TEMA 11 - Traducción III (Elongación y Terminación) Flashcards
¿Cuál es el esquema general de la elongación?
Cada vez que se añade un aminoácido a la cadena polipeptídica se tienen que dar tres pasos:
1. Fijación del aminoacil-tRNA al sitio A, facilitado por el factor de elongación EF-Tu.
2. Formación del enlace peptídico entre el aminoacil - tRNA del sitio A y la cadena peptídica unida al peptidil-tRNA en el sitio P.
3. Translocación del peptidil-tRNA y el codón asociado del sitio A al P, facilitado por el factor de elongación EF-G.
Los factores EF-Tu y EF-G dependen de GTP para funcionar.
La elongación y la terminación de la traducción están muy conservadas entre procariotas y eucariotas
¿Cómo se regulan por GTP los factores de elongación
¿Cuál es la función del factor de elongación EF-Tu?
Fijación del aminoacil-tRNA al sitio A (necesario que el sitio A este vacío antes).
Esto está mediado por EF-Tu en procariotas y eEF-Tu en eucariotas.
EF-tu solo se une al aminoacil-tRNA si está unido a GTP (y no GDP).
El aminoacil-tRNA no puede reaccionar con el péptido mientras esté unido a EF-Tu.
¿Cómo lleva a cabo el factor de elongación EF-Tu su función?
- El complejo EF-Tu-GTP aminoacil-tRNA se une al sitio A del ribosoma.
- La actividad GTPasa de EF-Tu se activa cuando se inserta el tRNA correcto (factor binding center o sarcin-ricin loop).
- EF-Tu-GDP pierde la afinidad por el aminoacil-tRNA y sale dejándolo en el sitio A.
- Cuando EF-Tu-GDP sale se da la acomodación del aminoacil- tRNA (el aminoacil-tRNA rota aproximándose al peptidil- tRNA).
- Cuando el anticodón del tRNA interacciona con el codón del mRNA, tres bases del rRNA 16S (subunidad 30S) estabilizan la unión.
¿Qué función tiene la proteína EF-Ts?
*La proteína EF-Ts es una proteína que actúa como factor intercambiador de nucleótidos de guanina (GEF) .
* Estimula la disociación de GDP del factor EF-Tu y la unión de una molécula de GTP para volver a tener EF-Tu-GTP activo.
¿Por qué necesita hidrolizarse el GTP de EF-Tu-GTP?
EF-Tu-GTP tiene que hidrolizar el GTP para permitir que se forme el enlace peptídico:
* EF-Tu-GTP bloquea físicamente el aminoácido del aminoacil-tRNA.
* EF-Tu-GTP no permite que el Aminoacil-tRNA se acomode.
¿Qué tres mecanismos contribuyen a la especifidad y ayudan a la selección del aminoacil-tRNA correcto?
- El rRNA 16S estabiliza solo la union anticodón-codon correcta.
- La hidrólisis de GTP y liberación de EF-Tu- GDP sólo se produce cuando se establece el apareamiento codon-anticodon correcto.
- La rotación del tRNA durante la acomodación crea una tensión sobre la interacción anticodón-codón que solo el anticodón apareado del modo correcto puede soportar.
¿Cómo se da la formación del enlace peptídico?
¿Cuál es la función del factor de elongación EF-G?
- Después de formarse el enlace peptídico los tRNAs fluctúan entre dos estados, clásico e híbrido.
- En el clásico el peptidil-tRNA está en el sitio A y en el sitio P está un tRNA vacío.
- En el estado híbrido los tRNAs se mueven en la parte de la subunidad mayor (el peptidil-tRNA al sitio P y el tRNA vacío al sitio E) pero continúan en sus sitios en la subunidad pequeña.
- El factor EF-G-GTP los estabiliza en la forma híbrida.
¿Cómo lleva a cabo el EF-G su actividad?
¿En que dos pasos se puede dividir la terminación de la traducción?
- Liberación de la cadena peptídica del tRNA.
- Liberación del ribosoma del tRNA y del mRNA (ribosome reclycing).
¿Que codones son stop?
UAA
UAG
UGA
Estos codones no son reconocidos por aa-tRNAs sino por proteínas.
¿Qué dos tipos de factores de terminación de la transcripción existen?
- Factores de clase I: RF1 y RF2 en procariotas, eRF1 y eRF2 en eucariotas.
- Factores de clase II: RF3 en procariotas, eRF3 en eucariotas.
¿Cómo se da la terminación de la traducción? (liberación de la cadena peptídica del tRNA)
- Los factores de clase I reconocen los codones stop y se introducen en el sitio A estimulando la hidrólisis del péptido sintetizado del t-RNA.
- Una vez que se ha liberado el péptido se une RF3-GDP, al unirse se provoca un cambio conformacional que hace que intercambie GDP por GTP, y libera a el factor de clase I (en este caso la proteína asociada a GDP es la que tiene más afinidad por su diana).
- RF3-GTP se hidroliza (por estimulación del factor binding center o sarcin-ricin loop) y pierde afinidad por el sitio A saliendo del ribosoma.
- Liberación del ribosoma del tRNA y del mRNA.
¿Cómo se da la terminación de la traducción? (ribosome recycling)
- Se une el factor de reciclaje del ribosoma RRF (ribosome reclycing factor).
- El factor de translocación EF-G-GTP reconoce el sitio A como un sitio vacío y mueve lo que hay en el sitio A, liberando los tRNAs.
- EF-G-GTP se hidroliza a EF-G-GDP empujando a RRF al sitio P (por el que no tiene afinidad) y liberándose del ribosoma.
- Al no haber tRNAs ni factores IF3 se puede unir separando las dos subunidades del ribosoma y liberando el mRNA.
*En eucariotas hay otra proteína Rl1-ATP que participa en la liberación del ribosoma del tRNA/mRNA
¿Qué son los mRNA eucariotas circularizados?
mRNAs en los que la PABP de la cola poly A y el eIF4F en el 5’cap se unen para formar un mRNA circularizado.
De esta forma, los ribosomas estan siendo constantemente reutilizados.
El factor eIF3 mantiene la subunidad 40S en su estado disociado hasta que se ensablan las dos unidades del ribosoma.
¿Cómo inhibe la traducción el antibiótico Puromicina?
