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MMD1042 (module 3) > Trafic Membranaire Intracellulaire > Flashcards

Trafic Membranaire Intracellulaire Flashcards

1
Q

Quel est le rôle des membranes internes?

A

Séparer les différents compartiments (organites) qui jouent différents rôles

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Q

Quelles sont les 2 voies principales de trafic membranaire intracellulaire?

A

Voie endosomale (internalisation de la membrane plasmique) et de dégradation (par lysosome)
Voie de sécrétion et de biosynthèse

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3
Q

Vrai ou faux. Il y a continuellement un flux de membranes entre les compartiments intracellulaires et la membrane plasmique?

A

Vrai

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4
Q

Quel type de compartiment est la membrane plasmique par rapport au flux de membranes?

A

Compartiment donneur pour l’endocytose (vésicules se forment à partir de la membrane)
Compartiment receveur pour la sécrétion (vésicules se fusionnent à la membrane)

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5
Q

Comment se fait le transport des vésicules?

A

Grâce aux microtubules

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6
Q

Comment se caractérise le cytoplasme des cellules?

A

Extrêmement dense (contient beaucoup d’organites)

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7
Q

Comment se fait le transport intracellulaire?

A

Via la formation et la fusion des vésicules
Bourgeonnement -> vésicules -> fusion

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8
Q

Qu’est-ce les vésicules transportent?

A

Molécules de chargement (cargo)

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9
Q

Quelles sont les 2 interactions qu’on les vésicules avec la membrane plasmique?

A

Exocytose : sécrétion (fusion avec la membrane plasmique)
Endocytose : internalisation (formation de vésicules à partir de la membrane plasmique)

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10
Q

Comment se caractérise l’endomembrane?

A

Bicouche de feuillets asymétriques (feuillet face à la lumière de la vésicule devient le feuillet externe de la membrane plasmique et vice-versa)

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11
Q

Comment se caractérise l’endomembrane?

A

Bicouche de feuillets asymétriques (feuillet face à la lumière des vésicules devient le feuillet externe de la membrane plasmique)

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12
Q

Quels sont les différents mécanismes d’internalisation à la membrane plasmique?

A

Phagocytose (particules larges)
Macropinocytose (liquide non-spécifique)
Endocytose (plus spécifique)

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13
Q

Quels sont les types d’endocytose?

A

Dépendante de la clathrine
Dépendante de la cavéoline
Indépendante de la caveoline et de la clathrine

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14
Q

Qu’est-ce que la phagocytose?

A

Polymérisation d’actinie à la membrane qui fabrique des pseudopodes qui entourent les particules

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15
Q

Comment est-ce que la phagocytose des corps apoptotiques se produit?

A

Perte de l’asymétrie de la membrane donc PS (phosphatidylsérine) devient exposée au feuillet externe de la membrane et ça fait un signal reconnu par les macrophages

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16
Q

Qu’est-ce que la macropinocytose?

A

Similaire à la phagocytose mais pas de particule solide : ingestion de gouttelettes de fluide avec nutriments
Polymérisation d’actine autour d’une région de membrane activée

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17
Q

Comment se fait l’endocytose dépendante de la clathrine ?

A

Récepteur de chargement qui reconnaît une molécule de chargement (hormone)
Recrutement de clathrine (grâce aux adaptines) et déformation de la membrane
Formation d’un manteau de clathrine et d’un cou de membrane
Scission par la dynamine (hydrolyse de GTP)
Vésicule mantelée de clathrine libérée
Élimination du manteau (hydrolyse d’ATP)

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18
Q

Comment est-ce que la clathrine forme la vésicule?

A

Polymérisation de clathrine en triskèle en forme polyedrale à la membrane forme la vésicule

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19
Q

Sous quelles formes se grive la clathrine ?

A

Cytosol : triskèle
Pendant la formation de vésicules : puits mantelés de clathrine
Après la polymérisation : treillis polyedral

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20
Q

Quels sont les différents manteaux qui peuvent former les vésicules?

A

Clathrine (membrane plasmique et appareil de Golgi)
COPI (appareil de Golgi)
COPII (reticulum endoplasmique)

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21
Q

Qu’est-ce que la caveoline?

A

Protéine membranaire intrinsèque qui s’associe avec les radeaux lipidiques (pour former de l’invagination à la membrane)

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22
Q

Quelle est la différence entre l´endocytose mediee par la caveoline ou par la clathrine?

A

Caveoline : moins spécifique (pas de récepteurs qui stimulent endocytose), vésicules plus petites
Sission par la dynamine (ressemblance)

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23
Q

Qu’est-ce qu’un endosome?

A

Vésicule entourée d’une simple membrane (qui provient de la membrane plasmique à la suite de l’endocytose)

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24
Q

Comment est-ce que les endosomes maturent?

A

Selon leur pH :
Endosome précoce (pH 6.5)
Endosome tardif/CMV (pH 6)
Endolysosome
Lysosome (pH 5)

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25
Q

Quelles sont les fonctions des endosomes?

A

Endosome précoce : tri et recyclage
Lysosome : dégradation

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26
Q

Comment est-ce que les lipoprotéines des basse densité (LDL) sont amenées à être dégradée ?

A

Endocytose de LDL grâce à liaison avec un récepteur
Perte du manteau
Fusion avec endosome
Séparation LDL et récepteur
Transfert de LDL au lysosome
Dégradation en cholestérol libre

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27
Q

Pour quoi est il important de recycler?

A

Il faut que les récepteurs retournent dans la membrane pour qu’il y ait un flux

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28
Q

Que sont les Lysosomes?

A

Site de dégradation du système endomembranaire
Acides et riches en hydrolases

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29
Q

Pourquoi est-il important que le lysosome ait un pH acide?

A

Hydrolases acides dans le lysosome sont des enzymes activent seulement à bas pH (inactivés avant de se retrouver dan s’un lysosome mature pour qu’elles ne dégradent pas les composantes des autres vésicules avant)

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30
Q

Qu’est-ce qui permet d’acidifiant le lysosome?

A

V-ATPase (pompe a H+)

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31
Q

Que sont les exosomes?

A

Vésicules extracellulaires qui proviennent du système endosomal

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32
Q

Comment se forment les exosomes?

A

Bourgeonnement a l’intérieur de l’endossâmes tardif qui donne des corps multivesiculaires (CMV) relâches hors cellule par fusion avec la membrane plasmique = exosomes

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33
Q

A quoi servent les exosomes?

A

Communication entre les cellules

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34
Q

Quelles sont les 3 sources de matériel reçu par les Lysosomes?

A

Phagocytose (phagosome)
Endocytose (endosome tardif)
Autophagie (autophagosome)

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35
Q

Qu’est-ce que l’autophagie?

A

Mécanisme qui entour en membrane des régions de cytoplasme, des agrégats protéiques et certains organites (ex mitochondries) permettant leur dégradation via la fusion avec des lysosomes
Comme phagocytose mais se forme direct dans le cytoplasme

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36
Q

Qu’est-ce que la mitophagie?

A

Autophagie des mitochondries

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37
Q

Comment se fait l’autophagie?

A

Nucléation et extension : fusion de vésicules provenant du RE pour former un phagophore qui lui même se forme autour de ce qui doit être dégradé
Maturation : autophagosome (double membrane bicouche)
Autophagolysosome : fusion du lysosome avec l’autophagosome
Digestion de l’autophagosome par le lysosome intact

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38
Q

Quel est le rôle de l’autophagie?

A

Maintenir l’homéostasie de la cellule
Promouvoir la survie de la cellule (en cas de dépravation de nutriments)

39
Q

Que sont les peroxysomes?

A

Organite sphérique à une simple membrane bicouche
Présent dans toutes les cellules eucaryotes
Ressemblent à des lysosomes

40
Q

Vrai ou faux. Les peroxysomes font partie du système endolysosomal?

A

Faux, ils ressemblent aux Lysosomes mais ne font pas partie du même système

41
Q

Pour quoi les peroxysomes sont importants?

A

Métabolisme : oxydation des acides gras
Detoxification : production et dégradation du H2O2 et le métabolisme des espèces réactive d’oxygène (ROS)
Synthèse des acides biliaire et de lipides

42
Q

Comment se forment les peroxysomes?

A

Bourgeonnement du RE
Peroxysomes matures (Grâce à l’import de protéines)
Fission (dynamine) et croissance

43
Q

Comment se fait la fusion des membranes?

A

Arrimage de la vésicule de transport (grâce aux protéines SNARE)
Coalescence des membranes
Fusion des membranes

44
Q

Quelles sont les protéines SNARE?

A

v-SNARE : sur vésicule
t-SNARE : sur membrane cible (target)

45
Q

Vrai ou faux. La fusion des membranes nécessite une consommation directe d’énergie ?

A

Faux, le désassemblage des complexes v-/t- SNARE dépend de l’hydrolyse d’ATP et cette étape engendre la fusion des membranes

46
Q

Qu’est-ce qui assure la spécificité de la fusion des membranes ?

A

Différents SNARE pour différents compartiments

47
Q

Quel est le rôle de Rab dans la fusion d’une vésicule à la membrane?

A

Attachement : Rab-GTP reconnaît protéines d’attachement (sur la membrane) alors s’attache
Appareillage : reconnaissance entre v-SNARE et t-SNARE
Fusion

48
Q

Quand est-ce que Rab est active?

A

Rab est une GTPase donc
GEF : Rab-GDP (inactive)
GAP : Rab-GTP (active)

49
Q

Vrai ou faux. Il existent différentes Rab pour différentes membranes certains compartiments?

A

Vrai

50
Q

Qu’est-ce qui crée la spécification des membranes des différents compartiments ?

A

Différents SNARES
Différents Rab
Différente composition de la bicouche lipidique

51
Q

Qu’est-ce que le PI?

A

Phospholipide relativement rare du feuillet interne (cytoplasmique) : phosphatidylinositol

52
Q

Que sont les phosphoinositides?

A

Variants de PI phosphorylés

53
Q

Comment sont créés les phosphoinositides?

A

Anneau d’inositol des PI peut être phosphorylé/déphosphorylé sur les positions 3,4 et 5 ar des kinases et des phosphatases (donne leur nom)

54
Q

Quelle est une façon que les cellules distinguent les compartiments ?

A

Différentes espèces (ex: PI3P, PI(4,5)P2, PI(3,4,5)P3) de phosphoinositides sont enrichies sur différentes membranes

55
Q

Qu’est-ce que la voie de biosynthèse ?

A

Voie de sécrétion :
Passage des protéines, nouvellement synthétisées au reticulum endoplasmique rugueux et destinées à la membrane plasmique, à l’exportation par sécrétion

56
Q

Qu’est-ce que le reticulum endoplasmique ?

A

Réseau de citerne (ou sacs membranaires) qui entoure le noyau

57
Q

Quels sont les 2 types de reticulum endoplasmique?

A

Lisse : sans ribosomes, réseau de tubules, en continuité avec le RER
Rugueux : avec ribosomes, réseau de citernes, en continuité avec le REL

58
Q

Quel est le rôle du reticulum endoplasmique ?

A

Usine de fabrication des membranes (et des protéines membranaires) de la cellule

59
Q

Vrai ou faux. Le rétinaculum endoplasmique est en continuité avec l’enveloppe nucléaire?

A

Vrai, distinction floue entre les 2

60
Q

Quels sont les rôles plus particulièrement aux RER et REL?

A

RER :
Synthèse protéique (ribosomes)
Repliement des protéines
Contrôle de qualité (surveille le repliement)
Glycosylation des protéines

REL:
Synthèse des lipides (phospholipides, cholestérol, hormones stéroïdes, parties lipidiques des lipoprotéines)
Réservoir de Ca2+ (ex: reticulum sarcoplasmique des muscles)

61
Q

De quoi sont composés les ribosomes?

A

ARNr et protéines
2 sous-unités : grande et petite

62
Q

Quel est le rôle du ribosome?

A

Traduction des ARNm en protéines

63
Q

Comment se fait (en gros) la traduction?

A

Ribosome se déplace de 5’ à 3’ en lisant chaque codon de 3 nucleotides
ARNt spécifique pour chaque codon transfère un acide aminé correspondant à la chaîne polypeptidique jusqu’à un cordon stop (dissocitation des sous-unités)

64
Q

Qu’est-ce qu’un polysome?

A

Multiples ribosomes en train de traduire le même ARNm simultanément

65
Q

Comment produire des protéines destinées à être sécrétées hors de la cellule ou à être insérer dans la membrane plasmique ?

A

Ces protéines ont une séquence signal N-terminal qui dirige le ribosome au reticulum sarcoplasmique

66
Q

Quelle est la différence entre les ribosomes libres et ceux du RE?

A

Libres : protéines cytosoliques (ou nucléaires, ou mitochondriales, etc)
Du RE : protéines destinées à être sécrétées ou transmembranaires ou qui fonctionnent dans le système endomembranaire

67
Q

Qu’est-ce que la translocation co-traductionnelle au RER?

A

Pendant la traduction, le ribosome fait une translocation:
Un SRP (particule de reconnaissance du signal) reconnaît la séquence signal sur la chaîne polypeptidique croissant
SRP se lie à un récepteur de SRP dans la membrane du RÉ pour que la protéine qui se forme s’allonge dans la citerne du reticulum à travers un translocon (protéine transmembranaire)

68
Q

Comment sont insérées les protéines transmembranaires dans la bicouche lipidique?

A

Pendant la traduction
Séquences hydrophobes de départ et d’arrêt de transfert se retrouvent dans le translocon en même temps
Séquence de départ détachée de la protéine maintenant rendue mature dans la membrane du RE

69
Q

Qu’est-ce que le glycocalyx ?

A

Protéines transmembranaires et lipides glycosylés forment un glycocalyx a l’extérieur de la cellule

70
Q

Quelle est l’importance du glycocalyx ?

A

Protection chimique (entérocytes intestinal)
Reconnaissance cellulaire (cellules immunitaires)

71
Q

Quand est-ce que commence la glycosylation des protéines ?

A

Dans la lumière du RE (précurseurs du glycocalyx)

72
Q

Quels sont les 2 mécanismes de glycosylation des protéines?

A

N-glycosylation : oses liés à un nitrogène de l’asparagine (Asn) dans le reticulum endoplasmique
O-glycosylation : oses liés à un oxygéné de la serine (Thr) dans l’appareil de Golgi (se fait plus tard)

73
Q

Comment se fait la N-glycosylation?

A

Dans la lumière de RE, ajout de glycane préformé à tous les Asn
Les N des asaparagines deviennent glycosylées avec une chaîne initiale de 14 sucres

74
Q

Qu’est-ce que la calnexine?

A

Protéine résidente de l’appareil de Golgi qui reconnaît les protéines mono-glycosilée

75
Q

Comment se fait le contrôle de qualité dans la lumière du RE?

A

Protéine non-repliée (nouvellement traduite) contient les 3 glucoses (du précurseur de glycane)
Enzymes enlèvent 2 glucoses pour entraîner le repliement
La chaperonne clanexine décide si elles sont correctement repliées
Glucosidase du dernier glucose
Si bien repliée départ vers Golgi
Si elle n’est pas correctement repliée elle recommence le cycle en ajoutant un glucose

76
Q

Quel est le rôle de la calnexine?

A

Retenir les glycoprotéines incorrectement repliées

77
Q

Que se passe-t-il s’il y a trop de protéines mal repliées?

A

Cellule augment transcription des gènes des clanexines (chaperonnes) pour augmenter la quantité de RE (auto-contrôle de la taille du RE)

78
Q

Que deviennent les protéines anormalement repliées ?

A

Elles sont rétro-transloquées (repassent à travers du translocon) et éliminées par ubiquitine et proteasome

79
Q

De quoi est constitué l’appareil de Golgi?

A

Série de citernes du côté RER (entrée) vers cote membrane plasmique (sortie):
Réseau cis du Golgi
Citerne cis
Citerne médiane
Citerne trans
Réseau trans du Golgi (bourgeonnement des vésicules)

80
Q

Où se situe l’appareil de Golgi?

A

Proche du noyau et du centrosome

81
Q

Vrai ou faux. Il y a une membrane qui délimite le RE du AG?

A

Faux, il y a une compartiment intermédiaire moins bien défini

82
Q

Quels sont les 2 types de transport dans le compartiment RE-Golgien?

A

COPII: transport antérograde (fusion des vésicules du RE qui éventuellement forment le réseau cis Golgien)
COPI: transport rétrograde (ramène les composantes des vésicules qui devraient être dans le RE et non le Golgi)

83
Q

Qu’est-ce qui permet le transport des vésicules?

A

Microtubule avec protéines motrices

84
Q

Qu’est-ce qui indique le transport rétrograde?

A

KDEL : protéine résidente du RE comme la calnexine
S’attache à un récepteur au signal KDEL qui recrute un manteau de COPI pour former une vésicule qui retourne au RE avec les KDEL

85
Q

Quels sont les rôles de l’appareil de Golgi?

A

Maturation des protéines produites dans le RER par glycosylation (fin de la N-glycosylation)
Étiquetage des protéines pour masquer leur destination finale
Triage, concentration et emballage des protéines dans des vésicules ou granules de sécrétion

86
Q

Que se passe-t-il lorsque la protéine arrive à la sortie du reseau trans-Golgien?

A

Tri:
Lysosomes
Membrane plasmique
Vésicule de sécrétion

87
Q

Quelle étape de la glycosylation se fait dans le Golgi?

A

Maturation des glycosylations en enlevant des mannoses pour les remplacer par les oligosaccharides plus complexes

88
Q

Quels sont les 2 types de sécrétion ?

A

Constitutive (non régulée)
Régulée

89
Q

Quelles sont les différences entres les modes de sécrétion?

A

Constitutive :
Fait par toutes les cellules
Protéines solubles sécrétées en permanence
Maintient de l’homéostasie de la membrane plasmique (ex: Na+/K+ ATPase)

Régulée :
Unique fait par les cellules secrétaires suite à un signal extracellulaire (ex: cellules bêta du pancréas qui sécrètent l’insuline en réponse au glucose ou dans des cellules adipocytes qui augmentent le nombre de transporteurs de glucose GLUT4 à leur membrane plasmique en réponse à l’insuline)

90
Q

Quel est le rôle du Golgi dans la sécrétion régulée?

A

Réseau trans Golgien fait le tri pour séparer les composantes des différentes types de vésicules sécrétoires

91
Q

Comment se fait la neurotransmission au bouton synaptique?

A

Livraison du contenu synaptique à la membrane plasmique (sécrétion constitutive)
Edpndocytose de composantes des vésicules synaptiques pour former de nouvelles vésicules synaptiques
Endocytose des composantes des vésicules synaptiques
Bourgeonnement de vésicules synaptiques depuis les endosomes
Chargement de neurotransmetteurs dan sales vésicules synaptiques
Sécrétion de neurotransmetteurs par Exocytose en réponse à un potentiel d’action (sécrétion régulée)

92
Q

Vrai ou faux. Il y a un équilibre entre l’exocytose regulee et l’endocytose dans la neurotransmission?

A

Vrai

93
Q

Comment se fait le transport entre les membranes d’une cellule polarisée?

A

Transport endosomal : transcytose
Endocytose de la membrane plasmique apicale p, suivi d’un transport et d’une fusion avec la membrane plasmique basolatérale

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