powerpoint 4 Flashcards

(33 cards)

1
Q

O que são mini-STRs?

A

versão otimizada dos STRs tradicionais, desenvolvidos para amplificar fragmentos curtos (<150 pb), ideais para DNA degradado ou de baixa qualidade

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2
Q

Qual é a principal vantagem dos mini-STRs em relação aos STRs convencionais?

A

Conseguem amplificar DNA altamente degradado devido ao tamanho reduzido dos fragmentos.

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3
Q

Frente: Qual a principal diferença entre STRs tradicionais e mini-STRs?

A

Nos mini-STRs, os primers estão mais próximos da região de repetição, reduzindo o tamanho do fragmento amplificado.

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4
Q

o que garante que se possa usar mini strs

A
  • Os miniSTRs mantêm a especificidade e a variabilidade dos STRs tradicionais, permitindo comparações entre perfis genéticos e a continuidade com bases de dados forenses existentes.
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5
Q

Frente: O que permite a análise multiplex nos mini-STRs?

A

Kits comerciais que amplificam múltiplos loci simultaneamente, melhorando a eficiência e o poder de discriminação.

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6
Q
  • Desvantagem da aproximação
A

: o número de loci (ou polimorfismos) que podem ser amplificados em simultâneo é mais limitado, comparado aos megaplexes de STRs convencionais, que conseguem amplificar dezenas de loci de uma só vez.

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7
Q

Q: O que são artefactos de adenilação incompleta na PCR?

A

A: Quando há excesso de DNA no PCR, podem surgir dois picos (com e sem nucleótido A na extremidade 3’), confundindo a leitura dos alelos.
* Isto pode ser confundido com um alelo verdadeiro e que o ajuste da quantidade de DNA é essencial para evitar essa ambiguidade.

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8
Q

Q: O que são alelos nulos nos mini-STRs?

A

São alelos que não amplificam devido a mutações pontuais na região de ligação do primer, especialmente na extremidade 3’.

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9
Q

nos alelos nulos que alteraçoes de resultados pode haver se estiverem em sitis diferentes

A

se a mutaçao estiver no meio da zona de hibridaçao - , o primer até pode ligar-se parcialmente, mas com menor eficiência, causando desequilíbrio nos picos heterozigóticos

se a mutação estiver na extremidade 3- onde a ligação do primer precisa ser perfeita para que a DNA polimerase inicie a síntese, a amplificação falha completamente para esse alelo. Isso leva à ausência total do alelo no resultado, mesmo estando presente no DNA

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10
Q
  • Q: Como contornar alelos nulos
A

: Usando primers alternativos para permitir a amplificação do alelo mutado.

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11
Q

Q: Quais são os requisitos dos mini-STRs?

A

A: Alta heterozigotia (>70%), elevado poder discriminatório, consistência entre laboratórios, baixa taxa de mutação, produtos de PCR cim tamanho <150 pb e localizaçao afastada ou em cormossomas distintos

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12
Q

vantagens principais dos mini-STRs?

A

Análise de DNA degradado, maior sensibilidade, compatibilidade com equipamentos tradicionais de STR.

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13
Q

desvantagens dos mini-STRs?

A

A: Nem todos os loci STR podem ser convertidos em mini-STRs; menor número de loci por multiplex.

Por vezes o genótipo obtido com os STRs tradicionais difere do genótipo obtido com os miniSTRs.

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14
Q

Q: Por que os mini-STRs são úteis em impressões lofoscópicas?

A

A: Permitem amplificar DNA em baixa quantidade ou degradado, como em impressões latentes com células epiteliais.

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15
Q

Q: Por que os mini-STRs são eficazes em casos de agressão sexual?

A

A: Identificam DNA degradado por tempo, lavagens ou ambientes acido da vagina ou minoritário (ex. esperma em secreções vaginais) mesmo após tempo prolongado.

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16
Q

Q: Como os mini-STRs são usados em testes de parentesco?

A

A: Permitem amplificação de DNA mesmo em amostras antigas, exumadas ou mal conservadas.

17
Q

Q: Qual a importância dos mini-STRs na identificação de vítimas?

A

A: São eficazes em restos mortais em decomposição, carbonizados ou esqueletizados.

18
Q

importancia geral dos mini str em dna degradadi

A

Por serem desenhados para amplificar fragmentos curtos, conseguem contornar a degradação e ainda gerar resultados, em comparação entre STR tradicionais (amplificam fragmentos de 100-400 pb) e mini-STRs (70-150 pb).

19
Q

Como se comparam os mini-STRs com STRs em casos de DNA degradado?

A

A: Mini-STRs amplificam fragmentos entre 70–150 pb; STRs convencionais, entre 100–400 pb.

20
Q

O que indica a correspondência de alelos em todos os loci entre amostra e referência?

A

para fazer a analise , analisaram locis de str especificos e em cada locus, sao obsrvados dois alelos, se os alelos da referencia com o da vitima corresponderem há A: Confirmação de identidade genética (ex: escova de dentes da vítima e amostra biológica).

21
Q

Como se faz a comparação genética quando não há referência direta da vítima?

A

Usa-se o perfil genético dos familiares e herança dos alelos para inferir compatibilidade.

Se em todos os loci, pelo menos um alelo da vítima coincide com o que era esperado como herdado pelo filho, e o outro pode ser alelo livre, ou seja, sem conflito com o perfil da mãe dizzemos q é compativel \

22
Q

Q: O que são InDels bi-alélicos?

A

A: Polimorfismos com presença ou ausência de pequenas sequências de DNA; apenas dois alelos possíveis- com ou sem inserçao
só tem didrença num ou poucas pb

🔹 Também chamados de DIPs.

23
Q

Q: Quais são as principais características dos InDels?

A

A: Alta estabilidade, baixa taxa de mutação, bialélicos, fragmentos curtos, genotipagem fácil.

24
Q

Q: Qual a diferença em poder discriminatório entre STRs e InDels?

A

InDels: bi-alélicos → menos poder discriminatório.
🔸 STRs: multi-alélicos → maior poder discriminatório.
✔️ No entanto, InDels são mais estáveis e confiáveis.

25
como podem ser classificados os indels
curto ou longo
26
3. Por que os InDels são úteis em genética forense/populacional?
* Existem milhares de InDels distribuídos por todo o genoma Têm baixas taxas de mutação ✔️ São estáveis ao longo do tempo ✔️ Permitem comparações entre populações geográficas
27
4. Quais as vantagens dos InDels?
Baixa taxa de mutação ✅ Fácil interpretação ✅ Pequenos fragmentos (ideal para DNA degradado) ✅ Genotipagem simples ✅ Possibilidade de PCR multiplex ✅ Funciona bem com DNA de baixa concentração (LCN)
28
5. Como é feita a análise de InDels?
Extração → Quantificação (qPCR) → PCR Multiplex (técnica permite amplificar simultaneamente vários loci InDel numa única reação) → Eletroforese capilar para separar os componentes → Análise estatística dos genotipos obtidos .
29
6. O que significa que os InDels são de "evolução lenta"?
⏳ Sofrem menos mutações ao longo do tempo → maior estabilidade em estudos evolutivos e populacionais.
30
7. Qual o tamanho típico dos InDels?
diferença típica de apenas 1 a poucos pares de bases ➡️ Resultam em amplicons curtos → úteis para DNA degradado
31
8. O que são inserções Alu?
* são um tipo de polimorfismo indel bi-alélico da família dos SINEs , ou seja, apresentam apenas dois alelos possíveis: a presença (+) ou ausência (–) do elemento Alu numa dada posição do genoma. Cerca de 300 pb, com ~1 milhão de cópias por genoma haploide
32
9. Qual a importância das inserções Alu?
✔️ São estáveis e raramente sofrem mutações ermitem traçar linhagens ancestrais ✔️ Muito úteis em estudos populacionais e evolutivos
33
10. Como se deteta uma inserção Alu por PCR?
Um único par de primers amplifica: Fragmento curto (~100 bp): ausência do Alu- alelo negativo Fragmento longo (~400 bp): presença do Alu- alelo positivo → Visualização por eletroforese