous quel % de réassociation peut-on dire qu'il s'agit d'espèces distinctes?

Answer 45

< 40%

Question 46

Vrai ou faux. Le séquençage permet seulement d'étudier les liens de parenté proches.

Answer 46

Faux, on peut aussi étudier les liens de parenté distants, selon la séquence étudiée

Question 47

Nommer une bonne séquence à utiliser pour comparer deux levures entre elles.

Answer 47

Région D1/D2 de la sous unité ribosome 26S

Question 48

Qu'est ce que la E value dans BLAST?

Answer 48

c'est une valeur de concordance. Plus elle s'approche de zéro, plus la séquence étudiée et la séquence correspondante sont semblables

Question 49

Quelle est la forme des levures à reproduction asexuée?

Answer 49

Forme anamorphe

Question 50

Quel est le mode de reproduction des levures à forme télomorphe?

Answer 50

Reproduction sexuée

Question 51

Nommer 3 choses qu'il faut décrire lorsqu'on identifie une nouvelle espèce de levure?

Answer 51

- Écologie et spécificité de l'habitat - Description de la morphologie - Ordre phylogénétique basé sur l'analyse de la séquence D1/D2 de l'unité 26S

Question 52

Décrire les deux types de clé d'identification.

Answer 52

- Générale: permettent d'identifier toutes les levures | - Spécialisées: permettent d'identifier certains groupes de levures