Brainscape's Knowledge GenomeTM

Browse over 1 million classes created by top students, professors, publishers, and experts.


See full index

Cours BCM6171 > Cytogénétique > Flashcards

Cytogénétique Flashcards

1
Q

Qu’est-ce que la cytogénétique?

A

étude pangénomique et détaillés des chromosomes composant la cellule

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
1
Q

Quel est l’objectif de la cytogénétique et quels sont les 3 domaines?

A

Objectif : Objectif : On veut identifier la présence d’anomalies chromosomiques qui expliquent le phénotype du patient ou oriente son diagnostic, sa prise en charge et son pronostic

3 domaines : prénatal, constitutionnelle et hématologie/oncologie

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

que cause des Anomalies constitutionnelles/germinales?

A

-infertilité
-fausse couche
-malformation génitale
-déficience intellectuelle
-retard de développement
-trouble du développement sexuel
-etc..

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Qu’est-ce que les anomalies acquises/somatiques et qu’elle est la plus fréquente?

A

-tumeurs solides et hémopathies malignes.
- Anomalie de remaniement chromosomique plus fréquente

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Comment est formé un embryon diploide 2n?

A

Ovule (gamète haploide 1n) + spermatozoides (1n) = embryon diploide 2n

-Gamète haploide 1n = 1 chromatide de chaque pair de chromosone

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

La méiose est spécifique à quelle type de cellules?

A

-spécifique aux cellules germinales

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Quelle est l’objectif de la méiose?

A

-objectif de réduire le contenu diploide (2n) de l’embryon pour former des gamètes haploides.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Explique moi la première phase de la méiose

A

-Prophase 1 : Individualisation et appariement des chromosomes homologues (tétrade ou bivalent). Recombinaison ou crossing-over. (2 modal (2n), 4 chromatines (4c) et 2 chromosomes (2)

-Métaphase 1 :Alignement des chromosomes dans le plan équatoriale. Se font face 2 à 2. 2n, 4c et 2

-Anaphase 1 : Disjonction puis séparation des chromosomes homologues. Un lot haploide migre vers des pôles de la cellule. 2n à n, 4c à 2c, 2

-Télophase 1 : Formation de 2 cellules haploides avec n chromosomes doubles. n, 2c et 2. Cela va former des cellules germinales primaires

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Explique le principe de la deuxième division de la méiose

A

-Prophase II : préparation des chromosomes pour la 2e division (n, 2c et 2)

-Métaphase II :Alignement des chromosomes dans le plan équatoriale. Se font face. n, 2c et 2

-Anaphase II : Disjonction puis séparation des chromatides soeurs. Un lot haploide migre vers des pôles de la cellule. n, 2c à c et 2 chromosomes à 1.

-Télophase II : Formation de 4 cellules haploides avec n chromosomes simples. n, c1 et 1.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Est-ce que la méiose 1 et 2 sont précédés de la phase S?

A

La méiose 2 n’est pas précédé de la phase S

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Quelle étape de la méiose est réductionnelle et quelle étape est équationnelle?

A

Réductionnelle : méiose 1
Équationnelle : méiose 2

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Quels sont les phases du cycle cellulaire?

A

interphase durant 23h
-phase G1
-phase S
-phase G2
mitose durant 1h
-phase M

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Que permet la mitose? Est-elle réductionnelle ou équationnelle? Expliquez le principe et nommez les 4 phases.

A

-Permet prolifération cellulaire
-Permet la conversation du matériel génétique d’une cellule à l’autre
-Phases : prophase, métaphase, anaphase et télophase
-1 cellule mère (2N) en 2 cellules filles identiques (2N1c). Toujours précédé d’une phase de réplication d’ADN (2N1c – 2N2c – 2N1C)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Est-ce les hommes ou les femmes qui font des corps polaires?

A

Les femmes

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

D’où proviennent les anomalies germinales?

A

proviennent de la division méiotique ou dans les toutes premières divisions mitotiques du fœtus.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Quelles sont les anomalies germinales les plus fréquentes?

A

21, 18 et 13

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Qu’est-ce qu’une aneuploidie?

A

Perte ou gain de chromosome (2N+1 ou 2N-1)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Qu’est-ce qui peut causer des anomalies germinales?

A

Causé par une non-disjonction
- une disjonction survient lors de l’anaphase d’une méiose ou mitose = la force d’attraction des pôles qui attirent les chromatides sœurs à l’opposé après attachement du centromère au fuseau mitotique).
-Peut survenir à la méiose I, II et mitose.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Quelle est la trisomie la plus fréquente et qu’est-ce qui peut augmenter les chances de faire un enfant avec cette maladie?

A

-Trisomie 21 : Anomalie autosomique la plus fréquente (1/700)
-Plus fréquent chez femmes de 35 ans et +

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Quels aspects physiologiques anormaux que l’on retrouve chez la trisomie 21?

A

-Protrusion de la langue et tâches de Brushfield.
-Dysmorphie faciale
-anomalies corporelles autres
-problème neurologique/cognitif
-problèmes cardiaques/digestif

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

pourquoi les femmes de 35 ans et plus de chance ont plus de chance de faire causer des trisomies 21?

A

-plus de chance de faire des non-dysjonctions potentiellement à cause de l’âge biologique des ovaires (dégradation avec l’âge) ou variation du taux de recombinaison en phase méiose 1.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Différences entre ovocytes et spermatozoides en relation avec la trisomie 21

A

-l’ovogénèse est plus permissive que la spermatogenèse puisque la nature peut vouloir garder les ovocytes produits même défectueux vs les hommes dont les spermatozoides seront remplacés.
-De plus, les ovocytes ne prolifères plus et s’arrête en prophase 1 au stade diplotène pendant de nombreuses années vs Spermatogenèse se fait tout long de la vie de l’homme.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Est-ce que les enfants avec trisomie 18 et 13 sont viables?

A

Non
-Importantes malformations (surtout la 13) qui rend l’enfant peu viable
-90% décès après 1 mois

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Quel est le cheminement prénatal lors d’anomalies ?

A
  • si haut risque (1/300) suite au dépistage biochimie ou TGPNI = échographie.
    -Si échographie positive (anormalité) on fait tests invasifs (amniocentèse ou biopsie des villosités choriales) ou un 2e TGPNI
    -Si positif, on fait un caryotype (test invasif) pour savoir si présence d’aneuploidie (trisomie libre ou non) et pour savoir probabilité de refaire la même chose pour la prochaine grossesse.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

D’où proviennent les anomalies somatiques?

A

Proviennent de cassures de doubles-brins ou origines de division mitotique erronée survenue dans une cellule d’un tissu, d’une lignée cellulaire.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Quelles anomalies somatiques sont les plus fréquentes?

A

remaniements chromosomiques structuraux causé par cassures de doubles brins

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Que peut causer une réparation erronée des cassures d’ADN?

A

-formation de translocations, d’inversions ou d’anomalies chromosomiques complexes.

25
Q

Qu’est-ce que la translocation chromosomique et qu’est-ce que cela cause?

A

-Échange réciproque et balancée de matériel entre 2 chromosomes, homologues ou non
-Doit avoir 2 cassures, chromosomiques, échange de matériel, réparation erronée des cassures (ces réparations augmente la survie)

-Présence de translocation cible des oncogènes ou TSG qui confèrent des propriétés transformant à la cellule.

26
Q

Nomme moi 2 types de délétions dans les chromosomes?

A

Délétion terminale (de la fin) vs interstitielle (du milieu)

27
Q

Quels sont les 3 analyses les plus utilisés en cytologie?

A

-caryotypes
-FISH
-CGH

28
Q

Quel est le seuil de détection du caryotype?

A

5-10mb

29
Q

Qu’est-ce que la résolution des chromosomes pour le caryotype?

A

-Augmentation du nombre de bandes (+ résolution et mieux c’est, dépend de la compaction de l’ADN

30
Q

Quelle est la technique pour faire du caryotype?

A

-prélèvement moelle
-isolement leucocytes par centri
-mise en culture 24,48 ou 72h
-arrête en métaphase par colcémid, choc hypotonique (KCl) et fixation (carnoy)
-étalement et coloration
-balayage et capture d’écrans
– montage et analyse des caryotyes.

31
Q

Quelles sont les indications cliniques pour faire le caryotype?

A

-Prénatal (trouvailles échographiques, marqueur anormal, mais réalisé d’emblé puisque diagnostique pour confirmer une aneuploidie fœtale)
-post-natal (suspicion syndrome à la naissance, infertilité, petite taille, fausses-couches à répétition, etc…)
-onco-hématologique (leucémie, lymphome, myélome, néoplasie, etc…)

32
Q

Quelle est la composition du chromosome? Quels sont les 3 types?

A

-Centromère
-2 télomères et sous télomère et 2 bras chromosomiques.

-3 types de chromosomes:
-métacentrique
-submétacentrique
-acrométacentrique

33
Q

Comment différencier l’euchromatine de l’hétérochromatine?

A

Suite à la trypsine qui permet la libération de l’ADN, on ajoute du Giemsa qui préfère se lier aux AT causant des bandes GTG (noir) et RHG (blanc)
-Se lie à l’hétérochromatine puisque en riche en AT pendant que l’euchromatine est riche en GC

34
Q

Dans quelle situation principale on fait du caryotype?

A

-Aide dans le diagnostic des cancers
-permettent la classification des pronostics des cancers hématologiques
-orientent les traitements

35
Q

Quelles sont les Hémopathies qui nécessitent absolument un caryotype pour sélectionner traitement et confirmer le diagnostic ?

A

-leucémie myéloïde aigue (LMA)
-leucémie lymphoïde aigue
-syndrome myélodysplasique
-néoplasie myéloproliférative

36
Q

Qu’est-ce que la leucémie?

A

-cancer effectant leucocytes du sang et/ou moelle.
-Selon type cellulaire ou selon l’évolution de la maladie

37
Q

Quels anomalies chromosomiques retrouvent-on dans les leucémie LMA, LMC et SMD?

A

-il y a réparation erronée des cassures dans l’ADN par fusion erronée de 2 gènes afin de créer un nouveau gène doté d’un avantage prolifératif
-des régions codantes de 2 gènes vont se lier pour créer un nouveau gène (gène de fusion))

38
Q

Qu’elle est la fusion chez la LMA qui nécessite une urgence clinique?

A

-fusion chez la LMA des gènes PML et RARA qui nécessite une urgence clinique et une chimiothérapie adaptée
-Bonne survie (81%) si pris en urgence

39
Q

Que cause la leucémie promyélocytaire aigue?

A

-urgence clinique d’hématologie,
-fièvre/infection
-ecchymose
-grande faible
-perte de poids.
-Pancytopénie dans la moelle avec accumulation de promyélocytes médulaires.
-Cause de la coagulopathie qui est fatale dans 20% des cas dans les premiers 48h.

40
Q

Quelle est la fusion chromosomique la plus populaire chez la Leucémie promyélocytaire aigue ? Quel type de test devrait-on faire ?

A

PML-RARA

Utilisation de FISH ici vu l’importance de la vitesse. Caryotype trop lent

41
Q

Comment traiter la Leucémie promyélocytaire aigue

A

-Traitement par acide rétinoique puisque recrutement constitutif de co-répresseur qui arrête la différenciation de myloides (stade promyélocyte).
-Acide rétinoique va favoriser le recrutement de co-activateurs

42
Q

Quels sont les avantages du caryotype?

A

-Analyse pangénomique qui révèle toutes les anomalies de grandes tailles (5Mb et +)
-pas besoin de savoir ce que l’on cherche avec un caryotype
-analyse qui montre tout
-Montre l’évolution clonale et le mosaïcisme jusqu’à 2%,
- résolution à la cellule près « single-cell »

43
Q

Quels sont les désavantages du caryotype?

A

-Les anomalies de plus petites tailles ne sont pas visualisées (5Mb et -), surtout si la résolution est faible
-les anomalies subtélomériques requièrent une haute résolution ce qui est très difficile en cancer
-requiert un personnel spécialisé pour analyser les chromosomes
-TAT le plus rapide : environ 5-7 jours. En routine, 21 jours.

44
Q

Quel est le seuil de détection du FISH?

A

seuil de détection 200kb à 1mb

45
Q

Dans quelle situation utiliser le FISH?

A

-Beaucoup utilisé en cancer hématologique surtout pour LPA puisque très rapide pour diagnostiquer/donner un traitement/faire le suivi.
-Permet de confirmer/infirmer un syndrome précis.

46
Q

Quelle est la technique du FISH?

A

-Co-dénaturation de l’ADN patient et de l’ADN d’une sonde FISH
– hybridation complémentaire de l’ADN de la sonde avec l’ADN cible du patient
– lavage post-hybridation dans le SSC/NP40, coloration DAPI-analyse fluorescence (prend 2 hr à 24 hrs)

47
Q

Qu’est-ce que sonde CEP? Avantages et désavantages

A

-Cibles séquences alphoides
Avantages :
-excellente force d’hybridation
-excellent pour énumérer chromosome

désavantages
-pas de sonde contrôle double couleur
-chromosomes 13 et 21; 14et 22 se ressemblent beaucoup du point de vue des séquences)

48
Q

Qu’est-ce que sonde LSI? Avantages et désavantages

A

Sonde spécifique d’un locus donné.

Avantages :
-Permet de détecter délétion
-duplication
-gène de fusion
-amplification
-Permet le couplage des couleurs, avec un locus d’hybridation contrôle
-Plusieurs sous-types disponibles.

Désavantages :
-spécifique à un locus,
-très petites anomalies pas bien détectées

49
Q

Qu’est-ce que sonde BAC? Avantages et désavantages

A

Sondes avec séquences uniques.

Avantages :
-permet de valider des remaniements personnalisés,
-très précis.

Désavantages :
-petite taille de la sonde
-hybridation croisée possible
-hybridation et visualisation plus difficile
-peut exiger une amplification des signaux si petite taille.

50
Q

Exemple du FISH avec PML-RARA

A

-gène RARA est vert
-gène PML est rouge
-si PML-RARA, cela va être jaune (vu fusion des deux)

51
Q

Quelle est la particularité du KMT2A? Comment savoir s’il y a a un problème avec ce gène?

A

-gène dans la LMA qui peut se lier à plus de 100 partenaires.
-Utilisation d’une sonde breakapart pour détecter un réarangement, et ensuite on caryotype.

52
Q

Avantages du FISH?

A

-Cible des régions particulières à l’aide d’une ou plusieurs sondes
-Résolution de +/- 200 kb (taille de la sonde)
-Pas besoin de culture pour la technique de FISH interphasique (analyse sur noyaux)
-Permet d’obtenir des réponses rapides et ciblées
-Technique également « single-cell » permettant de voir chaque cellule indépendamment

53
Q

Désavantages du FISH?

A

-Besoin d’une culture cellulaire pour la technique de FISH métaphasique (analyse sur chromosomes)
-Besoin de savoir ce que l’on cherche
-Hybridation non spécifique possible
-Délétion de petite taille pouvant être manquée.

54
Q

Quelles est le seuil de détection du CGH?

A

seuil de détection 5kb

55
Q

Qu’est-ce que permet et ne permet par le CGH sur microplaques?

A

permet : Haute résolution et analyse pangénomique des variations du nombre de copies (CNV) (gain/perte)
Ne permet pas :
-de détecter les réarrangements chromosomiques (inversion, délétion, translocation)
- de détecter les altérations équilibrées en mosaique faible.

56
Q

Comment faire du CGH?

A

-Patient + ADN control marqué par fluorescence et mis en microarray
– ADN patient + control compétition pour s’attacher ou hybrider le microarray
– scanner mesure les fluorescences – analyse par logiciel

57
Q

Que détecte le CGH?

A

Détecte les CVN qui peuvent avoir un impact neutre, être pathologique ou être de signification clinique incertaine (VUS)

58
Q

Est-ce préférable ou pas d’avoir des VUS?

A

-Préférable de pas avoir de VUS

59
Q

Qu’est-ce que des CVN VUS?

A

-cible gène connu mais n’ont pas des les mécanismes classiques
-cible gène non répertorié dont les fonctions corrèlent avec phénotypes rapportés
-pas de gène fonctionnel important, etc…
-De ce fait, CGH peut permettre des trouvailles fortuites.

60
Q

Dans qu’elle situation utiliser le CGH?

A

Utilisé pour le volet pédiatrique seulement et non hématologique.
-Pour tumeurs pédiatriques avec débalancement génique connu et pronostiques
-Fortement recommandé pour la prise en charge d’un retard mental, d’un trouble de spectre de l’autisme et retard dans le développement.

61
Q

Que cause la délétion du 22q? Quel test sera demandé?

A

CGH sera demandé comme premier test.

-Maladies très variables et cause majoritairement des malformations cardiaques
-absence de thymus
-hypoparathyroidisme
-malformation cardiaque congénitale
-fente palatine
-hypotonie fréquente
-anomalies de reins
-déficit intellectuel)

62
Q

Avantages du CGH?

A

Analyse pangénomique de haute résolution (qq kb à centaines de kb, selon la disposition des oligonucléotides)
-Indépendant de la culture des chromosomes (analyse de l’ADN directement)
-Petite quantité d’ADN nécessaire
-Impact clinique puissant de la CGH en constitutionnelle.

63
Q

Inconvénients du CGH

A

-Peu d’impact clinique en cancers hématologiques.
-Ne surpasse pas encore le bon vieux caryotype et le FISH
-Ne détecte pas les remaniements équilibrés (translocation, inversions: fréquents dans les hémopathies)
-Doit être combiné aux analyses traditionnelles
-Ne détecte pas la triploïdie ou tétraploïdie
-Ne montre pas les séquences répétées (centromère et hétérochromatine)
-Pas de visualisation directe
-détermine seulement si les régions sont en duplication ou délétion (positionnement dans le génome inconnu)
-Ne montre pas l’évolution clonale, ni le mosaïcisme faible (pool d’ADN)

Cours BCM6171 (10 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2024 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions