Génétique bactérienne Flashcards
(109 cards)
1
Q
quel est le dogme de la biologie moléculaire
A
réplication, transcription, traduction et protéine
2
Q
quels sont les modes de résistance et cibles des antibiotiques
A
a - altération de la perméabilité
b - modif ou destruction de l’antibio
c - modif ou changement de la cible
3
Q
les bactéries possedes un noyau?
A
non
4
Q
chez la bactérie, comment un appelle la structure qui assure un empaquetage compact du matériel génétique
A
nucléoide
5
Q
les bactéries ont combien de chromosome circulaire
A
un seul
6
Q
quel est la taille du chromosome escherichia coli
A
4639 kilo paire de base
7
Q
quel est la taille du chromosome vibrio cholerae
A
2961 et 1072 kilo paires de base
8
Q
quel est la taille du chromosome haemophilus influenzae
A
1830 kilo paires de base
9
Q
quel est la taille du chromosome mycoplasma pneumoniae
A
816 kilo paires de base
10
Q
le génome humain contient combien de paire de base et de genes
A
soit 3 milliard de paire de base et 22000 genes
11
Q
combien de gene a la bactérie E coli
A
4300 genes dispersés sur un chromosome de 1.4mm
12
Q
qu’est ce qu’un plasmide chez la bactérie
A
ce sont des elements extra chromosomiques (molécule circulaire bihélicales) capable de se répliquer de facon indépendante par rapport au chromosome principal
13
Q
le plasmide est plus petit ou plus grand que le chromosome bactérien
A
plus petit (1 a 1000 kilo paire de base)
14
Q
est ce que les plasmides code des fonctions essentiels a la cellule
A
non
15
Q
quel avantage le plasmide apporte a la bactérie hote
A
de l’info portant sur
- la résistance aux antibio
- capacité métabolique suppl
- facteur favorisant l’infection
16
Q
les bactéries se divisent de quelle facon
A
par fission binaire
17
Q
quel est le tps de génération de E coli dans des conditions optimales
A
20 min
18
Q
ADN est le support de quoi
A
de l’info génétique
19
Q
a quoi a trait le concept fondamental en génétique bactérienne
A
le mécanisme de base de régulation
20
Q
pk la bactérie n’active le sys que si elle en a besoin
A
pour minimiser ses dépenses énergétiques
21
Q
que fait la bactérie en l’absence de substrat
A
elle évite de produire des enzymes mais elle est tjrs prete a en produire si nécessaire
22
Q
quels sont les types de régulation
A
1- changement ds la séquence ADN
2- changement ds le nb de transcrit (transcriptionnelle)
3- changement ds la quantité de produit de gene actif (post-transcriptionnelle)
23
Q
les changements ds la séquence dADN engendre quoi
A
amplification de gene
réarrangement de gene (mutation)
24
Q
les changements ds le nb de transcrit engendre quoi
A
des activateurs
des répresseurs
25
les changements ds la quantité de produit de gene actif engendre quoi
ajout de cofacteur ou groupe prostétique
clivage protéolytique
intéractions avec d'autres macromolécules
26
sous quoi est le controle du gene tetB et a quoi sert il
sous le controle du gene répresseur tetR
| peremt aux bactérie des résister à la tétracycline (un antibio)
27
quel gène est précédé d'un promoteur dans lexxemple de tet B, tetR
tetB et tetR
28
comment son positionne les gene tetB et tetR lun par rapport a lautre
le tetR est situé sur le gene complementaire qui va en direction oppose
29
que se passe -t-il en l'absence de trétracycline
la protéine du répresseur (R) est produite et vient bloquer le promoteur de tetB et son propre promoteur = empeche la transcription des 2 genes
30
que se passe- t-il en présence de trétracycline
l'antibio vient se complexer a la protéine du répresseur la rendant ainsi incapable de bloquer le promoteur de tetB = permet la transcription et la traduction qui permettra la production de la protéine tetB responsable de la résistance a la tétracycline
31
quelle est la condition pour une régulation négative dans les gene de résistance
présence d'un répresseur
32
en quelle mode est le répresseur par défaut et pk
en mode ON pour l'attachement a l'ADN dans la région du promoteur/opérateur
33
que fait le répresseur seulement en présence de tétracycline
ne peut plus s'attacher a ADN pour bloquer la région du promoteur/opérateur et donc réprimer la transcription
34
le répresseur peut il exercer son action de répresseur en présence de tétracycline
non alors la transcription devient possible et cela va permettre la production de la pompe tetB et de la protéine répresseur tetR
35
la production de tetB et tetR est inductible par la présence de quoi
la tétracycline
36
pour que la régulation et l'autorégulation des genes se fasse, il faut que la cellule soit ds un état métabolique acitf vrai ou faux
vrai
37
dans quelle de ses phases, la régulation sera la plus rapide
1- croissance exponentielle
2- latente ou de plateau
3- décroissance
1
38
la régulation est un processus comprenant des boucles de controle vrai ou faux
vrai
39
quelles stratégies ont développées les bactéries pour controler l'activation ou l'inactivation de leur genes
1- régulation transcriptionnelle (négatif=répresseur et positif= activateur, les 2 pouvant etre inductible et répressible
2- regroupement des genes adjacents ds un opéron
3- controle de plrs genes non contigus ds un régulon (m protéine régulatrice)
4- controle de plrs genes non contigus ds un stimulon (m stimulus)
5- régulation au niveau traductionnel
40
c'est quoi une mutation
modif de la séquence des nucléotides de ADN
41
les modif de la mutation sont transmises a quelle cellule
cellule fille
42
les mutations peuvent etre de quel type
spontanée ou induite
43
les mutations spontanée sont causées par quoi
par l'action des radiations naturelles (rayons cosmiques) ou etre le résultat d'erreur survenues lors de la réplication
44
les erreurs survenues lors de la réplication sont elles fréquentes dans les mutations spontanées
non, 10^-7 a 10^-11 par paire de base durant une ronde de réplication bactérienne
45
quelle est la polymérase la moins fidele lors d'une réolication
celle du rétrovirus VIH avec une fréquence d'erreur de 10^-4 par paire de base par ronde de rétrotranscription
46
les altérations de ADN causés par les mutations peuvent etre de diff nature
1- délétion ou insertion de nucléotide
| 2- substitution de nucléotide (silencieuse, mauvais sens et non sens
47
ou retrouve ton les modif provoqué par les mutations
dans le génome de la descendance du mutant
48
quel est le terme employe pour décrire la séquence nucléotidique précise du génome
le génotype
49
le phénotype est formé par quoi
par les propriétés des mutants
50
exemple de phénotype
une mutation occasionnant une imperméabilité a un antibio, l'altération de cet antibio ou de sa cilbe, provoque un phenotype de résistance aux antibio
51
que peut affecter le phénotype
```
1- la mobilité
2- la présence d'une capsule
3- l'apparence des colonies
4- les éléments nutritionnels requis
5- résistance aux antibio
```
52
nomme 2 caractéristiques des phénotypes
observable et sélectionnables
53
quel est l'avantage pour la bactérie d'etre sélectionnables
dans un env avec condition sélective, ces bactéries pourront croitre plus rapidement que les parents et ainsi les remplacer pour former la majorité de la population (ex: phénotype de résistance aux antibio)
54
vrai ou faux, la pression sélective cré la mutation
faux. la mutation est créé au hasard et existait avant que le pression sélective ne s'exerce
55
les mutations des bactéries sont elle tjrs bénéfiques pour elle
non, elles entrainent souvent des effets néfastes
56
comment les effets néfastes des mutations bactérielles sont elles minimisées
par l"utilisation de systeme de réparation ( essentiel a la survie des bactéries)
57
nomme 5 groupes de sys de réparation pour ADN bactérien
1- réparation direct de ADN
2- réparation par excision
3- réparation par recombinaison
4- réponse SOS (simule transfert des genes)
5- réparation sujette a erreur (induit des mutations)
58
est ce que les bactéries on t des reproduction sexuéé
non. elle échange info génétique entre les cellules = transfert horizontal
59
nomme 3 mécanismes d'échange de gene chez la bactérie
1- transformation
2- conjugaison
3- transduction
60
la transformation a été décrite pour la premiere fois en quelle année et quelle espece
en 1926 chez les pneumocoques
61
les bactéries avec capsule formant des colonies avec morphologie smooth(S) sur gélose tuent les souris infectéés?
oui
62
les bactéries sans capsule formant des colonies avec morphologie rought(r) sur gélose tuent les souris infectéés?
non
63
qu'a ton découvert en mélangeant les (S) mortes avec (R) vivante?/
les (R) ont été transformés en bactérie (S) et que le principe transformant était dans ADN libéré par les bactéries (S) tuées
64
comment se nomme la capacité d'une cellule a etre transformé par de ADN externe
la compétence
65
de quelle facon est acquise la compétence
1- exposition a des agents chimiques (CaCl2)
2- exposition a des agents physique (décharge électrique)
3- de facon naturelle chez certaines especes
66
nomme 4 bactéries ou la compétence se fait de facon naturelle
1- bacillus sp
2- haemophilus influenzae
3- neisseria sp (gonocoque, méningocoque)
4- streptococcus pneumoniae (pneumocoque)
67
la transformation est plus efficace entre bactéries de meme espece ou d'espece différente
meme espece
68
qu'est ce que la conjugaison
c'est l'échange de matériel génétique qui ressemble le plus a un échange de type sexuel chez les bactéries
69
comment se fait la conjugaison
requiert des contacts cellule-cellule, de facon unidirectionnel, soit de cellule male a femelle
70
en général, les genes nécessaires a la conjugaison sont codés par de gros plasmides que l,on nomme
plasmides conjugatifs
71
comment se nomme le + connu des plasmides conjugatifs
le facteur de fertilité F de E coli
72
les plasmides conjugatifs de type R sont présents autant chez les bactéries a Gram négatif que positif (streptococcus vs clostridium)?
oui
73
comment se fait la conjugaison chez les bactéries Gram + et -
utilisation d'un mécanisme distinct du pli sexuel afin d'assurer le rapprochement entre les cellules donatrice et réceptrice
74
comment se nomme le mécanisme ou les plasmides conjugatifs sont transférés en meme tps que les plasmides non conjugatifs
mécanisme appele la mobilisation
75
le transfert des genes par transduction est fait par qui
les bactériophages (virus)
76
comment se passe la transduction
les bactériophages parasite seulement les bactéries et utilisent la machinerie cellulaire de leur hôte pour faire reproduire leur env protéique (capside) et leur matériel génétique (ADN ou ARN du phage)
77
le cycle de vie des bactériophages sont de 3 types
1- lytique et/ou
2- lysogénique et/ou
3- chronique
78
que se passe t-il pendant le cycle lysogénique
le matériel génétique du phage s'intèg
| re dans le chromosome de la bactérie et y est répliqué en meme tps que le chromosome sans affecter l'hôte
79
comment se passe le cycle lytique
ADN du phage s'excise du chromosome de l'hote et les nouvelles particules de phage sont produites et libérés entrainant la lyse cellulaire et la mort de la bactérie
80
comment se nomme un phage uniquement capable d'un cycle de croissance lytique
phage virulent ou strictement lytique
81
autre nom donné a un phage lysogene
phage tempéré
82
comment se fait le cycle chronique
certains bactériophages sont capables de sortir de la cellule bactérienne sans la lyser, mais elle les infectent de maniere chronique
83
il y a 2 types de transduction
spécialisée et généralisee
84
comment se fait la transduction spécialisée
un génome hybride phage-bacterie est créé quand le génome du prophage est improprement excisé du génome de l'hote. ces bactériophages hybrides peuvent se propager
85
comment se fait la transduction généralisé
c'est le résultat de l'empaquetage accidentel de fragments de ADN de l'hote a l'intérieur d'une capside de phage. Ne peut pas se propager
86
nomme des genes transférés par transductioh
la toxine de corynebacterium diphteriae
l'entérotoxine de certaines souches de E coli
la toxine du streptocoque (respo de la scarlatine)
certaine toxines de clostridium botulinum
certains genes de résistance aux beta lactamines
87
la transposition implique et requiet quoi
elle implique un mouvement de segment ADN a l'intérieur d'une meme cellule et requiere une certaine proximité physique entre les endroits ou a lieu le transfert
88
3 classes de transposons
1- les séquences d'insertion (IS)
2- les transposons complexes (IS + autres genes)
3- phages transposables
89
pk la transposons complexe ont une imp médicale considérable
pcq ils peuvent encoder a l'intérieur de leur région centrale, des genes de toxine ou de résistance aux antibio
90
qu'est ce qu'un intégrons
ce sont des éléments génétiques qui recrutent des genes de résistance et les integrent les uns a la suite des autres devant des promoteurs forts assurant l'expression de multiples genes simultanément
91
ou peut on retrouver des intégrons
a l'intérieur des transposons complexes ainsi que sur des plasmides
92
les mécanismes d'échange on un contrepoids qui permet quoi aux bactéries
conserver leur specificité génétique
93
nomme 2 sys qui protege les bactéries contre l'invasion ADN étranger
le sys de restriction-modification de classe II et le CRISPR/Cas
94
quels sont les 2 composantes du sys de restriction-modification de calsse II
la méthylase et la nucléase de restriction
95
quel est le role de la méthylase
c'est une enzyme qui va modifier l'ADN de l'hote a certaines séquences spécifiques pour le protéger d'une digestion éventuelle par la nucléase de restriction
96
que détruit la nucléase
ADN étranger non méthylé, restreignant l'entree du nouveau matériel génétique
97
comment fonctionne le CRISPR/C
quand un nouveau phage infecte une bact, le CRISPR de la bact incorpore une courte séquence dérivée du génome du phage, conservant une mémoire spécifique des infections passées
98
a quoi on compare le CRISPR/C
a un sys immunitaire bactérien ie que les séquences CRISPR sont transcrites et traitées pour générer de courtes molécules d'ARN CRISPR qui patrouillent l'intérieur de la bactérie a la recherche de séquence de phages qui pourrait infecter la bact
99
que fait ARN CRISPS si elle trouve un envahisseur
elle guide la protéine Cas qui sert a couper ADN étranger prévenant l'infection
100
combien espece bactérienne vivent ds le corps humain
entre 500 a plus de 1000 especes
101
la microflore remplit des fonctions essentiels a quel niveau
au niveau digestif et au niveau du sys immunitaire (stimulant la réponse de l’hôte ou tout simplement en occupant une niche écologique qui autrement pourrait être envahie par des espèces pathogènes)
102
est ce qu'il y a + de cell bactérienne ou humaines nuclées ds le corps
10 fois plus de bactériennes
103
est ce qu'il y a plus de genes associés au microbiome humain ou de gene humains
un humain pour 150 microbes
104
qu'est ce qui peut perturber l'équilibre de la flore
la prise d'antibio et de facon répétée favorise la sélection de souche résistante dans l'humain et son environnement
105
qu'est ce qui influence la nature de l'écosysteme microbien
antibio ds alimentation animale et humaine
106
les connaissances ds le domaine génétique microbienne ont permis de développer quoi
des techniques de génie génétique capable de produire des quantités de toute une panoplie de protéines ayant intéret thérapeutique
107
produit pharnaceutique sur le marché (combinant bact, micro org et cell eucary;otes
```
hormone de croissance humaine
insuline humaine
alpha-1 antitrypsine humaine
DNase humaine
activateur du plasminogene humaine
vaccin contr hépatitie B
anticorps monoclonaux humanisés
```
108
combien de tps pour identifier une bactérie a partir de tech basee sur critere morphologique, biochimique et métabolique
2 a 3 jours
109
combien de tps pour identifier une bactérie a partir de tech génétique (amplificateion en chaine par ls polymérase (PCR))
qqe heures
