Cours 2- Croissance microbienne et exigences nutritionnelles

Question 1

Quelles sont les 4 phases de croissance?

Answer 1

1. Latence
2. Exponentielle
3. Stationnaire
4. Mortalité

Question 2

Explique la phase de latence et elle varie en fonction de quoi?

Answer 2

C’est une phase d’adaptation avant de débuter à croître qui dépend de:
1. âge des bactéries
2. origine (composition/température du milieu)

donc on gros ça dépend de la bactérie et de son mileu où elle croit

Question 3

Dans quelle phase on est à la vitesse de croissance maximale de croissance?

Answer 3

exponentielle

Question 4

V ou F, la phase exponentielle est de courte durée

Answer 4

V

Question 5

La phase exponentielle varie en fonction de quoi?

Answer 5

Concentration des nutriments disponibles

Question 6

Pourquoi y a-t-il une stabilité au niveau de la phase stationnaire et c’est causé par quoi?

Answer 6

Parce qu’il y a autant de division que de mort cellulaire
* Mort causé par une accumulation de déchets toxiques et acides et un manque de nutriments

Question 7

V ou F
l’arrêt de la division cellulaire est le début de la phase de mortalité

Answer 7

V

Question 8

Quelles sont les causes de mortalité des cellules?

Question 9

Quelle sont les deux méthodes de mesure de la croissance des microorganismes?

Answer 9

Méthodes directes (on compte les bactéries):
1) Décompte totale
2) Décompte des unités viables (qui peuvent se reproduire)

Méthodes indirectes (on ne compte pas les bactéries):
1) Mesure de l’activité des moo (manger, excréter, composition)
2) Mesure de la masse cellulaire

Question 10

Explique le compteur de cellule Coulter et c’est une technique associée à quelle méthode?

Answer 10

Méthode directe - Décompte totale
Pour les cellules mammifères, levures et protistes

Question 11

Explique les dilutions en milieux liquides+étalement sur gélose et c’est une technique associée à quelle méthode?

Answer 11

Méthode directe - Décompte des unités viables (seule les unités viables pourront croitre sur les géloses)

1. On fait une dilution en milieux liquides
2. On étale chacune de ces dilutions sur des gélose
3. On calcule le nombre de colonies (en multipliant par le facteur de dilution) d’une gélose n’ayant pas trop/peu de colonies

Question 12

Explique le cytomètre de flux et c’est une technique associée à quelle méthode?

Answer 12

Méthode directe - Décompte total
Pour les cellules mammifères, les levures et les protistes

Question 13

Explique la turbidimétrie et c’est une technique associée à quelle méthode?

Answer 13

Méthode indirect - Masse cellulaire
On calcule la densité optique pour connaître la concentration cellulaire
1) On place une suspension dans un spectophotomètre qui va calculer la densité optique et on établit une courbe de référence
2) ↑ de lumière passe = ↓de cellules/colonies (absorbance ↓, transmission vers le détecteur↑)
3) ↓ de lumière qui passe = ↑ de cellules/colonies (absorbance ↑, transmission vers le détecteur↓)

Question 14

Explique l’hémocytomètre et c’est une technique associée à quelle méthode?

Answer 14

Méthode directe - Décompte total
Chambre de comptage observée au microscope pour les cellules mammifères et les levures
1. Puisqu’on connait la longueur, la largeur et la profondeur, on peut calculer le volume de la chambre de comptage (0.1 cm x 0.1cm x 0.1 cm = 1/10 000 cm3)
2. 10 000 x cellules comptées x facteur de dilution (si la suspension fut diluée)

Question 15

Mesurer l’alimentation, les déchets et les constituants cellulaires sont des techniques associées à quelle méthode?

Answer 15

Méthode indirecte - Mesure de l’activité
* Alimentation: consommation des substrats (C, O2, N2, etc)
* Déchets: CO2, NH3
* Constituants : ATP, ADN, protéines

Question 16

Explique les filtres de cellulose et c’est une technique associée à quelle méthode?

Answer 16

Méthode directe - Décompte des unités viables
1) on fait passer une suspension à travers un filtre de cellulose
2) le filtre de cellulose emprisonnant les moo est placé sur une gélose
3) décompte des unités ayant pu se reproduire sur la gélose

Question 17

Explique la mesure du poids sec et c’est une technique associée à quelle méthode?

Answer 17

Méthode indirecte - Masse cellulaire
1.

Question 18

Explique la cellule de Petroff-Hausser et c’est une technique associée à quelle méthode?

Answer 18

Méthode directe - Décompte total
Chambre de comptage observée au microscope pour les bactéries
* Même principe que l’hémocytomètre mais 10 x plus petit (pour de plus petites cellules)
* 100 000 x cellules comptées x facteur de dilution (au besoin)

Question 19

Quelles sont les techniques utilisées en méthode directe?

Answer 19

Décompte total (mortes et vivantes):
* Compteur de cellules Coulter
* Cytomètre de flux
* Chambre de comptage: Hémocytomètre et Cellule de Petroff-Hausser

Décompte des unités viables (vivantes/pouvant se reproduire):
* Dilution en milieu liquide et étalement sur gélose
* Filtre de cellulose

Question 20

Quelles sont les techniques utilisées en méthode indirecte?

Answer 20

Mesure de l’activité:
1. Consommation des substrats (C, O2, N2, etc)
2. Excrétion de CO2, NH3, etc
3. Composant cellulaires (ATP, ADN, protéines,etc)

Mesure de la masse cellulaire:
1. Poids sec
2. Turbidité par densité optique (concentration cellulaire)

Question 21

Explique c’est quoi le temps de génération/doublement

Answer 21

Temps entre chaque génération/doublement de cellules
temps de génération/doublement : g
g= temps / nb de générations
g=t/n

Question 22

Explique c’est quoi le taux de croissance

Answer 22

Nb de génération/doublement de cellules par unité de temps
taux de croissance : k
k= nb de générations/temps
k= n/t

Question 23

Quelle est la distinction entre le temps de génération/doublement et le taux de croissance?

Answer 23

g et k sont réciproques et ont les même variables mais ne sont pas issus du même calcul et représente pas la même chose

Question 24

Explique le princpe d’une culture continue (ouvert) et quelle est la phase de croissance qui en est affectée?

Answer 24

• Culture continue (ouvert)= apport en nutriments et élimination des déchets continuellement
• La phase exponentielle est donc beaucoup plus longue puisqu’il y a moins d’accumulation de déchet toxiques/acides + constamment de nutriments = moins de morts

Question 25

Quels sont les 2 types de culture continue et quelle est leur différence?

Answer 25

**Chemostat**: Vitesse apport nutritionnel **=** Vitesse élimination des déchets **Turbidostat**: Apport nutritionnel et élimination des déchets **dépend de la concentration cellulaire** Notre but est de maintenir une population cellulaire normale (on veut pas de sous/sur- population) | turbidostat = turbidité (DENSITÉ OPTIQUE/CONCENTRATION CELLULAIRE)

Question 26

Quelle est la différence entre les milieux de cultures liquide et solides?

Answer 26

Liquide: bouillon de culture Solide: bouillon de culture + ajout d'agar (polymère provenant d'une algue rouge)

Question 27

Comment ça se fait que l'agar n'est pas dégradé/mangé par les bactéries?

Answer 27

Les bactéries ne métabolisent pas l'agar

Question 28

Quelle est la différence entre les milieux de culture synthétique et empirique ?

Answer 28

Synthétiques: * **On sait ce qu'il y a à l'intérieur** puisqu'il s'agit de produits chimiques achetés commercialement * Milieux **pauvres** avec le strict minimum (C, N, S, etc) donc seulement certaines bactéries peuvent y croitre Empiriques: * **On ne se sait pas exactement ce qu'il y a à l'intérieur**. Ils possèdent également des **produits biologiques** (ex: peptone, extrait de levure) * Milieux **riches** où plusieurs bactéries peuvent croitre * Miluex **enrichis**: on a ajoutés des additifs (ex:gélose **sang**) pour les bactéries **fastidieuses**

Question 29

C'est quoi des bactéries fastidieuses?

Answer 29

Bactéries avec des besoins supplémentaires qui ont donc besoin de milieux enrichis

Question 30

Quelle est la différence entre les milieux de culture de base/propagation, sélectif et différentiel ?

Answer 30

**Milieux de base/de propagation**: * la majorité des MOO peuvent croitre **Milieux sélectifs**: * On inhibe la croissance de certains MOO de façon sélective * ex: présence de sels biliaire et cristal violet qui inhibe les bactéries gram+ et favorise les bactéries gram- **Milieux différentiels**: * Il y a des substrats qui nous permettent de différencier les bactéries par la couleur des colonie/gélose * ex: gélose devient rouge-rose lorsqu'une bactérie fermente le lactose , reste incolore si elle ne le fermente pas | IMPORTANT

Question 31

La gélose sang est un milieu _?

Answer 31

Empirique/enrichi

Question 32

La gélose MacConkey est un milieux _?

Answer 32

Sélectif ET différentiel S: présence de sels biliaire et cristal violet qui inhibe les bactéries gram+ et favorise les bactéries gram- D: gélose devient rouge-rose lorsqu'une bactérie fermente le lactose , reste incolore si elle ne le fermente pas | IMPORTANT

Question 33

Quelle est la couleur des colonies/gélose MacConkey en présence de E-coli (+ signification)?

Answer 33

rouge-rose pcq il ferment le lactose (lac+)

Question 34

Quelle est la couleur des colonies/gélose MacConkey en présence de Pseudomonas (+ signification)?

Answer 34

incolore parce qu'il ne fermente pas le lactose (lac-)

Question 35

Quels sont les besoins nutritifs des MOO?

Answer 35

C'HOPKNS | Ecq le reste est è apprendre, vérifier avec prof

Question 36

Explique la classification pour la **source de carbone** des moo

Answer 36

**Autotrophe**: source **inorganique** CO2 **Hétérotrophe**: molécules **organiques** hydrocarburées

Question 37

Explique la classification pour la **source d'énergie** des moo

Answer 37

Énergie **Photo**trophe: à partir de la **lumière** **Chimio**trophe: à partir de l'**oxydation** de **composés organiques et inorganiques**

Question 38

Explique la classification pour la **source d'électrons** des moo

Answer 38

**Litio**trophe: molécules **inorganiques réduites** **Organo**trophe: molécules **organiques réduites**

Question 39

Explique c'est quoi: - Autotrophes photolitotrophes - Hétérotrophes photoorganotrophes - Autotrophes chimiolitotrophes - Hétérotrophes chimioorganotrophes

Answer 39

Autotrophes photolitotrophes: * Auto= CO2, Photo= lumière, Lito= inorganiques réduites Hétérotrophes photoorganotrophes: - Hétéro: molec. organiques, Photo= lumière, organo= organiques réduites Autotrophes chimiolitotrophes * Auto= CO2, Chimio= oxydation composé org/inorg, Lito= inorganiques réduites Hétérotrophes chimioorganotrophes - Hétéro: molec. organiques, Chimio = oxydation composé org/inorg, organo= organiques réduites

Question 40

V OU F Lorsqu'un chimioautotrophe ne peut dégrader une substance organique, cette substance est appelé NON-BIODÉGRADABLE

Answer 40

F lorsqu'un **chimiohétérotrophe** ne peut dégrader une substance organique, cette substance est appelé NON-BIODÉGRADABLE

Question 41

Pourquoi l'azote est essentiel et quelles sont les différentes formes d'azote utilisées par les MOO?

Answer 41

Parce que l'azote forme les **acides aminés**, **bases azotées**, certains **glucides/lipides** etc MOO utilise l'azote **organique** et **inorganique**

Question 42

Donne moi des exemples d'azote inorganique utilisé par les MOO (+ de quelle façon)

Answer 42

Inorganique: - **Azote atmosphérique N2** (en la fixant) - **Ammoniaque NH3** (en oxydant ammoniaque→ nitrites (nitrosation)) - **Nitrites NO2** (en oxydant nitrites → nitrates (nitration)) - **Sel d'ammonium NH4+**

Question 43

Donne moi des exemples d'azote organique utilisé par les MOO

Answer 43

Organique: - acides aminés - bases azotées - phospholipides

Question 44

Pourquoi le phosphore est essentiel et quelles sont les différentes formes de phosphore utilisées par les MOO?

Answer 44

Phosphore forme l'**ATP**, les **acides nucléiques**, les **phospholipides** (membrane), etc Forme **INORGANIQUE** seulement : **Phosphate PO4**

Question 45

Pourquoi le soufre est essentiel et quelles sont les différentes formes de soufres utilisées par les MOO?

Answer 45

Soufre forme certaines **acides aminés** * **Inorganique**: **Sulfate SO4** * **Organique**: composés soufrés organiques comme la **cystéine**

Question 46

Pourquoi les ions inorganiques sont essentiels pour les MOO ?

Answer 46

Équilibre physicochimique au sein des cellules

Question 47

Explique c'est quoi des facteurs de croissance

Answer 47

Les facteurs de croissance sont des **composés que certaines MOO ne peuvent synthétiser** elle même: - **vitamines** - **acides aminés** - **bases azotés**

Question 48

C'est les bactéries prototrophe ou auxotrophe qui ont besoin de ces facteurs de croissance? et explique leur distinction

Answer 48

**Prototophes**: moo qui peuvent **synthétiser leur propres métabolites essentiels**. Ils sont **autonome** et peuvent croitre sur un **milieu minimal/pauvre**. **Auxotrophes**: moo qui **ne peuvent pas synthétiser leur propres métabolites essentiels** et donc peuvent croitre en **milieu enrichi** en ceux-ci

Question 49

C'est l'eau libre ou liée qui est disponible pour les MOO?

Question 50

Comment peut-on calculer l'activité de l'eau libre (Aw)?

Question 51

V ou F tout les eucaryotes sont aérobiques

Question 52

Pourquoi l'oxygène est important pour presque tout les eucaryotes et une partie des procaryotes?

Question 53

Quels sont les 5 groupes de bactéries à l'égard de loxygène?