ΑΝΤΙΓΡΑΦΗ Flashcards
(18 cards)
Ποια είναι τα χαρακτηριστικά της αντιγραφής;
α) Ημισυντηρητικός μηχανισμός
β) πιστότητα
γ) ταχύτητα (μέχρι 1000 νουκλ το δευτερόλεπτο)
δ) διευκολύνεται από το ζευγάρωμα των βάσεων καθώς κάθε κλώνος λειτουργεί ως εκμαγείο
Από που αρχίζει η αντιγραφή;
Η αντιγραφή αρχίζει στις αφετηρίες της αντιγραφής που είναι συγκεκριμένες αλληλουχίες βάσεων στα απλά κύτταρα περίπου 100 ζευγών βάσεων κυρίως ΑΤ (λιγότερη ενέργεια)
Στα βακτήρια υπάρχει κυρίως 1 αφετηρία
Στον άνθρωπο περίπου 10.000 αφετηρίες (220 ανά χρωμόσωμα)
Σε αυτές συνδέονται οι ενακτήριες πρωτεΐνες που διασπούν τους δεσμούς υδρογόνου
ΔΙΧΑΛΕΣ ΑΝΤΙΓΡΑΦΗΣ
REPLICATION FORKS
Σε κάθε αφετηρία αντιγραφής σχηματίζονται 2 διχάλες που απομακρύνονται από την αφετηρία προς αντίθετες κατευθύνσεις και παράλληλα ανοίγουν το ΔΝΑ
Οι διχάλες μετακινούνται πολύ γρήγορα
Ποιες είναι οι ιδιότητες της ΔΝΑ πολυμεράσης;
1) Καταλύει την αύξηση της αλυσίδας μόνο προς την μια κατεύθυνση και προσθέτει νέες υπομονάδες μόνο στο 3΄άκρο χρησιμοποιώντας ως εκμαγείο έναν από τους παλιούς κλώνους (καταλύει τον ΦΔ)
2) Παρακολουθεί προσεκτικά το ζευγάρωμα των βάσεων και καταλύει την αντίδραση προσθήκης μόνο αν το ζευγάρωμα είναι σωστό (πολυμερισμός 5 προς 3)
3) Επιδιορθώνει τα λάθη της (διόρθωση δοκιμίου 3 προς 5 proof reading)
Πως καταλύεται ο φωσφοδιεστερικός δεσμός;
τα νουκλεοτίδια εισέρχονται ως τριφωσσφορικά δεοξυριβονουκλεοτίδια
το εισερχόμενο νουκλεοτίδιο δημιουργεί ένα ζεύγος βάσεων με το συμπληρωματικό του στον κλώνο εκμαγείο
Συνδέεται με το ελεύθερο 3΄υδροξύλειο
Από που προέρχεται η ενέργεια για την αντίδραση πολυμερισμού;
Από την διάσπαση ενός φωσφορικού δεσμού υψηλής ενέργειας στο εισερχόμενο τριφωσφορικό νουκλεοτίδιο σε συνδυασμό με την απελευθέρωση πυροφωσφορικού
Τι είναι τα κλάσματα ΟΚΑΖΑΚΙ;
1 αλυσίδα αντιγράφεται συνεχώς (προπορευόμενος κλώνος) ενώ η άλλη ασυνεχώς (καθυστερημένος κλώνος). Στον καθυστερημένο κλώνο η ΔΝΑ πολυμεράση λειτουργεί σε αντίθετη κατεύθυνση από την κατεύθυνση της διχάλας της διχάλας της αμτιγραφής και δημιουργεί διαδοχικά ξεχωριστά μικρά κλάσματα
Ποια είναι η λειτουργία της ΔΝΑ πριμάσης;
χρησιμοποιεί ως εκμαγείο τον ένα κλώνο του ΔΝΑ και παράγει μικρά τμήματα ΡΝΑ (ΡΝΑ εκκινητές) Σχηματίζει ένα ζευγαρωμένο 3΄άκρο το οποίο μπορεί να αποτελέσει το σημείο έναρξης της αντιγραφής
Από πόσα νουκλεοτίδια αποτελείται ένας εκκινητής;
περίπου δέκα
ΟΙ ΕΚΚΙΝΗΤΕΣ ΣΥΧΝΑ ΠΕΡΙΕΧΟΥΝ ΛΑΘΗ
Πως αποδομούνται οι εκκινητές;
α) Μια νουκλεάση αποδομεί τον ΡΝΑ εκκινητή
β) Μια πολυμεράση επιδιόρθωσης αντικαθιστά το ΡΝΑ με ΔΝΑ χρησιμοποιώντας ως εκκινητή το γειτονικό κλάσμα ΟΚΑΖΑΚΙ
γ) Η λιγάση του ΔΝΑ συνδέει το 5΄φωσφορικό άκρο ενός νέου κλάσματος ΔΝΑ με το 3΄υδροξυλικό άκρο του επόμενου κλάσματος
Τι είναι η πρωτεινική αντιγραφική μηχανή;
μεγάλο πολυενζυμικό σύμπλοκο που μετακινείται ως ενιαία μονάδα κατά μήκος του ΔΝΑ επιτρέποντας να συντίθενται και οι 2 κλώνοι με συντονισμένο ρυθμό
προωθεί την διχάλα αντιγραφής και συνθέτει ΔΝΑ πίσω της
Ποια ένζυμα ανήκουν στην πρωτεινική αντιγραφική μηχανή;
ΔΝΑ ελικάσες
πρωτεΐνες που συνδέονται με μονούς κλώνους
ολισθαίνων συνδετήρας (sliding clamp)
φορτωτής του ολισθαίνοντα συνδετήρα
ΔΝΑ τοποισομεράσες
Τελομεράση
ΔΝΑ ελικάσες
Χρησιμοποιούν ενέργεια από την υδρόλυση του ΑΤΠ για να ξετυλίξουν την διπλή έλικα του ΔΝΑ
Πρωωτεΐνες που συνδέονται με μονούς κλώνους
Προσκολλώνται στο μονόκλωνο ΔΝΑ και το εμποδίζει παροδικά από τον επανασχηματισμό ζευγών βάσεων, ενώ παράλληλα το κρατά τεντωμένο = αποτελεσματικό εκμαγείο
Ολισθαίνων συνδετήρας;
διατηρεί την ΔΝΑ πολυμεράση ισχυρά προσδεδεμένη στο ΔΝΑ εκμαγείο (αλλιώς δημιουργούνται βραχέα κλάσματα)
σχηματίζει δακτύλιο γύρω από την έλικα του ΔΝΑ
φορτωτής του ολισθαίνοντα συνδετήρα
υδρολύει ΑΤΠ κάθε φορά που κλειδώνει το δακτύλιο γύρω από το ΔΝΑ
ΔΝΑ τοποισομεράσες
δημιουργούν παροδικές μονόκλωνες εντομές στον σκελετό του ΔΝΑ και μειώνουν προσωρινά την τάση
