Uitdagingen | Degradatie

Question 1

Wat gebeurt er bij DNA degradatie?

Answer 1

Willekeurig afbreken van DNA strengen door:
Water, zuurstof, UV, nucleases

Question 2

Wat doen endogene nucleases?

Answer 2

afbreken celmembranen

Question 3

Wat doen exogene nucleases?

Answer 3

Maken O-verbindingen in P-groep

Question 4

Waar is nucleases afhankelijk van?

Answer 4

PH, temp, kationen, expressieniveau

Question 5

Wat zijn 3 typen niet-enzymatische afbraak?

Answer 5

Hydrolyse, Oxidatie en UV-straling

Question 6

Wat gebeurd er bij Hydrolyse?

Answer 6

Basen breken af van ruggengraat. Aminegroepen breken af van basen.

Question 7

Waar is hydrolyse afhankelijk van?

Answer 7

Temperatuur, pH

Question 8

Waar richt oxidatie zich op?

Answer 8

Desoxyribose groep, hydantoinen, crosslinking

Question 9

Wat is het gevolg van oxidatie?

Answer 9

Polymerase kan niet meer verlengen.

Question 10

Wat is het gevolg van UV-straling?

Answer 10

Crosslinking, Dimeervorming, breken van strengen en oxidatie

Question 11

Hoe kun je degradatie controleren?

Answer 11

1. sample op agarosegel
2. controlesample
3. ladder
   –> goed sample = duidelijk bandje
   slecht sample = veeg

Question 12

Wat kun je doen om gedegradeerd materiaal te gebruiken?

Answer 12

1. nieuwe markers ontwikkelen
2. DNA repareren m.b.v. enzymen
3. miniSTRs

Question 13

Wat wordt er onderzocht met miniSTR?

Answer 13

Hetzelfde aantal STRs, maar met andere primers.
primers dichter op elkaar = kleiner PCR product

Question 14

Wat zijn de nadelen van miniSTR’s?

Answer 14

• Ongeveer dezelfde groottes
• Statistisch minder significant
• mutaties