Cours 7

Question 1

Comment se nomme la branche de Dr. Mueller?

Answer 1

Archéologie expérimentales et paléoéthnobotanique

Question 2

Que permet la comparaison de culture existante et disparue avec des plantes modernes?

Answer 2

Permet de savoir de ou viennent les plantes (enviro/climat), pourquoi on les utilise

Question 3

Est-ce que des fois l’industrialisation empêche de voir l’histoire des gens qui ont vécu ici avec les plantes?

Answer 3

Oui, mais montre aussi que ces plantes sont capable de résister à celle-ci

Question 4

Qu’est ce Dr Muller fait?

Answer 4

-Écologie historique
-Collaborer avec des généticiens

Question 5

Qu’est ce que la domestication?

Answer 5

-Un processus évolutif résultant de la modification par l’homme des écosystèmes et des pressions sélectives
-Une relation
-Des changements spécifiques dans les corps et les comportements des plantes/animaux
Ces changements peuvent être généralisés en tant que syndromes adaptatifs de la domestication, qui évoluent en réponse à des enviro anthropogéniques spécifiques et à des pratiques humains

Question 6

Qu’est ce qu’un syndrome adaptatif?

Answer 6

Une ensemble de caractéristiques similaires chez des organismes distants qui résulte d’une évolution parallèle ou convergente. Cette évolution se produit fréquemment dans la domestication.

Question 7

Exemples de syndromes adaptatifs, la pollinisation:

Answer 7

1) Pollinisation: 1. Par le vent: les fleurs mâles sont des chatons pendants et les fleurs femelles sont petites et sans odeur (parce que le vent ne peut pas les voir ou les sentir) 2. Par vibration: les anthères sont en tubes, le pollen est attaché mais peut être secoué en vibrant, les fleurs sont bleues et jaunes (les abeilles voient mieux les couleurs)

Question 8

Exemple de syndrome adaptatif, l’hypothèse du feuillage comme fruit:

Answer 8

-Les feuilles fonctionnent comme des fruits: elles incitent les dispersants animaux à consommer des graines qui sont indigestes
-Avantages évolutifs de la dispersion dans les excréments d’animaux : réduction de la compétition entre frères et soeurs + dispersion dirigée vers des ouvertures enrichies en azote (‘points chauds’)
-Absence de déhiscence des fruits mûrs (restent droits)
-Absence de structures spécialisées pour la dispersion
-Petites graines
-Protection robustes des graines
-Graines présentées au sommet de la plante

Question 9

Qu’est ce qu’un progéniteur sauvage?

Answer 9

L’espèce ancestrale à l’origine d’une espèce domestiquée

Question 10

Beaucoup de progéniteurs sauvages des cultures annuelles les plus importantes sont quoi?

Answer 10

Des mauvaises herbes

Question 11

Arguments sur les mauvaises herbes (2):

Answer 11

1) Une mauvaise herbe n’est pas seulement une plante indésirable
2) les mauvaises herbes devraient être définies en fonction de leur écologie (et non selon si on veut qu’ils soient la ou non)

Question 12

Caractéristiques écologiques des mauvaises herbes:

Answer 12

1. Pionnières des sols ouverts et des habitations humaines: a) suiveuses de camp b) plantes qui disputent aux hommes la possession du sol
2. Cosmopolites c’est à dire peu exigeantes

Question 13

Qu’est ce qui crée des habitats perturbés ou les mauvaises herbes pourraient prospérer?

Answer 13

Volcans, feux de forêts, animaux, les rivières

Question 14

Dire les étapes de la théorie à l’origine des mauvaises herbes:

Answer 14

1. Les humains perturbent une zone
2. Cette zone est colonisée par des plantes adventices
3. Les humains découvrent quelque chose d’utile à propos de ces mauvaises herbes et étendent la zone perturbée pour augmenter leur abondance
4. L’évolution d’espèces domestiquées se poursuit dans ces jardins naissants

Question 15

Quelle est l’hypothèse de Dr Mueller sur comment le syndrome de domestication des cultures annuelles de graines a évolué?

Answer 15

Un changement dans la dispersion des graines a entrainé ces changements:
-Disparition de la protection avec le temps
-Augmentation de la taille des graines
-Inhibiteurs de germinations réduits (pour germiner certaines plantes doivent expérimenter une longue période de froid ou de chaud/sec), germination uniforme

Question 16

Expliquez les termes prédateur de graines et disperseur de graines:

Answer 16

-Prédateur: exerce une pression sélective sur la population végétale pour éviter d’être mangé
-Disperseur: Ouvre des avantages sélectifs pour permettre aux graines d’être capturées

Question 17

Qu’est ce que l’endozoochrie?

Answer 17

Dispersion des graines dans les excréments d’animaux

Question 18

Preuves de la dispersion endozoochore des proches des cultures:

Answer 18

1) Circonstancielles:
-Absence de déhiscence des fruits mûrs
-Petites graines
-Protection robustes des graines
-Absence de structures spécialisées pour la dispersion
-Graines présentées au sommet de la plante
2) Expérimentales
3) Écologiques: regarder quelles graines dans le caca et regarder si sont capable de germiner hors du caca

Question 19

Hypothèses sur la dispersion endozoochore:

Answer 19

a) les humains ont d’abord été attirés par des peuplements denses et homogènes faciles à récolter, créées par la dispersion endozoochore vers des ‘points chauds’
b) Les humains ont pris le relais du dispersants de graines des grands herbivores, dont certains sont devenus extincts ou ont été domestiqués jusqu’à disparaitre
c) Les caractéristiques de la domestication (réduction protection des graines, augmentation taille des graines et perte de la dormance) peuvent toutes s’expliquer comme des réponses à ce changement de mécanisme de dispersion

Question 20

Est ce que les bisons ont joué un rôle dans la domestication des cultures perdues?

Answer 20

-Au moins 3 espèces de cultures perdues sont dispersées par les bisons modernes en liberté
-Le broutage et le suintement des bisons créent des zones denses de progéniteurs de cultures facilement récoltables

Question 21

Définition de la domestication par un archéologue:

Answer 21

Un processus évolutif conduit par la sélection qui transforme un organisme sauvage en un organisme plus adapté à l’utilisation humaine.
**Accent mis sur la sélection

Question 22

Comment les généticiens étudient la domestication?

Answer 22

-En décelant les signaux de sélection dans le génome parmi ceux d’autres types de changements évolutifs (dérive, flux génétique)
-La domestication agit sur des parties du génome qui affectent les phénotypes qui affectent la fitness
-Flux génétique: des progéniteurs et d’autres populations domestiquées

Question 23

Quel est le coût de la domestication?

Answer 23

-Peut entraîner des effets fondateurs et des goulots d’étranglement
-Charge génétique: accumulation d’allèles délétères (non bénéfiques) mais non létaux qui entraient une baisse de la fitness

Question 24

Qu’est ce que les centres d’origines de Vavilov?

Answer 24

-La dérive et le flux génique ne sont pas seulement des sources de variation que nous devons éliminer pour arriver aux effets de la sélection, ils nous renseignent aussi sur le processus de la domestication en soi: d’ou et de quelle population sont issus les domestications? Quelles pop se sont hybridés pour former des pop domestiquées?

Question 25

Comment établissons-nous le lien entre le changement génotypique et le changement phénotypique? Approche descendante:

Answer 25

-Commencez par le phénotype d’intérêt
-Croisez des populations ségrégantes (pop qui expriment le phénotype et celles qui ne l’expriment pas)
-Effectuez une cartographie génomique
-Trouvez les régions qui diffèrent
-Quand nous savons quelles parties du génome codent pour un phénotype associé à la domestication: Nous pouvons le découvrir en utilisant l’élevage: faire des croisements entre des individus qui diffèrent par les traits d’intérêt, puis génotyper les descendants qui diffèrent dans l’expression du trait
-Cela peut prendre bcp de temps et est plus réalisable avec des espèces modèles et des traits faciles à mesurer

Question 26

Comment établissons-nous le lien entre le changement génotypique et le changement phénotypique? Approche ascendante:

Answer 26

-Recherchez la signature d’une sélection inégale dans le génome
-Ensuite, essayez de comprendre ce que font ces régions
-Peut détecter les gènes sous-jacents au développement ou aux traits biochimiques qui ne sont pas évidents dans le phénotype
-Peut aussi analyser le génome à la recherche de régions qui devient du schéma neutre de sélection à l’échelle du génome
-Les régions présentant une très faible diversité génétique indiquent des balayages sélectifs, ou une mutation avantageuse est devenue dominantes car elle conférait un fort avantage sélectif

Question 27

Quand on est à la recherche de la sélection, qu’est ce qui est compliqué chez les végétaux?

Answer 27

-Les plantes peuvent avoir des génomes très grands, et il y a une grande variabilité
-Les gens n’ont pas autant travaillé sur les plantes que sur les animaux, donc il y a moins d’espèces modèles et moins de connaissances sur la fonction des gènes et la structure des réseaux de régulation

Question 28

Qu’est ce que la polyploïdie?

Answer 28

-Condition héréditaire de posséder plus de deux ensembles complets de chromosomes
-Complication propre aux plantes et aussi quelques poissons et amphibiens

Question 29

Quel est la taille du génome du blé versus celui des humains?

Answer 29

Blé tendre: environ 17 GB (milliard)
Humain: 3,5 GB

Question 30

Pourquoi utilise t’on des génomes d’insectes herbivores pour suivre les cultures?

Answer 30

-Quand les cultures se propagent, elles subissent souvent des goulot d’étranglement génétiques
-Les régions présentant la plus grande diversité génétique sont supposées être les régions d’origine
-Mais les génomes des plantes sont souvent énormes et inaccessibles…les entomologistes à la rescousse