Quiz 1

Question 1

Definición transcriptomica

Answer 1

Expresión
(ADN —> ARN)

Antes de que se haga proteína

Question 2

Definición proteomica

Answer 2

Se usa para diagnostico (biomarcador)
Modificaciones postraduccionales

Question 3

Definición nutrigenomica

Answer 3

Cambio de expresión segun tu dieta

Question 4

Definicion secuenciación

Answer 4

Orden exacto de los nucleotidos

Question 5

Método de Sanger

Answer 5

• Se utilizaban los ddNTPs (cortan la cadena de ADN que quieres secuenciar en los OH)
• Oligos flanquean (seleccionan la cadena de ADN para identificarla)

Usa radiación

Question 6

Definicion Next generation

Answer 6

Secuencia en multiple sitios en escala masiva

Question 7

Definicion cobertura

Answer 7

Numero de lecturas alineadas.

Es la secuencia de referencia

Question 8

Definición profundidad

Answer 8

Numero de repeticiones

Question 9

Etapas next generation

Answer 9

1. Fragmentacion
2. Libreria
3. Secuenciacion
4. Analisis

Question 10

Que pasa en la fragmentacion?

Answer 10

Se corta la cadena de forma
- Mecanica (sonicacion)
- Enzimas de restricción (químico)

Question 11

Que pasa en la libreria? en next generation

Answer 11

Agrega adaptadores en los extremos (códigos de barras para identificar el fragmento)

Question 12

Secuenciacion
Next generation

Answer 12

Amplificacion simultanea
Se hace por PCR
- Illumina SOLEXA (puente)
- Ion torrent (emulsion) (pH)
O
Pirosecuenciación: libera fosfato y crea luz

Question 13

Definicion de sensibilidad

Answer 13

Parámetro de porcentaje de muestras positivas de la enfermedad

Question 14

Definicion de limite

Answer 14

Menor frecuencia de variante

Question 15

Definición de especificidad

Answer 15

Detecta controles negativos

Question 16

Definicion de exactitud

Answer 16

Concordancia de mutuaciones detectadas a las esperadas

Question 17

Definicion de precision

Answer 17

Reproducibilidad de datos

Question 18

En que especies se hizo el proyecto del genoma humano?

Answer 18

• Drosofila (mosca)
• Raton (mus)
• C. Elegans (lombriz)
• Humano

Question 19

Definicion microarreglo

Answer 19

Evalua polimorfismos de ADN

Question 20

Definicion librerías en proyecto de genoma humano

Answer 20

El método de secuenciación que se usa es BAC —> cortar fragmentos

Question 21

Cual es la diferencia entre Next generation y proyecto del genoma

Answer 21

El metodo de secuenciacion
- NG: amplificacion simultanea
- PGH: BAC (cromosomas artificiales de bacterias)

Question 22

Definicion genoma

Answer 22

Conjunto de pares de bases contenidos en el ADN de un organismo

Question 23

Clasificacion de los cromosomas dependiendo de la posicion del su centromero

Answer 23

• Metacentrico (centrado)
• Submetacentrico (un brazo mayor que el otro)
• Acrocentrico (brazo p muy pequeño)
• Telocentricos (un solo brazo)

Question 24

Descripcion morfologica del crosomoma 21,22, Y

Answer 24

Pequeño
Acrocentrico
Con satelites en 21 y 22

Question 25

Cual es la region especifica del cromosoma Y

Answer 25

MSY (y no recombina) Se hereda del linaje paterno

Question 26

Explica la imagen del arbol de navidad

Answer 26

- La RNA polimerasa comienza a encontrar la secuencia promotora - Termina cuando encuentra la señal de terminación - Trabajan simultáneamente

Question 27

Epigenomica

Answer 27

Regulacion de la expresión mediante plegamiento de ADN - Metilación / acetilación - Programación fetal

Question 28

Años del proyecto del genoma humano

Answer 28

1990-2003

Question 29

Finalidad / objetivos del proyecto del genoma humano

Answer 29

- Conocer, caracterizar y clasificar - Organizar y almacenar - Desarrollar tecnologías y herramientas para analizar - Etico y legal

Question 30

Bandeo G

Answer 30

- Más utilizada - Digestión (tripsina) - Tinción Giemsa - Claras = G negativas

Question 31

Bandeo Q

Answer 31

- Tinción fluorescente (quinacrina) - A y T - Luz UV

Question 32

Bandeo C

Answer 32

- Solución de hidróxido barico - Tinción Giemsa - Centromero denso

Question 33

Bandeo T

Answer 33

- Cercanas a telomeros - Temperatura - Tinción Giemsa - Para ver la edad

Question 34

Bandeo R

Answer 34

- Q negativas - Inverso a bandas G - Temperatura y sal - Tinción Giemsa o cromocina - G y C

Question 35

FISH

Answer 35

Fluorescense in situ hibridization - Marcas la sonda - Desnaturalizas con calor

Question 36

XCR

Answer 36

Region conservada Presente en autosomas monotrema y x de marsupiales

Question 37

XAR

Answer 37

X added regions Origen autosomico Cromosoma X entre Euterianos y marsupiales

Question 38

PAR

Answer 38

Pseudoautosomal region Recombina con Y

Question 39

S1-S5

Answer 39

Estratos evolutivos Divergencias (se forman) por falta de recombinación

Question 40

Modelo evolutivo de los cromosomas sexuales

Answer 40

- Tiene una región que determina el género - Hay un giro en las regiones y eso impide la recombinación genética