Quiz 2

Question 1

Concepto de los elementos funcionales y repetidos del genoma

Answer 1

Distintas proteinas (isoformas) pueden venir del mismo gen, por el splicing alternativo

Question 2

Modificaciones post transcripcionales
Para que sirven? y Cuales son?

Answer 2

Para no degradar el ARN
- Cap: protege
- Cola de PoliA: protege
- Splicing: Mecanismo de producción de diferentes isoformas.
Deja pasar al exon, y corta al intron

Question 3

Que necesitas hacer para traducir el ARN?

Answer 3

Quitarle la Cap y la cola de PoliA.
Que se una la ligasa para juntar los exones

Question 4

Tipos de ARN.
Cuales son? A que pol estan unidos?

Answer 4

m: POL II (lleva el codon)
t: POL III (anticodon)
r: POL I (60s + 40s) (complejos proteicos + rARN)

Question 5

Modificaciones post traduccionales
Para que sirven? y Cuales son?

Answer 5

ARN —> proteínas
- Acetilacion: afloja la cadena (mejor lectura)
- Metilacion: enreda la cadena (más difícil la lectura)
- Ubiquitinacion: para que el proteosoma la ubique

Question 6

Tipos de Degradacion de ARN

Answer 6

• Independiente: una exonucleasa quita el 5’cap (decaping)
• Dependiente: una exonucleasa corta la cola de PoliA
• Endonucleotica: una endonucleasa corta todo el ARN

Question 7

Pasos de la Maduración de tRNA

Answer 7

1. Elimina intron de 14 nucleotidos
2. RNAasa elimina los primeros nucleotidos de 5’
3. El residuo UU en 3’ se cambia por ACC
4. Modificaciones de pb

Question 8

Que hay en rio arriba (-)?

Answer 8

• Enhacers
• Islas CpG
• TATA
• Factores de transcripción

Question 9

mRNA

Answer 9

Lineal

Question 10

tRNA

Answer 10

Unico para cada aminoacido

Question 11

rRNA

Answer 11

Subunidades

Question 12

siRNA

Answer 12

Silenciamiento genico
Degrada el mRNA

Question 13

snRNA

Answer 13

Spliceosoma
Esta en el nucleo
U1-U6

Question 14

mtRNA

Answer 14

Mitocondrial
Mujeres

Question 15

miRNA

Answer 15

Bloquea unión mRNA

Monocatenario = activo
Experimento flores

Question 16

hnRNA

Answer 16

Esta en el núcleo
Es el preRNA
Sin modifcaciones

Question 17

lncRNA

Answer 17

Incorpora

Question 18

Estruturas del RNA

Answer 18

Secundaria: Hairpins (5-10 nt)
Stemloops (1000s nt)
Terciaria: Pseudoknot (2 stem, 2 loops)

Question 19

Pasos de la maduración del miRNA

Answer 19

1. DROSHA: corta la forma bicatenaria
2. Sale del núcleo
3. DICER: corta el loop
4. Argonauta-RISC: exonucleasa corta extremos
5. Se une a la cadena blanco (a la que no quieres que se traduzca)
6. Inhibir traducción

Question 20

Fase piloto del proyecto ENCODE

Answer 20

• Estrategias y uso de tecnologías
• Hibridación CHIP chip
• Regiones ortológicas (vienen del mismo ancestro)

Question 21

Fase 2 del proyecto ENCODE

Answer 21

• Metodología
• Caracterización de RNAs no codificantes

Question 22

Definición gen

Answer 22

Secuencia de nucleotidos para sintetizar una proteína

Question 23

Concepto de pseudogen

Answer 23

No produce proteínas por mutaciones en codones.

Question 24

Definición de pseudogen

Answer 24

Secuencia de DNA derivadas de duplicación o retroposición de genes funcionales en selección natural adquieren nuevas funciones reguladoras o variabilidad.

Question 25

A que se deben los paros prematuros en los pseudogenes?

Answer 25

- Secuencias duplicadas - Mutaciones en marco de lectura - Adhesiones y deleciones

Question 26

Tipos de pseudogenes

Answer 26

- Procesado: No intrones, deriva de mRNA maduro, tiene cola de PoliA (RETROTRANSCRIPCION) - No procesado: Tiene intrones, deriva de DNA duplicado en tandem (DUPLICADO) - Unitary: no tiene gen parental - Segregating: una misma especie

Question 27

Que es un retrogen?

Answer 27

No tiene intrones y deriva de un pseudogen

Question 28

Que es el splicing alternativo?

Answer 28

Mecanismo de producción de diferentes isoformas

Question 29

Concepto duplicaciones segmentales

Answer 29

Pueden generar duplicaciones o deleciones

Question 30

Short tandem repeat

Answer 30

- Repetición de 2 o más pares de bases - No codificante - Marcador genético

Question 31

Low copy repeat

Answer 31

1-300 kb

Question 32

Tipos de low copy repeat

Answer 32

- Pericentromericos: generados por duplicación intercromosomal - Subtelomericos: En bloques, y da variabilidad genetica - Intersticiales: Duplicaciones intracromosomicas, y son los más grandes

Question 33

En el low copy repeat la heterocromatina es _________ y la región genica es _______

Answer 33

Neutro Riesgo

Question 34

snoRNA

Answer 34

rRNA Splicing

Question 35

XIST

Answer 35

Regula la inactivación del cromosoma X

Question 36

H19

Answer 36

Imprinting

Question 37

Trasposones

Answer 37

- Genes saltarines - Se pueden replicar e insertar en diferentes localizaciones

Question 38

Retrotrasposones

Answer 38

- Clase I - En duplicación o desplazamiento a RNA - En bandas G - Autonomos

Question 39

Retrotrasposones LTRs

Answer 39

Largas ( 100 pb a 5 kb ) En el extremo de los cromosomas

Question 40

Retrotrasposones no LTR

Answer 40

LINES: 20% del genoma SINES: 13% del genoma

Question 41

DNA trasposones

Answer 41

Saltan directamente