Genomika i proteomika

Question 1

kad su watson i crick otkrili sktrukturu DNA

Answer 1

1953.

Question 2

kad je izoliran i sekvenciran ljudski genom

Answer 2

2003.

Question 3

koliko parova baza sadrži ljudski genom

Answer 3

3⋅10^9

Question 4

koliko gena imaju ljudi

Answer 4

20 000-25 000

Question 5

koji kromosom ima najviše, a koji najmanje gena

Answer 5

najviše - I kromosom

najmanje - Y kromosom

Question 6

genomika se dijeli u

Answer 6

strukturalnu i funkcionalnu

Question 7

koje tehnike se često koriste u funkcionalnoj genomici

Answer 7

northern blotting

DNA microarray

Question 8

kak funkcionira DNA microarray

Answer 8

napravi se cDNA iz zdravog i bolesnog uzorka
svaka se oboji nekom bojom
stavlja se na provu su oligonukleotidima
ovisno o obojanosti možemo vidjeti koji geni su gdje eksprimirani

Question 9

kaj je fizička mapa genoma

Answer 9

daje informaciju o fizičkoj udaljenosti određenih parova baza

Question 10

čime se izrađuje fizička mapa genoma

Answer 10

shotgun metodom

Question 11

kaj je shotgun metoda

Answer 11

segmenti gena se nasumišno režu
preklapanjem određenim regija se otkriva kojem dijelu su pripadali
rekontruira se cijela DNA sekvenca pomoću fregmenata

Question 12

genetička mapa daje

Answer 12

točan položaj gena i njihove udaljenosti u centimorganima

Question 13

kaj predstavlja centimorgan

Answer 13

jedan centimorgan predstavlja jedan posto šanse da će se jedan marker na kromosomu odvojiti od drugog na istom kromosomu tijekom crossing-overa

Question 14

čime se traže geni koji kodiraju za protein

Answer 14

ORF (open reading frame)

Question 15

ORF traži sekvencu koja

Answer 15

počinje start kodonom

dovoljno dugo ne sadrži stop kodon da može kodirati za protein

Question 16

farmakogenomika uključuje

Answer 16

pravi lijek, pravu dozu i pravo vrijeme doziranja za svakog pacijenta

Question 17

pseudogeni su

Answer 17

funkcionalni geni koji više nemaju sposobnost transkripcije

Question 18

kak mogu nastati pseudogeni

Answer 18

1. podupla se sekvenca, jedna kopija ima mutaciju

2. insercija cDNA u genom

Question 19

transpozoni su

Answer 19

odsječci DNA koji se sami mogu kopirati, izrezivati i premještati unutar genoma

Question 20

tipovi transpozona

Answer 20

DNA transpozoni

retrotranspozoni

Question 21

DNA transpozoni kodiraju za

Answer 21

transpozazu koja može izrezivati taj transpozon i premjestiti ga na drugo mjesto

Question 22

kak se dijele retrotranspozoni

Answer 22

endogeni retrovirusi (ERV)
neviralni transpozoni

Question 23

kak nastaju endogeni retrovirusi

Answer 23

dok se retrovirus ugradi u genom spolnih stanica –> prenašanje na potomke

Question 24

koje ponavljajuće sekvence sadrže endogeni retrovirusi (ERV)

Answer 24

LTR (retriviral-like long terminal repeats)

Question 25

koji su neviralni transpozoni

Answer 25

LINE i SINE

Question 26

SINE je u biti

Answer 26

RNA sekvenca koju je reverzna transkriptaza prepisala u cDNA i ugradila u genom

Question 27

koja je najčešća SINE (kratka DNA sekvenca)

Answer 27

Alu sekvenca

Question 28

kak stanica kontrolira transpozone

Answer 28

metilacijom

nekodirajućom DNA (miRNA, siRNA)

Question 29

haplotip je

Answer 29

obrazac razmještaja SNP-a na jednom kromosomu

Question 30

kaj su politeni

Answer 30

gorostasni (debeli) kromosomi

Question 31

gdje su prisutni gorostasni kromosomi

Answer 31

u žlijezdama slinovnicama drosophile melanogaster

Question 32

ima li gorostasnih kromosoma kod sisavaca

Answer 32

ne

Question 33

kak nastaju gorostasni kromosomi

Answer 33

centomere se ne odvoje tijekom diobe, nego se kromatide podijele 10 puta

Question 34

koliko kromatida nastaje kod gorostasnih kromosoma

Answer 34

1024 (2^10)

Question 35

bojanje kromatina (kak je obojan heterokromatin, kak eukromatin)

Answer 35

heterokromatin - tamno

eukromatin - svijetlo

Question 36

transkripcija u politenim kromosomima se odvija u

Answer 36

puffovima

Question 37

razlika između siRNA i miRNA

Answer 37

siRNA mora biti potpuno komplementarna s mRNA kako bi se vezala
miRNA može biti parcijalno komplementarna