Microbiologie 1 Flashcards
Différence entre microbiologiste et infectiologue?
-Microbiologiste (spécaliste labo micro)
-infectiologue (spécaliste en diagnostique et traitement des maladies infectieuses)
Études du microbiologiste et infectiologue?
-Microbio : 2 ans tronc commun + 2 ans lab + 1 an maladies infectieuses
-Infectiologie : 3 ans tronc commun + 2 ans maladies infectieuses
-Maintenant : plutôt fusionné, 3 ans tronc commun + 3 ans lab/maladies infectieuses
Conséquences de voir une coloration gram +?
Arrêt probable de deux antimicrobiens
Qu’est-ce que la coloration Gram?
-Coloration la plus utilisée en microbio.
-Composition de la paroi cellulaire, permet séparer bactéries gram + (bcp de peptidoglycans) de gram – (quasiment pas de peptidoglycans).
-Permet aussi de visualiser la morphologie de la bactérie (cocci vs bâtonnets)
Sur l’échantillon, que permet la coloration gram?
-permet d’évaluer la qualité de l’échantillon (critères de rejet des expectorations et sécrétions vaginales)
-Permet aussi d’avoir une idée de la présence ou non de bactéries (surtout utile pour les liquides biologiques normalement stériles (valeur critique)
Sur la colonie, que permet la coloration gram?
étape initiale de l’identification bactérienne
Objectif de l’hémoculture?
objectif est de rechercher la présence de bactéries (ou p-t levures) dans la circulation sanguine
Quels sont les indications pour faire l’hémoculture?
-patients avec fièvre et signes cliniques d’atteintes systémiques sévères.
-Lorsque certains diagnostiques sont évoqués (méningite, endocardite, PNA(pneumonie bactérienne), pneumonie sévère).
-Tableau fièvre chez femme enceinte.
-Tableau de fièvre chez hôte immunodéprimé.
-Tableau de fièvre ou hypothermie chez la personne âgée.
QU’est-ce que les médecins prescrivent habituellement pour l’hémoculture?
2 hémocultures et donc prélève 4 bouteilles (2 aérobies et 2 anaérobies).
Que prendre en considération pré-clinique lors d’hémoculture?
-Avant prélèvement et après, importance de bien aseptiser avec lingettes le lieu de la ponction et les bouchons des tubes d’hémocultures.
-On récolte 10 mL de sang par bouteille
-on fait 2 prélèvement avec 15-20 minutes de différences !
Qu’est-ce qui augmente le % de trouver la bactérie dans le sang? Jusqu’à qu’elle point?
dépend du volume de sang cultivé. + élevé et + on a de chance. Risque coût bénéfique est moins intéressant après 40mL
Pourquoi on prélève à 2 temps l’hémoculture?
-pour évaluer la contamination cutanée (diminue chance avec 2 de faire 2 contaminations)
- évaluer le caractère continue de la bactérie (peu importe le temps, la bactérie devrait être présente lorsqu’elle se retrouve dans le réseau sanguin)
Qu’est-ce qui cause de la contamination pour hémoculture?
Mauvaise technique augmente chance de faire contamination, de ce fait, l’isolement d’une bactérie peu pathogène et reconnue comme colonisant la peau dans une seule hémoculture sera interprété par le MD comme contaminant.
Qu’est-ce qui augmente la bactériémie continue?
-Si S.Aureus dans une seule hémoculture à bactériémie peu probable
-si S.Aureus dans 2 hémocultures = bactériémie plus probables potentiellement indiquant la présence d’une endovasculite comme l’endocardite ( plus temps en prélèvement élevé et plus la probabilité est grande)
Pourquoi prélever des bouteilles anaérobies et aérobies? Quel est le volume idéal?
-volume de sang idéal = 20mL (10mL aé et 10mL anaé(rare et retrouvé des fois chez patients avec chrirugie bariatrique) puisque certaines bactéries aérobies croient mieux dans les bouteilles anaérobies
Comment traiter les échantillons en hémoculture?
Bouteilles incubées dans appareil dédié qui détecte automatiquement la croissance bactérienne (grâce à une pastille – alarme sonore)
Pour l’hémoculture, après détection de bactéries, qu’est-ce qu’on fait?
-Ensuite, on fait coloration Gram sur bouteille d’hémoculture positive et ensemence dans des milieux de culture (gélose) permettant d’identifier la bactérie impliquée et faire un antibiogramme.
Que permet les valeurs critiques obtenus grâce à la coloration gram en hémoculture? Est-ce quelque chose de rapide?
Reconnaître le microorganisme permet d’initier un traitement d’antibio
-ajouter ou modifier un traitement en cours
-restreindre le spectre antibiotique
-habituellement tous plusieurs heures après le début des traitements.
Quel est le taux de contamination, de positivité chez l’adulte et le TAT entre hémoculture positive et appel du clinicien?
Taux de contamination = 3% par année chez adulte
-taux de positivité = 6-12% chez l’adulte
-délai d’analyse (TAT) entre hémoculture positive et appel du clinicien = 1heure
Exemple de colorations spécifiques?
-Tuberculose (auramine)
-Pneumonies à Pneumocystis jirovecci ( immunoflurescence directe)
-Mycologie (blanc de calcofluor)
-parasitologie ( Giemsa)
Quels sont les problèmes lors des colorations?
Échantillons hétérogènes (ex : contamination)
-échantillon vivant (problème de reproductibilité, enjeu du BNQ)
-lecture est dépendante de l’humain (surtout problèmes lorsqu’identification ou résultats basés seulement sur la coloration).
Impact de la coloration sur la vérif et l’assurance qualité? Quelles est la solution pour pouvoir tester l’exactitude?
Pour exactitude, il n’y pas de coloration qui regardent la même chose et utiliser la culture comme comparateur est problématique ( puisque certaines bactéries ne poussent pas pendant que d’autres cultres la sensibilité est bien meilleure)
-Solution :
-procédure de vérification des procédures dites descriptives et complexe
-procédure à jour et basée sur la littérature
-contrôles de qualité interne
-formation des technologistes
-programme d’évaluation des compétences
-programme d’évaluation externe de la qualité
Quels sont les deux types de culture en microbio?
-Liquide : hémoculture, LBNS et mycobactéries
-Solide (gélose): plupart des échantillons mise en culture pour la bactériologie et la mycologie
Comment choisir le bon milieu de culture? Exemples de milieu de culture basique beaucoup utilisé.
-Dépend de la nature de l’échantillon et des bactéries recherchées.
-Milieux de base :
-gélose sang de mouton
-gélose chocolat
-gélose brucella
-bouillon (ex :viande).
