VL 3: Stoffwechsel I Flashcards

(47 cards)

1
Q

Transportsysteme

A
  • äußere Membran der gram- Bakterien als Barriere
    • mit Porinen
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Porine - LamB E.coli Maltoporin

A
  • zuständig für Aufnahme Maltose
  • Beta-Faltblattstruktur charakteristisch für Porine
  • Trimer
  • LamB
    • Bakteriophage lambda
    • Rezeptor
  • Diffusionsaufnahme
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Diffusion und aktiver Transport

A

Diffusion

  • Passiver Transport
  • Polare Verbindungen (Fettsäuren)
  • Kleine polare Substanzen (Wasser, Ethanol, Glycerol, Harnstoff
  • Gase
  • Cytoplasmamembran ist impermebael für größere polare Substanzen (Glucose und Ionen

Aktiver Transprortprozess

  • Diffusion abhängig von Konzentration außerhalb
  • Aktiver Transport besser bis zu bestimmter Konzentration à Sättigung
  • Spezifisch
  • Benötigen Energie
  • Spez aktiven häufig stark reguliert
    • Genexpression
    • Aktivität
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Aktive Transportsysteme

A
  • Primäre Transportsysteme
    • nutzen chemische Energie
    • ATP Hydrolyse
  • Sekundäre Transportsysteme
    • nutzen Ionengradien
    • Meist 12 Transmembrandomänen
    • verbrauchen weniger Energie
    • geringere Affinität(Spzifiät)
    • hohe Transportrate
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Beispiele Primäre Transportsystem

A
  • ATP-Synthase
  • ETK
  • Ione-ATPasen
  • ABC-Transporter
    • ECF
  • Decarbxylasen
  • PTS
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

ABC-Transporter

A
  • ATP-binding-cassette
  • Transport v. Zuckern, AS, anorganischen Substraten (z.B. Sulfat, Phosphat) und Spurenelemente
  • Hohe Substratspezifität
  • Periplasmatisches Bindeprotein
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

ECF

A
  • Energy-coupling factor
  • ABD Transportter ohen extrazelluläres Bindeprotein
  • Besitzen Transmembranuntereinheit zur Substratbindung
  • Ni2+/Co2+ oder wasslösliche Vitmaine (Biotin, Riboflavin, Thiamin
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Decarboxylasen

A
  • Koppeln Biotin-abhängige Decarboxylierung von Carbonsäuren wie Oxalat mit dem Export von Na+ IOnen
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

PTS

A
  • Gruppentranslokation
  • Phosphoenolpyruvat-Phosphotransferasesystem
  • Phosphorylgruppe von PEP (verfügt über hohes Gruppenübertragungspotential) wird über mehrere Proteinkinasen auf das Substrat (Hexosen und Zuckeralkohole (Mannitol übertragen)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Beispiele Sekundäre Transportsysteme

A
  • TRAP-Transporter
  • Uniport
  • Symport
  • Antiport
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

TRAP-Transporter

A
  • Tripartite ATP-independent periplasmic-Transporter
  • Weit verbreitet in Prokaryoten, jedoch nicht in eukaryotischen Zellen
  • C4-Dicarbonsäuren, Verbindungen für Osmoregulation (Ectoin, Taurin)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Maltose-ABC-Transporter

A

Maltase/Maltodetrin-Transport von e.coli

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Maltose-ABC-Transporter - Struktur

A
  • Rot: Periplasma
    • Bindeprotein
    • Substratgebudn. Zustand bindet an Transmembrandomäne
  • Blau und gelb: innere Membran
    • Transmembrandomäne
  • Cytosol: lila grün
    • ATP bindemonäne
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Maltose-ABC-Transporter Funktionsweise

A
  1. Maltosebindeprotein und Maltose im Periplasma
  2. Bindung Maltose und Maltosebindeprotein à Konformationsänderung zu geschlossenen Zustand
  3. Bindung geschlossene Transmembrandomäne, ATP bindet an MalK
  4. Konformationsänderung der ATP-Domäne à Konformaitonsänderung der Transmembrandomäne (Kanalprotene)
  5. Durch ATP-Hydrolyse Originalzustand der Proteine
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Lactose-System

A
  • Sekundärer Transportsystem
  • PMF-abhängige Symporter
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Lactose-system Struktur

A
  • Blau: Lactose
  • Transporter 1 Protein
  • 12 Transmembrandomänen
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Lactose-System Funktionsweise

A
  • Protonengradient (Atmungskette)
  • Lactosepermase (LacY) bindet Lactose und Proton
  • Lässt Lactose und Proton ins Cytoplasma
  • H+ kann in ETK wieder in Periplasma eingeschleust werden
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Gruppentranslokation - PEP-Phosphotransferase-System (PTS)

A
  • Verschiedene Enzyme
  • Unspezifische Komponenen
    • Enzym I
    • Histitidprotein
  • Spezifität
    • EII Komponenten (A,B,C)
    • EIIC Transmembran
    • EIIA und B Fusionen
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

PEP-PTS Funktionsweise

A
  • Phosphatrest von PEP auf EI übertragen
  • Übertragung auf HPr
  • Übertragung auf E II
  • Phosphorylierung des Substrats aus Periplasma in EIIC
20
Q

PTS

A
  • Phosphorylierungs-Reaktion ist nicht wie bei Phosphokinasen ATP und Mg2+, sondern PEP-abhängig
  • Enzym E I = durchgreführte Reaktion ist pleiotrop = steht generell allen PTS-Zucker Transporten zur Verfügung
  • Von E II katalysierte Reaktion ist eine spezifische Reakiton = jeder PTS-Zucker hat ein eigenes E II
  • Mutationen in HPr oder E I = unspezifische Auswirkungen, d.h. kein PTS-Zucker kann mehr verstoffwechselt weren
  • Mutationen in E II = spezifisch, d.h. es ist immer nur ein PTS-Zucker-Stoffwechselweg betroffen
21
Q

Energiegehalt in PTS-Systmen

A
  • Die Phsophorylierung besitzen vom PEP bis E II B den gleichen Energiegehalt
  • Befinden sich nahezu im GGW
  • Erst bei Phosphorylierung des Substrates (PTS-Zucker) findet starker Energieabfaöö statt
  • Nur in Gegenwart von PTS-Zuckern wird das Reaktionsgleichgewich nach rechts gezogen
22
Q

Beispiele PTS-Zucker

A
  • Glucose
  • Fructose
  • Trehalose
  • Mannitol
  • GluNAC
  • Mannose
23
Q

Nicht-PTS-Zucker

A
  • Lactose
  • Maltose
  • Arabinose
  • Galactose
  • Ribose
  • Xylose
24
Q

Regulation

A
  • Nährmedien mit versch. Zuckern
  • Bakterium kann sich aussuchen
  • Regulation !
25
Diauxie
* Wachstum auf Mischung von Glucose und Lactose * Zuerst wachsen Bakterien auf Glucose * Lagphase nach verbrauch der Glucose * Anschließendes Wachsen auf Lactose * Wachstum schneller auf Glucose * Lactose muss gespaltet werden * Blaue linie: Exprimieren der beta Galactosidase * ZP: bei Verbrauch von Glucose -à daher Lagphase
26
Das *lac* Operon Funktion
* 3 Gene unter Kontrolle eines Promotors * *lacZ, lacY, lacA* * Protranskribierung der 3 Gene * Entehung polycistronische mRNA * Riibosomen binden mRNA * Tranlation * Transkription und Translation können gleichzeitig stattfinden * Proteine * Beta-glactosidase (LacZ) * Permease (LacY) * Transactylase (LacA)
27
Regulation des *lac* Operons
* Repression * Induktion
28
Regulation des *lac* Operons - Repression
* Repressorprotein codiert von Gene *lacI* * Repressor: Bindeprotein * Bindet Operator *lacO* (repressor bindestelle in der DNA) * Tetramer * Dimer or dimers * Bindet an zwei Palindromische DNA Sequenzen, relativ weit weg voneinander * Sekundärstruktur loop * *Lac* Operon kann nicht translatieren
29
Regulation des lac Operons - Induktion
* Inducer, Molekül bindet an Represso * Konf änderung des Repressors * Abfallen des Repressors
30
Lactose Analoga
* Isopropyl-beta-D-thiogalactopyranosid (IPTG) * Künstlicher Induktor des *lac* Operons * O-Nitrophenyl-beta-D-galactopyranosid (ONPG) * Chromogenes Substrat für beta-Galactosidasen * Spaltung * Enzymaktivität Galactosidase messbar * Verwendung für versch. Sachen * Allolactose * Transglycosylierung von Lactose durch LacZ * Umwandlung der Gla-beta-1,4-Glc-Bindung in eine Gla-beta-1,6-Glc-Bindung * Physiologische Inucer von LacI
31
Katabolitrepression
* Leicht metabolisierbare C-Quellen wie Glucose, hemmen die Verwertung von Nicht-PTS-Zuckern * Bei Anwesenheit von Glucoose ist der cAMP-Spiegel niedrig (second messenger) * Transkriptionsfaktor CAP im Komplex mit cAMP aktiviert Promotoren von nicht PTS-Zuckern
32
cAMP
* globaler second-messenger * high [Glucise] = low [cAMP] * low [Glucose] = high [cAMP] * bindet an Transkriptionsfaktor CAP (catabolite aktivator Protein) CAP bindet an Promotor, agiert als Aktivator
33
Katabolitrepression - Kontrolle des *lac* Operons Anfang Wachstumskurve
* Nur Glucose vorhanden * cAMP nicht an CAP gebunden * kein Promotoraktivierung * lac Repressor ist an operator gebinden, weil kein Inducer vorhanden
34
Katabolitrepression - Kontrolle des *lac* Operons - erste Phase Wachstum, G und L vorhanden
* cAMP immernoch gering, keine Aktivierung * lac Repressor wird * gewisse Transkription findet statt * Allolactose * Nicht bedeuteden
35
Katabolitrepression - Kontrolle des lac Operons - G verbraucht, L vorhanden
* Bildung cAMP * Bindung mit CAP * Transkription nicht verhindert * Lac Operon
36
Induktorausschluss (Katabolitinhibition)
* Reduktion der Transportkapazität von Nicht-PTS-Zuckern bei Anwesenheit von Glucose * Dieser soogenannte Induktorausschluss (engl. Inducer Exclusion) verhindert, dass nicht-PTS Systeme indukziert werden, solange genügend Glucose aufgenommen werden kann * **Adenylatcyclase (Cya)** * Bildet cAMP
37
Katabolitrepression und Induktorausschluss bei Vorhandensein von Glucose
* Wenn Phosphattransfer zur Glucose stattfindet, wird das GGW zwischen unphosphoryliertem EIIAGlc und phosphoryliertem EIIAGlc(-P) zugunsten unphosphorylierten Form verschoben * EIIA Glc interagiert direkt mit vielen nicht-PTS-Transportern (z.B. ABC-Transportern oder Protonensymportern) und inhibiert deren Aktivität = **Induktorausschluss**
38
Katabolitrepression und Induktorausschluss bei keiner Glucose
* Wenn Glucose aufgebraucht ist, wird das GGW zwischen unphosphoryliertem EIIAGlc und phosphoryliertem EIIAGlc(-P) zu gunsten der phosphorylierten Form verschoben * EIIAGlc-P aktiviert die denylatcyclase (Cya) * cAMP in Komplex mit CAP aktiviert die Expression von nicht-PTS-Zuckertransportern * Aktivierung von Cya durch EIIAglc-P schaltet Katabolitrepression ab
39
Übersicht über zellulären Stoffwechsel
* Katabolismus * Substrate * Umwandlung zu Produkten * Energieerzeugung * Umwandlung der Energie zum ATP generieren oder Als protonmotive force * Anabolismus * Energieverbauch * Biosynthese bausteine
40
ATP - Adenosintriphosphat
* Regeneration von ATP * Substratkettenphosphorylierne * Oxidativer Abbau organischer Verindungen * Elektronentransportphosphorylierung * Atmungskette
41
Prozesse der Energiegewinnugn
42
Klassifizierung von Organismen nach Energie- und Kohlenstoffquellen
43
Chemoorganotrophes Wachstum - Abbau von Hexosen
asjf
44
Wichtigste Glucose-Abbauwege bei Prokaryoten
* EMP-Weg (Glykolyse) * KDPG-Weg (Entner-Doudoroff) * Pentose-Phosphatweg
45
EMP-Weg
1. Phosphorylierung Glucose durch Hexokinase zu G-6-P (=Aktivierung, stoffwechselaktive Form und Ausgangspunkt fü weiterre Abbauwege) 2. Isomerisierung zu F-6-P 3. Phosphorylierung F6P durch Phosphofructokinase zu F16BP 4. Spaltung zu DHAP und GA3P durch Aldolase 5. Dehydrogenierung GAP zu 3-Phosphoglycerat * wichtigster Schritt * Abspaltung Hydridanion (H-), Übertragung auf NAD+ und gleichzeitig Entfernung eines H+ = Entstehung von NADH + H+ * Generierung von ATP durch Phosphorolyse und Übertragung auf ADP = reversibel 6. Umwandlung von 3-Phosphoglycerat in 2-Phosphoglycerat 7. Wasserabspaltung durch Enolase von 2-Phosphoglycerat zu PEP 8. Energiereiche Phosphrylgruppe von PEP (Enolester durch Pyruvat-Kinase auf ADP übertragen Pyruvat ist Vorstufe weiterer Abbau Umwandlung und Syntheseprozesse. bilanz: 2 Pyruvat, 2 ATP, 2 NADH + H+
46
47
Schlüsselreaktionen der E-gewinngung im EMP-Weg
2. Herkunft von Reduktionsäquivalenten (NADH+H+) 4. beispiel für Substratstufenphospphorylierung