husk B3 Flashcards

(204 cards)

1
Q

Hvilken pka værdi mellem stærk og svag syre

A

Mere negativ end – 3 giver stærk syre

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

pKa og pH forhold

A

pH<pKa -> protoneret form – base ladnning, syre ikke ladning
pH =pKa -> 50/50,
pH = 7 -> begge har en ladning
pH>pKa -> deprotoneret form - base ingen ladning, syre ladning

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Base vs syre

A

Syre: proton donor
Base: proton modtager

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Forskel elektronegativitet

A

<0,4= elektronegativ
0,4-1,7= apolær
>1,7 ionisk binding

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Hvilke og hvorfor kan aminosyre phosphorlyere

A

Serin, threonin, tyrosin pga OH gruppe

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Forskel cis/trans

A

Ch gruppe på samm side = cis
Ch gruppe på hver sin side = trans

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Forskel T/R form

A

T er tense/tight bundet protein, R er relaxed bundet protein -

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Forskel L/D form

A

Den substituent som har lavest prioritet ( lavest atomnummer) skal stritte bagud eller væk fra mig. Den som har højest prioritet skal vende op ad og de andre to så nedenunder. Hvis nr 2 højest prioritet er til højre er denne r isomer og er denne til venstre for 1. prioritet er denne s isomer

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Hvilken form er aminosyre på i kroppen

A

L-form

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Hvilken form er kulhydrater på i natueren

A

Næsten udelukkende D form

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Hvilken form er hæmoglobin i vores blod

A

L form pga R binder O2 bedre – dette ønskes ikke

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Hvilken form findes peptidbindinger i

A

Findes udelukkende i trans på nær prolin

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Hvad er seglanæmi

A

Mutation i erytocytter som deformere de røde blodlegemer

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Hvad er kulilteforgiftning

A

Binding af CO2 i hæmgruppen i stedet for o2 – ændre til R-form, binder hurtigere %ilt =dør

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Hvad er en amyloid fibril

A

Misfoldetproteiner liggende i betasheets ovenpå hinanden – danner aggregat

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Prion protein vs prion

A

Prion er den syge misfoldet udgave af prionprotein – meget smitsom

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Charperoner

A

Proteiner som hjælpe med at refolde misfoolded proteiner eks hsp 60 og 70

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Km

A

et udtryk for hvor stor koncentration der skal til for at nå 1/2 vmax, jo lavere tal jo bedre affinitet

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Kompetitiv inhibitor

A

Km bliver større – færre substrater kan binde

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Non kompetitiv

A

Vmax vil falde fordi den katalyserende effekt bliver dårligere for alle substrater
Km ændres ikke fordi samme substrat koncentration skal til for at nå samme niveau

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

ukompetitiv

A

binder til enzymet når substratet binder og sænker både km og vmax fordi den sænker hastigheden for reaktionen og affiniteten af bindingen

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

har amin syre/base egenskaber

A

base

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

har Ester syre/base egenskaber

A

Ingen syre/base egenskaber

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

har Amid syre/base egenskaber

A

Ingen syre/base egenskaber

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
har Aminogruppe syre/base egenskaber
syre
26
Hvad kræver en hydrogen binding
En donor: H bundet til N, O eller F En acceptor: Lonepair på N, O eller F
27
Dipol dipol
Partialt ladet molekyler som fx h20 har en negativ og positiv pol som så tiltrækker andre partialladet og danner binding mellem disse
28
London
Midtleridigt forskydning af elektronerne i uladet partikler som skaber midlertidig pol og binding
29
Hydrofobe
Ikke dissideret bindinger men den tiltrækning der sker i fx proteiner blandt hydrofobe parikler som gør de samles inde i midten af proteinet
30
Ion binindger
Stærkeste form – to ioner går sammen og enten afgiver eller modtager en elektron
31
Stofmængde ligningen
n = m/M n : antal mol i mol m: masse i gram M : Molar masse - g/mol - det man finder i det periodiske system
32
formel stofmængdekoncentration
C=n/V c : molær koncentration - mol/l n : antal mol i mol V: Volumen i liter
33
omregning koncentration til pH
pH=-log[H+]
34
omregning pH til koncentration
[H+]=10^-pH
35
Formel for pH for svag syre
pH=1/2(pKa-logCa)
36
sammenhæng mellem ph og poh
pH+pOH=14
37
opbygning lipider
polær del: cholin del, phosphat del mellem del: glycerol upolær del: 2 haler
38
Hvad er skyld i flydende membran?
knækket i kæden medvirker til det flydende, cholesterol giver en mere tyktflydende hed
39
de 4 phosphorlipider
kohlesterol triglycerider steoid phosphatlipid
40
mættet/umættet
enkeltbinding/dobbeltbinding - mættet med hydrogen -
41
asymetrisk membran - hvad gør det forskel
forskellig koncentration i membranen af de forskellige lipider + giver eksempelvis ladningsforskel med negativ ladning mod cytosolen
42
forankrede/transmembrane/perifere/integrale proteiner
forankrede: sidder fast i membranen som integralt men er udenfor eller delvist udenfor Transmembrane: proteiner som går hele vejen gennem membranen Perifere: sidder fast i proteiner - kan godt frigives Integrale: proteiner som er integreret i membranen
43
kulhydrater som sidder på plasma membranen
Glycocalyx
44
parakrin, endokrin, autokrin
signal til nærliggende cellel, signalering til langt væk - gennem blodet signalering til egen celle
45
Elliptocytosis
en mutation i cytoskelettet som medføre deformitet i erytchocytter så de ikke foldes ud igen
46
de 3 hovedsignaleringstyper
endokrine system, nervesystemet, immunsystemet
47
agonister/antagonister
blokade eller forstærker af et signal
48
second messenger
små ekstra molekyler som der ved aktivering forstærker et signal fra en receptor
49
fosfortase/kinase
receptorer som fosforlyerer eller defosforlyerer molekyle - det varrierer om det er fosforlyering eller defosforlyering som er den aktiverende/hæmmende effekt
50
receptore - intracellulært/ekstracellulært og eksempler herpå
ekstracellulært: hydrofobe molekyler eksmepler - Ion kanal asocierede receptore - Kinase receptorer - 7TM intracellulært: hydrofile molekyler er ofte direkte involveret i regulering af DNA transkription - bidning af chemical messenger vil føre til en ændring i mængden af proteinproduktion transporteres gennem transport protein gennem kroppen - steoid hormon receptore - cortisol
51
7TM
7-transmembrane receptorer aka G-protein koblede receptorer er en stor familie af receptorer der er involveret i cellesignalering og kommunikation Struktueren som 7TM receptoerer er dannet af krydser cellemembranen 7 gange - Hver type af 7TM receptore binder primært en type ligand som eksempelvis kan være et hormon eller neurotransmitter Intracellulære signalering vidreføres via associerede G-proteiner og forskellige second messengers
52
terminering af signaler
Vigtig for præcisere signalet i tid - fejl i terminering kan føre til sygdomme Der findes her forskellige niveauer stop udskillelse, opyages nedbrydes - Desensitering - fosforlyering, internalisering eller nedbrydning - GTPase-aktivitet i G-proteiner - Nedbrydning af second messengers - Fosfatase fjerner fosforlyeringer på receptorer eller andre steps
53
Tyrosin kinase receptorer eksempel
Dermed gælder det overodnet set - en vækstfaktore binder hvilket esultere i en kryds fosforlyering, fosforlyeringen sætter gang i en masse molekyler som binder til hinanden som får Ras - et vigtigt element i celledeling - til at ændre GDP til GTP hvilket i gang sætter en mase MAP kinase pathways
54
chemical messengers
udskilles af en celle efter stimulering transporteres eller diffunderer til en målcelle binder til målcellens receptor kan både virke stimulerende eller hæmmende
55
JAK-Stat receptorer
Dermed - Cytokin binder -igangsætter JAKS fosforlyering af receptor og STAT, fosforlyeret STAT forsætter til kernen hvor den aktivere gener
56
Serine og Threonine kinase receptorer
vækstfaktore binder til type II, rekruttere type II, fosforlyere den og R-smad som binder til Co-smad
57
spilcning, hvad adskiller?
proces hvor introns klippes ud af pre mRNAet, adskilles af basesekvensen AGGU, genekendes af spliceosom som består af snRPS
58
eksempel 7tm
ligand binder, aktiverer G proteinet som omdanner GDP til GTP som herefter diffundere hen til adenylatcyklassen Her igangsættes cAMP via ATP ( en second messenger som gennem fosfordiesterasen nedbryder cAMP til AMP
59
nukleosid
sukkerenehden+ basepar
60
nukleotid
basepar+ sukkerenhed + phosphatgruppe
61
navngivning 5' og 3'
1' sidder ved basen og så tæller man så bare frem. Ved 5ø ende sidder phosphat gruppen på det 5. carbon, tilsvarende sidder 3' ende ved det 3. carbon efter basen
62
puriner vs pyrimidiner
Puriner er en dobbeltringetstruktur, adenin og guanun er begge puriner Pyramidiner er en enkelt ring og er henholdsvis cytosin og thymyn
63
hvad får strengen til at sno sig
Base stacking (van der Waals kræfter samt hydrofobe interaktioner mellem baserne) får strengene til at sno.
64
hvordan læses og rettes strengen
læser den altså fra 3' - 5' enden, syntentisere fra 5' - 3' enden, og hvis der sker fejl går den fra 3'-5' enden for at rette og fjerne nucleotider igen - her bruger den exonuclease aktivitet hoverfter den forsætter dens 5'-3' ende retning
65
redgør for replikation
helicase åbner strengen, danner replikationsgaffel SSBP beskytter den åbne streng Topoisomerase fjerner supercoiling primer sætter sig, danner fri OH gruppe til polymerasen Polymease III som danner komplementær streng og proofreader, leading strand bygges bare derud af men lagging strand bygges i små bider RNase fjerne primer delene på lagging hvorefter Polymerase I går ind og bygger mellem de små bider Telomerase forlænger på eukaryote celler strengen så hel e strengen kan dannes i eukaryote celler er replikationsgafflen flere steder for eukarote celler dannes start stykket af både primase og polymerase alfa og leading strand bygges af ebsylon mens lagging strand bygges af dleta
66
repair meaknismer
homolog rekombination - søster kromatid NHEJ - limer streng sammen single strand - pARP 1 syntentisere proteiner som laver komple,entær streng m,ismatch repair - mismatch del kilppes ud, ny del syntentisere
67
irreversibel inhibitor
Permanent ændring ved kovalent binding cmax falder pga mindre km uændret forudsat at der er flere enzymer end inhibitorer obs organfosfatase typisk eksempel
68
Non-kompetitiv hæmnong
Binder i andet site end den aktive site på enzymet hvorved enzymet inaktiveres så lælnge hæmmer er bundet - vmax sænkes mens km forbliver uændret
69
cooperativitet
binding af substrat til en subunit fremmer binding af substratet i en anden da først substrat. har svært ved at binde sig da enzymerne overvjende i T-state derfor er kurven først affladet affiniteten i de øvrige subunits øges efter første binding da enzymet ændrer konformation fra T til R-state
70
template vs kodende streng
tempalte - den RNA laver komplementær streng. til mens den kodende er den som er i dentisk med den egentligte mRNA streng
71
mRNA syntese
RNA dannes, og påsættes 5' cap, når 3' enden er ude, påsættes en poly A hale, herefter fraspalltes introns og færdig mRNA forvsinder ud af cellen
72
rRNA syntese
færdigt RNA dannes i nukleus, danner proteinkompleks i kernen, modificeres og methyleres, går tilsidst sammen om at danne det færdige ribosom
73
tRNA syntese
Den dannes ved at komme ud, danne sekundræ struktur hvorefter introns fjernes, efterfølgende modificeres baserne og CCA hale tilføjes til 3' enden Den kan nu forlade sytoplasmaet
74
mismatch repair
forekommer når proofreading slår fejl cellen fjerner den forkete base eler område og nysyntetiserrede streng og erstatter det med rigtig baser cellen opdager skaden i DNA'et endo- og exonuclease fjerner DNA rundt om skaden ved hydrolyse af fosfordiesterbindingerne repair DNA polymerase og DNA ligase hhv udfylder og limer hullerne sammen som vi kender det
75
operons
et mRNA kan kode og styre flere proteiner
76
hvorfor sættes methyleret guanosin på 5' enden
for at beskytte mRNA'et fra at blive nedbrudt exonucleaser og hjælper 5' cappen med at finde ud til og genkende ribosomerne
77
TATA boks
består af 5-8 basepar, er vigtig for det første punkt i samling af transkriptionskomplekset I TATA boksen binder TATA binding protein som er basal transkriptionsfaktor når denne binder bøjer DNA og dannet platform som RNA polymerase kan samles på sammen med en masse andre basale transkriptions faktore
78
start og slut codon
Start codon: AUG stopcodon: UAG, UAA og UGA
79
turnover numer
K3 giver den maximale mængde substar molekyler omdannet til produkt per enzym pr tid det såkaldte turnover nummer for enzyemr
80
hvor mange basepar i dna omgang
10,4
81
Parkning af DNA
niveau 1: 10 nm kromatin; DNA vikles om H2a, H2b, H3 og H4 x2 kerne histoner cirka 1,7 gange = nukleosomer niveau 2: 30 nm kromatin fiber: histon H1 hjælper med at pakke nukleosomerne i 30 nm kromatin -fibre : solenoider niveau 3: 300nm kromatin: solenoider pakkes i en hårnål struktus af nukleære matrix proteiner og danner kromatinslynge Niveau 4: 700 nm kromsom (kun ved metafasen): kondensiner folder kromatinfibrene og kondenserer DNA'et i en sådan grad at det er synligt i et mikroskop
82
allosterisk site
stedet inhibitor binder som ikke er i det aktive site
83
allosterisk hæmmer vs aktivator
binder til allosterisksite, holder enzymet i T-state fald i affinitet --> højreforskydning mindsker reaktionshastigheden binder til allosterisk site holder enzymet i R-state øger affinitetet --> venstre forskydning øger reaktionshastigheden ligner MM-graf
84
kodon
kombinationen af 3 basepar som giver en amimnosyre
85
hvor sidder hvad på tRNA
aminosyre sidder på 3' enden og antikodon på spidsen af kløveren
86
den genetiske kode er...
Den genetiske kode er Redundant = flere kodons for hver aminosyre Men er samtidigt Utvetydig = hver kodon koder kun for én specifik aminosyre og er dermed mega specifik
87
mutationer i translationen
point: -silent: udskiftning af base resultere stadig i samme kodon -missens : udskiftning af base resultere i ny kodon -nonsens: aminosyre udskiftes med stopcodon frameshift: -insertion: en tilføjelse af en eller flere baser -deletion: en fjernelse af en eller flere baser er en insertio/dletion ikke deligt med 3 forårsager det et frameshift idet læserammen ændres
88
hvornår er en mutation patogen?
en mutation siges at være patogen hvis den rammer et aktivt site eller ændrer proteinets konformation
89
Aminoacyl-tRNA synthetaser
de enzymer som påsætter aminosyrerne på tRNA hvilket er en energikrævende opgave - man siger at aminosyeren er aktivereret når der sidder en aminosyre på tRNA'ets 3'ende
90
ribosomer, hvad er det og hvilke dele indeholder det
proteindanner indeholdende proteiner og rRNA opbygget af en 40s subunit og 60s subunit som sammen danner 80s subunit Acceptor-site: her bindes det tRNA med den aminosyre, der skal tilføjes til den voksende peptidkæde. Peptid-site: her er tRNA-molekylet, der bærer den voksende peptidkæde, er bundet. Exit-site: her forlader det tRNA-molekyle, der har afgivet sin aminosyre til peptidkæden, ribosomet
91
translationsproces initiering
translationen starter med at methionyl tRNA binder til det lille ribosomale 40 s i cytosolen sammen med forskellige intieringsfaktore under forbrug af ATP vil mRNAøets 5ø cap binde til komplekset mRNA'et scannes nu indtil startcodon AUG er fundet
92
translations proces elongering
der findes 3 sites - E, P og A Når en ny aminoacyl-tRNA's anticodon matcher med mRNA næste codon - binder den nye aminoaceyl-tRNA'en til ribsomets A-site. den får hjælp af elongeringsfaktoerer og processen sker under hydrolyse af GTP et vigtigt ribozym, peptidyltransferase vil nu overføre aminosyreren fra tRNAøet i P-sitet til den nye aminosyre på tRNAøet i A sitet i praksis sker det ved at enzymer katalyserer dannelsen af peptidbinidngen Translokation: nye elongeringsfaktorer og GTP vil nu ændre ribosomets konformation så der både sker et ryk i mRNAøet og i de to tRNA'er - det tomme tRNA sidder nu i E-sitet og tRNA'et med den voksende peptidkæde sidder i P sitet elongeringsfaktoeren frigives sammen med den tomme tRNA det sker under hydrolyse af GTP det er N-terminalen af det nye protein der syntetiseres først
93
hvad danner peptidbinidngen mellem aminosyre
enzymet peptydyltranslerase
94
translations proces terminering
ved stopcodon sker termnieringen fordi stopcodons ikke koder for aminosyrer vil ingen tRNA parre med sekvensen i stedet vil en frigivelsesfaktore binde i A-sitet i stedet for at katalyserer dannelsen af peptidbidning vil peptidyltransferasen hydrolyserer peptidbindingen mellme peptidkæden og tRNA'et det gør at proteinet frigives og hele komplekset dissocierer
95
hvad sker der efter rRNA gennemgang?
proteiner der udskilles har en signal-peptid i deres N-terminal så snart signal peptidet er dannet vil hele proteinet og ribsomet blive dirrigereret til RER og resten af proteinet vil blive syntetisereret i RER og resten af proteinet vil blive syntetisereret ind i RER signal peptidet vil blive klippet vok og til sidst vil det færdige protein altsp i rer klar til modificering
96
polycistronisk mRNA
en lang kæde som føre til operons
97
prokaryot genregulering
negativ kontrol - represser protein binder til promotor region og forhindre genudtryk positiv kontrol - aktivator binder til promotor region og aktivere udtrykkelse
98
negativ kontrol regulering
Induktion via inducers - Ligand (inducer) binder til repressor og fjerner denne fra DNA'et og stimulerer transkriptionen - Repressor binder medmindre induceren er til stede Repression via co-repressors - Ligand (co-repressor) binder til repressor og muliggøre binidng til DNAet via konformationsændring af repressor - Repressoren binder kun, hvis der er en co-repressor til stede
99
RNA interferens
regulering af mRNAs levetid i cytosolen kaldes RNA-interferens sker gennem inaktivering eller nedbrydning af mRNA gennem RNAi som danner kompleks med RISC kompleks bevæger sig rundt i cytosol for at binde til mRNA - er der 100% match nedbrydes den, er der kun delvis binding bliver mRNA inaktivereret dette kan undgås for mRNA'et ved at den danne baseparringer
100
positiv kontrol regulering
Hæmning af aktivator via inhibitors: - Ligand (inhibitor) binder til aktivator og forhindre binding til DNAet - Transkription kun når ligand ikke er tilstede Stimulering af aktivator via inducer - Ligand (inducer) binder til aktivator og muliggøre bidning til DNAet Transkription kun når ligand er tilstede
101
sigma faktorer
Binder RNA polymerasen og dirigerer den til at transkribere et specifikt sæt gener afhængig af sigma-faktorer samt koordinerer transkriptionen af flere operons
102
HAT og HDAC
HAT - enzym som tilføjer acethyl grupper på lysin rester og på den måde mindsker den positive ladning - førende til letter pakket DNA HDAC - enzym som fjerner acethyl grupper på lysin rester og på den måde øger positiv ladning og strammer pakning af DNA
103
methylering
Cytosin rester i DNAøet kan methyleres af DNA methyltransferase (DNMT) og derigennem danne 5-methylcytosin Det foregår typisk i CG rige områder på genomet omtalt som CG-øer, og ofte i nærheden af en promotor-region Gener der er methylerede er mindre aktive
104
når DNA skal inaktiveres
Methylering af C eller A i DNA'et methylering af histoner - permanent slukning deacethylering af histonhaler begge mekanismer kondenserer DNAøet og får det til at blive transkriptorisk inakitvt hetrokromatin
105
kontrol af specifik transkription
DNA danner loop og binder derved til transkriptionsfaktore langt væk fra strengen - binder kan både virke som hæmmere eller aktivatorer og kan derved både have HAT evner og HDAC evner
106
post transkriptionel editing
altenativ splicing ændring på basepar (RNA editing)
107
miRNA
microRNA - små stykker som kodes for i genomet - danner ikke proteiner men regulerer udtrykningen af mRNA
108
reverse transcriptase
danner en DNA kopi ud fra RNA, som kaldes for komplementær DNA (cDNA)
109
PCR
DNA denatuerer dens binding gennem øgning temp hvorefter temp sænkes hvorefter specialt designet primer binder til ønskede sted, pollymerase binder og replikere strengen proces gentages mange gange for at få mange ens sekvenser
110
DNA kloning
reversetranskribtase (restriktionsenzym) skære ønskede donor dna og ønskede host over så de matche typisk omkring en palindrom sekvens og skære så der kommer sticky ends gennem ligase sættes de sammen rekombinant plasmid overføres til bakterie som man lader vokse i antibiotika de som overlever har overtaget rekombinant gen og er resistent
111
sanger sekventering
tilføjelse af dideoxy nukleotider til DNA replikation hvorved der vil komme mange forskellige længder af DNA sekvenser gentages nok gange vil der være en af alle sekvenserne og man vil kunne finde ud af sekvensen
112
next generation DNA sekventering
indsætning af nukleotider som lyser op, gøres millioner af gange, sættes på en glasplade hvori der er adapter som hybridiserer DNA sekvensen og på den måde samler dem efter længde
113
Crispr/Cas9
Cas9 skkære ved hjælp af guuide rNA NA over, gennem donor DNA som fungere som søster kromatid rettes dna sekvens der ønskes rettet
114
proteomics
proteiner skæres over af enzymer til peptider, samles i spektroskopi og gennem forskellige bølgelængder kan mændge bestemmes og dermed om der er flere eller færre end der burde være
115
endonuclease
nukleotider fjernes inde i DNA strengen
116
exonuclease
nukleotider fjernes fra enden af dna strengen
117
beligne celler
ikke invasive
118
maligne
invasive cancer celler
119
Ens karakteristika for cancer/hallmarks
- Øget væsktsignalering - Resistens overfor celledød - Forøget angiogenese - Repetikativ udødelighed - Aktivering af inavsion og metasignalering - Nedsat følsomhed for væksthæmmere
120
primær stase
knuden kræften opstår
121
Metastase
de kræftknuder som vandre ud af den oprindelige og danner kræft knuder andre steder i kroppen
122
mutationstyper for onkogener
Man starter med en almindelig proto-onkogen med promotor og kodende del Herfra kan der ske 3 forskellige former for mutationer - Der kan opstå mutationer i enten kodende del - Mutation i promoteren hvorved ekspressions aktiviteten ændres - Der kan forekomme en gen omrangeren og et gen kan eksempelvis indsættes foran et andet gen eksempelvis gennem translokationer - Ligeledes kan de kodende regioner mellem de to gener sættes sammen og give et langt fusion protein - duplikation hvorved der kommer en meget stor mængde af det samme gen som derved kan lave meget aktivitet
123
cykeliner afhængige kinaser SCK
cykeliner som driver cellen igennem cyklussen, idet de fungere som kontrol proteiner som følger cyklussen fase til fase De spiller sammen med de udøvende faktorer (CDK) som de danner kompleks med gennem phosphorlyering kan den styre cellecyklus og overgange
124
tumorsupressergener
Tumorsupressorgener hæmmer celleproliferation og inducerer apoptose hvorfor kræftceller har behov for en loss of function for at kunne prolifferer frit som respons på kontaktinhibering og DNA skader Eksempler på tumorsupressorgener er - Hæmmere af vækstsignaler - Hæmmere af cellecyklus - Aktivator af apoptose Adhessionsproteiner
125
efficiancy
lægemidlets effekt: den maksimale respons lægemidlet fremkalder uafhængigt af dosis tendensen efter den først er bundet til at aktiverer receptorer bestemmes af den efficiancy Emax er her et udtryk for maximal effekten af en givent drug - ligegyldigt dossisen - giver et udtryk for efficancy
126
potency
lægemidlets styrke altså koncentrationen af lægemidlet det kræves at opnå et givent respons - afgænger dosis Drugs med høj potency har normalt en høj affinitet for receptore og binder derfor ofte til mange receptore selv ved lav koncentration Potency hos agonister afhænger af to parametre - affiniteteb og efficiancy EC50 er koncentrationen af drugget som der er behov for for at producerer et given effekt - 50% af emax Sidst nævnt tal er dosis afhængig og er et udtryk for potency
127
hvilken binding er phosphat grupperne i ATP bundet med og hvorfor frastøder de hinadne
højenergisk phosphoanhydrid bindinger grundet den negative ladning i bindingerne
128
Højenergi-bindinger
1,3-bisfosfoglycerat (glykolyse) phosphosphat PEP (GLykolyse) Creatinphosphat ( reserve for ATP syntese) Acetyl Coenzym A
129
affinitet
lægemidlets bindingsevne Tendensen for et drug til at binde til receptore bestemmes af dens affinitet Affiniteten bestemmes her udfra dens tendens til at binde til receptore KD, fundet gennem logatrimen til koncentrationen er her koncentrationen på 50% af receptoerne bundetEr der høj affinitet er kd lav, er affiniteten lav skal der en høj Kd til og brug for meget drug for at binde nok
130
kompetitiv antagonist
En kompetitiv antagonist konkurrer mod agonisten om at binde til receptoerne i det samme binidngssite øger EC50 hvorved lægemidlets potens faldet mens emax er uændret
131
non-competiiv antagonist
En non kompetitiv/irreversibel antagonist binder til receptoerne på et andet bindings sted end ligandens bindingsite uændret ec50 nedsætter emax og efficancy falder
132
allosterisk antagonist positiv og negativ
positiv: binder reversibelt et andet sted end agonist og medøfre konformationsændring i receptoeren affinitet øges og fremmer agonist binding - kan påvirke efficancy eksempel er stesolid negativ; binder reversibelt et andet sted end agonist, medfører konformationsændring i receptoeren affinitet mindskes og hæmmer agonist binding kan påvirke efficancy --> fuld agonist bliver partiel
133
inverse agonist
den binder som agonisten, men hæmmer signalet
134
nuclear receptore
agonist kommer ind i cellen og binder til receptore i nucleus - receptore binder til DNA og aktiver eller inhiberer gen transktiption De kan herigennem kontrollerer transkription og udtrykkelsen af mange gener og proteiner og er derfor vigtig i regulering af metablov og udvikling i inaktiv form er den bundet til heat shock proteiner eksempel nicotinreceptor for acetylcholin eks glucocorticoid receptor
135
ion kanaler og opbygning
Der er to ligand bindingssites - siderne ad den transmembrane pore åbning udgøres i dette tilfælde af negativt ladede aminosyrer, hvilket gør ionkanlalen kation efektiv Ved agonist binding ændrer kanalen konformation hvorved passage af ioner tillades signalet termineres af acetylcholinesterase som hydrolyserer aceylcholin
136
apoptose
Ved et skade DNA går den apoptosiske respons ind og dræber cellen den bliver nedbrudt til små stykker som kan optages af fagocytter som så fjerner dem fra cellen - Aktivering via dødsreceptore - Aktivering vi frigivelse af cyt 2 fra mitrokondrier Begge responser resultere i en aktivering af caspaser som enten kan kløve sig selv eller andre i stykker, og derigennem igangsætte apoptose
137
alkylating agent
eks cyclophosphamid og cisplatin alkylerende midler virker ved at krydsbinde baser i DNA både inter og intra stand linkage dvs mellem de to strenge i DNA-molekyler krydsbinidnger sker typisk mellem to guanin i N7-position lægemidlet fungerer som en slags krog der hægter sig fast i 2 forskellige baser replikationen forhindres fordi de to strenge kan ikke adskilles eller aflæses korrekt repair-mekanisme aktiveres og der kommer apoptose
138
antimetabolites og opdeling
D) Inhibering af nukleotid syntesen Disse kan opdels i ○ Folate antagonists som inhiberer nukleotide syntesen ○ Puriner analoguger som dannner falske purin nukleotider ○ Pyrimidine analoger som danner falske pyrimidiner ( inhiberer thymidylate syntasen) her er det et molekyler som ligner den pågælende nukleotid bortset fra at der er påsat en flour gruppe i stedet
139
tyrosin kinase inhibitor
ikke cytotokiskske men virker ved at hæmme cellesiganlering i pathways involveret i proliferation den hæmmer typisk forskellige trin i phosphorlyeringsskaskaden Den fungerer ved at fjerne ATP og stopper derved growth factor da den ikke kan spalte ATP til ADP længere
140
vinca alkaloids
plantederivater virker i M-fasen af cellecyklus og er derved fasespecifik de virker ved at forhindre assemble af den mitotiske spindle hvorved cellen ikke kan fordele kromsomerne og dele sig korrekt
141
side effects og hvorfor
- Kvalme og opkast - Immunsupression = svækket immunforsvar pga knoglemarvstoksicitet bla pga nedsat syntese af leukocytter : risk of bleeding - Manglende evne til at hele sår - Hår tab - Ødelæggelse af gasrointestinal epithel - diarre og fejloptagelse - Manglende vækst i børn - Sterilitet Abnorm udvikling i fostre
142
Azathioprine
Fungerer som et prodrug som omdanner 6-mercaptopurine i leveren omdannes til videre til toxic thioguanine nucleotides (TGNs) TGNs fungerer som falske nukleotider som inkorporeres direkte i den nye DNA-streng ved replikation inkoporeres i RNA og DNA og føre til celledød tilhøre DMARDS = Disease modifying anti rheumatic drugs
143
Methotrexate
efterligner struktueren på folat og hæmmer enzymet dihydrofolate reductase effekten er nukleotid syntesen hæmmes og der kommer færre thymid som dermed ikke kan indgå i DNA hvilket hæmmer replikationen og apoptose' tilhøre DMARDS = Disease modifying anti rheumatic drugs på RA virker det ved at mindske proliferation af inflammatoriske celler ved at øge mængden af adeonosin levels der netop er anti inflamatorisk
144
glucocorticol
binding af glucocorticol receptoerne inhiberer cytokinsytesen eller NSAID ved patienter med høj sygdomsaktivitet - bruges ofte i overgangsfasen ifm opstart af DMARD skal bruges kortsigtet og meget gerne hurtigt med lav dosis idet der er mange bivirkninger forbundet hertil producerers i binyerebakken normalt skal enten administreres systematisk: oralt eller intravenøst eller lokalt: transdermalt til eksem, inhalation eller injektion glukokortikoid bivikninger eks abdominal fedme, buffalo hump, moonface
145
rheumatoid arthritis, hvad, patogenese, behandling
Rheumatoid arthritis er en autoimmun sydom som giver hævede, smertefulde, deforme og immobile led Der kommer en disabillity ved 1/3 patienter Patogenese: den primære årsag til ledhævelse er inflammation i synovialmembran muligvis pga frigivelse af cytokiner inflammation fører til fortrykkelse af membranen og på sigt nedbrydning af ledbrusken og knogleenhederne i leddet muligvis drevet af autoimun respons og i høj grad mediereret af B- og T-celler BehandlinG: dæmpe inflamation og mindske sygdomsprogression standardbehandling af RA udgørs i 3 trin : NSAID, glukotikoider og DMARDS
146
polysom
er en gruppe af to eller flere ribosomer som oversætter mRNA til protein
147
katabolisme
nedbrydning af organismer
148
anabolisme
opbygning af organismer
149
forskel glukose receptore i væv
muskler og fedt har Glut 4 som har en km på 1 - den tillader derfor meget at træde igennem, der kommer flere receptore ved intrædelse af glut Glut 2 sidder på leveren og på bugspytkirtlen som har km på 15 leveren skyldes den sidder så højt oppe og ville derfor få stor koncentration bugspytkirtlen skyldes dens insulin udspringning
150
nedbrydning fedt
Når fedt indtages, bliver triglycerol emulgeret af gallesalte fra leveren hvilket hjælper processen som katalyseres af pancreas lipase Grundet den negative overflade vil fedtet dele sig og danne små fedtdråber hvorved nedbrydningshasitgheden forøges Pancreas lipase går ind og spalter til TG til to mono glycerol - den fra spalter der ved de to fedt kæder Herefter kan den optages i fordøjelsesceller hvorefter de sammensætte til TG igen Kroppen pakker herefter TG ind i proteinerne chymecromer hvilket giver dem en vandopløslige overflade De kommer derved ud i vævet som LPL(LipoProtein Lipase Ude i Vævet kan fx muskler spalter det til FA Pancreas lipase går ind og spalter til TG til to mono glycerol - den fra spalter der ved de to fedt kæder Herefter kan den optages i fordøjelsesceller hvorefter de sammensætte til TG igen
151
triaglycerol opbygning
3 fedtsyre kæder, glycerolen og acylgruppen Man siger at triglycerol består af tree fedtsyreforbindelser som er estificerede til en glycerol Fedtet kan være mættet og umættet og have forskellige længder
152
nedbrydning kulhydrater
Nedbrydningen starter i munden - her påbegynder alfaamylase nedbrudning til mindre dele Pancreas går også her ind og tilføjer amylase til nedbrydningen Kulhydratet forsætter ned i tarmen hvor den nedbrydes til mindre dele I sidste ende nedbrydes det til glujosse som optages i fordøjelsesceller - idet de er vandopløslige kan de bare direkte udskilles
153
gibbs frie energi
Gibbs frie energi er et udtryk for kemiske energi i et molekyle Her er ∆G den maximale brugbare energi i en reaktion og forudsiger derved om reaktionen vil forgå spontant eller ej ∆G = ændring i fri energi for den givne reaktion = ikke konstant ∆G' = ændring i gibbs fri energi ved [P] =[S]=1M under standard betingelser
154
endergon reaktion
ikke spontan reaktion
155
exergon reaktion
spontan reaktion
156
substrat niveau phosphorlyering
Syntese af energetisk Phos-binding uden brug af oxygen. (phosphoryltransfer)
157
decarboxylering
carbonyl gruppe falder fra og der dannes co2
158
prostetiske grupper
En prostetisk gruppe er en del af et protein som ikke betår af aminosyrer kan også være metaller
159
regulering TCA cyklus
Allle dem som er forskidt til hæjr er stærkt regulereret af nadh mængden Citrat kan blive det ved acethyl coa ophobes Er de rikke brug for NADH er der helle r ikke brug for ATP og det ophpber sig = hvorfoor der sætter bremser
160
mediator
et protein som vidergiver signal mellem transkriptionskompleks - rør ikke stregen
161
hvad ser vi elektron transportkæden
En membran (intakt IMM, imperm.) Elektron donor Elektron acceptor Proton-translokation (proton-pumper) ATP syntase
162
hydrogencarrier
elektron carrier som bære elektroner sammen med hydrogen fx FMN, FAD, CoQ
163
ATP synthase
f0 del som sidder i den indre mitrokondrielle membran og f1 del som stikker ind i matrix siden F0 består af router med en masse c subunits - og er tæt forbundet et sted til en a subunit Det er koblingen mellem a subunit og c subunits som protonerne bevæger sig igennem F0 er forbundet til f1 - ten en gamasubunit som asymetrisk peger til den ene side og op i en kluster af alfa og beta subunits Her er det beta subunits som danner ATP konformationsændring reguulerer om der dannes atp
164
elektroncarrier
elektron carrier osm kun transporterer elektroner fx : FeS-centre, cytochromer
165
elektroncarriers - hvordan associereret og hvordan modtager elektroner
NAD: modtager to elektroner på samme tid som hydrid ion og er løst associereret til enzymet FAD: modtager kun en elektron af gangen fra hydrogen atom og er fast bundet i et enzym kompleks
166
shuttle
en forbindelse som kan danne redox reaktion og på den måde omdanne stof til at kunne komme gennem membran glycerolphosphat-shuttlen er eksempel herpå ebnyttes af cytosolisk glycerol-3-phosphat dehydrogenase og mitrokndriel glycerol-3-phosphat dehydrogenase
167
uønsket produktion af ROS i kroppen
redoxreaktioner i kroppen mitrokondriets dannelse af o2 ioniserende stråling
168
antioxidante enzymer
Antioxidanter beskytter mod rosser i det de står som en slags dead end - Cystein - Glutathion - Ascorbinsyre (vitamin C) - Alfa-tocopherol (vitamin E) (nedbrydes også OONO) - Behandling med antioxidanter (feks patineter med sepsis - Glutathion - N-acetylcystein(forøger den intracellulære cysteine koncentration I vores kost indegår mange ikke- enzymatiske antioxidanter der også beskytter mod ROS fx gulerødder
169
skader på celler
protein oxidation: oxidation af aminosyresidekæder ændrer deres kemiske egenskaber - bliver typisk mere hydrofile og/eller delvist nedbrudt og/eller danner kovalente krydsbinidnger med andre sidekæder DNA oxidation: oxidation af DNA pga hydroxylradikaler kan medføre dobbeltstrenget brud i DNAet, ændringer af baserne som medføre mutationer og forkert baseparring Lipid peroxidation: gør membranlipider mere hydrofile og medføre nedbrydning af membran lipider og giver en mere permabel membran med ukontrollereret influx af ioner hvilket giver en stresset celle nogle nedbrydningsprodukter kan modificerer proteiner = loss/gain of function
170
lipidperoxidation og hvorfor dårlig?
udgangspunktet er hydroxylradikalet OH prik som møder et lipid som danner en hydrogenatomabstraktion ( snupper en elektron og en proton og der kommer en lipid radikal og vand lipid radiaklet vil reagerer med ilt og danne et lipid peroxider radikal lipidperoxider er dårlige at have i membranen fordi slår et knæk det vil påvirke pakningen af lipider og memrbanens mekanisme barierer vil altså svækkes nedbrydnings produkterne fra disse er desuden meget giftige - kan danne aggregater
171
ROS forbindelser som er radikaler
O2- ( superoxid ( anion) OH prik ( hydroxyl-radikal R prik, RO prik, RS prik ( organiske radikaler) ROO prik ( peroxy-radikal NO ( nitrogenoxid
172
ROS forbindelser som ikke er et radikal
H2O2 (hydrogenperoxid HOCl (Hypochlorsyre) singlet O2 ( singlet oxygen) ONOO- (peroxynitrit)
173
Fenton reaktion
H2O2 som reagerer med jern 2 og danner hydroxyl radikal og hydroxid ion ( OH minus og OH prik)
174
dismutaser
man har en reaktion hvor man har to eksemplarer af det samme stof hvor det ene fungerer som oxidant og det andet som reduktant eks 2O2minus prik +2 H+ --> H2O2 +O2 is a redox reaction in which one compound of intermediate oxidation state converts to two compounds, one of higher and one of lower oxidation states
175
vitaminer
vitamin E og C beskytter cellen mod lipid peroxidation Vitamin E donerer en elektron til 2 lipid peroxyradikaler så der dannes det stabile lipiid peroxid - bryder kædereaktionen vitamin C gendanner vitamin E til sit fuldt reducerede form så den igen kan uskadeliggøre lipid peroxyradikaler
176
forskel på steady state og ligevægt
steady state: er en staionær tilstand som indstilles lidt efter reaktionen påbegyndes hvor E, ES og V holdes konsant = den buende del af MM ligning ligevægt: indstilles når grafen opnår plateau hor der er maksimal produktdannelse
177
regulering Pyruvat DH
Pyruvat DH kinase = fosforlyereret - gør inaktivt - hæmmes af ADP og pyruvat, stimulereres af acetyl-coa og NADH - forhindre over produktion pyruvat DH fosfortase defosforlyerer, gør komplet aktivt, kun aktivt ved ca2+
178
prostetisk gruppe vs coenzym
kovalent bundet cofaktor der ikke forlader enzymet under reaktionens forløb feks FAD coenzym er derimod løst associereret til enzymet feks NAD
179
syntase vs syntetase
kondensation af to C med og uden højenergisk fosfatbinding
180
energiudbytte NAD+ og fad
nad+ giver 2,5 og fad giver 1,5 ATP pr runde i ETK 4 H+ = 1ATP
181
hvor ligger hvad i mitrokondriet
pyruvat, TCA cyklus, beta oxidation ligger i matrixet mens ETK ligger i den IMM og Glykolysen er i cytosolen
182
regulering TCA cyklus
trin 3: isocitrat - det hastighedsbegrænsende trin - aktiveres af Ca2+ og er allosterusj regulereret af NADH som hæmmer og aktivereret af ADP Trin 4: alfa-ketogluterat DH - aktiveres af Ca2+ og inhiberes af NADH trin 8: Malat DH - inhiberes af NADH
183
Citrat
hastighedsbegrænsende trin - ophobes det sendes det ud i cytosolen hvor det virker regulatorisk på PFK-1 i glykolysen og carnitin-transport af B-oxidation
184
CoQ
mobil carrier, består af 10 isopren-enheder kan binde 1 eller 2 elektroner samt protoner og fungerer som shuttlebus mellem komplleks I, II og III
185
Cytochromer og cytochrom c
proteiner som indeholder en hæmgruppe cytochrom c findes i intermembranrummet mellem kompleks III og IV tæt associeeret til IMM
186
ATP synthase
Skift mellem O, L og T konformation L(loose): I loose state bindes ADP+P men sidder ikke tæt nok ppå hinanden til at reagere T(tight): Høj affinitet --> katalytisk aktiv - i tight state kan ADP+P nå hinanden og danne ATP O(open): lav affinitet --> atp frigives
187
afkobler
H+ kommer ind i matrix uden om ATP synthasen hvorved den protonmotoriske kraft nedsættes det kan enten foregå som komplet hæmning feks Cyanid forgiftning ( binder til cytochrom c oxidase og forhindre elektronstransport til O2 og når et kompleks hæmmes, hæmmes de alle delvis hæmning --> mitrokondrielle afkkoblere -leder H+ udenom ATP-syntasenog nedsætter protonmotorisk kraft men ETC fortsætter kan fx være UCP som danner kanal for H+ til matrix hvorved krafter falder, ETC øges og der kommer en øget termogenese UCP1 er særligt vigtig i brunt væv
188
Hvordan transporteres proton fra glykolysen ind i cellen
aerob reoxidation : shuttle ind i mitrokondrier gennem glycerol-3-fosfat shuttle ( overføre fra NADH til DHAP og videre til kompleks 2 udbytte = 1,5 ATP) eller malat-asparatat shuttle ( elektronerne overføres fra NADH til TCA - NADH går fra TCA til kompleks I i ETC - der fås 2,5 ATP) anaerob reoxidation NADH reoxideres direkte i cytosolen når pyruvat omdannes til laktat
189
anaerob glykkolyse
pyruvat raduceres til laktat - intet vidregår til TCA Enzym: laktat dehydrogenase
190
energiudbytte aerob vs anaerob forhold
2 ATP fra glykolysen 10 ATP pr acetyl-CoA i TCA = 20 ATP pr glykose 2,5 ATP pr pyruvat til acetyl-CiA = 5 ATP pr glukose 1,5-2,5 ATP reoxidereret NADH = 3-5 ATP pr glukose
191
regulering glykolyse
hexokinase (trin1) negativ feedback fra produkt glukose 6P comitted step til metabolismen PFK-1 - hastighedbegrænsende trin + comitting step allosterisk enzym med 4 regulatoriske sites aktiveres allosterisk af fruktose-2,6-bisP og AMP hæmmes alllosterisk af ATP og citrat Pyruvat DH complex pyruvat kinase inaktiverer, pyruvat fosforlyase aktiverer hæmmer Acetyl coa og nadh aktivereret af pyruvat og adp og ca2+ under muskelarbejde: ATP falder, AMP og ADP stuger høj rate i TCA = lavt acetyl-CoA og citrat, højt intracelullært Ca2+ aktivering af PFK-1 og PDC
192
glykogenolyse
dannelse af glukose 1 fosfat fra forgreninger gennem enzymet glycogen phosphorlyase - enzymet kløver en glykosid gruppe fra den terminale ende af en forgrening og tilføjer en fosfat gruppe debranching konversion af glukose 1P til glukose 6P gennem enzymet phosphoglukomutase
193
regulering af muskel glykogenfosforlyase
energi: muskelkontraktion/energiforbrug medføre en stigning i AMP AMP signalerer at der er lav energi og AMP stimulerer både a og b formen (AMP virker allosterisk og ændre konformationen af b-formen så den opfører sig lig a skaber øget glykogenolyse nervestimuli stigning Ca2+ er nervernes signal om at vi bruger energi i musklen. Ca2+ frigived ved arbejde og binder et calmodulin-domæne der aktiverer glykogenfosforlyase kinasen som påsætter fosfat og på den måde bliver aktiv = a form hormonel regulering under muskelarbejde stiger koncentrationen af adrenalin i blodet hvorved niveauet af cAMP stiger - PKA aktiveres som igangsætter fosforlyase b øget glykogenolyse glykogen phosphorlyase b = dehosphoryleret og inaktiv glykogen phosphorlyase a= phosphorlyerer og aktivt
194
beregning energiudbytte lipid
for 16 carbon fedtsyre bliver energiudbyttet 108-2=106 ATP
195
regulering beta oxidation
cellens energibehov, NADH, FAD 2H og ATP levels tilgængelighed af CoASH hormel regulering af lipolysen ( hæmmes af insulin transportniveau: CPT-I regulereret af malonyl-CoA hvilket betyder at mindre fedtsyre transporteres ind i mitrokondriets matrix til beta oxidation når niveauet af malonyl coa er høj
196
kernestoffer, hvad, nedbrydning og udbytte
betegnelsen for forbindelserne acetoacetat og beta-hydroxybutarat (reduceret form af beta-hydroxybuterat DH) - det dannes i mitrokondriets matrix ved langvarig faste ud fra ophobet acetyl coa i leveren og frigives derefter til blodet - acetyl-coa genskabes fra kernestofferne i øvrigt væv og sparer derved på kroppens glukose når de nedbrydes er det først til beta-hydroxybuterat DH hvorved NAD+ reduceres til NADH+H+ så skal der bruges succinyl CoA fra TCA resultat bliver 2 acetyl CoA acetoacetat giver 19 ATP fordi det koster en atp at aktiverer 21,5 ATP idet dne producerer et ekstra NADH som kan oxideres
197
dose-response kurver/ koncenrrstionbindingskurve
bruges til effiancy og potency ikke affinitet måler receptor responset på en bestemt dosis s formet
198
cytotoksiske antibiotika
eks doxorubicine DNA-intercalation = inserer sig i DNA's dobbelthelix og forstyrrer replikation og repairmekanismer inhibition af topisomerasens funktion ved at stabaliserer og forhindre re-ligation af de små brud enzymet laver for at forhindre supercoilling DNA-streng knækker over DNA-repair aktiveres og der kommer apoptose
199
DMARDS
disease modifying anti-rheumatic drugs måælrettet den tilgrundliggende lidelse - hjælper ikke kun på syptomerr men mindsker også sygdommen ofte 2-6 uger eller længere før effelt ses vigtig med tidelig opstart Methotrexat og azathioprin
200
hurigst til langsomst receptore
hurtigst: ligand gated, gprotein, kinase, nekleus
201
uønsket ROS dannelse
I mitrokondriernes etk kan CoQ reagerer med O ved en fejl og danne superoxid ved metabolisering af forbindelser vha monooxygenaser - den katalyserer overførelsen af elektroner til O2 og organiske substrater og kan ved en fejl frigive frie radikaler ved tilstedværelsen af frie Fe og hydrogeneroxid kan fentonreaktion danne hydroxylradikaler Xanthin oxidaser nedbryder puriner hvorved der samtidigt dannes hydrigenperoxid eller superoxid ved reaktion mellem NO og superoxid dannes peroxynitrit feks ved iskæmi reperfusion
202
iNOS
enzymet iNOS findes i fagocytterende celler fx neutrofile granulocytter og makrofager der dannes peroxynitrit vha kollision mellem superoxid og nitrogenoxid iNOS kan viderdannes til NO ved omdannelse af arginin til citrulin under forbrug af NADPH og O2
203
ROS i immunsystemet
de fagocyterende celler danner flere forskellige ROS forbindelse NADPH oxidase omdannilt til superoxid og starter respiratory bust superoid dismutase omdanner superoxid til hydrogenperoxid Myeloperoxidase omdanner hydrogenperoxid til hypochlorsyrling der dannes OH ud fra hydrogenperoxid og FE via fenton
204
hvordan dannes ONOO-
dannes via kollision mellem superoxid og nitrogenoxid - specielt ved infektion og betændelse den kan diffunderer gennem membranen og reagerer med proteiner og lipider