Cours 3 - Diagnostic moléculaire (Partie I) Flashcards
1
Q
Quelle est la première cause identifiable de mort subite chez le jeune ?
A
→ Une maladie génétique cardiovasculaire.
2
Q
Vrai ou Faux : La majorité des morts subites chez les jeunes sont dues à des infections virales.
A
→ Faux. La première cause identifiable est une maladie génétique cardiovasculaire.
3
Q
Quels sont les deux types de dépistage familial utilisés pour les maladies génétiques cardiovasculaires ?
A
→ Le dépistage clinique
→ Le dépistage moléculaire.
4
Q
Qu’est-ce que la médecine personnalisée ?
A
→ C’est une médecine visant à améliorer la stratification et la prise en charge des patients en utilisant des informations biologiques et des biomarqueurs.
5
Q
Quel est l’objectif principal de la médecine personnalisée ?
A
→ Améliorer la stratification et la prise en charge des patients.
6
Q
Vrai ou Faux : La médecine personnalisée repose uniquement sur les antécédents familiaux du patient.
A
→ Faux. Elle repose sur des informations biologiques et des biomarqueurs.
7
Q
Quels domaines biologiques sont mentionnés comme sources d’informations pour la médecine personnalisée ? (4)
A
→ Les voies moléculaires des maladies,
→ La génétique,
→ La protéomique
→ La métabolomique.
8
Q
Définissez la pharmacogénétique.
A
→ C’est l’étude de la relation entre le profil génétique d’un patient et sa réponse aux médicaments, permettant d’adapter la sélection et la dose des traitements.
9
Q
Complétez : En pharmacogénétique, le choix des médicaments (__________ et __________) est adapté au profil génétique du patient.
A
→ sélection, dose.
10
Q
Vrai ou Faux : La pharmacogénétique adapte le traitement selon la tolérance du patient à la douleur.
A
→ Faux. Elle adapte selon le profil génétique et la réponse aux médicaments.
11
Q
Qu’est-ce que l’oncogénétique permet de faire ?
A
→ Adapter les thérapies en fonction des caractéristiques génétiques de la tumeur et du profil génétique du patient.
12
Q
Quel est le but de la cardiogénétique ?
A
→ Guider le traitement à partir des caractéristiques génétiques du patient et dépister les membres de la famille à risque.
13
Q
Vrai ou Faux : La cardiogénétique ne concerne que le traitement du patient et non sa famille.
A
→ Faux. Elle permet aussi le dépistage familial.
14
Q
Par quels types de chromosomes le génome est-il encodé ?
A
→ Par les chromosomes nucléaires et les chromosomes mitochondriaux.
15
Q
Complétez : Les chromosomes nucléaires comprennent 22 paires d’__________ et 1 paire de __________.
A
→ autosomes, gonosomes.
16
Q
Vrai ou Faux : Les chromosomes sexuels sont appelés autosomes.
A
→ Faux. Ils sont appelés gonosomes.
17
Q
Sous quelle forme se présentent les chromosomes mitochondriaux ?
A
→ Sous forme circulaire.
18
Q
Combien de gènes sont encodés par les chromosomes mitochondriaux ?
A
→ 37 gènes.
19
Q
Comment se transmettent les chromosomes mitochondriaux ?
A
→ Exclusivement par la mère.
20
Q
Vrai ou Faux : Les chromosomes mitochondriaux peuvent être transmis par le père.
A
→ Faux. Ils sont transmis uniquement par la mère.
21
Q
À quoi sont associés les variants dans les gènes mitochondriaux ?
A
→ À des maladies à transmission maternelle.
22
Q
Quels sont les trois processus principaux de l’expression génétique ?
A
→ Réplication, transcription, traduction.
23
Q
Quel enzyme est responsable de la réplication de l’ADN ?
A
→ L’ADN polymérase.
24
Q
Quel rôle joue l’ARN dans l’expression génétique ?
A
→ Il sert de matrice pour la traduction en protéine par le ribosome.
25
Vrai ou Faux : L’ARN est fréquemment utilisé en clinique.
→ Faux. Il est rarement employé en clinique.
26
Quel est le rôle du ribosome dans l’expression génétique ?
→ Il effectue la traduction de l’ARN en protéine.
27
Pourquoi les protéines sont-elles importantes dans l’analyse de laboratoire ?
→ Elles sont majoritairement analysées (sérum/plasma) et jouent de multiples rôles dans la cellule (structure, métabolisme, régulation, etc.).
28
Complétez : Le transfert d'information génétique permet l'expression du __________ dans le __________.
→ génotype, phénotype.
29
Vrai ou Faux : Les protéines n’ont qu’un rôle structural dans la cellule.
→ Faux. Elles participent aussi au métabolisme, à la régulation et à d'autres fonctions cellulaires.
30
Quel acide nucléique est transcrit à partir de l’ADN ?
→ L’acide ribonucléique (ARN).
31
Que devient l’ARN après épissage ?
→ Il devient l’ARN messager (ARNm).
32
Quel est le rôle de l’épissage ?
→ L’épissage consiste à retirer les introns de l’ARN et à assembler les exons pour former l’ARNm.
33
Sur quoi repose le code génétique ?
→ Sur la correspondance entre les triplets de nucléotides (codons) présents sur l’ARN messager et les acides aminés.
34
Combien de codons existent dans le code génétique ?
→ 64 codons.
35
Combien d’acides aminés sont codés par les 64 codons ?
→ 22 acides aminés.
36
Complétez : Le code génétique est dit __________ car plusieurs codons peuvent coder pour un même acide aminé.
→ dégénéré.
37
Pourquoi dit-on que le code génétique est universel ?
→ Parce que le même code génétique est utilisé par presque tous les organismes vivants.
38
Quelle relation le code génétique établit-il au sein d’un organisme ?
→ Il établit la correspondance entre le génotype et le phénotype.
39
Complétez : Le code génétique lie le __________ (information génétique) au __________ (caractères observables).
→ génotype, phénotype.
40
Qu’est-ce que le génotype ?
→ C’est l’information codée dans notre génome, correspondant à une composition et une séquence génétique spécifique.
41
Par quoi est défini un génotype ?
→ Par la séquence des deux allèles d’un gène.
42
Qu’est-ce que le phénotype ?
→ C’est la manifestation physique ou clinique du génotype.
43
Vrai ou Faux : Le phénotype ne peut pas être mesuré.
→ Faux. Il peut être représenté par des quantités mesurables comme l’IMC ou le taux de cholestérol.
44
Donnez un exemple de phénotype discret.
→ La présence ou l’absence d’une maladie.
45
Donnez deux exemples de phénotypes quantitatifs.
→ Indice de masse corporelle (IMC) et niveaux sanguins de cholestérol.
46
Qu’est-ce que la corrélation génotype-phénotype ?
→ C’est l’association entre la présence d’un ou plusieurs variants génétiques (génotype) et leurs expressions cliniques ou physiologiques (phénotype).
47
Vrai ou Faux : Le génotype détermine totalement le phénotype sans influence externe.
→ Faux. Le phénotype est influencé par le génotype mais aussi par des facteurs environnementaux.
48
Qu’est-ce qu’un individu hétérozygote ?
→ C’est un individu dont les deux allèles d’un gène sont différents.
49
Qu’est-ce qu’un individu homozygote ?
→ Un individu dont les deux allèles pour un gène sont identiques.
50
Qu’est-ce qu’un individu hémizygote ?
→ Un individu qui ne possède qu’un seul chromosome (ou segment de chromosome) pour un gène donné, notamment en référence aux gènes portés par le chromosome X chez un individu XY.
51
À quoi réfère la notion d’hémizygotie chez l’humain ?
→ Aux gènes localisés sur le chromosome X chez un individu XY.
52
À quoi correspond la génétique mendélienne ?
→ À l’étude de la transmission des caractères héréditaires selon les lois établies par Mendel.
53
Quel était le but des expériences de Mendel sur les petits pois ?
Établir des lois statistiques sur la transmission des caractères héréditaires. (Hybridation)
54
Quel est le mode de transmission des maladies mendéliennes ?
→ Monogénique (ou monofactorielle).
55
Quelle est la différence entre une maladie mendélienne homogène et hétérogène ?
→ Homogène : le gène impliqué est le même chez tous les patients (myopathie de Duchenne.)
→ Hétérogène : le gène affecté peut être différent d’un patient à l’autre. (cardiomyopathie hypertrophique.)
56
Quels sont les quatre modes de transmission des maladies mendéliennes ?
→ Autosomal dominant,
→ Autosomal récessif,
→ Lié à l’X dominant,
→ Lié à l’X récessif.
57
Combien d’allèles mutés sont nécessaires pour qu’une maladie autosomique dominante se manifeste ?
→ Un seul allèle muté suffit.
58
Quel est le statut des individus hétérozygotes dans une maladie autosomique dominante ?
→ Ils sont malades.
59
Comment sont affectés les individus homozygotes dans ce type de maladie ?
→ Ils sont atteints plus sévèrement.
60
Quel est le risque de transmission de la maladie à chaque grossesse dans un cas de transmission autosomique dominante ?
→ 50 %.
61
Vrai ou Faux : Un enfant ne peut hériter de la maladie que si les deux parents sont porteurs.
→ Faux. Un seul parent porteur suffit dans une transmission autosomique dominante.
62
Nommez trois exemples de maladies à transmission autosomique dominante.
→ Cardiomyopathie hypertrophique,
→ Syndrome de Marfan,
→ Hypercholestérolémie familiale.
63
Qu’est-ce que la pénétrance en génétique ?
→ C’est le pourcentage d’individus ayant un génotype donné qui présentent le phénotype associé.
64
Que signifie une pénétrance incomplète ?
→ Un individu possède le génotype associé à la maladie, mais ne développe pas la maladie.
65
Vrai ou Faux : Une pénétrance de 100 % signifie que tous les individus porteurs du génotype développent la maladie.
→ Vrai.
66
Qu’est-ce que l’expressivité ?
→ C’est le niveau d’expression d’un génotype donné au niveau phénotypique.
67
Complétez : L’expressivité mesure le __________ d’expression d’un génotype donné.
→ niveau.
68
Qu’est-ce qu’une mutation de novo ?
→ C’est une mutation qui apparaît spontanément chez un individu, sans être héritée des parents.
69
Vrai ou Faux : Dans la variabilité de l’expressivité, tous les individus présentent un phénotype identique.
→ Faux. Ils présentent le phénotype à des degrés divers.
70
Quelle est la différence visuelle entre la pénétrance variable et l’expressivité variable?
→ La pénétrance variable alterne entre présence ou absence totale du phénotype,
→ Alors que l’expressivité variable montre des variations d’intensité du phénotype chez tous les individus.
71
Combien d’allèles mutés sont nécessaires pour qu’une maladie autosomique récessive se manifeste ?
→ Deux allèles mutés.
72
Quel est le statut des individus hétérozygotes (Aa) dans une transmission autosomique récessive ?
→ Ils sont porteurs, mais généralement non malades.
73
Que signifie être homozygote (AA) pour un gène muté récessif ?
→ Cela signifie que l’individu est malade.
74
Quelles sont les probabilités pour chaque grossesse lorsque les deux parents sont porteurs (Aa) ?
→ 25 % d’enfant homozygote malade,
→ 50 % porteur,
→ 25 % sain.
75
Donnez deux exemples de maladies autosomiques récessives.
→ Fibrose kystique,
→ Hémochromatose.
76
Qu'est-ce que l'effet fondateur ?
→ C'est la perte de variation génétique qui survient lorsqu’un petit groupe d’individus fonde une nouvelle population dans une zone géographique différente.
77
Quel phénomène génétique est observé lors de l’effet fondateur ?
→ Une perte de variation génétique.
78
Quel est le mode de transmission de l’hérédité mitochondriale ?
→ Transmission maternelle, non-mendélienne.
79
Complétez : Lors de la fécondation, le cytoplasme de l’oocyte est exclusivement d’origine __________.
→ maternelle.
80
Pourquoi l’hérédité mitochondriale est-elle dite non-mendélienne ?
→ Parce qu’elle ne suit pas les lois classiques de Mendel, les mitochondries sont transmises uniquement par la mère.
81
Tous les enfants d’une femme atteinte d’une maladie mitochondriale seront-ils malades ?
→ Oui.
82
Tous les enfants d’un homme atteint d’une maladie mitochondriale seront-ils malades ?
→ Non, ils seront sains.
83
Quel est le type d’hérédité de l’hérédité multifactorielle ?
→ Non-mendélienne.
84
Complétez : L’hérédité multifactorielle dépend à la fois de l’__________ et de l’__________.
→ hérédité, environnement.
85
Pourquoi dit-on que certains caractères (comme la taille) ont une hérédité multifactorielle ?
→ Parce qu’ils dépendent de plusieurs gènes (multigénique) et de facteurs environnementaux.
86
Comment est distribuée l’expression des caractères multifactoriels dans la population ?
→ Selon une distribution normale.
87
Que peuvent affecter les variants rares dans l’ADN ? (2)
Ils peuvent affecter une énorme (ex. : trisomies) ou une infime (un seul nucléotide) partie de l’ADN.
88
Quels types de maladies peuvent être causées par des variants rares ?
Ils peuvent être à l’origine de maladies génétiques (variants germinaux) et de cancers (variants somatiques).
89
Quel impact fonctionnel peuvent avoir les variants rares sur une protéine ?
Ils peuvent augmenter (gain de fonction) ou diminuer (perte de fonction) la fonction de la protéine encodée.
90
Qu’est-ce qu’un variant structural ? (3)
- Anomalies chromosomiques de nombre
- Anomalies de structure (translocations, insertions, inversions, délétions, duplications)
- Variations du nombre de copies (CNVs)
91
Que sont les InDels ?
Ce sont de petites insertions ou délétions de nucléotides dans l’ADN.
92
Que sont les SNPs ? (5)
Ce sont des polymorphismes d’un seul nucléotide.
- Variants synonymes
- Variants faux-sens
- Variants non-sens
- Variants affectant les sites d’épissage
- Variants non-codants
93
Qu’est-ce qu’une anomalie chromosomique de nombre ?
C’est une anomalie affectant le nombre total de chromosomes présents chez un individu.
94
Que signifie "monosomie" ?
C’est l’absence d’un chromosome dans une paire (aneuploïdie par défaut).
95
Quelle est la monosomie viable la plus connue ?
Le syndrome de Turner (45, X).
96
Que signifie "trisomie" ?
C’est la présence d’un chromosome en trop dans une paire (aneuploïdie par excès).
97
Quelles sont les trisomies les plus connues ?
- Trisomie 13 : Syndrome de Pateau
- Trisomie 18 : Syndrome d’Edwards
- Trisomie 21 : Syndrome de Down
98
Qu’est-ce qu’une délétion ?
C’est la perte ou suppression d’une portion d’un chromosome.
99
Que se passe-t-il dans une duplication ?
Une portion du chromosome est dupliquée, créant du matériel génétique supplémentaire.
100
Qu’est-ce qu’une inversion ?
Une portion du chromosome est brisée, retournée tête-bêche puis réattachée, ce qui inverse la séquence génétique.
101
Que désigne une insertion ?
Une portion d’un chromosome est insérée dans un autre chromosome.
102
Qu’est-ce qu’une translocation ?
C’est un échange de matériel génétique entre deux chromosomes non homologues, après cassure.
103
Que se passe-t-il si une insertion ou délétion est un multiple de 3 nucléotides ?
Il n’y a pas de changement du cadre de lecture (lecture des codons reste intacte).
104
Et si l’insertion ou la délétion est inférieure ou supérieure à 3 nucléotides (non multiple de 3) ?
Il y a un changement du cadre de lecture (frameshift), ce qui peut fortement altérer la protéine produite.
105
Qu’est-ce qu’une mutation faux-sens (missense) ?
→ C’est une mutation qui entraîne le remplacement d’un acide aminé par un autre.
106
Qu’est-ce qu’une mutation non-sens (nonsense) ?
→ C’est une mutation qui introduit un codon stop prématuré, stoppant la traduction.
107
Qu’est-ce qu’une mutation synonyme ?
→ C’est un changement de nucléotide qui ne modifie pas l’acide aminé codé.
108
Qu’est-ce qu’un variant au niveau d’un site d’épissage ?
→ C’est une mutation qui affecte les régions spécifiques (sites donneurs 5' ou accepteurs 3') impliquées dans l’épissage de l’ARN.
109
Que sont les mutations non-codantes ?
→ Ce sont des mutations situées dans les introns ou les régions intergéniques, en dehors des exons.
110
Quels sont les deux grands types d’effets fonctionnels des variants génétiques ?
→ Perte de fonction (LoF)
→ Gain de fonction (GoF).
111
Quels sont les principaux types de variantes?
1) Faux-sens (missense)
2) Perte de fonction (LoF)
3) Gain de fonction (GoF)
112
Qu’est-ce qu’un mécanisme épigénétique ?
→ C’est un facteur qui affecte le fonctionnement des gènes sans modifier le génotype.
113
Complétez : Chaque maladie est associée à des variants dans certains gènes __________.
→ spécifiques.
114
Qu’est-ce qu’un cas-index ?
→ C’est une personne chez qui un diagnostic clinique ou suspecté déclenche une recherche génétique pour une cause génétique.
115
Que se passe-t-il si le résultat génétique du cas-index est positif pour un variant pathogénique ?
→ Un dépistage en cascade peut être réalisé dans la famille pour identifier les porteurs et les membres à risque.
116
Que signifie “prise en charge clinique différentiée” ?
→ Adapter les soins (médication, chirurgie, suivi…) selon les résultats génétiques.
117
Qu’est-ce qu’un cas-index (ou proband) ?
→ C’est le premier membre de la famille chez qui une maladie génétique est identifiée, menant à une investigation génétique.
118
Vrai ou Faux : Le diagnostic d’un cas-index permet de poser un diagnostic sur l’ensemble de la population.
→ Faux. Il concerne les membres de la famille à risque.
119
Quel est l’impact du diagnostic d’un cas-index sur les membres de la famille ?
→ Il soulève un indice de suspicion et permet de diagnostiquer certains membres porteurs du même variant.
120
À quoi sert la génétique médicale ?
1) Pour le patient atteint
2) Pour les grossesses futures
3) Pour les familles
4) Pour la société
121
Quel est le premier rôle de la génétique médicale pour un patient atteint ?
Elle permet de poser un diagnostic clinique précis.
122
Quel est l’apport de la génétique médicale en planification de grossesse ?
Elle permet la détermination du risque de récurrence d’une maladie génétique.
123
En quoi la génétique médicale est utile pour les proches d’un patient ?
Elle permet le dépistage en cascade des personnes à risque dans la famille.
124
Quelle est l’utilité de la génétique médicale pour la santé publique ?
Elle permet le développement de la médecine préventive.
