Cours 9 Flashcards

(53 cards)

1
Q

Pourquoi les recepteurs InsulinR et EGFR sont beaucoup etudiés?

A

Car ils jouent un role dans le cancer

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Q

Quelle est la structure d’un RTK (recepteur tyrosine kinase)?

A

1 seul passage transmembranaire, agit en dimere

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Q

Quelles sont les 3 segment d’un recepteur?

A
  • N-terminal (grande diversité)
  • Transmembranaire (sequence d’a.a hydrophobes —> sert a ancrer la prot. dans la memb.)
  • C-terminal : domaine kinase peut etre separé en 2 classes : —> domaine kinase continue
    —> domaine kinase séparé par sequences d’a.a
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4
Q

Quelles sont les caractéristiques du recepteur EGF?

A
  • 4 recepteurs (EGFR, ErbB2, ErbB3, ErbB4)
  • 11 ligands
  • ErbB2 : pas de ligand
    -Possibilité d’hétéro ou homodimerisation sauf pour ErbB2 et 3 (ne fonctionne qu’en heterodimere (pas possibilité d’etre homodimere))
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5
Q

Expliquez le processus de formation de dimeres chez EGFR

A

En absence de ligand (ex: EGF), le recepteur est monomerique, lorsque le ligand se lie —> changement conformationnel qui pousse le recepteur à se lier a un autre recepteur pour former un dimere (pas le ligand qui induit la dimerisation, points de contact entre recepteurs (bras de dimerisation))

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6
Q

Vrai/faux :tout travail en complementarité dans les EGFR et un motif present en N-terminal est important pour la phosphorylation induite par EGF

A

vrai

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7
Q

Comment la dimerisation de la partie intracellulaire fonctionne-t-elle?

A

Dimerisation asymetrique des domaines cellulaires, la partie amino-terminale d’un recepteur interagit avec la partie carboxyle terminale d’un autre recepteur (interaction dynamique —> 2 monomeres seront phosphorylés)

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8
Q

Comment inhiber la fonction des RTK?

A
  • En utilisant des bloqueurs qui vont empecher la liaison du ligand —> donc empeche l croissance (AC meilleurs bloqueurs : bloque le site extracellulaire qui interagit avec ligand)
  • En utilisant des inhibiteurs qui vont bloquer l’activité tyrosine kinase du recepteur
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9
Q

Quelles sont les differences entre RCPG et TRK?

A

RCPG: - 7 passages TM
- aucune activité enzymatique intrinseque (facteur echange pour proteine G)
- Dimerisation homo-hetero possible, mais non-essentielle
- liaison du ligand peut induire de multiples conformations 3D

TRK: - 1 passage TM
- Activité tyrosine kinase
- dimerisation obligatoire
- liaison ligand stabilise une conformation qui permet aux domaines intracellulaires de se phosphoryler

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10
Q

Quel est le mecanisme de signalisation du RTK?

A
  • ligand arrive
  • changement conformation
  • dimerisation
  • phosphorylation
  • recrutement proteines adaptatrices
  • assemblage de complexes de signalisation
  • activation des effecteurs
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11
Q

Les RTK activés forment des complexes avec quels domaines? quelle est la difference majeure entre ces deux domaines? Quelles liaisons en decoulent?

A
  • PTB et/ou SH2
  • PTB peut se lier a la tyrosine phosphorylée ou non mais SH2 doit se lier a la tyrosine phosphorylée seulement
  • PTB et SH2 se lie à PH qui se lie au differents phopshoinositides membranaires (mene a leur recrutement aux membranes) —> SH3 et WW se lie a des sequences riches en Proline —> Domaine PDZ se lie aux residus hydrophobes au c-terminal de proteinsc cible —> FYVE se lie au Phosphotydil inositol 3- phosphate
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12
Q

Comment les proteines adaptatrices font-elles pour interagir avec les recepteurs activés?

A

Elles ont des domaines d’interaction proteine-proteine pour transmettre le signal

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13
Q

Vrai/faux : étant donné que les domaines PH sont formés de differents a.a, la structure peut varier d’un a l’autre

A

Faux : meme si differents a.a, la structure reste la meme

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14
Q

uelles sont les 4 classes d’interaction PDZ?

A
  • Reconnaissance de domaines C-term dans les peptides
  • Reconnaissance de motifs internes dans les peptides
  • Dimerisation PDZ-PDZ
  • Reconnaissance de lipides
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15
Q

Quel domaine est le plus rencontré?

A

PDZ

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16
Q

Quels sont les 3 genes de Ras?

A

H-Ras, N-Ras, K-Ras

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17
Q

Quel est le processus de l’activation de la voie MAPK?

A
  • Recrutement proteines adaptatrices : Shc et/ou Grb2 —> recrutement SOS
  • Activation des Ras (GDP—>GTP)
  • Activation des MAPKs
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17
Q

Quelles sont les 4 differentes voies de signalisation pouvant etre activée par EGFR?

A
  • MAPK
  • PI3K (proliferation cell.)
  • PLC-gamma
  • STAT (reponse cell., reponse cytokines)
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18
Q

Quel est la fonction de Grb2? Le role?

A
  • Proteine adaptatrice qui sert a lier des proteines de signalisation au recepteur activé
  • Développement, differentiation et proliferation
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19
Q

Que se passe-t-il si on enleve Grb2 (Grb2-KO)?

A

Mort embryonnaire rapide

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20
Q

Quelle est la fonction de Ras?

A

Proteine G monomerique ou GTPase

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21
Q

Vrai/faux: Ras est l’oncogene le plus retrouvé dans les cancers

22
Q

A quoi sert GEF dans le cycle du GTP pour l’activation de Ras? Le role de GAP?

A
  • Il se lie à Ras inactive et change le GDP pour un GTP —> la rend active
  • GAP active la GTPase —> rend Ras inactive
23
Q

Quels sont les roles de la voie PI3K?

A
  • proliferation
  • differenciation
  • motilité
  • trafic intracellulaire
24
Combien y a-t-il de classes de PI3K? Quelles sont les particularités de la classe II et III?
- 3 classes - Classe II : unités catalytiques seulement - Classe III : unités catalytique et regulatrice
25
Qu'est-ce que l'Akt? Combien y a-t-il d'isoformes d'Akt? Qu'est-ce qui influence la presence d'un isoforme plutot qu'un autre? Dans quelle voie de signalisation est-elle impliquée?
- Aussi connue sous le nom proteine kinase B (PKB) - Serine/threonine kinase - 3 isoformes: peuvent differer selon la conformation ou le site de liaison qui est phosphorylé - Impliquée dans voies de signalisation de PI3K menant au processus anabolique
26
Quelle est le processus d'activation de la phospholipase C?
- Recrutement PLC-gamma - Transformation des lipides membranaires - Signalisation PKC et Ca2+-dependante
27
Combien d'isoformes de PLC y a-t-il chez l'humain?
2 —> PLCg1 et PLCg2
28
Pourquoi la PLCg peut etre activée par des RTK?
car elle possede 2 domaines SH2 et un domaine SH3 localisés entre un domaine PH divisé
29
Comment se fait l'endocytose des RTK?
- une vesicule de clathrine se forme - amene le recepteur a endosome immature —> enleve le ligand et dephosphoryle - Fast recycling ou slow recycling et retour a la surface
30
Qu'est-ce que Eps15?
Une proteine adaptatrice importante pour « regulating intracellular trafficking »
30
Qu'est-ce qui cause le developpement d'une resistance au inhibiteurs des RTK?
La surexpression d'Axl (atteint les memes effecteurs que RTK donc compense pour RTK pas fonctionnel et proliferation cancer continue)
31
Qu'est-ce que JAK et STAT?
- JAK est une tyrosine kinase qui necessite une dimerisation heterologue - STAT sont des facteurs de transcriptions cytosoliques qui doivent etre phosphorylé pour entrer dans le noyau
32
Quelle est le processus de la voie d'activation JAK/STAT?
- Mesure du niveau de phosphorylation de STAT - Dimerisation des STAT - Translocation nucleaire
33
Vrai/faux: il est maintenant possible avec les differentes technologies de bloquer une seule voie de signalisation avec un bloqueur
Faux: il n'est que possible de bloquer un recepteur generique, qui bloquera donc toutes les voies de signalisations qui en decoulent
34
Quelle est la structure des recepteurs tyrosine phosphatase (RTP)?
- Differe principalement dans la partie extracell. - Partie intracell. contient deux domaines : domaine proximal (activité enzymatique) et domaine distal (essentiel pour activité, spécificité, stabilité et interactions prot-prot)
35
Quelle est la majeure difference entre RTK et RTP?
RTK phosphoryle tandis que RTP dephosphoryle des proteines intracellulaires
36
Comment fonctionne l'activation des recepteurs de type TGFβ (serine/threonine kinase)
- Dimerisation et recrutement d'un 2e type de recepteur - TGF-β se lie au recep. de type II qui recrute et phosphoryle les recep. de type I - Recep. I phosphoryle effecteurs (Smads (facteurs de transcription)) - Smads forment un complexe avec Smad 4 pour transloquer au noyau ** certains Smad ont un effet negatif et recrutent E3 ubiquitine ligase
37
Comment fonctionne les recepteurs de type ANP (ANF) (guanylyl cyclase)?
- NPR-C est un recepteur de clearance, qui ne possede pas d'activité enzymatique : lie ANP, BNP et CNP - NPR-A : lie ANP et BNP - NPR-B : lie CNP **- NPR-A et B sont phosphorylés de facon maximale a l'etat basale et forment des oligomeres (2,3,4) - liaison du ligand produit une dephosphorylation de ces recepteurs et une augmentation du GMPc - GMPc controle activation de canaux ioniques, PKG, phosphodiesterases et AMPc
38
Qu'est-ce que la PKG?
- Proteine kinase G - Ser/thr kinase - 2 types : PKG-I (alpha et beta), PKG-II - homodimeres
39
Qu'est-ce que PDE?
- enzymes qui degradent le lien phosphodiester - 11 types (PDE1 à 11) (AMPc et GMPc) - PDE5 : GMPc selective
40
Quels sont les 3 recepteurs a activité enzymatique intrinseques autres que RTK?
- Recepteurs tyrosine phosphatase - Ser/thr kinase - Guanylyl cyclase
41
Quelles sont les ressemblances/differences entre RCPG et les recepteurs activité enzymatique?
- Mode d'activation pareil : changement conformationnel induit pas la liaison d'un ligand - Effet de l'activation : —> RCPG : Activation de proteins G et productions de seconds messagers —> R activité enzymatique : transphosphorylation du recepteur et recrutement de proteines adaptatrices et de signalisation - Controle du signal : —> RCPG : desensibilisation et internalisation —> R act. enzy. : Dephosphorylation et internalisation
42
Comment sont activés les recepteurs nucleaires?
par des hormones lipophiles (capables de diffuser d'une source et penetrer une cible)
43
Qu'est-ce qui permet aux recepteurs nucleaires de se lier a l'ADN directement?
La presence du domaine de liaison a l'ADN (DBD), qui contient 2 motifs de type « ZN finger »
43
Qu'est-ce qu'incluent les recepteurs nucleaires? Cb y en a-t-il chez l'humain?
- 48 chez humain - incluent : —> recepteurs nucleaire hormonaux (NHR) et orphelins —> recepteurs cytosoliques en complexe avec un inhibiteur —> recepteurs nucleaires associés a l'ADN
44
Quelle est la structure d'un recepteur nucleaire?
- domaine de liaison a l'ADN (DBD) - Domaine de liaison du ligand (LBD) **homo ou heterodimeres
45
Quels roles ont les co-regulateurs des recepteurs nucleaires?
- Supportent l'activité du nucleosome - Fonctionnent pour former un complexe transcriptionnel actif avec la polymerase
45
Quels roles ont les co-activateurs des recepteurs nucleaires?
- promouvoir activité transcriptionnelle - controlent les differentes etapes du processus de transcription - s'assemblent a un complexe de haut poids moleculaire - Employés pour la transcription de plusieurs genes puisque c'est le recepteur qui est responsable de la specificité **ne se lient pas a l'ADN
46
Quels sont les 4 types de recepteurs nucleaires?
1- recepteur nucleaire endocrine (homodimere), presents dans le cytoplasme 2- RXR partner: principalement dans le noyau, si pas de ligand souvent en complexe avec des co-represseurs (forme homo ou heterodimere) 3- Recepteur nucleaire orphelin dimere (liaison de l'agoniste resulte en formation dimere homo souvent et hetero possible aussi) 4- recepteur nucleaire orphelin monomere
47
Vrai/faux : RXR doit toujours lier son ligand
Faux : parfois il peut lier seulement l'autre recepteur avec qu'il est en dimere (recepteur agit comme modulateur allosterique)
48
Nommez un exemple pour les recepteurs nucleaire de classe I et 2
- Classe 1 : recepteurs des oestrogenes - Classe 2 : VDR —> recepteur de la vit. D
49
Quelles sont les deux possibilités de signalisation cellulaire? nommez un exemple de chaque
- Divergence des signaux (1 signal pour plusieurs effecteurs) (ex: migration cellulaire) - Convergence des signaux (plusieurs stimuli pour une reponse) (ex: contractilité cardiaque, augmentation calcium)