Riboswitches Flashcards
Qu’est-ce qu’un ARN régulateur?
ARN non codant impliqué dans la régulation post-transcriptionnelle
Quels sont les 2 grands types d’ARN régulateurs?
- sRNA (small RNA) : S’apparient avec des ARNm et inhibent ou activent la traduction
- Riboswitches : Structures qui se replient en réponse à un métabolite
Quelles sont les 2 catégories de sRNA?
- sRNA trans : Appariement partiel
- sRNA cis : Antisens, appariement parfait
Comment les sRNA trans vont inhiber la traduction?
En masquant la séquence Shine Dalgarno ou en dégradant l’ARNm
Quelle protéine est nécessiare pour l’appariement du sRNA à l’ARNm?
Hfq
Comment RyhB régule-t-il l’expression de gènes fer-dépendants comme sodB?
En cas de carence de fer, il bloque le site Shine Dalgarno, ce qui empêche la liaison du ribosome et amène la dégradation de l’ARNm
Comment RyhB inhibe la synthèse de clusters Fer-Soufre?
Inhibition des gènes iscS, iscU et iscA
Comment RyhB active la transcription de shiA?
En déliant la structure hairpin qui bloquait le RBS
Comment RyhB active cirA?
En retirant Hfq de l’ARNm
Dans quels contextes RyhB va-t-il activer la transcription?
Lorsque les protéines visées peuvent importer du fer ou des acides aminés aromatiques, qui nécessitent du fer lors de leur synthèse
Quel est le rôle de MucD chez P. aeruginosa?
Inhiber la production d’alginate, protéine impliquée dans la formation des biofilms
Quel est le rôle de GlnA chez C. acetobutylicum?
Synthèse de la glutamine, enzyme clé dans l’assimilation de l’azote
Que se passe-t-il chez C. acetobutylinum en cas d’excès d’azote
L’ARNas va s’apparier à l’ARNm de glnA pour réduire le coût énergétique qu’engendrerait lasynthèse de toutes ces molécules
Explique le fonctionnement du système Csr
1- CsrA se lie à la séquence SD
2- ARNas CsrB/CsrC séquestre CsrA
3- Activation de la traduction
Que sont les riboswitches
Segment d’ARN situé dans la région 5’ non traduite d’un ARNm qui change de conformation en réponse à un signal chimique (ligand), régulant l’expression du gène sans intervention de protéine
Quelles sont les composantes d’un riboswitch?
- Aptamère : Domaine qui lie le ligand
- Plateforme d’expression
Quelles sont les applications des sRNA et des riboswitches?
- Optimisation d’expression génique
- Antibiotiques ciblant les riboswitches => Arrêt de voies métaboliques essentielles
- Outils de détection (stress pour ARNs et biosenseur en couplant le ligand à une GFP pour riboswitch)
