Gastcollege

Question 1

Wat zijn bronnen van niet-humaan DNA?

Answer 1

bloed, haren, pollen, botten, darmflora etc.

Question 2

Waaruit en waarom wordt autosomaal DNA gehaald?

Answer 2

Celkern, voor een volledig DNA profiel

Question 3

Wat is DNA-barcoding?

Answer 3

Het bepalen van soorten aan de hand van korte genetische merkers uit het DNA.

Question 4

Wat is de procedure van DNA-barcoding?

Answer 4

1. DNA extractie
2. PCR
3. DNA sequencing PCR product
4. Vergelijking Database

Question 5

Hoe worden referentie sequenties gemaakt?

Answer 5

Collecties van musea, botanische tuinen, dierentuinen.

Question 6

Wat is metabarcoding en hoe wordt dit gedaan?

Answer 6

Gelijktijdige identificatie van aanwezige soorten in mengmonsters. Met NGS

Question 7

Wat is de procedure van metabarcoding? (5)

Answer 7

DNA extractie, amplificatie, sequensen, databank, identificatie

Question 8

Waarvoor wordt DNA-fingerprinting gebruikt?

Answer 8

Identificatie van een individu.

Question 9

Wat zijn de beperkingen van DNA-fingerprinting?

Answer 9

• Voor beperkt aantal soorten DNA-merkers beschikbaar
• Hoge kosten ontwikkeling merkers
• Hoge allelfrequenties in kleine populaties, meer merkers nodig voor uniek DNA-profiel
• Validatie merkerset vaak lastig, beperkte bewijslast

Question 10

Hoe worden soortspecifieke STR loci opgespoord?

Answer 10

• Sequencen genoom (NGS) v.d. soort
• Opsporen repeats
• Primers ontwikkelen om de STR loci te kunnen amplificeren
• De STR loci testen op polymorfisme

Question 11

Wat doet CITES? (3)

Answer 11

• Vergunningen voor handel of bezit bedreigde diersoorten
• Controleren en handhaven door NVWA, douane en politie
• Door Gendika o.a. ouderschapsbepalingen vogels