proyecto encode

Question 1

año en que inició el proyecto ENCODE

Answer 1

2003

Question 2

Propósitos del proyecto ENCODE

Answer 2

catalogar elementos funcionales del genoma humano
investigar la regulación de la expresión genica y la salud

Question 3

Que regiones pretendía identificar el proyecto ENCODE

Answer 3

genes codificantes para proteínas
genes que no codifican para proteínas
elementos reguladores de la transcripción
secuencias que median la estructura y dinámica cromosómica

Question 4

Propósito de la fase piloto (etapa 1) del proyecto ENCODE

Answer 4

Evaluación de las estrategias para la identificación de regiones del genoma
Fue la fase de desarrollo tecnológico
Se descubrieron 44 regiones para estudiar
Identificacion de regiones de DNA que transcriban a RNA

Question 5

Que líneas celulares se utilizaron en la fase piloto

Answer 5

HeLA S3 (cancer de cuello uterino a cervical, adenocarcinoma)
GM06990 (virus epstein-barr

Question 6

Que anticuerpos se utilizaron para fase piloto

Answer 6

TF: TAFII250, STAT-1

Question 7

Histonas acetiladas…

Answer 7

inhibe

Question 8

Histona desacetilada

Answer 8

activa

Question 9

Metodologías utilizadas en el proyecto ENCODE

Answer 9

Hibridacion chip-chip
Inmuprecipitacion de cromatina

Question 10

Secuencias ortólogas

Answer 10

Secuencias de seres del mismo ancestro

Question 11

Volumen 489 Issue 7414, publicado el 6 de septiembre del 2012, de cuantos artículos consta?

Answer 11

13

Question 12

Cantidad de regiones se marearon con union de proteínas de DNA

Answer 12

119

Question 13

Mediante que estrategia s identificaron las RNA polimerasa de los 72 tipos de celulas

Answer 13

Chip-sea

Question 14

Cuantas secuencias fueron especificas de FT

Answer 14

87

Question 15

que % tiene regiones de DNA con union a proteínas

Answer 15

8.1%

Question 16

Que sitios ayudan a explorar las propiedades de la cromatina

Answer 16

Sitios de unión a factores de transcripción

Question 17

H3K27me3 modifica:

Answer 17

modifica epigeneticamente la histonas H3
trimetilacion de las lisina 27

Question 18

2 tipos de promotores en la regulación epigentica del procesamiento del RNA

Answer 18

Islas C-G (en menor cantidad que TATA)
Cajas TATA

Question 19

Técnica utilizada para la caracterización de RNAs no codificantes

Answer 19

técnica CAGE-seq, para identificar sitios de inicio de transcripción (TSSs)