UA2 - Notions de base en biologie clinique Flashcards
(102 cards)
1
Q
Pourquoi est-ce qu’on demande des analyses de laboratoire en contexte médical ? (4)
A
- Confirmer ou exclure un/des Dx
- Évaluer le degré d’une pathologie (phase active, aigue, chronique, etc.)
- Monitoring d’une thérapie (principale!)
- Médecine préventive (dépistage)
2
Q
Pourquoi est-ce qu’on demande des analyses de laboratoire en contexte d’une étude clinique ? (7)
A
- Faire le criblage des sujets recrutés
- Protection des sujets inclus
- Déterminer l’efficacité du mx
- Déterminer la toxicité du mx
- Déterminer l’innocuité du mx
- Déterminer la posologie d’un mx
- Déterminer l’observance au mx
3
Q
Quelles sont les étapes dans l’exécution d’une analyse de laboratoire ? (3)
A
- Phase pré-analytique
- Phase analytique
- Phase post-analytique
4
Q
Pour chaque phase, il y a une source de variabilité qui peut influencer le résultat final de l’analyse ou l’interprétation que l’on fait de ce résultat final. Quelles sont les classifications des causes de variabilité pré-analytique des résultats d’analyse de laboratoire?
A
- Avant le prélèvement
- Pendant le prélèvement
- Après le prélèvement
5
Q
Quelles sont les variation prévisibles avant le prélèvement ? (4)
A
- Variations ultradiennes (sécrétions épisodiques < 20h ; ex. hormone de croissance qui varient sur des cours laps de temps)
- Variations circadiennes (24h; ex. hormone de croissance)
- Variation infradiennes (> 3 jours ; ex. cycle menstruel où les pics et les creux des hormones exemples FSH et LH sont en fonction d’on est rendu où dans le cycle menstruel)
- Variations circannuelles (1an: exemple dans le métabolisme de la vitamine D où il y a des périodes dans l’année où l’on est moins exposé au soleil et donc on produit moins de vitamine D)
***ce sont toutes des variations cycliques
6
Q
Comment est-ce que les variations cycliques vont influencer la prescription de l’analyse de laboratoire ? (2)
A
- Peut nécessiter plusieurs mesures s’il y a des pic et des creux (variations) fréquemment
- Le moment du prélèvement va dépendre de ce qu’on recherche (ex. taux hormonal selon le cycle menstruel)
7
Q
Quelles sont les variation imprévisibles avant le prélèvement ? (2)
A
- Variations intra-individuelles
- variation interindividuelles
*** Ce sont toutes des variations biologiques
8
Q
Quelles sont les variations reliées aux pt avant le prélèvement ? (4)
A
- Exercice (on va au gym –» on dommage les tissus –» libération du contenu des tissus dans la circulation sanguine et donc augmentation de certains marqueurs)
- Stress
- Posture (étant debout plus de sang est redistribué aux extrémités ce qui augmente la pression hydrostatiques et permet aux grosses molécules de rentrer dans le sang)
- Diète (après repas, taux de triglycérides et glucose augmentent dans le sang)
9
Q
Quelles sont les sources de variabilité pré-analytique qu’on peut rencontrer pendant le prélèvement ? (3)
A
- Type d’échantillon
- Contenants et additifs
- Techniques de prélèvement
10
Q
Quels sont les types d’échantillon qu’on peut utiliser pour un prélèvement ? (7)
A
- Sang total
- Plasma
- Sérum
- Urine (bcp utilisé en lab)
- Salive
- Autres liquides (céphalorachidien, pleurale ascite, …)
- Autres matrices
11
Q
Quelle est la différence entre le sang total, le plasma et le sérum ?
A
- Sang total : Présence d’anticoagulants + cellules sanguines
- Plasma : Fraction liquide du sang total en présence d’un anticoagulant (explication de l’obtention du plasma: si on prélève du sang dans un tube ce dernier va coaguler d’ou la nécessité de la présence d’un anticoagulant pour que le sang reste liquide. Si on sépare les cellules de cet échantillon du reste du liquide, il va rester du plasma (on nomme ce liquide le plasma) on y retrouve les protéines de la cascade de coagulation qui sont en fraction liquide)
- Sérum : Fraction liquide du sang total sans les protéines de coagulation (si on travaille plutôt à partir de sang qu’on laisse coaguler dans le tube puis après on sépare le caillot du reste du liquide, on appelle ce liquide du sérum)
12
Q
Quels sont les ‘‘autres liquides’’ qui peuvent être prélevés (autre que le sang, l’urine et la salive) ? (5)
A
- Céphalorachidien (LCR)
- Pleural
- Synovial
- Péricardique
- Ascite
- Etc.
13
Q
Quels sont les ‘‘autres matrices’’ qui peuvent être prélevés ? (2)
A
- Selles
- Expectorations
- etc.
14
Q
Quels sont les types de contenants qu’on peut utiliser lors d’un prélèvement ? (2)
A
- Anticoagulants (prélèvement sanguin)
- Préservatifs (prélèvement pour la glycémie)
15
Q
Quels sont les additifs qu’on peut utiliser lors d’un prélèvement ? (3)
A
- Gel séparateur (crée barrière mécanique entre la fraction cellulaire et la fraction liquide et empêchent les échangent ou la cellule captent des composantes de la fraction liquide)
- Séparateur mécanique
- Activateur de coagulation
16
Q
Quels sont les types d’anticoagulants qu’on peut mettre dans un contenant lors d’un prélèvement ? (3)
A
- EDTA di ou tri-potassique
- Héparine de lithium
- Citrate de sodium
ces substances chimiques séquestrent le calcium qui est un cofacteur essentiel à la coagulation
17
Q
Quels sont les types de préservatifs qu’on peut mettre dans un contenant lors d’un prélèvement ? (2)
A
- Fluorure de Na ((inhibiteur de la glycolyse)
- HCl 6 N
18
Q
Décrit la technique de prélèvement sanguin (8 étapes)
A
- Mettre des gants
- Choisir une veine de gros calibre
- Appliquer le garrot pour faire gonfler la veine en le serrant modérément
- Désinfecter l’endroit de la ponction veineuse et laisser l’alcool sécher
- Tenir l’aiguille avec un angle de 30 degrés et piquer 1cm au dessous de la saillie veineuse
- Desserrer le garrot (sinon risque d’hémoluse)
- Remplir les tubes adéquatement
- Assurer une bonne identification des tubes immédiatement
19
Q
Pourquoi est-ce qu’on doit desserrer le garrot avant la prise de sang ?
A
Risque d’hémolyse (encore plus si on a demander au pt de ‘‘pomper le poings’’ avant).
20
Q
C’est quoi l’hémolyse et qu’engendre t-elle
A
destruction des globules rouges (relâche du contenu intracellulaire) –» Augmentation causée par la relâche du contenu intracellulaire des globules rouges
(érythrocytes). Le potassium K+, Mg2+, fer, phosphate, ammoniaque
21
Q
Quelles sont les sources de variabilité pré-analytique qui peuvent se passer après le prélèvement ? (3)
A
- Transport
- Prétraitement/centrifugation
- Entreposage
22
Q
Quelles sont les sources de variabilité en lien avec le transport après le prélèvement ? (2)
A
- Délais
- Température (en biologie on veut conserver au froid pour préserver paramètres biochimiques du sang, alors qu’en hématologie on préfère conserver à température ambiante)
23
Q
Quels sont les effets induits par le métabolisme lors d’un délai ou d’une mauvaise conservation des échantillons pendant le transport pour :
- Glucose
- PO2
- PCO2
- pH
- Concentration de Ca2+
A
- Glucose: diminuent parce que le glucose est métabolisé
- PO2 : Diminue (oxygène est consommé par les cellules sanguines)
- PCO2 : Augmente (cellules sanguines produisent du CO2)
- pH : Diminue (causé par augmentation de PCO2 + glycolyse)
- Ca2+ : Augmente (changement de pH influence les liaisons entre Ca2+ et protéines)
24
Q
Quels sont les effets induits par le métabolisme lors d’un délai ou d’une mauvaise conservation des échantillons pendant le transport pour :
- Concentration glucose
- Concentration lactate
A
- Glucose : Diminue (par métabolisme du glucose)
- Lactate : Augmente (par glycolyse)
25
Quelles sont les sources de variations potentielles de la centrifugation après le prélèvement ? (2)
- Vitesse (force)
- Température
26
Quelles sont les sources de variations potentielles du prétraitement après le prélèvement ? (4)
- Séparation
- Aliquote
- Extraction
- Précipitation
ce sont tous des techniques pour manipuler le sang mais on y introduit une source de variabilité potentielle
27
À quelle température est-ce qu'on devrait maintenir un prélèvement à court terme afin d'éviter des variations pré-analytiques?
Température ambiante : 20-24°C
28
À quelle température est-ce qu'on devrait maintenir un prélèvement à moyen terme afin d'éviter des variations pré-analytiques?
Réfrigération : 2-8°C
29
À quelle température est-ce qu'on devrait maintenir un prélèvement à long terme afin d'éviter des variations pré-analytiques?
Congélation : -80 à -20°C
30
Qu'est-ce que l'erreur analytique ?
erreur associée inhérente avec la mesure présente, et ce, même si la mesure a été faite très soigneusement
31
De quoi dépend l'importance de l'erreur analytique ? (2)
- Précision de l'appareil de mesure
- Calibrage approprié du dispositif ou de l'appareil
32
Vrai ou Faux : Le non respect des étapes d'une procédure représente une erreur analytique
Faux
33
Quels sont les facteurs pris en compte lors d'une erreur analytique ? (2)
- Exactitude
- Précision
34
Qu'est-ce que l'exactitude ?
mesure dont les résultats expérimentaux sont conformes à la valeur vraie ou admise (standard).
En d'autres mot : Décrit la différence entre la valeur obtenue et la valeur réelle
35
Qu'est-ce qu'une inexactitude ?
Différence entre la valeur obtenue expérimentalement et la valeur vraie
36
Qu'est-ce que la précision ?
Mesure de la fiabilité de l'expérience ou comment l'expérience est reproductible
37
Qu'est-ce que l'imprécision ?
Écart-type ou coefficient de variation (%) calculé à partir des résultats obtenus
38
précise et exacte
39
imprécise et exacte
40
précise et inexacte
41
Quels sont les types d'interférences analytiques qui peuvent affecter les résultats du prélèvement?
- Interférences in vivo (au niveau du pt)
- Interférences in vitro (au niveau des manipulations en labo)
42
Donne des exemples d'interférences in vivo (6)
- Tabagisme (augmente le taux de la carboxyhémoglobine (HbCO))
- Mx ( La prise d’acétaminophène augmente les niveaux de l’enzyme aspartate aminotransférase (AST))
- Drogues/alcool ( L’alcoolisme augmente les niveaux de l’alanine aminotransférase (ALT) et de l’AST)
- Diète
* Repas entraîne l’augmentation du glucose et des triglycérides
* Aliments riches en sérotonine (banane, avocat, chocolat, etc.) entraînent une augmentation du 5-HIAA urinaire
- Menstruations (Diminution de l’hémoglobine et du fer sérique)
- Hémolyse (Hémolyse intravasculaire cause l’augmentation du potassium)
- etc.
43
Donne des exemples d'interférences in vitro ? (4)
- Interférences spectrophotométriques
- Interférences chimiques
- Interférences immunologiques (interférence des immunoessais)
- Interférences chromatographiques (co-migration)
44
Quelles sont les interférences spectrophotométriques qui peuvent influencer les résultats d'un prélèvement ? (3)
Spectrophotométrie: La concentration d’une substance
chimique en solution (c) est proportionnelle à la quantité de lumière absorbé dans la cellule de lecture (A)
- Hémolyse (à la suite d’un mauvais prélèvement) - hémolyse implique prélèvement rouge mais prélèvement rouge peut aussi être causé par une grande quantité de la substance A qui absorbe donc beaucoup de lumière rouge
- Lipémie (dans le cas d'une interférence turbidimétrique et non spectrophotométrique)
- Ictère (si les méthodes analytiques sont associés à l'absorbance des longueurs d'ondes de la couleur brune)
45
Qu'est-ce qui peut causer des variations post-analytiques?
Valeurs de références
46
Quelles sont les méthodes qu'on peut utiliser pour établir des valeurs de référence? (3)
- Hard way
- Soft way
- No way
47
Comment établir des valeurs de référence avec le ''Hard way''?
On doit faire une sélection a prori minimum 120 individus sains selon des critères d'inclusion et d'exclusion, puis la valeur de référence = la moyenne ± 2 écart types
48
Comment établir des valeurs de référence avec le ''Soft way''?
Utiliser les résultats des patients déjà emmagasinés dans les bases de données du laboratoire (LIS) pour établir les valeurs de référence
49
Comment établir des valeurs de référence avec le ''No way''?
Pour certains paramètres, il n'y a pas de valeur de référence. On utilise des seuil consensus (ex. seuil pour Dx le diabète)
Exemples de seuil consensus (pas à apprendre)
* Diabète– Glucose
* Ostéoporose– Vitamine D
* Cancer de la prostate– Antigène prostatique spécifique (PSA
50
Comment déterminer qu'une analyse est utile pour le Dx ?
En étudiant ses caractéristiques
51
Quels sont les 2 ordres des caractéristiques d'une analyse ?
- Caractéristiques relevant exclusivement du test lui-même (caractéristique intrinsèque)
- Caractéristiques relevant du test lui-même ET de la population à qui il est appliqué (Prévalence de la maladie dans la population considérée)
52
Nomme 2 exemples d'indices statistiques qui dépendent des caractéristiques intrinsèques
- Sensibilité (Se)
- Spécificité (Sp)
53
Nomme 2 exemples d'indices statistiques qui dépendent des caractéristiques intrinsèque et de la population étudiée
- Valeur prédictive positive (VPP)
- Valeur prédictive négative (VPN)
54
Quel indice statistique recherche-t-on dans cette situation : Connaissant le diagnostic, combien (quelle est la proportion) de personnes vraiment atteintes de la maladie est-ce que le test identifie?
Sensibilité
55
Qu'est-ce que la sensibilité + sa formule
Proportion de vrai positifs chez les malades
En d'autres mots : Probabilité qu'un test soit positif chez un pt atteint de la maladie
56
Quel indice statistique recherche-t-on dans cette situation : Connaissant le diagnostic, quelle est la probabilité que le test identifiera correctement une personne n’étant pas atteinte de la maladie?
Spécificité
57
Qu'est-ce que la spécificité + sa formule ?
La portion de vrais négatifs chez les non malades
58
Quel indice statistique recherche-t-on dans cette situation :
Ne connaissant pas le diagnostic, mais sachant que le résultat du test est positif, quelle est la probabilité que le patient soit atteint de la maladie?
Valeur prédictive positive (VPP)
59
Qu'est-ce que la valeur prédictive positive (VPP) + sa formule ?
Probabilité que le sujet soit réellement malade sachant que son test est positif
60
Quel indice statistique recherche-t-on dans cette situation :
Ne connaissant pas le diagnostic, mais sachant que le résultat du test est négatif, quelle est la probabilité que le patient ne soit pas atteint de la maladie?
Valeur prédictive négative (VPN)
61
Qu'est-ce que la valeur prédictive négative (VPN) + sa formule ?
Probabilité qu'un sujet ayant un test négatif soit réellement non atteint de la maladie
62
Qu'est-ce que le rapport de vraisemblance ?
Rapport de la probabilité d'être malade sur la probabilité de ne pas l'être une fois que je connais le résultat du test. En gros si on fait le test et qu’il est positif, on veut savoir :
Est-ce que ça augmente vraiment la probabilité que la personne soit malade ? Idem pour si le test est négatif, ecq ça diminue la probabilité d'être malade
63
Complète l'énoncé : Le rapport de vraisemblance varie selon que le résultat du test diagnostique est (1)____ ou (2)____
1. Positif (rapport de vraisemblance positif)
2. Négatif (rapport de vraisemblance négatif)
64
Comment est-ce qu'on peut calculer le rapport de vraisemblance positif (L+) ?
L+ = Sensibilité / (1- Spécificité)
65
Comment est-ce qu'on peut calculer le rapport de vraisemblance négatif (L-)
L- = (1- Sensibilité) / Spécificité
66
Idéalement ;
L+ = ...
L- = ...
L+ = infini
L- = 0
Plus le L+ est élevé, plus il nous permet de **confirmer** la maladie, alors que plus L- est près de 0, plus il nous permet **d'exclure** la maladie
67
Plus le rapport de vraisemblance d'un test positif est ..., plus il nous permet de
...
Plus le rapport de vraisemblance d'un test positif est élevé, plus il nous permet de
confirmer la maladie
68
*Plus le rapport de vraisemblance d'un test négatif est ..., plus il nous permet
d'...
*Plus le rapport de vraisemblance d'un test négatif est petit, plus il nous permet
d'exclure la maladie
69
Dans les types de rapport de vraisemblance, quand le test n'apporte aucune information, quelle est la valeur de L+/L-
1
70
Le Odds ratio permet de savoir qui
Si la maladie est plus fréquente
dans le groupe A ou dans le groupe B?
71
Vrai ou Faux : un Odds Ratio (OR) est toujours > ou = à 1
Faux, c'est toujours > ou = à 0
72
Si la probabilité qu'un évènement arrive dans le
groupe A est p, et q dans le groupe B, le
rapport des cotes est
73
Complète l'énoncé : Si le OR est proche de 0, la maladie est _____ fréquente dans le groupe A (p) que le groupe B (q)
beaucoup moins
74
Complète l'énoncé : Si le OR est inférieur à 1, la maladie est _____ fréquente dans le groupe A que le groupe B
moins
75
Complète l'énoncé : Si le OR est bien supérieur à 1, la maladie est _____ fréquente dans le groupe A que le groupe B
beaucoup plus
76
Complète l'énoncé : Si le OR est supérieur à 1, la maladie est _____ fréquente dans le groupe A que le groupe B
plus
77
Complète l'énoncé : Si le OR est proche ou égale à 1, la maladie est _____
indépendante du groupe
78
Quelle analyse diagnostique choisir pour un dépistage ?
Analyse avec une haute sensibilité (Se) --» qui identifie bien les malades et donc qui a autant de VP et que de malades
79
Quelle analyse diagnostique choisir pour confirmer un Dx ?
Analyse avec une grande spécificité (Sp) --» qui identifie bien les non malades et qui a donc autant de VN que de non malades
80
Graphique d'une courbe ROC et identification de l'axe des Y et axe des X
Y: Taux de VP = sensibilité
X: Taux de FP = 1 - spécificité (taux de VN)
81
Valeur de Se et SP d'un test parfait
Valeur de Se et Sp d'un test inutile
Test parfait: Sensibilité = 100% et
Spécificité = 100%
Test inutile: Se = 50% et Sp = 50%
82
Comment déterminer si test est bon par la courbe ROC
Plus la courbe est proche du coin haut gauche, plus l'AUC est élevé, meilleur est le test.
83
Que peut on conclure si,
Valeur seuil très élevée =
Diminution du seuil =
Valeur seuil très basse =
Test parfait =
Valeur seuil très élevée = tous les
individus sont sains; Sp = 100%
Diminution du seuil = diminution de
la Sp et augmentation de la Se
Valeur seuil très basse = tous les
individus sont malades; Se = 100%
Test parfait = Se = Sp = 100%
84
Quelle est la valeur
seuil optimale?
Le point de la courbe
le plus éloigné de la
diagonale représentant
le test d’apport nul
Selon l’exemple, c’est le seuil
avec une
Se = 79% et une Sp = 71%
85
Quel test a les performances diagnostiques de
plusieurs tests biologiques
Test A
86
Comment construire une courbe ROC (Receiver Operating Characteristic) ?
1. Fixer une valeur seuil
2. Calculer la sensibilité et la spécificité
3. Placer le point sur la courbe ROC
4. Répéter à partir d'une autre valeur seuil
87
Comment déterminer si une différence significative
(cliniquement) existe entre 2 résultats consécutifs?
1. Jugement et expérience des professionnels
2. RCV = reference change value
3. SCL = significant change limit
88
Formule du RCV et formule du SCL
RCV (%) = 2,77.√(CVa2 + CVb2)
CVa = Coefficient de Variation analytique
CVb = coefficient de variation biologique et intra individuelle
SCL = 3.ETu
ETu = ET analytique usuel des 3-6 derniers mois
89
2024-02-05: 3,7 mmol/L
2024-02-10: 4,9 mmol/L (+ 32%)
CVa: 3,4%
CVb: 4,8%
Changement entre les deux mesures est significatif ??
RCV= 2,77.√(3,42 + 4,82) = 16,3% ≈ 16%
Le changement est donc significatif
* (32% > 16%)
90
2024-02-05: 3,7 mmol/L–
2024-02-10: 4,9 mmol/L (+ 1,2 mmol/L)
ETu= 0,12 mmol/L (3 derniers mois: 0,11; 0,13; 0,12)
Le changement entre les deux mesures est signficatif
SCL= 3 . 0,12 mmol/L = 0,36 ≈ 0,4 mmol/L
Le changement est donc significatif
* (1,2 mmol/L > 0,4 mmol/L)
91
Un patient a effectué par erreur deux test de thyreostimuline (TSH) deux semaines de suite et a obtenu des valeurs de 1,4 mUI/L et de 2,6 mUI/L. Pourtant, il n’y a eu aucune modification à son état de santé et il ne prend aucune substance pouvant influencer le résultat. Quels sont les facteurs qui peuvent expliquer cette variation ? (8)
- Variation cyclique
- Variation biologique
- Contenant
- Technique de prélèvement
- Transport de l'échantillon
- Entreposage de l'échantillon
- Prétraitement
- Variabilité du test en soi (exactitude et précision)
92
Quelle est la différence entre un plasma et un sérum?
Le sérum ne contient pas de protéines de coagulation
93
Veuillez définir les termes suivants : exactitude, valeur prédictive négative et sensibilité.
Exactitude : Décrit la différence entre la valeur obtenue et la valeur réelle.
Valeur prédictive négative : Probabilité qu’un sujet ayant un test négatif soit réellement non atteint de la maladie.
Sensibilité : Probabilité qu’un test soit positif chez un patient atteint de la maladie.
94
Dans un échantillon de sang, la valeur de glucose augmente ou diminue ? Pourquoi ?
La valeur de glucose devrait diminuer puisque les cellules vivantes dans l'échantillon continuent à métaboliser le glucose
95
96
Complète l'énoncé : Plus un test de vraisemblance négatif est petit, plus il permet de confirmer l'______ de la maladie
abscence
97
Vrai ou Faux : Sur une courbe ROC, l’ordonnée (axe vertical) correspond à la fraction des vrais négatifs et l’abscisse (axe horizontal) représente la fraction des faux positifs.
Faux
98
Vrai ou Faux : Pour le dépistage, une méthode à haute spécificité sera privilégiée
Faux
99
Vrai ou Faux : Quand le test n’apporte aucune information, le rapport de vraisemblance positif est égal à 0.
Faux
100
Vrai ou Faux : Sur une courbe ROC, la ligne diagonale représente un test d’apport important
Faux
101
Vrai ou Faux : La méthode du Reference Change Value (RCV) dépend seulement du coefficient de variation analytique.
Faux
102
Vrai ou Faux : La méthode du Significant Change Limit (SCL) dépend de l’écart type analytique usuel des 3 à 6 derniers mois et de la variation biologique
Faux
