Microbio 1 + 2 (examen)

Question 1

Qu’est ce que c’est la coloration gram?

Answer 1

-Coloration la plus utilisée en microbio
-Composition de la paroi cellulaire permet de séparer bactéries gram+ (bcp de peptidoglycans, mauve) de gram– (peu de peptidoglycans, rose)
-Permet de visualiser la morphologie de la bactérie (cocci vs bâtonnets)

Question 2

Quels sont les avantages de la coloration de gram?

Answer 2

Possible de faire coloration sur échantillon et colonie

Sur échantillon :
-permet d’évaluer qualité de l’échantillon (critères de rejet des expectorations et sécrétions vaginales)
-permet d’avoir une idée de la présence ou non de bactéries dasn certains liquides (surtout utile pour les liquides biologiques normalement stériles, valeur critique)

Sur la colonie :
-étape initiale de l’identification bactérienne

Question 3

Quels sont les désavantages de la coloration gram?

Answer 3

-échantillons hétérogènes (erreur d’échantillonnage, ex: on fait 3 frottis et on voit aucune bactérie sur 2 mais bcp sur le dernier)
(ex : contamination)
-échantillon vivant (problème de reproductibilité, enjeu du BNQ)
-lecture est dépendante de l’humain (surtout problèmes lorsqu’identification ou résultats basés seulement sur la coloration)
-note pour interprétation : ce n’est pas pcq on ne voit pas les bactéries qu’il n’y en a pas

Question 4

Pourquoi prélever des bouteilles anaérobies et aérobies pour l’hémostase? Quel est le volume idéal?

Answer 4

-Objectif: rechercher la présence de bactéries (parfois de levures) dans la circulation sanguine
-Volume de sang idéal = 20mL (10mL aé et 10mL ana (rare et retrouvé des fois chez patients avec chirurgie bariatrique)
note: ana car certaines bactéries aé croient mieux dans les bouteilles ana

Question 5

Qu’est-ce que les médecins prescrivent habituellement pour l’hémoculture?

Answer 5

2x hémocultures et donc prélève 4 bouteilles (2 aérobies et 2 anaérobies pour 40mL total)

Question 6

Que prendre en considération pré-clinique lors d’hémoculture (comment faire le prélèvement)?

Answer 6

-Lavage des mains
-Avant prélèvement et après, importance de bien aseptiser avec lingettes le lieu de la ponction et les bouchons des tubes d’hémocultures
-On récolte 10 mL de sang par bouteille (aé- en premier et ana- en 2e)
-On fait 2 prélèvement avec 15-20 minutes de différences

Question 7

Pourquoi prélever 2 hémocultures, soit 40 mL de sang?

Answer 7

-probabilité de trouver bactérie dans le sang dépend du volume de sang cultivé
-Plus le volume est grand, plus la probabilité de trouver les bactéries est grande
-Risque « coût-bénéfice » devient moins intéressant après 40 mL

Question 8

Pourquoi prélever les hémocultures en 2 temps?

Answer 8

-Évaluer la contamination cutanée (contamination 2x pareille = peu probable)
-Évaluer le caractère continu de la bactériémie (système vasculaire infecté, patient envoi bactérie dans le sang de temps en temps)

Question 9

Quels sont les avantages du Maldi-TOF (techniques d’identification)?

Answer 9

-résultats supérieurs aux méthodes conventionnels

-temps de réponse bcp plus rapide pour moindre coût

-étape de dépôt de l’échantillon critique (courbe d’apprentissage rapide et utilisation des outils de la compagnie)

-Technique simple et préparation des échantillons sur cellules complètes

-microscopie sur thalles filamenteux (pour identification en mycologie)

Question 10

Quels sont les limitations du Maldi-TOF (techniques d’identification)?

Answer 10

Problème de l’identification de Shigella spp vs E.coli :
-génétiquement pareil donc pas de différence par séquençage et par Maldi-TOF
-autres limites = pas d’impact clinique

-long et certaines souches ne sporules pas (stérile) donc nécessite biologie moléculaire pour identifier. NO: JE NE SAIS PAS SI CA FAISAIT SUITE AU MALDI, je pense que c’était juste pour suite de identification

Question 11

Est-ce que la standardisation de l’antibiogramme est important?

Answer 11

Oui car importance de la reproductibilité inter et intra laboratoire, puisqu’impact réel d’un mauvais résultat sur patient.

Question 12

Comment faire pour avoir une standardisation de l’antibiogramme?

Answer 12

-Inoculum standard basé sur la turbidité de la suspension bactérienne (McFarland)
-gélose à composition standardisé ou semi-standardisé
-quantité d’antibiotique standardisé
-incubation dans atmosphères
-températures contrôlées pour des durées précises
-lecture standardisée.

Question 13

Est-ce que les critères d’interprétation des antibiogrammes sont souvent changés?

Answer 13

Nécessite de souvent être changé et refaire vérif en fonction du CLSI (feuille avec infos sur bactérie, contrôles à tester et instructions précises)

Question 14

Comment faire le contrôle qualité des antibiogrammes?

Answer 14

Obtenir souches contrôles standardisées de manufacturiers autorisés (ATCC) ensuite maintien/conservation des souches par protocoles standardisées
-Contrôle journalier avec tableaux de références des valeurs attendues pour chaque combinaison souche/ATB (tjrs tester nouveaux lots de géloses et antibiotiques)

Question 15

Quels sont les types d’erreurs des antibiogrammes?

Answer 15

-aléatoires (valeurs de référence = 95% du temps)
-identifiables (majorité, ex: oublie disque/mauvaise gélose/mauvaise souche)
-systémiques (doit être investigué puisque pas corrigé par reprise, ex: lot défectueux)

Question 16

Qu’est-ce qui est fait avec des résultats avec des erreurs dans l’antibiogramme?

Answer 16

Action dépend :
-de l’écart du contrôle
-du reste de l’antibiogramme
-de l’urgence de la situation
-du type d’erreur (identifiable ou non)

Question 17

Y a-t-il une vérification/assurance qualité pour l’antibiogramme?

Answer 17

-pour diffusion disque: pas de vraie vérification car méthode de référence qui ne peut être facilement comparée (CQI rigide et normée)
-on en retrouve pour systèmes commerciaux comme M52

Question 18

Qu’est-ce que le M52? Comment cela fonctionne?

Answer 18

-Verification of commercial microbial susceptibility testing systems

-deux paramétriques à vérifier = fidélité et précision
-pour systèmes d’identification par groupes de microorganismes (pas de différence entre vérif d’un MALDI-TOF et d’un système biochimique)

Question 19

Qu’est-ce que des panels syndromiques? Qu’est-ce que cela permet?

Answer 19

-analyses de biologie moléculaires (certains = POC)
-permet détecter rapidement présence des principaux agents de maladies spécifiques directement sur échantillons cliniques (Sang, LCR et selles)

Question 20

Quels sont les avantages du panel syndromique?

Answer 20

-+ rapides
-permet d’éliminer certains diagnostiques avec grande fiabilité (diminution de la mauvaise utilisation des ATB)

Question 21

Quels sont les limites du panel syndromique?

Answer 21

-+ coûteux
-on ne sait pas quoi faire avec certains résultats
-pas d’antibiogrammes pour l’instant (juste trouver X, pas savoir quel antibio est mieux)
-certains = POC (EBMD)

Question 22

Quels sont les avantages de l’automatisation?

Answer 22

-Meilleure organisation du travail (dashboard)
-Coût-efficace
-Plus grande reproductibilité
-Meilleur délai d’analyse
-Moins d’erreurs
-Moins d’accidents

Question 23

Quels sont les désavantages de l’automatisation?

Answer 23

-Peu de redondance
-Implémentation peut être difficile (gestion du changement)
-Perte de certains sens (odeur et texture)
-Contamination des appareils
-Perte d’expertise (on ne trouve que ce que l’on cherche, devient habitué à l’automation)

Question 24

Qu’est-ce qu’un antibiogramme cumulatif?

Answer 24

% de probabilité qu’une bactéries soit résistante envers les antibiotiques

Développé puisque les médecins hésitent à prescrire empiriquement des antibiotiques à spectre plus étroit par crainte de résistance

Question 25

Quelles sont les règles de l’antibiogramme cumulatif?

Answer 25

-Utiliser uniquement les échantillons cliniques (pas le dépistage)
-Utiliser uniquement les antibiotiques testés de routine (rapportés ou non)
-Définir la période d’étude (généralement 1 an)
-Utiliser la première souche par patient par année
-Rapporter uniquement les % de sensibilité (et non la résistance)
-Obtenir au moins 30 résultats par couple microorganisme/antibiotique
-Stratification selon les besoins cliniques

Question 26

Quel serait une autre stratégie dans l’utilisation des antibiogrammes au labo?

Answer 26

-rapporter sélectivement les antibiogrammes testés en fonction du reste de l’antibiogramme ou du type d’échantillon

-Fait puisque les médecins hésitent à réduire le spectre après un traitement empirique à large spectre qui fonctionné et puisqu’ils oublient que certains antibiotiques ne fonctionnent à certains sites (ex: urine et LCR)

Question 27

Qu’est-ce que le SARM?

Answer 27

Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline

-associés à des infections potentiellement mortelles (endocardites/bactériémies, infections de corps étrangers, pneumonies nécrosantes)
-avait peu d’options thérapeutiques avant années 1990
-transmission et éclosions très bien décrites dans les milieux de soins
-l’isolement de contact et l’hygiène des mains préviennent la transmission

Question 28

Quel est le principe du TIC (technique d’inhibition des carbapénèmes)?

Answer 28

1.mettre suspension de bactéries dans eppendorf
2.ajouter disque de meropenem
3.incuber
4.mettre disque sur gélose avec bactéries (E coli le plus sensible au monde)
5.incuber
6.lire
-si zone sans bactérie autour du disque: pas d’activité carbapenemase provenant de la suspension
-si bactérie autour de disque: + activité carbapenemase provenant de la suspension
NICK: dit moi si les 2 derniers points sont ok?
Nick : OK pour moi!

Question 29

Quels sont les avantages de faire un TIC (technique d’inhibition des carbapénèmes) pour dépister le BGNPC?

Answer 29

-Facile, Sensible et spécifique
-Permet d’isoler rapidement les patients en attendant les résultats du CHUM

Question 30

Quels sont les inconvénients du dépistage de BGNPC?

Answer 30

-Long (plusieurs isolements, plusieurs antibiogrammes et plusieurs TICs)

-Couteux (géloses et ID + antibiogramme = 10$ par souche + temps technique)

-PCR (nécessite de cibler plusieurs gènes. Trousses commerciales dispendieuses, pas tellement plus sensibles et difficilement utilisable en gros volume)

Question 31

Qu’elles sont les maladies à surveillance extrême?

Answer 31

-Botulisme
-Choléra
-Fièvre jaune
-Fièvres hémorragiques virales (ex: Ébola)
-Maladie du charbon (anthrax)
-Peste
-Variole

MADO:
-à déclarer dans les 48h
-envoyer une copie du rapport (SANS RÉSULTAT DE VIH)

Question 32

Nommez moi 3 rôles d’un laboratoire en santé publique.

Answer 32

1. Surveillance, prévention et contrôle des maladies transmissibles
2. Gestion intégrée des données sur les maladies transmissibles
3. Épreuves diagnostiques, dépistages spécialisés et tests de référence
4. Santé environnementale
5. Salubrité des aliments
6. Amélioration et règlementation des laboratoires (assurance de la qualité)
7. Conception et évaluation des politiques de santé publique
8. Préparation et réponse
   —A. Intervention d’urgence en cas d’apparition et de propagation de maladies transmissibles
   —B. Programmes d’intervention en biosécurité, en confinement et lors du déversement de matériel biologique dangereux
9. Recherche et développement en santé publique
10. Formation et éducation des travailleurs en soins de santé et en santé publique
11. Partenariat et communications

Question 33

Décrire 3 rôles d’un laboratoire en santé publique.

Answer 33

Salubrité des aliments :
-Analyser des spécimens pour cerner et surveiller les éventuelles menaces microbiologiques pour la santé humaine,
-Analyser des spécimens associés à des maladies d’origine alimentaire afin de déterminer les causes et les sources de ces maladies, et de détecter des organismes, tels que la E. coli O157 et Salmonelle
-Analyser avec des outils d’épidémiologie moléculaire
-Participer à des réseaux de surveillance (ex PulseNet)

Amélioration et règlementation des laboratoires :
-Appuyer l’élaboration de programmes d’assurance de la qualité des laboratoires cliniques et environnementaux en proposant une
formation, des services de consultation et des tests de compétences,
-Concevoir et superviser la prestation de programmes destinés à assurer la fiabilité des données de laboratoire utilisées pour la surveillance environnementale et des maladies transmissibles
-Effectuer des tests à l’appui de la règlementation environnementale fédérale et provinciale/territoriale.

Conception et évaluation des politiques de santé publique
-Jouer un rôle médical et scientifique déterminant dans l’élaboration de politiques en santé publique et l’intégration des connaissances scientifiques à la pratique,
-Participer à l’instauration de normes (alimentaires, environnementales, cliniques, en recherche, etc.) pour les laboratoires dont les activités sont liées à la santé.

Santé environnementale:
-Analyser des spécimens environnementaux pour cerner et surveiller les éventuelles menaces microbiologiques pour la santé humaine,
-Analyser des spécimens environnementaux pour vérifier le respect des règlements environnementaux,
-Fournir des services pour renforcer divers aspects d’assurance de la qualité pour les analyses microbiologiques de l’eau,
-Jouer un rôle de premier plan dans l’agrément des laboratoires qui effectuent des tests de qualité́ d’eau potable pour les besoins de la santé publique,
-Réaliser des études scientifiques ou des analyses de spécimens environnementaux (ex. : aliments, eau) pour clarifier les liens entre les dangers environnementaux et la santé humaine,