Translation

Question 1

Beskriv tRNA

Answer 1

• D-arm: identifieras av tRNA aminoacyl syntetas
• antikodon
• T-arm: fäster tRNA-molekylen vid ribosomen.
• variable loop
• 3’ CCA-domän: där aminosyran sitter

Question 2

Hur fungerar aminoacyleringen?

Answer 2

ATP reagerar med aminosyra och bildar aminoacyl-AMP. Aminoacyl tRNA syntetas laddar sedan aminosyran på tRNA-molekylens 3’ CCA-domän. Reaktionen kostar AMP:et.

Question 3

Vad är the wobble effect?

Answer 3

The wobble effect innebär att den tredje kvävebasen i kodonet (5’->3’) inte måste ha perfekt matchning i antikodonet. Det gör att även om kodonets tredje kvävebas är fel så kan mRNA-strängen avläsas korrekt, vilket minskar risken för mutationer.

Question 4

Hur är ribosomen uppbyggd i prokaryota celler resp. eukaryota celler?

Answer 4

Ribosomen består av rRNA och proteiner. Den har en liten och en stor subenhet. I prokaryota celler kallas ribosomen 70S och har en 30S- och en 50S-subenhet. I eukaryota celler kallas ribosomen 80S och har en 40S och en 60S-subenhet.

Question 5

Vilka tre steg består translationen av?

Answer 5

Initiering, elongering, termination.

Question 6

Hur fungerar initieringen av translationen?

Answer 6

Prokaryot initiering:

1. Initieringsfaktorer i lilla subenheten känner igen Shine Dalgarno-sekvensen - lilla subenheten binder och flyttar ~8nt till den hittar startkodonet N-formyl metionin.
2. Initieringsfaktor tar tRNA till startkodonet.
3. Stora subenheten binder in när GTP på initieringsfaktorn på tRNA bryts ner till GDP och Pi.

Eukaryot initiering:

1. Eukaryot initieringsfaktor 4 binder till 5’-änden.
2. Lilla subenheten och dess initieringsfaktor binder till AUG.
3. Eukaryot initieringsfaktor 2 hjälper tRNA att binda.
4. GTP bundet till initieringsfaktor 2 bryts ner till GDP och Pi och den stora subenheten binder in.

Question 7

Hur fungerar den eukaryota elongeringen?

Answer 7

• Metionin i P-plats.
• Eukaryot elongeringsfaktor 1 tar en tRNA till A-plats på bekostnad av sin GTP.
• A-platsens aminosyras kvävegrupp utför en nukleofil attack på C-terminalen på P-platsens aminosyra och bildar så en peptidbindning. Enzym: peptidyltransferas. P-platsens aminosyra lossnar från tRNA.
• Eukaryot elongeringsfaktor typ 2 använder sin GTP till att skifta plats på tRNA-molekylerna.

Question 8

Hur fungerar termineringen?

Answer 8

Release factor binder till stoppkodonet och hindrar ribosomens framfart. Peptiden klipps från P-platsens tRNA.

Question 9

När sker translationen med ER-bundna ribosomer?

Answer 9

När proteinerna ska sekreteras, bli en del av membranet eller en del av lysosomen.