Developing specific molecular biomarkers for thermal stress in salmonids Flashcards
DOI: https://doi.org/10.1186/s12864-018-5108-9 Autores: Arash Akbarzadeh, Oliver P Günther, Aimee Lee Houde, Shaorong Li, Tobi J Ming, Kenneth M Jeffries,Scott G Hinch5 and Kristina M Miller1 (51 cards)
Q: ¿Cuál es el objetivo principal del estudio en el documento?
A: Identificar biomarcadores térmicamente sensibles robustos en salmónidos que puedan monitorear firmas fisiológicas moleculares del estrés térmico crónico utilizando muestreo no letal de tejido branquial.
Q: ¿Por qué se consideran los salmones del Pacífico buenos indicadores biológicos de los efectos del calentamiento climático?
A: Porque su ciclo de vida anádromo los expone a desafíos ambientales tanto en ambientes marinos como de agua dulce.
Q: ¿Cuáles son los principales tipos de estresores que pueden afectar a los organismos vivos?
A: Factores naturales como temperatura, oxígeno, salinidad, pH, desecación y luz ultravioleta, así como factores antropogénicos como metales pesados y contaminación térmica.
Q: ¿Cómo afecta el estrés térmico a los salmónidos a niveles subletales?
A: Puede bloquear la migración, reducir el crecimiento, estresar a los peces, aumentar la susceptibilidad a enfermedades, afectar la reproducción y la esmoltificación, y alterar la dominancia competitiva.
Q: ¿Cuántas características de microarrays relacionadas con IDs de genes únicos fueron seleccionadas como candidatos a biomarcadores de estrés térmico crónico?
A: Ochenta y dos características de microarrays relacionadas con 39 IDs de genes únicos.
Q: ¿Qué método se utilizó para identificar candidatos a biomarcadores de estrés térmico en el estudio?
A: Una combinación de minería de datos de microarrays de varios estudios y minería profunda de la literatura.
Q: ¿Qué tipo de ensayos de expresión génica se desarrollaron para evaluar la actividad de los genes candidatos?
A: Ensayos de PCR cuantitativa de transcripción inversa (qRT-PCR).
Q: ¿Cuántos genes únicos mostraron una respuesta fuerte y robusta al estrés térmico crónico?
A: Ocho genes, incluyendo dos transcritos de cada SERPINH1 y HSP90AA1, FKBP10, MAP3K14, SFRS2 y EEF2.
Q: ¿Qué genes están incluidos en el panel para detectar el estrés térmico en el salmón?
A: SERPINH1, HSP90AA1, FKBP10, MAP3K14, SFRS2 y EEF2.
Q: ¿Cuál es el papel de las proteínas de choque térmico (HSPs) en respuesta al estrés térmico?
A: Funcionan como chaperones moleculares para ayudar a replegar proteínas desnaturalizadas y proteger las células del daño por estrés.
Q: ¿Por qué es ventajoso el muestreo no letal de tejido branquial para monitorear el estrés en el salmón?
A: El tejido branquial contacta directamente con el entorno externo y puede ser muestreado sin matar al pez, permitiendo medidas repetidas y conservación de la especie.
Q: ¿Cuáles son las implicaciones de las temperaturas ambientales elevadas en organismos ectotermos como los salmónidos?
A: Las temperaturas elevadas pueden causar estrés fisiológico, afectar el crecimiento y desarrollo, y aumentar las tasas de mortalidad.
Q: ¿Qué plataforma de alta capacidad se menciona como útil para evaluar la expresión génica en la investigación del salmón?
A: La plataforma Fluidigm BioMark™.
Q: ¿Cómo reaccionan típicamente los genes de respuesta al choque térmico al estrés térmico?
A: Son regulados al alza para ayudar a mitigar los efectos de las temperaturas elevadas en las funciones celulares.
Q: ¿Cuál es la importancia del gen SERPINH1 en la respuesta al estrés térmico?
A: SERPINH1 codifica una proteína de choque térmico que ayuda en el plegamiento adecuado del colágeno bajo condiciones de estrés.
Q: ¿Cómo contribuye el gen HSP90AA1 a la respuesta al estrés térmico en el salmón?
A: HSP90AA1 codifica una proteína de choque térmico involucrada en el plegamiento, estabilización y degradación de proteínas bajo estrés.
Q: ¿Qué papel juega el gen FKBP10 en la respuesta al estrés térmico?
A: FKBP10 codifica una proteína que actúa como chaperón en la biosíntesis de colágeno y ayuda a mantener la homeostasis celular bajo estrés.
Q: ¿Cuál es la función del gen MAP3K14 en la respuesta al estrés térmico?
A: MAP3K14 codifica una quinasa involucrada en vías de transducción de señales que regulan las respuestas inmunes y la supervivencia celular bajo estrés.
Q: Describe el papel del gen SFRS2 en el estrés térmico.
A: SFRS2 codifica un factor de empalme que ayuda a regular la expresión génica a nivel de ARN durante condiciones de estrés.
Q: ¿Qué codifica el gen EEF2 y cuál es su papel en el estrés térmico?
A: EEF2 codifica una proteína involucrada en la fase de elongación de la síntesis de proteínas y es crítica para mantener la producción de proteínas bajo estrés.
Q: ¿Cómo se relaciona el estrés oxidativo con el estrés térmico en salmónidos?
A: El estrés térmico puede aumentar la producción de especies reactivas de oxígeno, llevando a daño oxidativo y la necesidad de defensas antioxidantes mejoradas.
Q: ¿Cuál es la importancia de los genes de biosíntesis de proteínas en la respuesta al estrés térmico?
A: Son cruciales para mantener la producción y reparación de proteínas durante periodos de temperaturas elevadas.
Q: ¿Por qué se dirige específicamente el tejido branquial para monitorear el estrés térmico en el salmón?
A: Porque el tejido branquial está en contacto directo con el entorno externo y refleja el estado fisiológico del pez bajo condiciones de estrés.
Q: ¿Cómo afecta la exposición prolongada al estrés térmico a la supervivencia a largo plazo de los salmónidos?
A: La exposición prolongada reduce las reservas de energía, aumenta la susceptibilidad a enfermedades y disminuye las posibilidades generales de supervivencia.
