UE1B-6 La Relation structure-fonction des Biomolécules : ACIDES AMINÉS et PROTÉINES Flashcards
Qu’est-ce qui constitue les peptides et les protéines ?
Les Acides Aminés
Qu’elle est la formule chimique d’un acide aminé ?
- Une fonction Amine (NH2)
- Une fonction Carboxyle (COOH)
- Un radical : variable d’un acide aminé à l’autre, détermine les propriétés physico-chimiques des peptides et protéines (peuvent être chargés ou non, de nature aliphatique, de taille plus ou moins grandes…)
Il existe 2 types d’acides aminés :
- AA Protéinogènes
- AA non Protéinogènes
Définition : Acide Aminé Protéinogènes
=> incorporés dans une protéine, lors d’une synthèse dépendante de la traduction d’un ARN messager par un ribosome.
Définition : Acide Aminé Non Protéinogènes
=> pas incorporés dans les protéines lors de la traduction d’un ARNm par un ribosome.
→ ils peuvent être retrouvés dans les protéines lors de modifications post-traductionnelles (à partir de dérivés acides aminés protéinogènes).
Quelles sont les fonctions des acides aminés non protéinogènes ?
- intermédiaires du métabolisme
- neurotransmetteurs
Exemple : L’hydroxyproline (= dérivé de la proline) et l’hydroxylysine (= dérivé de la lysine) interviennent dans le collagène.
Combien d’Acides Aminés Protéinogènes existent ?
=> 20
- éléments de base (monomères) des peptides et protéines.
Que donnent donc les Acides Aminés Protéinogènes ?
- des Peptides ou Oligopeptides
(2 à quelques dizaines d’Acide Aminés) - des Polypeptides et Protéines
(nombre important d’Acide Aminé, masse moléculaire > aux peptides)
Acides Aminés Apolaires et Hydrophobes (9)
Glycine, Alanine, Valine, Leucine, Isoleucine, Méthionine, Phénylananine, Tryptophane, Proline.
Acides Aminés Polaires et Hydrophiles (6)
Serine, Thréonine, Cystéine, Tyrosine, Asparagine, Glutamine.
Acides Aminés chargés négativement (ACIDE) et Hydrophiles (2)
Acide Aspartique et Acide Glutamique.
Acides Aminés chargés positivement (BASIQUE) et Hydrophiles (3)
Lysine, Arginine, Histidine.
Quels sont les 9 Acides Aminés ESSENTIELS ?
= pas de synthèse endogène (dans le corps), on doit les trouver dans notre alimentation.
=> Méthionine, Leucine, Valine, Lysine, Isoleucine, Phénylalanine, Tryptophane, Histidine, Thréonine.
«Met le dans ta valise il fait trop d’histoire»
Par quoi sont liés les peptides et protéines ?
=> Acides Aminés liés entre eux par des liaisons peptidiques.
Par quoi se forme la liaison peptidique ?
Par une réaction de condensation entre la fonction carboxyle et la fonction Amine de 2 Unités.
Qu’est-ce qui définit la structure PRIMAIRE d’un peptide et d’une protéine ?
- L’enchaînement d’acides aminés par ces liaisons, correspond à une séquence d’acide aminés.
Quel est le sens de lecture imposer par le sens de synthèse et d’enchaînement des monomères d’acides aminés ?
Depuis l’extrémité Amino-Terminale (N-ter) vers l’extrémité Carboxy-Terminale (C-ter).
Exemples et Fonctions d’acides aminés non protéinogènes
° Précurseurs pour la synthèse de molécules importante en physiologie : Glycine
° Rôle dans le métabolisme : Carnitine
° Actions sur la physiologie : Histamine
° Moyens de communications entre cellules (signaux, médiateurs, hormones,…) : Glutamate & Acide-Aminobutyrique (GABA) + Triidothyronine
Précurseurs pour la synthèse de molécules importantes en physiologie : GLYCINE
=> précurseur de la Porphyrine et de l’Hème, groupement prosthétique (= non protéique), associé à la myoglobine ou à l’hémoglobine.
Rôle dans le métabolisme : CARNITINE
=> intervient dans le catabolisme des lipides et permet le transport intracellulaire de ces lipides vers les mitochondries.
Actions sur la physiologie : HISTAMINE
=> composé dérivé l’acide aminé histidine.
C’est un médiateur pro-inflammatoire vasoactif : facilite la réponse immunitaire en cas de danger.
- aussi impliquée dans l’hypersensibilité allergique avec réponse exacerbée.
Moyens de communications entre cellules (signaux, médiateurs, hormones…) : GLUTAMATE & ACIDE-AMINOBUTYRIQUE (GABA) + TRIIODOTHYRINE
° Glutamate et Acide-Aminobutyrique (GABA) = neurotransmetteurs.
° Triidothyronine (T3), dérivée de résidus tyrosine modifiés à partir de la protéine thyroglobuline = hormone thyroïdienne.
Définition : Peptides et Ogligopeptides
- 2 à quelques dizaines d’acides aminés
- Fonctions diverses
- En général, ils sont facilement «synthétisables» = cibles pharmacologiques intéressantes
Exemple de Peptides et Oligopeptides (3)
- Pénicilline
- Gramicidine
- Cyclosporines