07.02.24

Question 1

irgendwas chemical tool veränderung keine ahnung??

Answer 1

• Mögliche Frage: Welche Vorsichtsmaßnahmen sollten bei der Auswahl und Optimierung/ Veränderung von Chemical Tools beachtet werden um deren Selektivität und Wirksamkeit zu verbessern ?”
• Welche Schritte und Vorsichtsmaßnahmen sollten bei der Auswahl, Validierung und Optimierung/ Veränderung von Chemical Tools beachtet werden?

Question 2

Was sind PROTACs, ( wahrscheinlich mechanismus erklären)

Answer 2

Der Wirkmechanismus von PROTACs (Proteolysis Targeting Chimeras) besteht darin:
* gezielt den Abbau spezifischer Proteine in der Zelle zu induzieren. Sie bestehen aus einer Zielprotein-bindenden Domäne, einer E3-Ligase-bindenden Domäne und einem Linker, der beide Domänen verbindet.
* Durch die Bildung eines ternären Komplexes aus Zielprotein, PROTAC und E3-Ligase wird das Zielprotein polyubiquitiniert und anschließend vom Proteasom abgebaut.

Question 3

targeted covalent inhibitors ( frage wurde nicht genau formuilert aber wahrscheinlich erklären vlt bsp von funktoinller gruppe dafür angeben …)

Answer 3

Allgemein Erklärung verständis :
Targeted covalent inhibitors (TCIs) sind designed um schlecht konservierte Aminosäuren mithilfe reaktiver Gruppen, sogenannter warheads zu binden, zunächst formen sie reversible Assoziation, gefolgt von der formation einer kovalenten Bindung zwischen einem Elektrophil am Liganden und einem nukleophilen Zentrum im Protein, im Gegensatz zum traditionellen Mechanismus der Arzneimittelwirkung, der auf reversiblen, nichtkovalenten Wechselwirkungen beruht.
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• Von der Folie:
• Targeted covalent Inhibitors:
  Inhibitor, der eine Bindungsformende funktionelle Gruppe von geringer Reaktivität trägt, die nach der Bindung an das Zielprotein so positioniert ist, dass es schnell mit einem spezifischen Rest an der Target site reagiert.
• Zuerst wird reversible Bindung zum Target ausgebildet –> dafür ist bereits gewisse Selektivität nötig –>reversibel
• Dann wird der Ligand so positioniert, dass er kovalente Bindungen mit dem Target- Protein eingehen kann –>irreversibel
  * Zweistufiger Bindemechanismus
• Acrylamide häufig verwendet, aber viele Warheads verfügbar
  o Maßgeschneiderte reaktive Gruppen, z.B. abhängig von Target-Aminosäure und deren Umgebung
  Target-Aminosäuren: Cystein, Serin und Leucin
• Binde-Kinetik, kinetische Selektivität