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biologie du gène (BIM501) > Cours 5 - Maturation ARN > Flashcards

Cours 5 - Maturation ARN Flashcards

(54 cards)

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1
Q

différence maturation arn chez eucaryote vs procaryote

A
  • bactéries: transcrits arn prêts à agir comme des ARNm
  • eucaryotes: molécule produite par transcription (pré mRNA) est rarement fonctionnelle -> étapes supplémentaires pour devenir mRNA
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Q

Étapes maturation

A
  • Addition d’une coiffe en 5’
  • Addition d’une queue poly A en 3’
  • Épissage
  • Édition (optionnelle)
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Q

Capping des pré ARNm

A
  • addition de 7-méthylguanosine en 5’ de l’ARN
  • attaché par liaison triphosphate
  • spécifique aux ARNm
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4
Q

Biochimie du capping (enzymes)

A

1- élimination du P en 5’ (ARN triphosphatase)
2- Ajout guanosine mono phosphatée en 5’ à partir du GTP (ARN guanylyltransférase)
3- Méthylation du résidu de guanylate en position N7 (ARN méthyltransférase)
4- Méthylation de la première base adjacente (ARN nucléoside méthyltransférase)

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5
Q

Le capping de l’ARN pré messager se produit de manière _____

A

co transcriptionnelle

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6
Q

Lors du capping, le recrutement des enzymes se fait au niveau de?

A

domaine CTD P de l’ARN pol II

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7
Q

Pourquoi le capping se fait rapidement?

A

pour pas que l’ADN se dégrade

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8
Q

Importantes fct de la coiffe

A
  • stabilité: protège extrémité 5’ de l’ARN contre ribonucléases
  • traduction: reconnu par facteurs d’initiation
  • épissage: recrute complexe nucléaire CBC qui orchestre assemblage spliceosome
  • export: recrute CBC qui interagit avec facteurs d’exportation nucléaire
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9
Q

Polyadénylation

A
  • extrémité 3’ des ARNm caractérisée par présence de nombreux résidus A
  • se fait post transcriptionnellement (pas présente au niveau de l’ADN)
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10
Q

Étapes polyadénylation

A

1- Clivage: Quand séquence consensus AAUAAA apparaît dans une molécule ARN pendant transcription, pré-ARNm est clivé par complexe protéique (entre séquence consensus et région riche en GU)
2- Élongation: PAP ajoute avec l’aide de facteurs additionnels (PAB II) environ 200 nt A

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11
Q

Complexe de clivage de la polyadénylation

A
  • CPSF
  • CstF
  • CFI et CFII
  • PAP
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12
Q

Signal de polyadénylation

A
  • hautement conservé
  • signal retrouvé 20-30 pb avant site de polyadénylation
  • délétion de la séquence AAUAAA élimine la polyadénylation des ARN
  • des mutations de la séquence AAUAAA réduisant la polyadénylation des ARN
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13
Q

Fonctions importantes polyadénylation

A
  • stabilité: ARNm sans queue poly a sont dégradés rapidement par des ARNases
  • export: exporter ARNm noyau->cytosol
  • traduction: reconnu par Pab1p qui interagit avec complexe d’initiation de la traduction via eIF4G
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14
Q

Épissage

A
  • permet à un ARN pré messager de se débarrasser des séquences non codantes (introns) pour donner ARNm
  • séquences codantes dans ARNm final sont les exons
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15
Q

Les gènes humains ont généralement plus d’ADN consacré aux _____ qu’aux _____

A
  • introns
  • exons
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16
Q

Séquences consensus de l’épissage

A
  • détermine endroit ou épissage a lieu
  • jonctions entre les introns et les exons contiennent des séquences spécifiques
  • dans site de branchement, A est le résidu de branchement
  • site donneur (5’) et receveur (3’)
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17
Q

L’épissage se produit par une série de _______

A

2 rct de transestérification
- 1: grp OH du résidu A du site de branchement attaque le grp phosphoryle du résidu G au site d’epissage 5’
- 2: grp Oh de l’exon en 5’ attaque le grp phosphoryl du site d’épissage 3’. permet liaison des exons et libération de l’intron (LARIAT)

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18
Q

Le processus d’épissage est catalysé par un énorme complexe protéique: _____

A

le spliceosome

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19
Q

de quoi est composé le spliceosome

A

50 protéines et 5 ARN

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20
Q

noms des 5 petits ARN nucléaires du spliceosome

A

U1, U2, U4, U5, U6

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21
Q

Les actions du spliceosome entraînent…

A

L’épissage de deux exons et la libération de l’intron sous forme de lariat

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22
Q

Étapes spliceosome

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A

1- U1 et U2 snRNPs se lient respectivement au site donneur 5’ et au site de branchement
2- U4/U6 and U5 se lient pour former un spliceosome inactif
3- U1 et U4 sont déplacés et le spliceosome devient actif pour les deux étapes catalytiques (formation lariat, libération de l’intron)

23
Q

Autres types d’épissage

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A
  • auto épissage groupe I
  • auto épissage groupe II
  • présent pour quelques rares gènes et pour les ARN d’organelles de certains eucaryotes
24
Q

Toutes les étapes de maturations de l’ARN se produisent de manière ______

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A

co transcriptionnelle

25
Avec quoi interagit chaque étape de maturation?
CTD phosphorylé de l'ARN pol II
26
Épissage constitutif
maintien de tous les exons dans l'ARNm final
27
Épissage alternatif
tous les exons ne sont pas inclus dans l'ARNm
28
Conséquences épissage alternatif?
- possibilité (ou absence) de nouveaux partenaires protéiques - possibilité (ou absence) de nouvelles modifications post traductionnelles - possibilité d'une nouvelle localisation cellulaire - nouvelle activité enzymatique
29
Les exons peuvent être épissés de façon alternative dans:
- un tissu spécifique - une circonstance particulière
30
Anomalie de l'épissage alternatif
- dans de nombreuses pathologies - dans cancer, peut favoriser prolifération et survie des cellules cancéreuses - mutations dans les sites d'épissage peut causer pathologie
31
Édition des ARN
- modification de l'ARNm après sa fabrication
32
deux types de chgt dans la séquence d'ARN par rapport à sa séquence génomique
- insertion/délétion de U - modification individuelle de base (C-->U, A-->I) (désamination)
33
Conséquences édition des ARN
- peut compromettre développement de certains tissus et conduire à des maladies
34
structure secondaire des ARNm
- stable - conséquence de l'ensemble des appariements internes - composé de régions en hélice et non appariées
35
La structure de l'ARN est essentielle à sa _____
stabilité
36
Quand les ARN sont structurés, ils peuvent interagir avec certaines protéines:
- former des complexes avec ribonucléoprotéines et former spliceosome - reconnus par des enzymes qui en s'associant peuvent modifier leur séquence
37
Export des ARNm
- doivent avoir subi toutes les étapes de maturation pour être exporté vers cytoplasme - coiffe m7G aide exportation des ARNm - doit passer par pores nucléaires avant, détruit si défectueux
38
Étapes export ARNm
1- coiffe recrute complexe CBC qui interagit avec TREX et facteur d'export Aly 2- TREX recrute protéines d'adressage au pore TAP et p15 (interagit avec protéines spécifiques du pore) 3- ARNm franchit pore nucléaire grâce à ARN hélicase Dbp5 et son cofacteur Gle1
39
Mécanismes d'export utilisés par les ARNt et microARN
exportines
40
La stabilité de la présence des ARNm dépend du
- niveau de transcription - niveau de dégradation
41
La dégradation de l'ARNm se produit à cause de:
- absence de structure de coiffe - raccourcissement de la queue poly A - dégradation directe par l'action d'endoribonucléases et exoribonucléases
42
3 mécanismes de dégradation de l'ARNm
- dégradation des ARNm dépendante de la déadenylation - dégradation des ARNm indépendante de la déadenylation - dégradation des ARNm médiée par enconucléase
43
dégradation des ARNm dépendante de la déadenylation
- queue poly a éliminé par une activité déadenylase (PARN) Deux mécanismes ensuite: 1- Lsm1-7 s'associe à l'extrémité 3' de l'ARNm pour induire le décapage par le complexe DCP1-DCP2. Ensuite dégrader par exoribonucléase 5'->3' XRN1 2- ARNm déadénylé peut être dégradé 3->5' par l'exosome et la coiffe est hydrolysée par l'enzyme Dcp5
44
dégradation des ARNm indépendante de la déadenylation
- Rps28 interagit avec Edc3 pour activer complexe Dcp1-Dcp2 - ARNm dégradé par Xrn1
45
dégradation des ARNm médiée par endonucléase
- endonucléase provoque clivage interne de l'ARNm qui génère deux fragments - fragments dégradés par XRN1 et exosome
46
L'ARNr et ARNt sont traduits en protéines? V ou F
F
47
ARNr
constituant principal des ribosomes qui sont en charge de la synthèse des protéines à partir des ARNm
48
ARNt
reconnaît codon sur ARNm et amène a.a approprié au ribosome pour permettre synthèse des protéines
49
deux sous unités du ribosome eucaryote
- 60S: 28S, 5.8S, 5S + 50 protéines - 40S: 18S + 33 protéines
50
Maturation des ARNr
- 28S, 18S, 5.8S dans nucléole à partir de préARNr (47s) (ARN pol I) - 5S dans nucléoplasme (ARN pol III) - 47s méthylé par fibrillarine - succession d'étapes d'élimination des séquences ETS et ITS
51
5 régions ARNt
- tige acceptrice - tige boucle - bras D - bras T - région variable
52
anticodon
triplet de bases complémentaires du codon présent dans l'ARNm
53
ARNt et anti codon
- interaction entre premier nucléotide de l'anticodon et le troisième nucléotide du codon de l'ARNm est un appariement non canonique appelé paire wobble - appariement différent de watson crick - implique parfois nucléotide modifié
54
Maturation des ARNt
- ARNt transcrit sous forme d'un pré ARNt qui nécessite plusieurs étapes de maturation avant que l'ARNt soit utilisé pour traduction

biologie du gène (BIM501) (5 decks)

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