ΜΕΤΑΓΡΑΦΗ Flashcards
(22 cards)
Ποιες είναι οι διαφορές των ριβονουκλεοτιδίων με τα δεοξυριβονουκλεοτίδια;
α) Έχουν ριβόζη αντί για δεοξυριβόζη (επιπλέον ΟΗ)
β) Έχουν ουρακίλη αντί για την ομόλογη βάση στο ΔΝΑ θυμίνη
(μια ομάδα CH3 λιγότερη)
Ποιες είναι οι διαφορές του ΔΝΑ και του ΡΝΑ στην δομή;
α) Το ΔΝΑ έχει την δομή διπλής έλικας ενώ το ΡΝΑ είναι μονόκλωνο
β) Το ΡΝΑ διπλώνεται σε διάφορες δομές και μπορεί να σχηματίσει ενδομοριακά ζεύγη βάσεων (δυνατότητα για διάφορες λειτουργίες) ενώ το ΔΝΑ δεν έχει την δυνατότητα να διπλωθεί και είναι επιφορτισμένο μόνο με την αποθήκευση της γενετικής πληροφορίας
Ποιες είναι οι ομοιότητες της μεταγραφής με την αντιγραφή του ΔΝΑ;
1) Η μεταγραφή ξεκινά με ξεδίπλωμα ενός μικρού τμήματος της δίκλωνης έλικας του ΔΝΑ
2) Ο ένας από τους δύο κλώνους της διπλής έλικας του ΔΝΑ δρα ως εκμαγείο για σύνθεση του ΡΝΑ
3) Η αλληλουχία των ριβονουκλεοτιδίων του ΡΝΑ καθορίζεται από το εκμαγείο ΔΝΑ σύμφωνα με τον κανόνα της συμπληρωματικότητας
4) Η αλυσίδα που παράγεται από την μεταγραφή ονομάζεται μετάγραφο (TRANSCRIPT) και επιμηκύνεται με ρυθμό ένα νουκλεοτίδιο την φορά
Ποιες είναι οι διαφορές της μεταγραφής με την αντιγραφή του ΔΝΑ;
- Ο κλώνος ΡΝΑ δεν παραμένει συνδεδεμένος με τον κλώνο εκμαγείο του ΔΝΑ. Τα μόρια ΡΝΑ που παράγονται είναι μονόκλωνα
- Τα μόρια ΡΝΑ είναι βραχύτερα από τα μόρια ΔΝΑ
- Πιστότητα. Η ΡΝΑ πολυμεράση ενσωματώνει λάθος ένα νουκλεοτίδιο στα 10^4
ενώ η ΔΝΑ πολυμεράση ένα στα 10^7 - Άμεση απελευθέρωση του κλώνου ΡΝΑ από το ΔΝΑ
- Ταυτόχρονη παραγωγή πολλών μεταγράφων
Ποιος είναι ο ρόλος της ΡΝΑ πολυμεράσης;
α) Ανοίγει την διπλή έλικα
β) Καταλύει τον σχηματισμό φωσφοδιεστερικών δεσμών που συνδέουν τα νουκλεοτίδια μεταξύ τους και δημιουργούν τον σακχαροφωσφορικό σκελετό της αλυσίδας του ΡΝΑ
γ) Μετακινείται βήμα βήμα κατά μήκος του ΔΝΑ
δ) Η αυξανόμενη αλυσίδα του ΡΝΑ επιμηκύνεται με ρυθμό ένα νουκλεοτίδιο την φορά σε κατεύθυνση 5 προς 3 χρησιμοποιώντας τριφωσφορικά νουκλεοσίδια
Ποια είναι η διαφορά της ΡΝΑ και της ΔΝΑ πολυ;
Η ΡΝΑ πολυμεράση καταλύει σύνθεση ριβονουκλεοτιδίων
Μπορούν να αρχίσουν αλυσίδα ΡΝΑ χωρίς εκκινητή
Ποια είναι τα είδη ΡΝΑ
mRNA
tRNA
rRNA
miRNA
Άλλα μικρά μη κωδικοποιητικά μόρια ΡΝΑ
mRNA;
αγγελιοφόρο ΡΝΑ messanger RNA
Τα μόρια ΡΝΑ που μεταγράφονται από τα γονίδια του ΔΝΑ τα οποία τελικά κατευθύνουν την σύνθεση πρωτεινών
rRNA;
Ριβοσωμικό ΡΝΑ ribosomal RNA
σχηματίζει το κέντρο των ριβοσωμάτων, πάνω στα οποία πραγματοποιείται η μετάφραση του mRNA σε πρωτεΐνη
tRNA ;
μεταφορικά transfer RNA
σχηματίζει τους συναρμολογητές που επιλέγουν αμινοξέα και τα συγκρατούν στην κατάλληλη θέση πάνω στο ριβοσωμάτιο για να ενσωματωθούν σε πρωτεΐνη
miRNA
microRNA
Ρυθμίζουν την έκφραση των γονιδίων στους ευκαρυώτες
Άλλα μικρά μη κωδικοποιητικά μόρια ΡΝΑ ;
χρησιμοποιούνται στην συρραφή στην συντήρηση των τελομερών και σε άλλες διεργασίες του κυττάρου
Ποια είναι η διαδικασία της μεταγραφής στους προκαρυώτες;
α) Η ΡΝΑ πολυμεράση πρέπει να αναγνωρίσει την αφετηρία της μεταγραφής (Transcription start site) και να προσδεθεί ισχυρά στον υποκινητή
β) Έπειτα ανοίγει την διπλή έλικα που βρίσκεται μπροστά από τον υποκινητή
γ) Ο ένας από τους δύο εκτεθειμένους κλώνους δρα ως εκμαγείο για να σχηματίσει συμπληρωματικά ζεύγη βάσεων
δ) Η αλυσίδα επιμηκύνεται έως την αλληλουχία τερματισμού (stop site) οπότε σταματά και απελευθερώνει την νεοσυνντεθειμένη αλυσίδα ΡΝΑ
Ο παράγοντας σ είναι μια υπομονάδα της βακτηριακής πολυμεράσης που αναγνωρίζει την αλληλουχία του υποκινητή
Με ποιον τρόπο οι ευκαρυώτες ξεκινούν την μεταγραφή;
Με την βοήθεια των γενικών μεταγραφικών παραγόντων οι οποίοι
α) Τοποθετούν κατάλληλα την ΡΝΑ πολυμεράση
β) Ανοίγουν την διπλή έλικα και μια αλυσίδα δρα ως εκμαγέιο
γ) Απελευθερώνουν ΡΝΑ πολυμεράση
2 Γνωστοί μεταγραφικοί παράγοντες
TFIID
TFIIH
TFIID ;
προσδένεται σε μια περιοχή του ΔΝΑ με πολλά Τ Α ΤΑΤΑ ΜΠΟΞ
αλλάζει την διαμόρφωση του ΔΝΑ και προκαλεί την συναρμολόγηση επιπρόσθετων πρωτεινών
πλήρες σύμπλοκο έναρξης της μεταγραφής
transcription initiation complex
TFIIH
Έχει μια υπομονάδα με ενζυμική ενεργότητα πρωτεινικής κινάσης και προσθέτει φωσφορικές ομάδες στην ΡΝΑ πολυ γεγονός που επιτρέπει την απελευθέρωση της
Ποιες είναι οι διαφορές στους ευκαρυωτικούς και στους προκαρυωτικούς οργανισμούς κατά την διαδικασία της μεταγραφης;
- Τα βακτήρια έχουν ένα είδος πολυ ενώ οι ευκαρυώτες 3
- Η βακτηριακή ΡΝΑ πολυ μπορεί να ξεκινήσει μόνη της την μεταγραφή (παράγοντας σ) ενώ η ευκαρυωτική χρειάζεται τους γενικούς μεταγραφικούς παράγοντες
- Περίπλοκοι μηχανισμοί έκφρασης στους ευκαρυώτες
- Κατά την έναρξη της μεταγραφής στους ευκ. πρέπει να επιλυθεί το ζήτημα της συσκευασίας του ΔΝΑ σε νουκλεοσωμάτια και πιο συμπαγείς δομές χρωματίνης
- Στους ευκ. όλα τα πρωταρχικά mRNA υφίστανται ωρίμανση
- Η σύνθεση του ΡΝΑ στους ευκ γίνεται στον πυρήνα ενώ στους προκαρυωτικούς στο κυτταρόπλασμα
7.Ο χρόνος ημιζωής του mRNA των ευκ μετριέται σε ώρες ενώ των προκαρυωτικών σε λεπτ’α - Τα βακτήρια έχουν ομάδα γειτονικών γονιδίων που μεταγράφονται σε ενιαίο μόριο ΡΝΑ ενώ στους ευκαρυωτικούς οργανισμούς ένα μόριο ΡΝΑ αντιστοιχεί σε ένα μόνο γονίδιο
- Στους ευκαρυωτικούς οι κωδικοποιητικές αλληλουχίες (εξώνια) διακόπτονται από μη κωδικοποιητικές αλληλουχίες (ιντρόνια)
- Διαφέρει ο τρόπος πρόσδεσης της ΡΝΑ πολυμεράσης στην αφετηρία μεταγραφής
Ποιες δύο επεξεργασίας υφίστανται όλα τα μόρια ΡΝΑ των ευκαρυωτικών οργανισμών;
1) Ο ΣΧΗΜΑΤΙΣΜΟΣ ΤΗΣ ΚΑΛΥΠΤΡΑΣ ΤΟΥ ΡΝΑ
RNA capping τροποποίηση του 5΄άκρου καθώς το ΡΝΑ καλύπτεται με την προσθήκη ενός άτυπου νουκλεοτιδίου μια γουανίνης που φέρει μια μεθυλομάδα
2) Η ΠΟΛΥΑΔΕΝΥΛΙΩΣΗ
polyadenylation προσθήκη στο 3΄άκρο μια σειρά διαδοχικών αδενινών (λίγες εκατοντάδες)
Ποια είναι η χρησιμότητα των μηχανισμών επεξεργασίας των μορίων ΡΝΑ των ευκαρυωτικών οργανισμών;
α) επικυρώνεται ότι είναι ΡΝΑ
β) αυξάνουν σταθερότητα του μορίου
γ) διευκολύνουν την έξοδο από τον πυρήνα και την είσοδο στο κυτταρόπλασμα
Ποια είναι η διαδικασία της συρραφής;;
α) Ολόκληρο το γονίδιο μεταγράφεται σε μΡΝΑ (πρόδρομο)
β) Μετά τον σχηματισμό της καλύπτρας και καθώς το ΔΝΑ μεταγράφεται, τα ιντρόνια κόβονται και τα εξόνια συνδέονται μεταξύ τους
γ) Τελικά κάθε μετάγραφο αποκτά μια ουρά πολυ(Α) (πριν ή μετά)
δ) Το μΡΝΑ γίνεται λειτουργικό και μπορεί να εγκαταλείψει τον πυρήνα
Εναλλακτική συρραφή;
τα εξώνια μπορούν να συρραφούν με διαφορετικούς τρόπους και να προκύψουν διαφορετικές πρωτεΐνες 95% ανθρώπινων γονιδίων
