T11 - T15 Flashcards
1
Q
Porque razão conseguimos manipular DNA?
A
- Múltiplas espécies , uma mesma linguagem genética.
2
Q
O que é cDNA Cloning?
A
- A clonagem a partir de moléculas de mRNA depende de uma polimerase incomum, a transcriptase reversa, que pode usar uma molécula de RNA de fita simples como molde e sintetizar um DNA complementar (cDNA).
- O cDNA resultante em comprimento total contém uma sequência ininterrupta que codifica a proteína de interesse.
3
Q
Que tipos de cromossomas são geneticamente instáveis?
A
- Aqueles sem centrómero ou com mais de um.
4
Q
Caso um cromossoma apresente 2 centrómeros um deles pode ser desativado, qual?
A
- O do braço comprido, isto é o do braço Q.
5
Q
Porque razão as bandas citogenéticas aparentam cores diferentes após coloração específica?
A
- Devido à variação na composição de bases e estrutura cromatínica das diferentes regiões do DNA.
- Regiões ricas em adenina e timina (A-T) ⭢ coram mais intensamente, aparecendo como bandas escuras (bandas G);
- Regiões ricas em guanina e citosina (G-C) ⭢ coram menos, aparecendo como bandas claras.
6
Q
Como pode descrever a localização de um dado gene num cromossoma?
A
- Nº do cromossoma;
- Braço Q ou P;
- Região;
- Banda;
- Sub-banda.
7
Q
Qual a importância do centrómero?
A
- Crucial para a correta segregação dos cromossomas durante a divisão celular.
- É o ponto de ligação para as fibras do fuso mitótico.
8
Q
Identifique os três tipos de cromossomas no que diz respeito à localização do centrómero.
A
- Metacêntrico: centrómero está aproximadamente no meio, braços de comprimento quase igual.
- Submetacêntrico: centrómero está deslocado do centro, criando um braço curto (p) e um braço longo (q).
- Acrocêntrico: centrómero está muito próximo de uma extremidade, criando um braço muito curto e um braço muito longo.
9
Q
O que distingue os centrómeros dos diferentes cromossomas humanos?
A
- Cada centrómero possui um padrão único de sequência de DNA satélite que facilita a correta segregação dos cromossomos durante a divisão celular.
10
Q
Identifique as regiões importantes do cromossoma Y humano.
A
- Região pseudo-autossômica (PAR): áreas que recombinam com o cromossoma X durante a meiose.
- Região não recombinante do Y (NRY): contém genes específicos do Y.
- Gene SRY: responsável pela determinação do sexo masculino.
- Euchromatina e heterocromatina: diferentes regiões estruturais e funcionais do cromossoma.
11
Q
Qual a importância do gene SRY?
A
- É crucial para a determinação do sexo masculino.
- Codifica um fator de transcrição que inicia o desenvolvimento dos testículos, levando à diferenciação sexual masculina.
- A ausência ou mutação deste gene geralmente resulta no desenvolvimento de características femininas.
12
Q
O que significa um organismo ser hermafrodita sequencial? Dê exemplos.
A
- Pode mudar de sexo durante sua vida.
- Existem dois tipos principais:
- Protândrico: inicialmente macho e depois se torna fêmea (ex. peixes-palhaço).
- Protogínico: inicialmente fêmea e depois se torna macho (ex. peixes-labrídeos).
13
Q
Defina SNP e SSR no contexto de mapeamento genético.
A
- SNP ⭢ Single Nucleotide Polymorphism : variações de um único nucleotídeo no genoma que ocorrem com frequência na população. Marcadores genéticos para mapear genes associados a doenças.
- SSR ⭢ Simple Sequence Repeat: repetições curtas de sequências de DNA (microssatélites) que são altamente polimórficas e usadas em estudos de ligação genética e identificação individual.
14
Q
Defina RFLP e suas aplicações no mapeamento genético.
A
- RFLP ⭢ Restriction Fragment Length Polymorphism: é uma técnica que explora variações no comprimento de fragmentos de DNA gerados por digestão com enzimas de restrição.
- As diferenças nos padrões de fragmentos podem ser usadas para mapear a localização de genes, estudar a variabilidade genética e analisar a herança de características genéticas.
15
Q
Quais são alguns exemplos de doenças resultantes de mutações em células germinativas?
A
- Fibrose Cística;
- Hemofilia;
- Anemia Falciforme.
16
Q
O que é uma mutação condicional?
A
- Uma mutação condicional é uma mutação cuja expressão fenotípica depende de certas condições ambientais específicas.
- Isso significa que o efeito da mutação só se manifesta sob determinadas circunstâncias, como mudanças na temperatura, na presença ou ausência de determinados nutrientes, ou outros fatores ambientais.
17
Q
O que é uma mutação de ganho de função?
A
- Mutação que qualitativamente altera a ação de um gene, por exemplo, fazendo uma célula expressar um gene que normalmente não expressaria.
18
Q
O que é uma Mutação Hipomórfica?
A
- Mutação que reduz a expressão de um gene.
19
Q
O que é uma Mutação Hipermórfica?
A
- Mutação que aumenta a expressão de um gene.
20
Q
Qual a diferença entre uma Mutação de Tipo Transição e Transversão?
A
- Mutação Tipo Transição alteram as bases para um do mesmo tipo, p.ex: uma pirimidina para uma pirimidina.
- Mutação Tipo Transversão alteram as bases para um tipo diferente, p.ex: uma pirimidina para uma purina e vice-versa.
21
Q
Que 2 grandes tipos de mutações podem ocorrer a ORF?
A
- Mutação por Substituição de bases;
- Mutação por Adição ou Deleção de bases.
22
Q
O que acontece se o número de bases adicionadas ou deletadas numa mutação não forem múltiplos de 3?
A
- Ocorre um Frameshift!
- Existe uma mudança na estrutura de toda a proteína dessa mutação para a frente.
23
Q
O que é uma mutação sem sentido?
A
- É codificado um codão STOP onde não deveria e a tradução pára.
24
Q
O que é um Hot Spot de mutação?
A
- Locais na cadeia e DNA onde é mais provável ocorrer uma mutação.
- P.ex: sítios de metilação da citosina.
25
Qual o **efeito** dos seguintes **agentes** sobre o **DNA**?
1. Água;
2. Agente Oxidante;
3. Agente Alquilante;
4. Agente Intercalante;
5. Raios Ultra-violeta.
1. **Depurinação** ⭢ Retirada de A e G das deoxirriboses;
2. **Deaminação** ⭢ -NH2 para O;
3. **Adição** de um grupo **metil** ou **etil** nas bases;
4. Moléculas que se enfiam na cadeia de DNA de maneira intercalada e faz **a topoisomerase II deixar uma quebra de DNA e faz haver erros no reparo do DNA**;
5. Forma **dímeros de pirimidinas** (ligações covalentes entre pirimidinas adjacentes, especialmente T).
26
Qual o **efeito** dos seguintes **agentes** sobre o **DNA**?
1. Radiação ionizante;
2. Análogo de base azotada como o 5-bromouracil;
3. Análogos de nucleótidos.
1. **Quebra de DNA** de cadeia única ou de cadeia dupla e causa danos a nucleótidos;
2. Aumenta o **mispairing entre bases**;
3. Alguns análogos podem ser **erroneamente incorporados no lugar dos nucleótidos normais**, resultando em mutações.
27
Qual é o **resultado da radiação UV sobre o DNA**? Quais as **alterações moleculares** que resultam deste processo?
* Pode formar **dímeros de pirimidinas** (especialmente timina) através da formação de ligações covalentes entre pirimidinas adjacentes;
* Causando a **distorção da dupla hélice de DNA** e formação de **fotoprodutos 6-4** (ligações entre o carbono 6 de uma timina e o carbono 4 de uma citosina adjacente).
28
Quais os **mecanismos de reparação** envolvidos nas **mutações** resultantes da **radiação UV**?
* **Reparação por Excisão de Nucleotídeos (NER):** Remove e substitui segmentos de DNA contendo dímeros de timina e outros fotoprodutos. Envolve as etapas de **reconhecimento do dano**, **excisão do segmento danificado**, **síntese** de DNA **complementar** e **ligação**.
29
Em que **circunstâncias** mutações associadas à **radiação UV** podem ter **piores consequências**?
* **Exposição prolongada** a radiação.
* Pessoa com **sistema de reparação deficiente**.
30
Quais os efeitos de **radioatividade no DNA**?
* **Quebra de cadeia dupla e simples de DNA**, e danos em nucleótidos, que podem causar tumores e mutações que podem ser transmitidas hereditariamente (germinativas).
31
O que são **mutações dinâmicas**?
* Mutações dinâmicas são um tipo específico de mutação genética caracterizada pela **expansão instável de sequências repetitivas trinucleotídicas de nucleotídeos no DNA**.
* Essas mutações são dinâmicas porque a quantidade de repetições pode aumentar (ou, menos frequentemente, diminuir) de uma geração para a outra, tornando-as instáveis ao longo das gerações.
32
Qual é uma **patologia** resultante de uma mutação dinâmica e qual a sua **causa molecular**?
* A **Síndrome do X frági**l, causada pela expansão do trinucleotídeo **CGG no gene FMR1**.
33
Qual é o efeito das **aflatoxinas no DNA**?
* Elas são um potente **carcinógeno**.
* Elas **geram sítios apurínicos** após a formação de um produto de adição na posição N-7 da guanina.
34
Qual o **mecanismo /enzimas** responsável por reparar alterações provocadas pela presença de **bases modificadas quimicamente**?
* **Excisão de base** realizado por **DNA glicosilases** específicas para cada base!
35
Qual é o **mecanismo /enzimas** responsável por reparar alterações provocadas pela **presença de bases mal emparelhadas**?
* O **sistema de reparo de incompatibilidade**, que reconhece o grau de metilação de uma fita e prefere excisar nucleotídeos da fita menos metilada, que deve ser a fita recém-sintetizada.
36
Qual é o **mecanismo /enzimas** responsável por reparar alterações provocadas pela **presença de nucleótidos que perdem as suas purinas /pirimidinas**?
* **Sistema de reparação de endonucleases AP** que retiram os açúcares sem base (espaço que vai ser posteriormente preenchido por DNA polimerase).
37
Qual é o **mecanismo /enzimas** responsável por reparar alterações provocadas pela **existência de um fragmento na cadeia de DNA contendo uma sequencia de 10 nucleótidos mutados**?
* Através do **mecanismo de NER (nucleotide excision repair)**, que retira a porção de DNA mutada e usa a cadeia que restou como template para preencher o espaço vazio.
38
Qual é o **mecanismo /enzimas** responsável por reparar **alterações provocadas pela radiação ultravioleta**?
* Uso de enzimas para **excisão de nucleótidos ou bases (NER e BER).**
39
Descreva o **mecanismo que permite que a replicação** prossiga **apesar** de existir uma **sequência mutada** que **não** foi **reparada** numa das cadeias do DNA.
* Reparo Pós-Replicação (Sistema **SOS**).
* Síntese **Translesão** (**TLS**).
* **Mecanismo**: O sistema SOS é uma resposta global ao dano no DNA em bactérias (principalmente Escherichia coli), ativado pela presença de lesões que bloqueiam a replicação. Ele envolve a **indução de um conjunto de genes que codificam várias proteínas de reparo e tolerância a danos.**
40
Qual o **complexo** responsável pela **reparação por excisão de nucleótidos** e qual a sua **constituição**?
* O complexo responsável pela reparação por excisão de nucleótidos (**NER**) é composto por:
1. **XPC-RAD23B:** Detecta lesões distorcidas na hélice de DNA.
2. **XPA, RPA:** Estabilizam a região do dano e recrutam outras proteínas.
3. **TFIIH:** Um complexo proteico com atividade helicase (XPB e XPD) que desenrola a hélice de DNA ao redor do dano.
4. **ERCC1-XPF:** Nuclease que **corta** o DNA no **lado 5'** da lesão.
5. **XPG**: Nuclease que **corta** o DNA no **lado 3'** da lesão.
41
Em que situações da célula é que o **complexo de reparação por excisão de nucleótidos vai atuar**? Exemplifique.
* Danos por **radiação UV**, produtos quimicos, oxidação e toxinas.
42
Qual a função do **XPD**, membro do complexo **NER**?
* **Separa** as cadeias de DNA na **direcção 5’-3’** e **ancora** o complexo **CAK**.
43
Qual o **fenótipo** e **alteração molecular** de um individuo com **Xeroderma pigmentoso**?
* **Hiperpigmentação** da pele após exposição a luz solar
* **Aumento do risco em 1000x** = de desenvolver cancro de pele
* A nível **molecular**: mutações no **domínio helicase no XPD** sem alterar a sua estrutura (altera a NER).
44
Qual o **fenótipo** e **alteração molecular** de um individuo com **Tricotiodistrofia**?
* **Atraso mental** e de desenvolvimento severo;
* Características de **envelhecimento precoce**;
* A nível **molecular**: Causa alterações na **estrutura geral do XPD**
45
Qual o **fenótipo** e **alteração molecular** de um individuo com a **síndrome de Cockayne**?
* **Fotossensibilidade**;
* **Malformações ósseas e estatura reduzida**;
* A nível **molecular**: Mutações numa **glicina** no dominio **helicase** (**altera a NER e a transcrição**).
