חלק ראשון Flashcards

Question

ממה ההיסטונים מורכבים בעיקר?

Answer 1

חומצות האמינו ליזין וארגנין לכן יש להם מטען חיובי

Answer 2

כי המטען של הדנא הוא שלילי (בגלל הפוספאט) ולכן חשוב שההיסטונים יהיו חיוביים

Answer 3

מקטע דנא חשוף בין שני נוקליאוזום באמצעותו יש דינאמיות לגנום כך שיוכל לעבור שעתוק או לשמש כאיזור בקרה

Answer 4

N הקצה ה טרמינלי השערות הצהובות באיור

Answer 5

**H3 ל H4 נוצר דימר בין** שני דימרים כאלו מתחברים ויוצרים טטראמר **H2A ל H2B נוצר דימר בין** שני דימרים כאלו מתחברים לטטראמר הקיים כדי ליצור אוקטומר

Answer 6

פחות שמור מיתר הסוגים פחות קושר דנא יותר קושר חלבונים

Answer 7

האזור הדחוס בכרומוזום לא עובר שעתוק הצנטרומר והטלומר הם הטרוכרומטין רק 10% מהדנא הוא במצב הטרוכרומטרין

Answer 8

האיזור הפחות דחוס שעובר שעתוק בכרומוזום

Answer 9

חלבונים שמעורבים בהחלפת היחידות הפנימיות של הנוקליאוזום בהתאם לצרכי התא

Answer 10

משתמשים בהם כשרוצים לשחלף תת יחידות של הסטונים בהתאם לתפקוד הנדרש באותו רגע, נעשה ע"י שימוש ב ATP

Answer 11

יודעים לחתוך בסיסים בודדים בדנא, לא ספציפיים לרצפי בסיסים מסויימים, מעכלים מהקצה כלפי פנים (לא יודעים לחתוך באמצע מכאן נובא שלא יחתכו פלסמיד)

Answer 12

סינתזת דנא, שבר דנא, הגנה לחיידק

Answer 13

בגדול- עובדים יחד כדי להפיץ מודיפיקציות

Answer 14

כאשר יש רצף בסיסים בדנא שמונע דחיסה באיזור מסויים

Answer 15

דחוס- עם הסטונים

Answer 16

א מה הקשר קשר מימני

Answer 17

הבנייה עצמה היא מ-5 ל-3 אבל!! בונים הפוך הרי, קצה 5 של גדיל הבניה הוא קצה 3 של הגדיל שבונים עליו

Answer 18

שכפול דנא אבל הוא לא יודע להתחיל ביצירת גדיל חדש ולכן הוא צריך מקטע התחלתי- פריימר

Answer 19

RNA רצף של 20 בסיסים מספק לאנזים פולמיראז נקודת התחלה בשכפול ליצירת הגדיל החדש יש הרבה פריימרים בכל נק שכפול כפי שניתן לראות בתמונה

Answer 20

מעט (1 ל100) איטי (80 נוקלאוטידים בשניה)

Answer 21

פורם את המבנה הדו גדילי של הדנא ע"י הידרוליזה של ATP

Answer 22

משחרר את המתח בדנא בשכפול (במזלג ההכפלה), הוא מפרק את הקשר הפוספודיאסטרי בין שני בסיסים (יוצר ניק) , הסלילים מסתובבים סביב עצמם קשי לשחרר את המתח. הריאקציה הפיכה והקשר הופופדיאסטרי בין שני הנוקלאוטידים יכול להיווצר מחדש באופן ספונטני

Answer 23

פותח פלונטרים בעייתים (שלא בשגרה) שנוצרים בדנא

Answer 24

שההליקאז פותח את הדנא כלולים להיווצר קשרי מימן בין בסיסים שלא חייבים להיות סמוכים זה לזה , זה מאט את פעילות האנזים פולימראז והשכפול. SSB ה פורסים את הדנא החד גדילי . lagging strand יותר נפוץ ב leading strand מאשר ב.

Answer 25

NICK אנזים שמחבר

Answer 26

מתאר כמה נוקלואטידים מוסיף הפולימראז עד שנמאס לו וישתחרר מהדנא

Answer 27

עושה תיקוני חירום בהגהה של הדנא

Answer 28

יכול להחזיק 200 בסיסים בשכפול עד שהוא נופל Lagging strand זה טוב ל Leading strand אבל לא ל

Answer 29

הפולימראז האמיתי שמבצע את עבודת השכפול בתא, המהירות שלו היא בערך 2000 נוקלאוטידים לשניה. יש לו פרוססיביות טובה- הוא עובר 500,000 בסיסים לפני שהוא חושב להתנתק. Leading strand עובד בעיקר ב **הבעיה בו שהוא לא יודע להאריך את שרשראות הפריימר ולכן פולימראז 1 מתחיל את ההארכה אחרי הפריימר ואז פולימראז 3 מחליף אותו**

Answer 30

במקום מספרים- אלפא, דלתא, אפסילון

Answer 31

באאוקריוטים- היחיד שיודע לבצע הארכה אחרי הפריימר

Answer 32

הפולימרז שמסנתז (יוצר) את ה lagging strand

Answer 33

בעל פרוססיביות גבוהה (יכול לסנתז הרבה בסיסים ברצף) ולכן מסנתז את ה Leading strand

Answer 34

טבעת שדוחפת את הפולימראז לאורך הדנא ומגדילה את הפרוססיביות שלו. גם לפולימראז אפסילון וגם לפולימראז דלתא

Answer 35

להגן על קצוות הכרומזום C ו G עשיר ב

Answer 36

מתקן בעיה שנוצרת באופן טבעי בהכפלה- קיצור הטלומר. הוא מאריך את הטלומר מחדש ושומר על הכרומוזום שלא יתקצר עם החלוקות. עושה זאת באמצעות מקטע של רנא שמשלים לרצפים שנמצאים בטלומר. עושה הארכה מכיוון 5 לכיוון 3!

Answer 37

שיטה המשמשת לשכפול מזורז (אמפליקציה ) של מעט מקטעי דנא. מרתיחים את הדנא כדי שייפרד לשני גדילים בודדים מקררים ל56 מעלות מערבבים עם סוג של אנזים פולימראז ב72 מעלות כדי שיסנתז את המקטע. כל סבב כזה מכפיל את כמות הגדילים שהייתה בהתחלה, חוזרים על התהליך כמה שצריכים.

Answer 38

מצבי עקה, הפעילות של הפולימראז היא פחות טובה ויש יותר סיכוי למוטציות.

Answer 39

מנגנון תיקום לפגם בגדיל בודד מטרתו לתקן אי התאמת בסיסים שנוצרו במהלך שכפול דנא הוא פועל על הגדיל המסונתז החדש ולא משפיע על הדנא המקורי בפרוקריוטים: MutS MutL MutH החלבונים עובדים יחד כדי לתקן את הגדיל. מזהים את הטעות לפי מתילציה.

Answer 40

תיקון מוטציות ספונטניות בהן הוסר בסיס אחד. 1. C A U דה אמינציה, נעשה על בסיסים ( T לא נעשה על NH3 אין בו אמין - ) 2. דה פורינציה- הסרה של פורין, A G 3. דה- פירמידיניזציה- הסרה של פירמידין T C 4. הוספה של קבוצות מתיל לבסיסים בכולן מדובר על פגיעה בבסיס חנקני אחד של הדנא, ואז המים משלימים את הפעולה ומסירים את הבסיס.

Answer 41

תיקון מוטציות שנוצרות בדנא **עקב חשיפה לאור השמש**. חשיפה לקרינה גורמת לשני הנוקולאוטידים הסמוכים להיקשר זה לזה בקשר קוולנטי וליצור דימר (בתמונה). גורם בסופו של דבר אם אין תיקון למלנומה. ATP מנגנון התיקון עושה שימוש ב ומתקן ע"י החלפת הבסיסים.

Answer 42

תיקון מוטציות בדנא עקב חשיפה לגורמים סביבתיים בעייתיים שיצרו בו מודיפיקציה (כימיקלים/ קרציונוגנים). מתקן גדיל אחד.

Answer 43

חלבונים, נהיים פעילים אחרי שנקשרים אליהם חלבונים בשם cyclin משפעלים תהליכים בתא, נמצאים בעודף בכל התאים האאוקריוטים, מעורבים בוויסות שלבי מחזור התא.

Answer 44

P53- מפעיל את P21. עוצר את מחזור התא- P21

Answer 45

מתקן שבר דו גדילי בעיקר תאים סומטיים, מהיר אך גורם למוטציות,מדביק את שני חלקי הכרומוזום השבורים. תוצרי לוואי: איבוד מידע גנטי, איבוד הרצף התקין, לעיתים אף איחוי בין שני גדילים מכרומוזומים שונים.

Answer 46

המנגנון נכנס לפעולה לאחר השכפול כאשר הכרומטידות האחיות נמצאות מספיק קרוב אחת לשניה, עושה שחלוף בין כרומוזומים הומולוגיים/ כרומטידות אחיות לצורך השלמת המקטע החסר. משתמש בכרומוזומים התקינים לשחזור החלקים החסרים.

Answer 47

גן שמונע חלוקה תאית סרטנית. אם אין אותו יש סרטן.

Answer 48

נוק אאוט- להנדס יצור שבו גן מסויים לא פעיל NHEJ mediated repair נעשה באמצעות נוק אין- תהליך של החדרת גן חליפי במקום זה שהשותק. HDR mediated repair נעשה באמצעות

Answer 49

Tale nuclease CRISPER nuclease

Answer 50

אנדוקלאז שחותך רצפים ספציפיים בדנא. משמש לעריכת גנום.

Answer 51

בקצרה- מערכת שבאמצעותה אפשר להנדס תאי גזע, עובדת על שני גדילים במקביל. cas עושה זאת באמצעות שימוש בחלבוני.

Answer 52

1. להישאר במקום שאליו הוא יצא ולהתחיל לעבור דיפוזיה ולהגיע לכל מיני מקומות בציטופלזמה 2. להתפס ע"י מנגנון שמסיע אותו בצורה אקטיבית למקום שבו הוא נדרש.

Answer 53

תקשורת בין השלבים שונים, הביטוי הגנטי לא יעשה ע"י שלב מסויים אלא ע"י אינטראקציה של כל השלבים בינם לבין עצמם

Answer 54

כי אם יהיה מיצוי מקסימלי לא תהיה אפרות להגביר שעתוק בהתאם לצורך מסויים. גם כדי שהרנא פולימראז שלא מחוברות יוכלו להחליף פולימראז שמתנתק

Answer 55

דומה במבנה המרחבי שונה בתתי היחידות (מבחינת הרצף)

Answer 56

אינטראקציה של הרנא פולימרז בעל יחידה הסיגמא עם הדנא. הדנא נקשר לסיגמא 3- סיגמא 3 נקשרת לרנא פולימראז- אינטראקציה בין הרנא פולימראז לדנא. מי שמנחה את הרנא פולימראז לאן להיקשר היא σ 3

Answer 57

A-T בגלל שהקשרים G-C חלשים יותר מ הם נפתחים ספונטנית ונסגרים. TATA BOX ישנם אזורי A-T שמלאים בקשרי ככה הרנא פולימראז יכול עם הסיגמא לתפוס באיזורים האלו. נמצאים באיזור 10 ו 35 בסיסים לפני נקודת השעתוק.

Answer 58

הנוקלאוטידים נכנסים לאיזור השעתוק באופן אקראי- אך השהייה שלהם מושפעת מההתאמה לבסיס שנמצא באתר הפעיל של הדנא. הבסיס הנכון נשאר מספיק זמן כדי לאפשר לקטליזטור (מגנזיום) לעשות את העבודה שלו וליצור קשר פוספודיאסטרי

Answer 59

הסיגמא מלווה את הרנא עד הבסיס התשיעי, שם יש לשונית של הסיגמא. במידה והרנא שיכפל את הדנא כמו שצריך הוא יהיה מספיק חזק בשביל להוצי את הלשונית של סיגמא ולהמשיך את השעתוק. אם הייתה בו טעות אז הלשונית תעיף את הרנא. השעתוק יפסיק. כנראה שמשם יתחיל מחדש.

Answer 60

קובעים לאיזה פרומוטרים יגיע הרנא פולימראז, מתי ובאיזה עוצמבה הוא ישעתק.

Answer 61

חלבון דכאן, קשירה שלו אל הדנא מעכבת את השעתוק. הרפרסור נקשר לאופרטור וחוסם לרנא פולימראז חלק מאתר הקשירה שלו כך שהוא לא יוכל לשעתק.

Answer 62

קטעים בדנא שאליהם נקשרים דברים

Answer 63

mRNA אחראי על שעתוק של שמקודדים לחלבונים.

Answer 64

אלמנטים שעושים הגברה לשעתוק. האלמנטים יכולים להיות מאוד רחוקים משני צידי הפרומוטור, ואפילו בתוך הגן עצמו, ועדיין להשפיע על תחילת השעתוק. דבר זה מתאפשר בזכות קיפול הדנא (?) (במבחן- גמישות הכרומטין בתנאי שאין חסמים מבניים)

Answer 65

גנים לא מקודדים שמבקרים שעתוק של גנים, אליהם נקשרים פקטורי השעתוק.

Answer 66

הגנים שמקודדים לפקטורי השעתוק עצמם?

Answer 67

חלק ברנא פולימראז שאליו נקשרים חלבונים שקשורים בבקרת ביטוי גנטי ובקרת שעתוק. מכיל רצף חוזר של 7 חומצות אמינו. למשל: 1. תהליך הקאפינג. (הוספת בסיסים של G) 2. קישור של הספלייסוזום

Answer 68

חלבונים שמעודדים התחלה של שעתוק, מורכבים משני חלקים 1. DNA Blinding Domation אחראי לקישור של פקטור השעתוק אל הדנא. 2. Activating Domain איזור בחלבון שאחראי לאקטיבציית הגן. שני הדומיינים האלו הכרחיים לביצוע שעתוק יעיל. (- דומיין חלבוני- יחידת קיפול עצמאי- קיפולו מתרחש באופן עצמאי)

Answer 69

במצב בו יש מעכב לא צריך לייצר מחדש את האקטיבטור אלא פשוט לשחרר את המעכב.

Answer 70

לסמן לתא מה לעשות עם הדנא- לדחוס/ לשחרר/ לתקן ועוד.

Answer 71

מודיפיקציות על היסטונים הן הפיכות. | (לעומת הדנא שכל שינוי בו הוא קבוע)

Answer 72

לא מספרי אבל- יותר מאחת, שינוי בתא נגרם ע"י מס רב של מודיפיקציות.

Answer 73

Histone chaperone חלבונים שיודעים לעבור אינטראקציה עם נוקלאוזומים. השפרונים עובדים לפני הרנא פולימראז, מסירים עבורו את המכשולים כדי שהוא יוכל להתקדם. לאחר שהוא מסיים את עבודתו השפרונים מחזירים את ההיסטונים חזרה לנוקלאוזום וכך לא לפגוע במבנה הנוקלאוזומלי המקורי של הגן. **חשוב מאוד לשמור את האינפורמציה שאיתו הכרומטין הגיע מלכתחילה**

Answer 74

תהליך שקורה אחרי שנוצר הרנא הראשוני, הוא עובר עריכה והסרה של איזורים לא רלוונטיים שנוצרו בו ולאחר מכן חיבור מחדש של כל המקטעים שכן רלוונטיים. mRNA בסוף תהליך השחור הוא ייקרא.

Answer 75

החלקים מהדנא שנשארים ל mRNA

Answer 76

מקטעים שלא צריכים להיות ב mRNA

Answer 77

רצף בקרה שמכתיב את נקודת תחילת השעתוק.

Answer 78

הוספת בסיסים לקצוות במטרה לייצב את הרנא כך שישרוד עד לסיום התרגום שלו. בקצה 5 מוסיפים לו 7 נוקלואוטידים של G. בקצה 3 מוסיפים לו 200-250 נוקלאוטידי של A (Poly A נקרא גם)

חלק ראשון Flashcards

(189 cards)