Cours 1 (Description et historique de microorg) Flashcards
Définition de la microbiologie ?
Science qui étudie organismes microscopiques
Sens large : science qui se définit par les techniques qu’elle emploie
Domaine d’étude de la microbiologie?
Bactériologie, myco,phyco,protozoo,viro (logie)
Impact des microorgansime sur activités humaines?
- Agriculture (nitrification)
- Énergie/environnement (biocarburants)
- Aliments (fermentation)
- Maladies (traitement et maladie)
- Biotechnologie (OGM)
Impact positifs des microorgs chez l’homme?
- microbiote
- Source de nourriture
- Antibiotiques et autres molécules
- Biotechnologie
Impact positifs des microorgs dans la nature
- décomposition
- Balance écologique
- Biodégradation
- bioremédiation
Impacts négatifs chez l’homme et dans la nature?
?
- infection
- détérioration des aliments
- corrosion
- mauvaise odeur
Types des microorg (6)
- algues
- protozoaires
- mycètes
- bactéries
- virus
- prions
Propriété de la cellule (6)
- Métabolisme: Les nutriments prélevés dans l’environnement sont transformés dans la cellule et les déchets sont éliminés dans l’environnement. La cellule est un système ouvert.
- Reproduction: Les éléments chimiques de l’environnement se transforment en
de nouvelles cellules sous la conduite de cellules préexistantes. - Différentiation: La formation d’une nouvelle structure cellulaire.
- Communication: Les cellules communiquent ou interagissent par des échanges de molécules chimiques.
- Mouvement: Les cellules possèdent diverses formes de motilité (déplacement de cellules et/ou mouvements internes).
- Évolution: Les cellules contiennent des gènes et évoluent, présentant de nouvelles propriétés biologiques.
Comparaison cellule eucaryote et procaryotes ?
Eucaryote
- mitochondrie, RER, REL, Pores nucléaires, MP, Chromatine, Ribosomes, Cillia, Golgie, MT, Centrioles, Peroxisome, Lysosome, NOYAU
Procaryote :
-flagelles, nucleoide, cytoplasme. capsule, paroi, ribosomes, pilus
Première classifications ?
Carl von Linné = 2 règnes
1) plantes (immobiles et photosynthétique)
2) Animaux (mobiles et non photosynthétiques
Difficulté : algues et champignon sont parmi les plaintes car les 2 sont immobiles. Euglène est animale pour zoologiste et plante pour botaniste
Deuxième classification ?
Haeckel = 3 règnes
1) plantes
2) animaux
3) Protiste (algues, champignons, bactéries)
foncdé sur organisation biologique : unicellulaire, pluricellulaire..
Vue moderne de classification des organismede Whittaker? (5)
Whittaker = 5 règnes
1) monères (bactérie) - unicell
2) protistes (algues, protozoaires) - unicell
3) mycètes (champignon)
4) plantes
5) animaux
Se base sur le type de cellule : pro/eucaryote, organisation biologique (uni/pluricell) et le type de nutrition (autotrophe)
Où classer les virus dans la classifications des org de Wittaker?
Ils sont non vivants, mais microorg.
- ADN ou ARn entouré d’une capside
- parasite intracellulaire obligatoire
Type de nutrition autotrophe ?
Source de carbone (CO2)
Type de nutrition hétérotrophe?
Molécules organiques réduites
Type cellulaire, niveau d’organisation et nutrition des Monères (bactéries)
Procaryote, Unicellulaire, Autotrophe ou hétéro
Type cellulaire, niveau d’organisation et nutrition des Protistes
Eucaryote, Unicellulaire ( un peu pluri), Autotrophe ou hétéro
Type cellulaire, niveau d’organisation et nutrition des Mycètes
Eucaryote, Pluricellulaires, Hétérotrophe
Type cellulaire, niveau d’organisation et nutrition des plantes
Eucaryote, Pluricellulaire, Autotrophe
Type cellulaire, niveau d’organisation et nutrition des animaux
Eucaryotes, Pluricellulaires, Hétérotrophes
Vue moderne classification de Woese ? (3)
- Suggère de nouvelles relations phylogénétiques -> ancêtre commun = Progénote
- Classé en trois grands règnes : Eubactérie, Archéobactéries et Eucaryotes
Les Archées seraient plus proche de quelle autre grand règne selon Woese?
Des eucaryotes
D’où proviennent les mitos et chloros selon Woese?
De bactéries aérobies et photosynthétiques par endosymbiose
Où sont retrouvés les archés
Dans des endroits plus extrêmes, condition environnementales plus extrêmes
Qu’est-ce que la classification au niveau moléculaire ARN 16S
Arbre phylogénétique universel du vivant à partir des comparaisons de squences du gène d’ARNr. (3 règnes)
Description comparative des 3 domaines primaire : Bactérie
Longueur : 1 à 10 um
paroi cellulaire = Peptidoglycane
Organelles = ** Pas de noyau **peu d’organelles, pas de noyau, inclusions, ribosomes, flagelles, pili
ADN = Bicaténaire, Circulaire et dans le nucléoïde. généralement 1 seul chromosome. Plasmides, Génome petit
Pas d’introns
Description comparative des 3 domaines primaire : Archées
Longueur : 1 à 10 um
Organelles = peu d’organelles, pas de noyau, inclusions, ribosomes, flagelles
Paroi cellulaire : peptidoglycane modifiée
ADN = Pas de noyau Circulaire et dans le nucléoïde. Plasmide, génome petit, peu d’introns
Membrane cellulaire = acides gras liés au glycérol par liaisons éther
Description comparative des 3 domaines primaire : Eucaryote
Longueur : 10 à 100 um
paroi cellulaire = cellulose (plante) chitine (mycètes)
Organelles = ** Noyau**, mitochomdires, chloroplastes, RE, Golgi, lysosomes, peroxysomes
ADN = Très long, linéaire avec bcp introns. Limité par enveloppe nucléaire. Organisé en chromosomes. Génome important
Comment hiérarchiriser en taxonomie?
Domaine-phylum-classe-ordre-famille-genre-espèce
Étude des histoires de microorg.
Quelle était la première hypothèse sur la cause des maladies de Fracastoro?
Elles sont provoquées par des être vivants invisibles
Que découvre Robert Hooke ?
Découvrent les «cellules» d’une plante, décrit moisissure
Que fait Van Leuwenhoek?
Premier à décrire des bactéries qu’il appelle animalcules
Qu’est-ce que la génération spontanée? Et qu’a fait Lazzaro Spallanzani à cette théorie?
Certaine disait qu’après chauffer un liquide, celui peut changer de couleur et puer, mais ce n’est pas la propriété du liquide mentionne Spallanzani, c’est les bactéries. Bouillon change seulement quand contact avec l’air…
Comment Pasteur continue les recherches de Spallanzani?
Il réfute la théorie de la générations spontanée en ce qui concerne les microorgansimes.
L’expérience utilisent les flacons à col de cygne (air stérile)
Que découvrent t’ont dans l’âge d’or de la microbiologie?
- découvre +sieurs microorg
- fermentation/pasteurisation
- métabolisme microbien
- importance immunité
- vaccin
- préventions des infections
Qui développe la théorie des germes ?
Koch
Que fait Robert Koch?
- Méthodes du culture pure
- Démontre microorg peuvent causer maladies
Que fait Hans Christian Gram?
Coloration de Gram
Que fait Joseph Lister?
- Méthode antiseptiques
- se laver les mains
- stériliser outils avant opérations
Que fait A. Fleming?
Découvre pénicilline
Postulat de Koch
1- Organsime suspecté pathogène présent chez animaux malades, absents chez animaux sains
2- Organsime suspecté pathogènes doit être cultivés en culture pure
3- Cellules issus d’une culture pure d’un organsime suspect doivent provoquer maladie chez animal sain
4- Org doit pouvoir être isolé à nouveau et s’avérer identique à l’original.
Quels sont trois personnages ayant aidé la vaccination?
Edward Jenner
- vaccin contre variole
- immunisation
Pasteur
- explique principe de la vaccination
- Controle
- 1er vaccin humain : la rage
Von Behring
- fabrique sérum antitoxine (diphtérie)
Qui est Thomas Roddick?
Chirugien hopital de montreal
Étudié l’antisepsie sous Lister
Qu’a t-il été découvert de nos jours
- antibiotique
- biotechnologie
- microbiome humain
- séquencer ADN
Caractéristique des batéries
- règnes des monères
- petites cellules (1-10um)
- s’adaptent facilement
- paroi cellulaire
- peu d’orgnaelles
- petit génome
- partout dans le monde
- certains sont pathogènes
- Decomposition et recyclage
- eucaryote ont besoin des procaryotes pour vivre, mais pas l’inverse
Forme de la bactérie
Sphérique ou ovale (coque)
Allongée (batonnet) (bacille)
Arrangements de la bactérie
- isolé
- en amas
- paire
- chaîne
- grappe
- tétrade
Quelles formes ont les coques?
Sphérique ou ovoïdes :
- diplocoques
- longue chaines (streptococcus)
- Grappes de raisin (staphylococcus)
- Tétrades de 4 cellules (Micrococcus)
Quelle forme ont les bacilles?
Batonnet :
- certains courts et larges (coccobaciles
- solitaire ou attachés ensemble après cdc
- incurvés comme une parenthèse (
Quelles sont les morphologie bactériennes? (5)
- Sphérique (coques)
- Batonnets (bacilles)
- Hélices ou spirale (spirilles = rigide et spirochètes = flexible)
- Bactéries bourgeonnantes et appendiculées
- bactéries filamenteuse (actinomycètes) = + longque
Qu’est-ce que la différenciation ?
Sous certaine condition, permet de fixer à une surface si forme de pédoncule. Cellule passe de forme nageuse à cellule fixe
Formation d’une colonie
Bactérie se multiplie si conditions favorables, et forme des colonies. Une colonie = millions de cellules du même type.
Qu’est-ce l’Agar, boite de pétri? remplace la gélatine
- Agen solidifiant (polymère de D-galactose)
- Poudre ajoutée à un milieu liquide
- solubilise à éblitions : solidifie à 42 c
- Non toxique, non métabolisable
- découvert par Koch, par une queen
- reste solide à haute température après sa formation
Peut on utiliser un pétri comme une base d’indentification de caractère métabolique?
Oui, permet de distinguer des bactéries = Hémolyse sur gélose-sang.
Couleur change selon l’utilisation de l’hémoglobine. Utilisation totale = rouge -> jaune. Incomplète = rouge -> verdâtre.
Aspect macroscopique des colonies (3)
- forme
- relief
- contour bordure
N’est pas précis
Qu’est-ce qu’une culture pure ?
Culture composée d’une seule espèce de micro-organisme
Comment faire une culture pure?
Isolement pas striation :
À l’aide d’un manche de Koch stérile. Étalement de l’inoculum (bouillon de bactérie)
Pertmet de prendre une petite quantité de bactérie et de dilué avec une série de strie (zigzag)
Le but est d’obtenir des colonies isolées
Qu’est-ce que l’isolement par dilutation en milieu liquide?
Dilution successives en milieu liquide afin d’obtenir un dilutation de l’inoculum permettant la croissance de colonie isolées sur une gélose.
Dilution en série -> mettre sur gélose pour croitre et voir la diffréence de concentration.
