Cours 7 Flashcards
Pourquoi les humains sont pas des bons sujets expérimentaux? (5)
• Ils sont génétiquement hétérogènes. • Il y a des différences environnementales • La reproduction est lente, peu de progéniture • Ils vivent trop longtemps • Ils sont réticents à donner des tissus ou à être injectés avec des toxines
Quelles sont les 8 caractéristiques communes des org modèles?
- Croissance et développement rapides
- Petite taille chez l’adulte et/ou facilité de manipulation
- Anatomie relativement simple
- Facilité de production (aménagements, coûts des opérations, etc.)
- Manipulable génétiquement (génétique directe et réverse simples)
- Outils de génétique moléculaire disponibles (e.g. transgénèse)
- Génome séquencé et annoté
- Multiples ressources (banques de données, collection de mutants, etc.)
Quels sont les 7 orgs modèles en neurobio?
Invertébrés Caenorhabditis elegans (nématode) Drosophila melanogaster (mouche à fruit) Vertébrés Xenopus laevis (xénope) Rattus norvegicus (rat) Danio rerio (poisson zèbre) Mus musculus (souris domestique) Macaca mulatta (macaques rhésus)
Décrit le nématode
petit vers, existe en 2 formes: hermaphrodite (self fertilising) et mâle mais est juste 1/1000
Le mâle est utile pour faire les croisements génétiques pour garder les mutations (souches de vers avec +ieurs mutations)
Quelles sont 3 technologies utilisées pour les modèles invertébrés?
Les incubateurs 15, 20 and 25℃
Système de micro-injection
Stéréoscope fluorescent
Quels sont 6 avantages qu C. elegans?
INVARIANCE ANATOMIQUE, PETIT NOMBRE DE CELLULES : permet
l’identification de toutes les cellules de l’animal
TRANSPARENCE, SIMPLICITÉ, VITESSE et INVARIANCE DU
DÉVELOPPEMENT : permet la description du LIGNAGE CELLULAIRE
COMPLET : séries reproductibles des divisions cellulaires par lesquelles un oeuf fertilisé produit un adulte, marqueur à haute résolution du sort cellulaire
SYSTÈME NERVEUX entièrement reconstruit par sections de ME
GÉNÉTIQUE : petite taille, développement rapide, reproduction par autofertilisation et croisement facultatif pour faciliter les analyses génétiques
ANALYSE MOLÉCULAIRE : génome séquencé et bien aligné en cartes
génétiques, permet un progrès rapide des analyses moléculaires génétiques
On peut les congeler et ils sont vivants quand on les décongèle
Décrit le lignage cellulaire embryonnaire de C. elegans
Toutes les divisions qui servent à faire le vers sont tjrs les mêmes chez chaque vers, c’est invariant, c’est stable donc est un bon syst donc on peut facilement voir des mutants
Ya des patterns d spécifiques pour les diff cell ex y’en a un que son destin est la mort donc a permis de trouver quels gènes sont nécessaires pur la mort cell (ced-3 et caspase-9 = gène pour apoptose)
Qu’est-ce qu’un promoteur?
formé de séquences d’ADN spécifiques reconnues par des facteurs de transcription,qui sont recrutés, avec l’ARN polymérase, sur le site pour initier la transcription.
bcp de gènes sont très conservés dans bcp d’sp mais les promoteurs neu sont pas bien conservés donc il faut trouver des promoteurs pour presque chaque sp diff
Qu’est-ce qu’un amplificateur?
ce sont des séquences d’ADN régulatrices qui, lorsqu’elles sont liées par des protéines spécifiques,
appelées activateurs, améliorent la transcription du gène associé
aug la trans, permet de contrôler le niveau d’expression
Qu’est-ce qu’un inactivateur?
c’est une séquence d’ADN qui
peut se lier à des facteurs de régulation de la transcription, appelés répresseurs.
Qu’est-ce qu’un transgène et un animal transgénique? Comment on les fait?
- Tout gène exprimé dans un animal qui ne porte pas normalement ce gène est appelé un transgène, et tout animal qui porte cet ADN étranger est appelé un organisme transgénique.
- Les scientifiques peuvent injecter ces transgènes dans des embryons pour créer des lignées transgéniques d’animaux qui passeront le transgène à leur descendance. Sinon, ces transgènes peuvent aussi être introduits directement dans des cellules ou des régions du cerveau.
Comment on fait une mouche transgénique?
• Le processus de fabrication d’une mouche transgénique utilise des
segments d’ADN spécialisés, endogènes appelés transposons
qui peuvent se déplacer d’une position à l’autre du génome.
• Ces séquences génétiques mobiles ont une sélectivité modeste de leur site cible dans le génome et peuvent donc s’insérer en des emplacements génomiques aléatoires.
• Dans la transposition, une enzyme appelée transposase agit sur
des séquences d’ADN spécifiques à la fin d’un transposon, en le
déconnectant d’abord de son ADN flanquant, puis en l’insérant dans un nouveau site d’ADN cible.
Comment se fait l’Injection de construction transgénique dans les mouches?
- Pour faire des mouches transgéniques, un chercheur va faire une micro-injection d’ADN transgénique dans le postérieur d’un embryon de Drosophile.
- Le chercheur injecte la construction transgénique dans un jeune embryon de Drosophile avec également un autre plasmide séparé contenant le gène codant pour la transposase
Comment on fait des vers transgéniques?
les vers ont un gonade; un long tube avec bcp de noyaux et injecte dans une partie ou ya pas de memb et noyaux vont vers là et gardent l’ADN comme un chromom extra (extra chromosomal array) mais le nbre de progéniteurs qui gardent le chrom est très instable
Un transgène est injecté dans la gonade d’un hermaphrodite
jeune adulte au moment où les embryons se divisent.
Vrai ou faux? le niveau d’expression est stable?
Le niveau d’expression est aléatoire et un transgénique est variablesi on aime notre transgénique, on doit faire un transgénique stable, on doit faire intégrer le chrom dans le génome
Comment on fait des poissons zèbres transgéniques?
injecte ADN avec un marqueur dans embryos de poisson zèbre et regarde les larves + tard
Comment on peut être sure que cette mutation est la cause d’un phénotype?
on fait un rescue test, injecte le gène dans le vers avec le gène muté pour voir si bon phénotype revient mais risque de fuck up l’injection donc on met un marqueur pour voir si, vue que ce gène est pour la peau, fluo sera dans la peau et si la forme revient normale, on sait que ce gène muté était la cause de la mutation
Comment contrôler quand et où un gène est exprimé?
facteur de trans devient actif avec le choc termique et fait trans des heat shock proteins
peut prendre promoteur du gène du choc thermique et l’utiliser pour causer expression d’un gène spécifique juste quand on cause choc thermique
On peut aussi faire l’expression des gènes par le stress; + stress, ya bcp d’expression de la prot, le promoteur rép au stress, pas de stress -> prot est pas exprimé, on contrôle quand le gène est exprimé
Comment on utilise des transgènes pour contrôler l’activité neuronale?
Optogénétique avec channelrhodopsin / halorhodopsin
activation avec lumière bleue -> dépola
activation avec lumière jaune -> hyperpola
Qu’est-ce que l’activation inductible de l’activité neuronale?
Channelrhodopsin-2: activation des neurones mécanosensoriels
mec-4 code pour un canal Na+, qui est exprimé dans les neurones mécanosensoriels. Ainsi, le promoteur mec-4 peut être utilisé pour exprimer des gènes spécifiquement dans les neurones mécanosensoriels.
Activer les neurones mécanosensoriels avec la lumière provoque des changements de
direction des animaux
Qu’est-ce que l’inhibition inductible de l’activité neuronale?
Halorhodopsin: inhibition des neurones moteurs
unc-17 code pour une vésicule synaptique de transport de l’acétylcholine, ainsi le promoteur unc-17 peut être utilisé pour exprimer des gènes dans les neurones moteurs
Inhiber les neurones moteurs avec la lumière provoque la paralysie des animaux.
Comment on observe l’activité neuronale?
Indicateurs transgéniques de Ca2+
e.g. GcaMP = fusion of green fluorescence protein (GFP), M13, and calmodulin (CaM)
CaM et GFP non lié à Ca2+ -> La structure permet la protonation
Faible absorbance de la lumière,
Pas de fluorescence
CaM et GFP lié à Ca2+ -> Changement conformationnel de CaM, Changement structurel
Déprotonation rapide de GFP,
Fluorescence lumineuse
Activité neuronale → fluorescence
Décrit le circuit neuronal de la mécanosensibilité chez C. elegans
Quand touche vers, sommation du circuit fait en sorte que vers change de direction ou pas mec-4 encode un canal sodique, et s'exprime dans les neurones récepteurs tactiles (neurones sensoriels).
Décrit la Dynamique du calcium dans les interneurones avant, pendant et après la stimulation des neurones mécanosensoriels
mec-4: est dans neurone mécanosensoriel, lumière active le neurone
rig-3: est dans interneurone, marqueur de Ca2+
quand allume lumière, vers change de direction et on peut regarder activité calcique
Lors de changement de direction, GCaMP aug bcp (activité neuronale aug bcp)
GCaMP est un marqueur de l’activité neuronale