Modelaje molecular y estructuras 3D

Question 1

unidad de construcción de las proteínas

Answer 1

aminoácido

Question 2

Estructuras de las proteínas

Answer 2

1 carbono central
amino - NH2
carboxilo - COOH
Átomo de hidrógeno
Cadena lateral o grupo R - variable

Question 3

Union de los aa en las proteínas

Answer 3

mediante enlaces covalentes
por esta unión se pierde una molécula de H2O

Question 4

Estructura primaria

Answer 4

• Arreglo lineal simple
• Polimerizacion de aa
• Peptido -> cadenas cortas de 20-30 aa
• Polipeptido -> cadenas de mas de 100-400 aa
• Tamaño por Da

Question 5

Estructura secundaria

Answer 5

• Espacios después de que se pliega la proteína
• Ausencia de interacción de enlaces no covalentes (puentes de H)
• Estructura espiral
• Puentes H: helices alfa y hojas beta

Question 6

Helices alfa

Answer 6

• Carbonilla-oxigeno unido por puentes de H
• Todos los puentes de H dirigidos en misma dirección
• Grupos R en los extremos, determinan hidrofobicidad o hidrosulubilidad

Question 7

Hojas beta

Answer 7

• Láminas paralelas con 2 cadenas de aa
  puentes de H entre N y H y C y O
• 5-8 residuos de aa
• dirección dada por enlaces peptididcos

Question 8

Giros

Answer 8

• 3-4 aa
• En la base de la proteína
• Formado por puentes de H entre aa

Question 9

Estructura terciaria

Answer 9

-Tridimensional
- Estabilizada por interacciones hidrofóbicas de la sacdenas laterales no polares (gpos R )
- Puentes H de las cadenas laterales polares
- Mantiene laminas y hélices compactas
-Interactúa con otras moléculas

Question 10

Motivos de combinación de estructuras secundarias

Answer 10

• Dedos de zinc (3 estrcutruas 2arias, hélice a con 2 láminas b antiparalelas)
• 2 helices unidas
• Estabilización por interacción de cadenas hidrofóbicas y tienen un patron de 7 aa repetidos
• Posición 1: valina, albanina y metionina- hidrofóbicos
• Posición 4: leucina- hidrofóbicos
• Anfipatica

Question 11

Dominios de combinación de estructuras secunadarias

Answer 11

• Subdivisiones de la estructura 3aria
• 100-150 aa en diferentes combinaciones
• Un aa repetidamente seguido
• Secuencias conservadas
• Estructura 3aria HA
• 3 subunidades
• 2 cadenas polipéptido as HA1 y HA2
• Dominio globular - distal
• Dominio fibroso - proximal

Question 12

Estructura cuaternaria

Answer 12

• No en todas las proteínas
• Multimericas (2 o mas subunidades)
• Estructuras macromoleculares
• 10 a cientos de cadenas polipetidicas (capside de los virus)