Traduction Et Repliement Des Protéines Flashcards

1
Q

Comment est-il possible de lasser de nucleotides aux acides aminés?

A

Les ARNm sont décodés en groupes de 3 bases (codons) qui codent pour des acides amines

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Q

Vrai ou faux. Différents codon peuvent coder pour un même acide amine?

A

Vrai (sauf pour la methionine et la tryptophane)

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3
Q

Quel codon signale l’initiation?

A

AUG (methionine)

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4
Q

Quels condoms signalent stop?

A

UAA, UAG, UGA

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5
Q

Vrai ou faux. Les plantes et les humaines n’ont pas le même code génétique?

A

Faux, le code génétique est universel

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6
Q

Quelle est la structure d’un ARNm?

A

Coiffe
5’ UTR
AUG
Région codante (synthèse protéique)
UAA, UAG, UGA
3’ UTR
Queue poly-A

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7
Q

Pour quoi est-ce que 3’ UTR permet la stabilité de l’ARNm?

A

Ribosome est beaucoup plus gros qu’un cordon, donc 3’ UTR permet de soutenir le ribosome après stp

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8
Q

Comment est-ce que le ribosome reconnaît AUG?

A

Il se déplace sur la coiffe à la recherche d’un AUG

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9
Q

Qu’est-ce qu’un cadre de lecture ouvert?

A

ATG (ou AUG) suivis de plein de codons avant un cordon stop

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10
Q

Combien de cadres de lectures possibles il y a pour une molécule ARNm?

A

3 (enlève 1 nucleotide à chaque fois par mutation)

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11
Q

Quelles sont les mutations dans le cadre de lecture au niveau de l’ADN?

A

Silencieuse : change une base mais pas d’impact sur l’acide aminé
Faux-sens : change une base et l’acide aminé
Non-sens : change une base qui entraîne un acide aminé stop (problème si ça arrive trop tôt dans la protéine)
Continuation : change un cordon stop en acide aminé (en général la synthèse protéines s’arrête pas longtemps après)
Insertion : ajout d’une base donc déplacement du reading frame
Deletion : élimination d’une base donc déplacement du reading drame

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12
Q

Qu’est-ce qui permet la lecture du code génétique?

A

ARNt : adaptateurs moléculaires qui assortissent les acides aminés aux codons

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13
Q

Combien y a t’il de codon?

A

64 codons
61 codent pour 20 acides amines
3 codons stop
1 codon initiation

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14
Q

Pour quoi le code génétique est dit dégénéré?

A

Il y a une redondance : certains acides aminés ont plus qu’un ARNt

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15
Q

Comment le cadre de lecture est-il lu?

A

Aminoacyl-ARNt-synthétase (activité ATPase) reconnaît et couple un acide aminé à son ARNt spécifique = processus de chargement

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16
Q

Comment se caractérise la liaison entre le groupe amino acide et l’ARNt?

A

Riche en énergie dinc très réactive

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17
Q

Qu’est-ce qu’un ARNt chargé?

A

Une ARNt avec son acide aminé

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18
Q

Une fois que l’assortissement est fait, comment se fait la traduction?

A

Reconnaissance et appariement entre les codons de l’ARNm et les anticodons de l’ARNt

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19
Q

Où se fait la lecture du cadre de lecture?

A

Dans les ribosomes (permet la proximité et donc force le lien entre l’acide aminé et l’ARNt)

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20
Q

Quelles sont les composantes de ribosomes?

A

Gros complexe composé de 4 arn (tiennent protéines ensemble) et de plus de 80 protéines
Deux sous-unîtes : grande et petite
Arn pèsent plus que les protéines dans la masse du ribosome

21
Q

Quels sont les sites du ribosome?

A

1 site de liaison a l’ARNm
3 sites de liaison a l’ARNt : A (accepteur), P (transition) et E (exit)

22
Q

Quelles sont les 3 phases majeures de la traduction?

A

Initiation : chargement du ribosome
Élongation : lié le code génétique pour associer les aa
Terminaison : trouve stop et se dissocie

23
Q

Quelles sont les étapes de l’élongation ?

A

Dans site À, ARNt nouvellement chargé présente son anticodon au codon
Rapprochement entre les acides aminés des arnt du site À et P
Formation d’un lien entre ces acides aminés
Déplacement du ribosome pour que le ARNt qui n’a plus d’acide aminé soit dans le site E
Expulsion de celui-ci
Et on recommence

24
Q

Comment est-ce que la traduction se termine?

A

Ribosome arrive à un colon stop et aucun ARNt n’y correspond
Facteur de libération se lie au site À (où il y a un cordon stop) met fin à la traduction
Libération du polypeptide achevé et dissociation des sous-unîtes du ribosome

25
Q

Que sont les polysomes?

A

Série de ribosomes qui traduit simultanément une même molécule d’ARNm
Effet : plus grande efficacité de la traduction

26
Q

Quand commence le repliement des protéines?

A

Tout de suite après que l’ARNm mature sort du ribosome

27
Q

Qu’est-ce qui peut affecter le repliement de protéines?

A

Environnement (selon leurs propriétés qui varient selon le pH, le sel, la température, le statut oxydatif, etc.)
Mutations (changement de la séquence) héréditaires ou non

28
Q

Quel impact à la grandeur des protéines?

A

Plus la protéine est grande, plus elle est complexe et donc plus les erreurs de repliement sont fréquentes

29
Q

Vrai ou faux. Dans certaines maladies, le taux d’erreur de repliement augmente de façon bénéfique ?

A

Faux, de façon nefaste

30
Q

Comment est-ce qu’une mutation peut affecter le repliement de protéines?

A

Change le cordon donc change l’acide aminé
Changement majeur parce que les différents acides aminés ont des propriétés spécifiques qui ne s’avancent pas de la même façon ensemble

31
Q

Nomme des exemples de mauvais repliement de protéines?

A

Anémie falciforme (maladie genetique)
Cataracte (repliement des protéines affecte avec l’âge)

32
Q

Que sont les cristallines?

A

Protéines structurales solubles dans l’eau se trouvant dans la lentille et la cornée de l’œil permettant la transparence

33
Q

Quelle protéine empêche les cataractes?

A

Alpha-cristalline : chaperone moléculaire ayant la capacité d’empêcher la précipitation des protéines dénaturées et d’augmenter leur tolérance au stress cellulaire

34
Q

Que sont les cataractes?

A

Déclin des fonctions de l’alpha-cristalline (avec l’âge), ce qui cause une précipitation des protéines dans la lentille
Donc plus de maintien de la transparence de la lentille parce que les protéines solubles ne sont pas maintenues

35
Q

Quelle partie de la protéine est repliée en premier?

A

N-terminal (synthétise en premier donc sort du ribosome en premier)
C-terminal replié après

36
Q

Quelles sont les étapes du repliement d’une protéine ?

A

Formation (par replis indépendants) dès éléments de la structure secondaire (hélice alpha, feuillet bêta, boucle et coudes)
Formation des domaines
Ajustement des domaines pour repliement final

37
Q

Qu’est-ce qui permet aux protéines nouvellement synthétisées d’acquérir leur conformation correcte?

A

Protéines chaperones moléculaires (hsp70)

38
Q

Quel est le rôle des chaperones moléculaires?

A

Prévenir l’agrégation en s’attachant à des parties prones à s’agréger telles que les régions hydrophobes (qui veulent sortir du cytoplasme parce que elles interagissent très mal avec le milieu aqueux)

39
Q

Comment se fait la consommation d’énergie lors du repliement des protéines?

A

Fixation des chaperones au polypeptide en synthèse : pas de consommation d’ATP
Délogement des chaperones de la protéine : consommation d’ATP

40
Q

Vrai ou faux. Toutes les protéines sont correctement repliées grâce à hsp70?

A

Faux, le repliement est complexe et ça demande moins d’énergie de faire plein de protéines meme si beaucoup d’entre elles seront mal repliées que de toutes les avoir correctement repliées

41
Q

Que se passe-t-il avec les protéines mal repliées?

A

Degradation par l’UPS (pour pas d’accumulation de protéines incorrectes)

42
Q

Comment se fait en gros la dégradation des protéines mal repliées ?

A

E3 reconnaît les protéines mal repliées pour promouvoir l’attachement de l’ubiquitine (habituellement 4 pour s’assurer qu’on ne dégrade epas une protéine pour rien)
Protéine avec ubiquitine passe dans le tube du proteasome où les proteases hydrolysent les protéines en petits peptides

43
Q

Quelles maladies peuvent être causées par des mutations affectant le repliement des protéines?

A

Fibrose kystique
Maladie de Huntington (maladie génétique neurodegenerative)
Maladie de Alzheimer (protéines mal repliées qui ne sont pas éliminées)
Maladies causées par des prions ( protéines en plusieurs conformations dont une est auto réplicative)

44
Q

Quel est le rôle de la Huntingtine?

A

Réguler diverses fonctions cellulaires comme le trafic vésiculaire et la sécrétion de facteurs neurotrophiques

45
Q

Que se passe-t-il dan sle cas de maladie de Hungtington?

A

Huntingtine s’agrége (à cause d’expansions du triplet CAG qui code pour la glutamine) en formant des fibres amyloïdes (toxiques) et donc perte de sa fonction, ce qui engendre la mort de neurones par Apoptose (pas de renouvellement des neurones)

46
Q

Qu’est-ce qui cause la maladie de l’Alzheimer?

A

Diminution de l’efficacité du repliement et la dégradation de protéines avec l’âge
Formation de plaques amyloïdes (toxiques) détruisant les neurones environnant
Donc perte de fonction dès neurones et leur mort

47
Q

Comment fonctionne la maladie de prion ?

A

Changement de conformation d’une protéine prion (donc une correct et l’autre mal repliee)
Celle mal repliée se réplique et peut former des plaques amyloïdes qui induit l’apoptose des neurones

48
Q

Pourquoi est-ce important que les protéines soient repliées dès qu’elles sortent du ribosome?

A

Pour que les domaines hydrophobes ne s’agrègent et ne se précipitent pas dans la cellule
Les chaperonnes s’assurent de ça