Cours 3 - Diagnostic moléculaire (Partie II) Flashcards
(168 cards)
Définis l’analyse moléculaire.
→ C’est une analyse qui permet d’identifier des modifications dans l’ADN des gènes associés au développement de maladies.
Quelle est la définition de l’extraction de l’ADN ?
→ C’est une technique permettant d’isoler l’ADN de cellules ou de tissus.
Quelles sont les quatre étapes principales de l’extraction de l’ADN ?
→ 1) Lyse des cellules
→ 2) Élimination des protéines
→ 3) Élimination des autres acides nucléiques (ARN, etc.)
→ 4) Concentration de l’ADN
Comment peut-on contrôler la qualité de l’extraction de l’ADN ?
→ Par électrophorèse sur gel d’agarose, spectrophotométrie UV ou fluorescence.
Quelle est la définition du séquençage ?
→ C’est une méthode qui consiste à déterminer l’ordre d’enchaînement des nucléotides pour un fragment d’ADN donné.
Vrai ou Faux : Le séquençage permet d’identifier uniquement les gènes codants.
→ Faux. Il permet de déterminer la séquence de gènes individuels, de grandes régions génétiques, de chromosomes complets ou même de génomes entiers.
Quelles sont les deux méthodes de séquençage les plus utilisées en diagnostic ?
→ Le séquençage direct Sanger et
→ Le séquençage en parallèle à haut débit (« séquençage de nouvelle génération »).
Quels sont les deux grands types de SPHD mentionnés ?
→ Le séquençage par synthèse
→ Le séquençage par nanopore.
Que signifie l’acronyme SNV ?
→ Single Nucleotide Variant (variation d’un seul nucléotide).
Que signifie le fait que le SNV soit hétérozygote dans cet exemple ?
→ Cela signifie que les deux allèles sont différents : un allèle contient C (45 %) et l’autre contient T (55 %).
Que signifie l’acronyme NGS ?
→ Next-Generation Sequencing, ou séquençage de nouvelle génération.
Que signifie l’abréviation WGS et que représente-t-elle ?
→ Whole-genome sequencing, c’est le séquençage du génome complet.
Quelle est la différence entre le WGS et le WES ?
→ Le WGS couvre l’ensemble du génome (exons + introns),
→ Tandis que le WES ne cible que les régions codantes (exons).
En quoi consiste le séquençage de profil de gènes ciblés ?
→ Il s’agit du séquençage des exons uniquement dans des gènes cliniquement associés à une maladie.
Quelles sont les cinq grandes catégories de variants selon les lignes directrices de l’ACMG et de l’AMP ?
→ 1) Variant pathogénique
→ 2) Variant probablement pathogénique
→ 3) Variant de signification incertaine
→ 4) Variant probablement bénin
→ 5) Variant bénin
Quels critères permettent d’évaluer si un variant est pathogénique ou bénin ? (5)
→ La fréquence dans la population,
→ Les études de ségrégation familiale,
→ Le type de variant,
→ Les outils bio-informatiques de prédiction,
→Les études fonctionnelles.
Quels sont les quatre grands types de maladies cardiovasculaires héréditaires ?
→ Les cardiomyopathies,
→ Les arythmies,
→ Les aortopathies
→ Les dyslipidémies familiales.
Qu’est-ce que la cardiomyopathie hypertrophique (CMH) ?
→ C’est un épaississement (hypertrophie) du muscle cardiaque (cardiomyocarde).
Quelle est la première cause de mort subite chez les moins de 40 ans ?
→ La cardiomyopathie hypertrophique.
Quelle est l’origine cellulaire de la CMH ?
→ C’est une maladie du sarcomère cardiaque entraînant une perte de l’alignement des myofibrilles.
À quel âge la CMH peut-elle se développer ?
→ À tout âge, en particulier à l’adolescence et au début de l’âge adulte.
Quelle est la prévalence approximative de la CMH ?
→ 1 individu sur 500 à 1 sur 200 (donc assez fréquent).
Quel est le mode de transmission génétique de la CMH ?
→ Autosomique dominant.
Quels sont les symptômes cliniques possibles de la cardiomyopathie hypertrophique (CMH)? (6)
- Fatigue
- Essoufflement à l’effort
- Angine (douleur thoracique)
- Palpitations et arythmies
- Étourdissements, syncopes (pertes de connaissance brutales)
- Œdème aux jambes